Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_006288.5
Sequence Length
4502 nt
GC Content
0.5613
AGCAACCGGAGGCGGCGGCGCGUCUGGAGGAGGCUGCAGCAGCGGAAGACCCCAGUCCAGAUCCAGGACUGAGAUCCCAGAACCAUGAACCUGGCCAUCAGCAUCGCUCUCCUGCUAACAGUCUUGCAGGUCUCCCGAGGGCAGAAGGUGACCAGCCUAACGGCCUGCCUAGUGGACCAGAGCCUUCGUCUGGACUGCCGCCAUGAGAAUACCAGCAGUUCACCCAUCCAGUACGAGUUCAGCCUGACCCGUGAGACAAAGAAGCACGUGCUCUUUGGCACUGUGGGGGUGCCUGAGCACACAUACCGCUCCCGAACCAACUUCACCAGCAAAUACAACAUGAAGGUCCUCUACUUAUCCGCCUUCACUAGCAAGGACGAGGGCACCUACACGUGUGCACUCCACCACUCUGGCCAUUCCCCACCCAUCUCCUCCCAGAACGUCACAGUGCUCAGAGACAAACUGGUCAAGUGUGAGGGCAUCAGCCUGCUGGCUCAGAACACCUCGUGGCUGCUGCUGCUCCUGCUCUCCCUCUCCCUCCUCCAGGCCACGGAUUUCAUGUCCCUGUGACUGGUGGGGCCCAUGGAGGAGACAGGAAGCCUCAAGUUCCAGUGCAGAGAUCCUACUUCUCUGAGUCAGCUGACCCCCUCCCCCCAAUCCCUCAAACCUUGAGGAGAAGUGGGGACCCCACCCCUCAUCAGGAGUUCCAGUGCUGCAUGCGAUUAUCUACCCACGUCCACGCGGCCACCUCACCCUCUCCGCACACCUCUGGCUGUCUUUUUGUACUUUUUGUUCCAGAGCUGCUUCUGUCUGGUUUAUUUAGGUUUUAUCCUUCCUUUUCUUUGAGAGUUCGUGAAGAGGGAAGCCAGGAUUGGGGACCUGAUGGAGAGUGAGAGCAUGUGAGGGGUAGUGGGAUGGUGGGGUACCAGCCACUGGAGGGGUCAUCCUUGCCCAUCGGGACCAGAAACCUGGGAGAGACUUGGAUGAGGAGUGGUUGGGCUGUGCCUGGGCCUAGCACGGACAUGGUCUGUCCUGACAGCACUCCUCGGCAGGCAUGGCUGGUGCCUGAAGACCCCAGAUGUGAGGGCACCACCAAGAAUUUGUGGCCUACCUUGUGAGGGAGAGAACUGAGCAUCUCCAGCAUUCUCAGCCACAACCAAAAAAAAAUAAAAAGGGCAGCCCUCCUUACCACUGUGGAAGUCCCUCAGAGGCCUUGGGGCAUGACCCAGUGAAGAUGCAGGUUUGACCAGGAAAGCAGCGCUAGUGGAGGGUUGGAGAAGGAGGUAAAGGAUGAGGGUUCAUCAUCCCUCCCUGCCUAAGGAAGCUAAAAGCAUGGCCCUGCUGCCCCUCCCUGCCUCCACCCACAGUGGAGAGGGCUACAAAGGAGGACAAGACCCUCUCAGGCUGUCCCAAGCUCCCAAGAGCUUCCAGAGCUCUGACCCACAGCCUCCAAGUCAGGUGGGGUGGAGUCCCAGAGCUGCACAGGGUUUGGCCCAAGUUUCUAAGGGAGGCACUUCCUCCCCUCGCCCAUCAGUGCCAGCCCCUGCUGGCUGGUGCCUGAGCCCCUCAGACAGCCCCCUGCCCCGCAGGCCUGCCUUCUCAGGGACUUCUGCGGGGCCUGAGGCAAGCCAUGGAGUGAGACCCAGGAGCCGGACACUUCUCAGGAAAUGGCUUUUCCCAACCCCCAGCCCCCACCCGGUGGUUCUUCCUGUUCUGUGACUGUGUAUAGUGCCACCACAGCUUAUGGCAUCUCAUUGAGGACAAAGAAAACUGCACAAUAAAACCAAGCCUCUGGAAUCUGUCCUCGUGUCCACCUGGCCUUCGCUCCUCCAGCAGUGCCUGCCUGCCCCCGCUUCGCUGGGGUCUCCACGGGUGAGGCUGGGGAACGCCACCUCUUCCUCUUCCCUGACUUCUCCCCAACCACUUAGUAGCAACGCUACCCCAGGGGCUAAUGACUGCACACUGGGCUUCUUUUCAGAAUGACCCUAACGAGACACAUUUGCCCAAAUAAACGAACAUCCCAUGUCUGCUGACUCACCUGGCUGGAACAACAUGCUUACUGCCAACAUGUGGGCCGAACCACAUGGCCCUGGCUCUGGAAUGCACAAGUGGCUUUGCGUGAAUCUGCGCUAAGCUAUGCAGUCUGCUUUUUCUUCUCAGCUCUGGUAGUUCUUCAGAAAUGUACCCUCCAGGCACAUCCACUAUUGCGAGGGUGAGCACGAAGGGUGGGAGAUGCCCAUGUCCUCAAGGCAUCACUUCCUAAAUCCAAAAGCAUCGGCAGGAGAAAGGACUGGGGACAAAUACUGUCCCUUCGGGAGUAGGGAGGGAACACUGAGGCCCAUCCCUGGCUCCUUCCCUAAAAGUAGAGUAAAAUGGAAGCGAGCAUCCUGGGAUUGGGGGCAAGAGGGGGACCGCAGGGUAGCUGUGGGUUCCAACUGCUGUCAGAGUCAGAGAGGCAGCCCCAAGCCAGCCUCCCUGCUUUGCCAGGGAAUUUGGGGGAGGAAGGUGACAGCUGCCCAGAGGCUGACUCAUCUGAUAUUUAGCACUGGGUAGGAUGAUUGUUUCUGAGCAUUUUUCUUAAAGGCCUCAGAUCUAAAUUAUGCCACCGGCUCCCACUCUUGCUACCUCCCGUCAACUUCUCUGCCUUGCCUUCCACCCCUGUAGUUACCAUACACAGAGGAGGAGGAGCUGUCCUUGUCCCAGGUUGGGAGGCUGACAACCCCUUAGCAAGAUGCUGCCAGCCCAGAGCUCUCCAAGGGGAGGAACACCCCUGAGACUCAGGCCCCUCUCCUUCAGCCCUGCUUGGGCUGCAAGCGCCGUGCCAAGGAAAGGCAUCUUGGUGAGAAGAGCUGCUGUGGGGGAAGGGAGAUCAAAUGCCAGAGAAAUGUGGGGUGCCCCACCCUCAGGAUAGUAAAAGAGUAUGGAGGUAUUUCUGGAAGGAAAUGAGCGGCACUGUGUGAAGCCUCGCACCUGUGUGACACUUCCUAUGGGGUCUUUGUCACACUCUAGUACUAUGUCCCUGAAGAGUUUAGCAGCCACACUCUUAGAAGGGUGCUGGGAGAUGGUGUUGCCCUCUGCAGCCAUGUUUAGGGGAGCGGAACCUGAGGCCCACAGUGGGUGAGAUUAGCUCAAGAAGCCACAGAGGCCACCAGAGGGCCACGGACUUCGGAAAGGAGAAGAGAAGAACAGGGCAUCAGGCCUCACAACGCAAACCUACCCAGAGAUGGGCACAGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCACCACUUUGGGAAGAGGCGGAUCGCUUGAGGUCAGGAGUUCGAGACUAGCCUCGAAACCCUAUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGCAUGGUGGCCUGCGCCUGUAAUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCACUUGAACCCGGGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUUGCACCACUGCACUCCAGCCUGGGAGAUAGAGUGAGACUCCAUCUCAAAAAAAUAAAAAAUAAAAUAAACCUACCCGGAAUGACCAUGCUGAGGACUGGGAGCCCGCAGACUUUCAGCCACAGGCCGCGACAGCCGUGGGUCCCUCCCUGGUCAAGUCAGCAGGCCUUGUGGAGGCUGUGGGGUAUCUGUGGUGACUCAGGUAAUUAUAGAGGGCUGGCCCCCAGCCCUGGUUCCUGUACACAUGCCCCAACCCCAUCCCCAUCCACUCCCUCGCCAGUCCUAACCUCUUUCCUGGGUCCCCCCCCUUCAGCACCUAAGUCCAUACCUAGGGCCGUGGAAUUCCCGCUCAAGAGCAACAGAAGCCCCUCUCUGCACCCCCAUUUCUGGACUGGAUUGUCCACUGAGACGCGCAAUGUCUGCAUCUCUGACAUCUAGAGGCUUCCUCGGGAAGGGCAUGGGGAUCUCCGUGAGAUGUGGGGACUUUCACUGGCCAACCAAGAAAUCUACACAGCGUCCGGGGACCUGUGACACACAUCCCUCCCGCCUCCUCAACCUGAUGUCCCUCUCUGAAUCUGCAGCUUUCGUGCUGUGAAGGUGUCUUUACAUGUGAAACAAACAAACCCAAGUCAAGAGUAAAUCAUCUCAUUUACUAGUGAGAAAAUGUUGGAGCUGGAGUCCUUCAGAGAGUCCUGGCCAGGCAAGAGGGCCAUCAGCUCUCUUCUGCUCAACAGGGGCUCUCAGCCUCAGGACACUCUCAGGCCUGGAAUGUCCCCAACACACUCAAGGAGAAACAUGUCCUGUGCAGACCCACAGGAGGCAUCUUUGCCCGGCACAAGGAAGAGCUGGGGUCAGUGGGACCUGUAGAUGUAGACACAUCAUAUGGAGGGUGGGUAGGACCAAUGUGGCAGCUUCAUGGAGGCCAAGUGUGGCUCUGCACCAGGAAGGGGCUGUGAUGGCUGGAGGUGCCCAGCAGUGCAGGCGGGGAGUGCCUGGCAGUGGCGUGGCCAGGUGGAGGCCACCUGUCAAGUUUGCAAUAAAGCAGUUUCCUGAAUUUGGUGAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1740.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1817.50
Frequency: 0.0000
Diversity: 935.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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