Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_006225.4
Sequence Length
2651 nt
GC Content
0.5994
AUUCAGGUCCCUGCACCGCACUCCGCUCGGACCCCAGGCCGCCGGUGCUGUCGCUACUCAAGUGAGUCCCGCGGUGCCCCUCCCGCCGCGCCGCCCGUCGGGCAUGGACUCGGGCCGGGACUUCCUGACCCUGCACGGCCUACAGGAUGAUGAGGAUCUACAGGCGCUGCUGAAGGGCAGCCAGCUCCUGAAGGUGAAGUCCAGCUCAUGGAGGAGAGAGCGCUUCUACAAGUUGCAGGAGGACUGCAAGACCAUCUGGCAGGAGUCCCGCAAGGUCAUGCGGACCCCGGAGUCCCAGCUGUUCUCCAUCGAGGACAUUCAGGAGGUGCGAAUGGGGCACCGCACGGAGGGUCUGGAGAAGUUCGCCCGUGAUGUGCCCGAGGACCGCUGCUUCUCCAUUGUCUUCAAGGACCAGCGCAAUACACUAGACCUCAUCGCCCCAUCGCCAGCUGAUGCCCAGCACUGGGUGCUGGGGCUGCACAAGAUCAUCCACCACUCAGGCUCCAUGGACCAGCGUCAGAAGCUACAGCACUGGAUUCACUCCUGCUUGCGAAAAGCUGACAAAAACAAGGACAACAAGAUGAGCUUCAAGGAGCUGCAGAACUUCCUGAAGGAGCUCAACAUCCAGGUGGACGACAGCUAUGCCCGGAAGAUCUUCAGGGAGUGUGACCACUCCCAGACAGACUCCCUGGAGGACGAGGAGAUUGAGGCCUUCUACAAGAUGCUGACCCAGCGGGUGGAGAUCGACCGCACCUUCGCCGAGGCCGCGGGCUCAGGGGAGACUCUGUCGGUGGAUCAGUUAGUGACGUUCCUGCAGCACCAGCAGCGGGAGGAGGCGGCAGGGCCUGCGCUGGCCCUCUCCCUCAUUGAGCGCUACGAGCCCAGCGAGACUGCCAAGGCGCAGCGGCAGAUGACCAAGGACGGCUUCCUCAUGUACUUACUGUCGGCUGACGGCAGCGCCUUCAGCCUGGCACACCGCCGUGUCUACCAGGACAUGGGCCAGCCACUUAGCCACUACCUGGUGUCCUCUUCACACAACACCUACCUGCUGGAGGACCAGCUAGCCGGGCCCAGCAGCACUGAAGCCUACAUCCGGGCACUGUGCAAAGGCUGCCGAUGCCUGGAGCUUGACUGCUGGGACGGGCCCAACCAGGAACCAAUCAUCUACCACGGCUAUACUUUCACUUCCAAGAUCCUCUUCUGCGAUGUGCUCAGGGCCAUCCGGGACUAUGCCUUCAAGGCGUCCCCCUACCCUGUCAUCCUAUCCCUGGAGAACCACUGCACACUGGAGCAGCAGCGCGUGAUGGCGCGGCACCUGCAUGCCAUCCUGGGCCCCAUGCUGUUGAACCGACCACUGGAUGGGGUCACCAACAGCCUGCCCUCCCCUGAGCAACUGAAGGGGAAGAUCCUGCUGAAGGGGAAGAAGCUCGGGGGGCUCCUGCCCCCUGGAGGGGAGGGUGGCCCUGAGGCCACUGUGGUGUCAGACGAAGACGAGGCUGCUGAGAUGGAGGAUGAGGCAGUGAGGAGCCGUGUGCAGCACAAGCCCAAGGAGGACAAGCUCAGGCUAGCACAGGAGCUCUCUGACAUGGUCAUUUACUGCAAGAGUGUCCACUUUGGGGGCUUCUCCAGUCCUGGCACCCCUGGACAGGCCUUCUACGAGAUGGCGUCCUUCUCUGAGAACCGUGCCCUUCGACUGCUCCAAGAAUCAGGAAACGGCUUUGUCCGCCACAACGUGGGGCACCUGAGCAGAAUCUACCCGGCUGGAUGGAGAACAGACUCCUCCAACUACAGCCCCGUGGAGAUGUGGAAUGGGGGCUGCCAGAUCGUGGCCCUGAAUUUCCAGACACCUGGGCCAGAGAUGGACGUGUACCAGGGCCGCUUCCAGGACAACGGGGCCUGUGGGUACGUGCUGAAGCCCGCCUUCCUGCGAGACCCCAACGGCACCUUUAACCCCCGCGCCCUGGCUCAGGGGCCCUGGUGGGCACGGAAGCGGCUCAACAUCAGGGUCAUUUCGGGGCAGCAGCUGCCAAAAGUCAACAAGAAUAAGAAUUCAAUUGUGGACCCCAAAGUGACAGUGGAGAUCCAUGGCGUGAGCCGGGACGUGGCCAGCCGCCAGACUGCUGUCAUCACCAACAAUGGUUUCAACCCAUGGUGGGACACGGAGUUUGCGUUUGAGGUAGUUGUGCCUGACCUUGCCCUCAUCCGCUUCUUGGUGGAAGAUUAUGAUGCCUCCUCCAAGAAUGACUUCAUUGGCCAGAGUACCAUCCCCUUGAACAGCCUCAAGCAAGGAUACCGCCAUGUCCACCUCAUGUCUAAGAACGGGGACCAGCAUCCAUCAGCCACCCUCUUUGUGAAGAUCUCCCUCCAGGACUAGGCUGGAGGAAGCCAGUGGGGUCCCCCCUGAGUGGGCUGGGCCCUCUGUCCACAUGUGGGGACAGGGCUGGUGUGGCUGCUCCCAGCCUCUUGCUCAGAGCUAGGCCCCCAAAUUGCCUUCAGCCCUAACAUAGUGUCUGCUGCUGCCUCCCUGGGGACCAGGAGCUAGCCCAGUCCCUGGAGCUGUCCUUCAUUCCGUUAGGAAUAACACUGCAGCCCUCUCCACCCUCCGGCCAGCGAGUGGUCAAGGAUUUUUAUAAAAAUCACGAUAAGAUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1087.