Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_006158.5
Sequence Length
3584 nt
GC Content
0.4693
GCACACAGCCAUCCAUCCUCCCCCUUCCCUCUCUCCCCUGUCCUCUCUCUCCGGGCUCCCACCGCCGCCGCGGGCCGGGGAGCCACCGGCCGCCACCAUGAGUUCCUUCAGCUACGAGCCGUACUACUCGACCUCCUACAAGCGGCGCUACGUGGAGACGCCCCGGGUGCACAUCUCCAGCGUGCGCAGCGGCUACAGCACCGCACGCUCAGCUUACUCCAGCUACUCGGCGCCGGUGUCUUCCUCGCUGUCCGUGCGCCGCAGCUACUCCUCCAGCUCUGGAUCGUUGAUGCCCAGUCUGGAGAACCUCGACCUGAGCCAGGUAGCCGCCAUCAGCAACGACCUCAAGUCCAUCCGCACGCAGGAGAAGGCGCAGCUCCAGGACCUCAAUGACCGCUUCGCCAGCUUCAUCGAGCGCGUGCACGAGCUGGAGCAGCAGAACAAGGUCCUGGAAGCCGAGCUGCUGGUGCUGCGCCAGAAGCACUCCGAGCCAUCCCGCUUCCGGGCGCUGUACGAGCAGGAGAUCCGCGACCUGCGCCUGGCGGCGGAAGAUGCCACCAACGAGAAGCAGGCGCUCCAGGGCGAGCGCGAAGGGCUGGAGGAGACCCUGCGCAACCUGCAGGCGCGCUAUGAAGAGGAGGUGCUGAGCCGCGAGGACGCCGAGGGCCGGCUGAUGGAAGCGCGCAAAGGCGCCGACGAGGCGGCGCUCGCUCGCGCCGAGCUCGAGAAGCGCAUCGACAGCUUGAUGGACGAAAUCUCUUUUCUGAAGAAAGUGCACGAAGAGGAGAUCGCCGAACUGCAGGCGCAGAUCCAGUACGCGCAGAUCUCCGUGGAGAUGGACGUGACCAAGCCCGACCUUUCCGCCGCGCUCAAGGACAUCCGCGCGCAGUACGAGAAGCUGGCCGCCAAGAACAUGCAGAACGCUGAGGAAUGGUUCAAGAGCCGCUUCACCGUGCUGACCGAGAGCGCCGCCAAGAACACCGACGCCGUGCGCGCCGCCAAGGACGAGGUGUCCGAGAGCCGUCGUCUGCUCAAGGCCAAGACCCUGGAAAUCGAAGCAUGCCGGGGCAUGAAUGAAGCGCUGGAGAAGCAGCUGCAGGAGCUGGAGGACAAGCAGAACGCCGACAUCAGCGCUAUGCAGGACACGAUCAACAAAUUAGAAAAUGAAUUGAGGACCACAAAGAGUGAAAUGGCACGAUACCUAAAAGAAUACCAAGACCUCCUCAACGUGAAGAUGGCUUUGGAUAUUGAGAUUGCAGCUUACAGGAAACUCUUGGAAGGCGAGGAGACCCGACUCAGUUUCACCAGCGUGGGAAGCAUAACCAGUGGCUACUCCCAGAGCUCCCAGGUCUUUGGCCGAUCUGCCUACGGCGGUUUACAGACCAGCUCCUAUCUGAUGUCCACCCGCUCCUUCCCGUCCUACUACACCAGCCAUGUCCAAGAGGAGCAGAUCGAAGUGGAGGAAACCAUUGAGGCUGCCAAGGCUGAGGAAGCCAAGGAUGAGCCCCCCUCUGAAGGAGAAGCCGAGGAGGAGGAGAAGGACAAGGAAGAGGCCGAGGAAGAGGAGGCAGCUGAAGAGGAAGAAGCUGCCAAGGAAGAGUCUGAAGAAGCAAAAGAAGAAGAAGAAGGAGGUGAAGGUGAAGAAGGAGAGGAAACCAAAGAAGCUGAAGAGGAGGAGAAGAAAGUUGAAGGUGCUGGGGAGGAACAAGCAGCUAAGAAGAAAGAUUGAACCCCCAUUUCCUUAAUUAUUUCAGGAAUAAUUCUCCCGAAAUCAGGUCAACCCCAUCACCAACCAACCAACCAGUUGAGUUCCAGAUUCUAUGUGAAUUAAAAAGUCAAUAUAUGUAUAAUUCUGAGAUGACUUAGGUUGGACAUUCAAUGUUGUGCUAUGAAUUUCCUCUUUAUGCAGAGUAUCUGUUUGCUUGCAGAGUGGCUUUCUGGCUUGCUGCCAGCCUGUGCAUGGACCACGCUUAUGAGUUCAGGAUCUACGGCAAUGUGAAUCAUUCAGAUGUUUACAAUAAAAAACACCACAUGAGUAAAUGAAUUCACUAAUGUUAAUGUUAAACUUCAUGGAAAAAUAGUCCUUUGAACCUUCGGUGGUUAGCAAUUAAAGACCCUGAGUUAUGUGCAAUAAAUAGUAAAUAAAGUUAUACCGAAUGAUGUAUUUUUUGCUGUGGUUGUUACUUAAUUAAAAUACCUUAAAGAUGGCACCAAUAUAAAGUAUAUACCAGUGGACUAUUGACCUCCAAUUUUUUAAAAAGUUGAAAUUUUAACAAUUACCAAUACUUUUUUUUCUUCCUUCAAUUGGAAAUUCUGAGGGAUACAGUUAUGUCAUGAUUACUUGUGAAAUCUCUCCCCACAAAAAUUUUACUGAUAAUAAACAUGAGUAAAUGAGAAAGUCUAUAAAUAACAAUAGACUUUGCCUCAUAACACGUGUUGUGUUAGGUUUUGGGAUGGCUUUCUAGGGAGCAAUUCUGAAAUUACUUGACAGAUACACUCUUUAUGGUAAACAGGUCAUUUCAGAGUCUAGAGUGCUAACCAUUACACUAUGGAACCAUGAUAAAUAGGUCAUUUCAAACUGAUAUGUCACAAUGCAAUAUGGAUAGAAUAUGAAUCCCAUACAUUCAUCCCUAUAACUGCAUUUUAAAAUAUAGUCUAAAUAUCAUGGGAGGAGGUUAAAACCUGAGAACAUGGUACAAUAAGAAGGAAUAAUUUUUUAUCUAUAUAUAAUUUCAGGAGAAGGGAUUAAAACUACCAAAGGUUAUUUGCCACUCCACUGCAAACAUGUUGCCUGCAAUCCUGAGCUCAUGAUUUAGUGUGUUGUUAAGCGUAAUUCUGUUGCCUCAAGUAAAUACCACUUAAUGCUACACAUUUUUAAACCUUUAAAAGCUACAGACACAAGUAAUGAAAUUAUGAGUCACUUAAGGGGGGAGGUAAUAUGCUUGUAUGUUACAUUGACAUUGCUCUGCAUGUCUCUACUGGGAGAUAUUUGGAUUUCAAUGAUAGCUUGACUGGUUGGACAUUGCAUCAAAUACACGCCCCAUGUAUCCUUUCUGUCGUAAAGUUAAGAACGCUCUUGCAUUUGAUGUGGAAUAAAUAUAGAUGAUAUUACUAUCUGCUAUUCUGCCUUUGUUCUGAAACAAUUGCUUUGUCAGCUAAUUUCAUUCAAUAUUUGUUUUUUAGACGAUCUCUAUAAGUUAUUAAUUUAACCUGAAACCAAAGUGGUCUCCAUUUAAAGUUACUUAAUCCCUUUGUACCACCUAUUUCUAGUUAAAUAUAUGUUGCUAUGCAAAUAGGUAAAGUGCUUCCUUGCCAUGAUGGUAAUGGAUUGGAACUAUGAAGGCUCUCAGUGUAUUGGCUUCUGUAAAGAUGAGGCGUCUCCUCAGAAACAAAACUUUUCACAUUUCUGCUUACUAGACCUGGGUUGAUGUACAUGGUAAGUCUCAAACAGAUGCAAGCUAUGUGCAAAAAGUAACUUUAGCCAAAUGGAAAUAGCUGGAUGCUUUGAGAAUUACUUGGUUGAAGUAAGAAAACUGUACCAUCCUCUAUCCUGUGUGCCAUAAUAAAAUAGUAAAAAACCUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1097.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1169.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 939.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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