Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_006120.4

Sequence Length

1093 nt

GC Content

0.5306

GGAGUUGGGGAAGCUGGGUUGGCUGGGUUGGUAGCUCCUACCUACUGUGUGGCAAGAAGGUAUGGGUCAUGAACAGAACCAAGGAGCUGCGCUGCUACAGAUGUUACCACUUCUGUGGCUGCUACCCCACUCCUGGGCCGUCCCUGAAGCUCCUACUCCAAUGUGGCCAGAUGACCUGCAAAACCACACAUUCCUGCACACAGUGUACUGCCAGGAUGGGAGUCCCAGUGUGGGACUCUCUGAGGCCUACGACGAGGACCAGCUUUUCUUCUUCGACUUUUCCCAGAACACUCGGGUGCCUCGCCUGCCCGAAUUUGCUGACUGGGCUCAGGAACAGGGAGAUGCUCCUGCCAUUUUAUUUGACAAAGAGUUCUGCGAGUGGAUGAUCCAGCAAAUAGGGCCAAAACUUGAUGGGAAAAUCCCGGUGUCCAGAGGGUUUCCUAUCGCUGAAGUGUUCACGCUGAAGCCCCUGGAGUUUGGCAAGCCCAACACUUUGGUCUGUUUUGUCAGUAAUCUCUUCCCACCCAUGCUGACAGUGAACUGGCAGCAUCAUUCCGUCCCUGUGGAAGGAUUUGGGCCUACUUUUGUCUCAGCUGUCGAUGGACUCAGCUUCCAGGCCUUUUCUUACUUAAACUUCACACCAGAACCUUCUGACAUUUUCUCCUGCAUUGUGACUCACGAAAUUGACCGCUACACAGCAAUUGCCUAUUGGGUACCCCGGAACGCACUGCCCUCAGAUCUGCUGGAGAAUGUGCUGUGUGGCGUGGCCUUUGGCCUGGGUGUGCUGGGCAUCAUCGUGGGCAUUGUUCUCAUCAUCUACUUCCGGAAGCCUUGCUCAGGUGACUGAUUCUUCCAGACCAGAGUUUGAUGCCAGCAGCUUCGGCCAUCCAAACAGAGGAUGCUCAGAUUUCUCACAUCCUGCCCAGGAUCUCCUCUUAGGGUAGAAGUCUCUGGGACAUCCCUGGGGUGUGUGUGUAGAUUUCCCACCUGGGGACUCUGCUGUCCCUGGGCUUGCAUCCCAGGGAUCCCAGAGUGGCCUGCCUAUCACAACCACAUCCCUUCCCCCCACAAGGCAAUAAAUCUCAUUUCUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-386.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -407.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 321.28

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((....(((((((.((((((((.(((((.((((((((((.....(((((((((............)))))..)))).....)))))))))((.((((((((.((....)).)))))))).))....((((((.((((..(((((((......((((......))))...((((..(((((....(((((((((((((((...)))))(((...((((((((((((((...))))))))((((.((....(((.(((((........))))).)))......)))))).....((((((...)))))).(((((...((((.((((..(((((..(((((......)))))))...((((((((..(((..(((((.(((((((((((...(((((..((((((((...((.((((......((((..(((((.(((((((....((.((((...))))))..))))))))))))..))))....)))).)).))))))))..)))))....((((.(((((((...((((((.(((....))).))))))...........)).)))))))))((((.(.......).))))(((..((((((.((((((.((((((((......................((((....))))...............(((((...)))))......(((((((((((((..(((((...)))))..((((......(((....))).....))))......)))))))))))).)......))))))))...))))))..))))))..))).........))))))))))).)))))..)))..))))))))..((((((........)))))))))..)))))))))))))))))))...))).((((((((((((((((...((((((...(((....)))..)))))))))))..)))))).)))))..)))))))))))))))........(((((((((......)))))))))....)))).))))))))))))))))).).))))).).))))).))...)))))))))..........................

Thermodynamic Ensemble Prediction

,{.,..(((((((.((((((({.(((((.(((((...||}}}..,(((((((...,.((((.,.((((({....,|,....{((((({.|((.((((((((.((....)).)))))))).))...{(({....||||......,.|.}))))))..,,...,))))}}..,,,})))......))}}}}}.{(((({{,.,,|,},.,}}.})}}|.((((((((({...}))))))))},,(((({..(((.(((((........))))).)))......|{{|||....{((((((,..,)},,}}||||,...((((.(((({{{({((..{{((({{,.,|}}}}},|...((((((((,.(((..(((((.(((((((((((..,(((({,{(({(((((...,{.{(((,...,|||({,.(((((.(((((((....{(,((({...})))}),.))))))))))))..||||,,,,||||,,,.}))))}}},.}})))|||...........|||,.((((((.(((....))).))))))...{((.{{{....))),)))}}}||{|}}}....,},,..,(((..((((((.((((((.((((((((......................((((....))))............,..,{{{|...}}})}....}.,((((((((((((..(((.,.{{(((...}))}}...)},,,,..,,|||.....)))),}....)))))))))))).}......))))))))...))))))..))))))..)))...,.....))))))))))).)))))..))),.)))))))),,{,,{{{..,,,,,,}))))}}}}.,})))))))}}}))}|||||.....,,|||||||,,{,,,,|}...,||||{|||||{,...,,),,,.)))}))}}}}|(((((({.,(((((((((((({.{.,...........(((((((((......))))))))),.,)))))))))))))))))))),))))}))))).}.))))).))...)))))))||....||....................