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1130.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 579.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((.((.((((((..(((((((.((...)))))..))))..)).)).........(((((((((((((.......)))))))..((((...))))..)))))))))).))))))((((((((((((..((((...(((.((..((((..........(((((.((((((((((.((((((((..((......)).(((((..((((.((((.(((((((.....((((((.....))))))(((((.(((((((.(((((((((......))))).((((.(((.(((.(((((((((....)))))))....(((((((((....((((((..(((((..((.((.....)).))..)))))..))))))((((.((((((....(((.(((....)))))).)))))..........).))))...((((((.((((.((((.....))))....)))).)))))).......((((.((((((.(....(((....((..((((((((((((.....((.((.(((...(((((.(((.((...(((((......((..(((......(.((((((((.(((((.(.....).)))))...)))))))).).)))..))......))))).....)).)))..(((((((((((.((.(........).)).)))))))))))....)))))))).)))))))))....)))))))..))))))))))))))))...)))))))))((....)).)))))))).)))).)))))))))))))).))............((((((.((....)).)))))))))))))...(((((......)))))))))))))..)))))........(((((.(((...((....))((((((((((((.((....(((((................)))))((((((.(((((........(((((((((((((((.(((((.((((((((.((((((((((((((((((((.((((((((((.((((...............(((((....))))).....((((((..(((((.(.((((.....((((((((.((.(((.....))))).)))))))))))).).)))))....))))))..(((((.......(((((.((((((.........(((.((..(((......)))..)).)))((((((((((((((((((...((((...)))))))))....((((((..(((.......)))..))..((((........))))..((((......))))((((......)))).....((((.....(((((((....((((.((....))))))..)))))))..))))((((((.((((......(((.....)))))))..))))))......(((((((((....)))))))))))))..)))))))))))))........((((((((((...((.((((((.(((((.((((.(.....(((((((((((((.((((((((...(((((.....))....)))...))).))))).).))))).((((...)))).))))))).....).)))).))))).))))))))..)).))))))))...((((..(((.(((...))).)))))))((((((.((....(((((((.((.....(((........)))...(((.......)))....)).))))))))).)).)))).......(((((..(((((.........)))))....))))))))))))))))(((((..((((((((......))))))))....)))))....))))).(((....))).((((((((((((((.((.(((((....(((((.((((((((.(.(((.((((.....))))..))).)))))..))))..........)))))...)))))...)).)))))))))..))))))))).))....))))))))(((((((.(((((((...)))))....(((.((((((((....))))..)))).))).)).))))))))))))...((...((((((((...((((((((((((.(((.(((((.(((((.((((((....(((.......))))))))))))).).)))))))).)))(((((....)))))..((((((..((.((((((....)))))).))....((((.(((..(((((((....))).))))...)))...))))...((((......)))))))))).....)))))))))..))))))))...))..(((((((.....((((..(((((.......)))........(((((((.......)))))))..))..))))))))))).)))))).)))).)))))..))))).....)))))))).))).)))))(((((....)))))(((.....)))))))))).......))))).))))))........))))))))))))))))).)))))...))))))))...((((...)))).))))))))))(((((....)))))