Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_006287.6
Sequence Length
3859 nt
GC Content
0.3467
AGACAGCAGCGACUUUAGGCUGGAUAAUAGUCAAAUUCUUACCUCGCUCUUUCACUGCUAGUAAGAUCAGAUUGCGUUUCUUUCAGUUACUCUUCAAUCGCCAGUUUCUUGAUCUGCUUCUAAAAGAAGAAGUAGAGAAGAUAAAUCCUGUCUUCAAUACCUGGAAGGAAAAACAAAAUAACCUCAACUCCGUUUUGAAAAAAACAUUCCAAGAACUUUCAUCAGAGAUUUUACUUAGAUGAUUUACACAAUGAAGAAAGUACAUGCACUUUGGGCUUCUGUAUGCCUGCUGCUUAAUCUUGCCCCUGCCCCUCUUAAUGCUGAUUCUGAGGAAGAUGAAGAACACACAAUUAUCACAGAUACGGAGUUGCCACCACUGAAACUUAUGCAUUCAUUUUGUGCAUUCAAGGCGGAUGAUGGCCCAUGUAAAGCAAUCAUGAAAAGAUUUUUCUUCAAUAUUUUCACUCGACAGUGCGAAGAAUUUAUAUAUGGGGGAUGUGAAGGAAAUCAGAAUCGAUUUGAAAGUCUGGAAGAGUGCAAAAAAAUGUGUACAAGAGAUAAUGCAAACAGGAUUAUAAAGACAACAUUGCAACAAGAAAAGCCAGAUUUCUGCUUUUUGGAAGAAGAUCCUGGAAUAUGUCGAGGUUAUAUUACCAGGUAUUUUUAUAACAAUCAGACAAAACAGUGUGAACGUUUCAAGUAUGGUGGAUGCCUGGGCAAUAUGAACAAUUUUGAGACACUGGAAGAAUGCAAGAACAUUUGUGAAGAUGGUCCGAAUGGUUUCCAGGUGGAUAAUUAUGGAACCCAGCUCAAUGCUGUGAAUAACUCCCUGACUCCGCAAUCAACCAAGGUUCCCAGCCUUUUUGAAUUUCACGGUCCCUCAUGGUGUCUCACUCCAGCAGACAGAGGAUUGUGUCGUGCCAAUGAGAACAGAUUCUACUACAAUUCAGUCAUUGGGAAAUGCCGCCCAUUUAAGUACAGUGGAUGUGGGGGAAAUGAAAACAAUUUUACUUCCAAACAAGAAUGUCUGAGGGCAUGUAAAAAAGGUUUCAUCCAAAGAAUAUCAAAAGGAGGCCUAAUUAAAACCAAAAGAAAAAGAAAGAAGCAGAGAGUGAAAAUAGCAUAUGAAGAAAUUUUUGUUAAAAAUAUGUGAAUUUGUUAUAGCAAUGUAACAUUAAUUCUACUAAAUAUUUUAUAUGAAAUGUUUCACUAUGAUUUUCUAUUUUUCUUCUAAAAUGCUUUUAAUUAAUAUGUUCAUUAAAUUUUCUAUGCUUAUUGUACUUGUUAUCAACACGUUUGUAUCAGAGUUGCUUUUCUAAUCUUGUUAAAUUGCUUAUUCUAGGUCUGUAAUUUAUUAACUGGCUACUGGGAAAUUACUUAUUUUCUGGAUCUAUCUGUAUUUUCAUUUAACUACAAAUUAUCAUACUACCGGCUACAUCAAAUCAGUCCUUUGAUUCCAUUUGGUGACCAUCUGUUUGAGAAUAUGAUCAUGUAAAUGAUUAUCUCCUUUAUAGCCUGUAACCAGAUUAAGGAAUACAGCUCUUAAAAAAUCAAGAACUUCCUGAGUUUCACAUAUAAAAUGGUGACAAACACCUGCUUCUGAUAAAGUUUAUCCAAUUUUGUAUUUAUAGUAUUCUAUUGUAAUAAUAGAAUUCUAUUAUGUGCUUCCCUCCUUAGACAUAGUUUUUCUCCUUUUGUACUAACCAGUACUUCCAUCUAUAUUGAGCUAAACUGUCUUUGAACAGUCAACUCUGCAUCAUGUGCCUGCCUGAUUUGGAUUGGUUUCACUUUUUUUUUUGUUUGACCAUAGCCCAUUCUAUCAGUCAAGAUGACUGAAUAAUUGUGUGUUAAAUACAACUCAUGAUAAGGAGAACCUUUAUGGAAACAAGAAGUUUUAUGGCAAUCGAGAGGGAAUUAUUUAUAUGUACUUCUUAAUACUAUGCUUCCCAAUAUUUUUUCUUACUAAAAAUAACAAAAAUAUUUAAACCUUCUGAAAUCUAUUCAGUUAUCAUUAGGAUUUGCACACAAUGCAACUAAUAAUUCAUGCUUUAAAAAGUAGGUUAUUUCUGUUGAAGAGAAAAUUAUCAGCAGGGAAGAGUCUACUAGAAAAUUCAUGUGCUAGUCAUUCUUGGGGAUUUAAUAUUUUGCUGGAGUUAAUUCACUAUAUCCAGACCUGUAUCUUUCAUUUAUUGCUGAGCCAUGUGCAGUCUGGCAUCUCAACAACCUCAACAACCUCAACAACCUCCAAGACAUGUCAGUUUCUGUAGUGUUCACCUCAAAUCUGACACUGGAAUUGGAACUGAUUUAGAAACAACCAUUUCAUUCAUUUGGUAUGACUAGCUUCAUGACUAGCUUCAUGAAUAGCUUCAUGAAUAGCUUCAUGACUUCUCGCUAACAAUGAUAGUAUAAUUCUGCCUGUUCUUCAGGAUUGAAAUUUUGAACUCAAUUUAGAUUUCCUGUUUUCCCUCAUAUACCACAUCUAAACAGUCUCCAAAUCUUUAUGCUUUUUUUUUUUUUUUUCGAAAAAGUUCACCCAAUCCCUAGGCUUUUUACUUUUUUCUUUUUCUUUUCUUUUUUCUUGUUUUUUUUUUUUUUUCAUUUUGUUUUGUUUUGUUAUGUUUUUUUAGACAGGGUCCCACUCUGUCACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCAAUCACAGGACACUGAAACCUCCCACCUAGCUGGGACUAGAGGUGCAGGCCACCACACCAGCUAAUUUAUGUAAUUUUUGUAGAGACGAGUUUCACCACGUUACCUAGGCUUGUCUUGAACACCUGGGCUCAAGCAAUCUUCCAGCCCCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUAUAAACCACAAUGCCCCCGUUUUUACUCUUUACUGCAUCCUUCCCAUCAGUAUUAAUUCCUCAGAAAUUUAGUACAUUCCUCCACCAUUUCAAAAUGCUCCCAGAACUCACACUAGUUGGUACUUAACUACAACCUUCAACCUCACCAUUUAAUUUUGAUGUAUGUUUUUGGAUUUACCAACAGUACUUUCUUUCAUGACUACUUUGAUUUAGUUAAGAAUGCUCACUGUACACUGAAUGUUAAUUACUCAGCUAAUUCACACUGAUUUCCUGUUUAAAAAUAUGAUCCCCUCCAGGCCAUUCAUGUGAAGUCAGGGUACAGCUGAUGCCAGCUACAGAAUCACUAUGUUUCAAUAUGGAAUAUGAAAAGUCCUAACACAUAAUUGCAAAUCAUUUUCUACUAUGGUAUACAAAUUUUAUCAUUACAAAAUAGUAUCAGCUUUUUUCACUUAAGGAAAAUAAUACAUCUUCAUUCAAAUAUUCAGUGCAUAAAUAAUUGCCUUAAAUUGAGUCUUUGCUGUGGAAUUUGAGAGUUUUGGAAAUCAAAGGCCCUUGUGAAACAUUUCCUGUUGCCAUUUAUUUAUAGAUAGCAAUAGCUUCAAAUGAGUGGGAAAGUCUACUUAGGUGAAGUGGUAAAUAGUCACUAAGAUUGUAUAAAUAGCGCAUUGAUGAGUUGCCUAAUUGUUUUCUCCAACAAUAACCACUGGUCCAUUGGUUCACUACUUACUCAAGAAAGACAUAUACUGAGAUGGCUUGAAAUGUUUAAUGCAUGUGAACGUUAUUUUUACCGUGUUUUGGAAAAAGAUCUUGAUGUUAUUGUCUUCCUUUAUUUUCCACAAUUAAGUGCAUCUAACUGUGAAUUGUAUAUGGAAUUACAUUAUUCAGCAUAUACAUAUAUUUACCUGCUUUGUUCAUUCUCUGUAUUCAAAAUUAACAGAUCAUGCUGAAAACCACUCAAACGAUUAUAUUUUUUACAUUAUAAGAAGUAAAAUAUAUUAUUCUGAAUAAUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-862.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -941.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 805.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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