......)))))))))..)).)))..)))).)).)).)))).))))..........((((.......))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((.((.((({({{{(({,(((.({...}}}}}.,})})|.,,,{{,.....,,,||(((({((((((.......)))))))..((((...))))..)))))))))).)))))){(((((((((((..((((...(((.((..((((.......,,.(((((,((((((((((,((((((((..((,...{{,,.(((((..((((.((({{(((((((.....((((((.....)))))}({(((,(((((({{(((((((((......))))).((((.((({(({.(((((((((....)))))))....(((((((((....((((((..(((((.,((.((.....)).,)..)))))..))))))((((.,(((((.,..(((.(((....)))))).)))))..........}.))))...((((((.((((,((((.....))))..,.)))).)))))).......((((.((((((.{....,{,...(((..((((((((((((.....((.((.((({..((({{{(((.,,..}|||{|.......,..{,.......,.((((((((.(((((.,.....,.)))))...)))))))).}.|({.{{|{,.,..,,))).,))}.))).}.,(((((((((((.((.{........}.)).))))))))))),..}))}})))).)))))))))....)))))))..))))}}))))))))))...))))))))){{....)).)})))))).)))).)))))))))))))).}}.,,,...}},..((((((.((....)).))))))))))))).},(((((......)))))))))))))..)))))...,,..}|||||.|||.,,|(...,|}((((((((((((,,,..{(((,,,..}}}}...,..,...,|||,((((((.(((((.{{{,..{(((((((((((((((.(((((.((((((((.((((((((((((((((((((.((((((((((.((((...............(((((....))))).||{{(({((({((((,,.(.((((.....((((((((.((.(((.....))))).)))))))))))).}}))))))}..||||||..(((||..||...(((((.((((((,........{{(.{(,.{((......}}},.}}.}||((((((((({{{{(((((...((((...)))))))))....{{{{{(,.(((.......))),.,}..((((.....,..}}}},,(({({.{{{{||||{({..,,)).})))}}}..((((...,.(((((((....((((.(,....))))))..))))))).,)}}}((((((.{({,.....,||||,...}}})))},.}))))}.....,{((((((((....))))))))}}))),,}|||||||}}}})}||}||{,((((((((((...((.((((((.(((((.((((.(.....(((((((((((((.((((((((...(((((.....))....)))...))).))))).).))))).((((...)))).))))))).....).)))).))))).))))))))..))}})))))))}},||{{.,(((,(((...|||.||}||)).{{{{{,||....(((((((.((..,..(((........)))...(((.......)))....)).)))))))}}.}}|}}},,,..,..(((((..(((((.......,.)))))....)))))}))))))))))|||{,|,|(((((((......}}|||||}.,..,}|||....,}}))}|||}}..))).|(({((((((((((.((.(((((.,..((((({({{{((({.(.(((.((((.....))))..))).)}}))),.})),.........))))).,.)))))...)).))))))))),.))}}))))).))....))))))))(((((((.(((((((...))))}....(((.((((((((....))))..)))).))),)).)))))))))))).,.{{...((((((((...((((((((((({.((,{(((((.(((((.((((((....(((.....,,)}})))))))))).).)))))))).}))(((((.,,.}||||,.(({,({..,,.,..,{(((((((.(({.{......,,,,,))).))))))},}....}...)),.}),)},,}||{{.{((((......))))),..)),,...)))))))))..))))))))...},..(((((((.{{.{((.({{(({....{{{,.|.|,,|.....{||||||},...}}))))}))}.))..}}}}))))))).))))))}))))})})))..))))).....)))))))).))).)))))(((((....)))))....}}.})).))))))).......,)))).))))))...,,,.,)}))))))))))))))).))))},,|}}||}}}}...{{{|,.,)))).))))))))))|((((....))))}......)))))))))..)).)))..)))).)).)).))))},))}..........{{{{.......}},,..
Back