Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_006455.3
Sequence Length
2352 nt
GC Content
0.6114
AGCUCAGCUCCGGAGAGCCGGCGGCGCGGCGGGCAUGGCUCGGGUGGCGUGGGGGCUGCUGUGGUUGCUGCUGGGCAGCGCCGGGGCGCAGUACGAGAAGUACAGCUUCCGGGGCUUCCCGCCCGAGGACCUGAUGCCGCUGGCCGCGGCGUACGGGCACGCUCUGGAGCAGUACGAGGGAGAGAGCUGGCGCGAGAGCGCGCGCUACCUGGAGGCGGCGCUGCGGCUGCACCGGCUCCUGCGCGACAGCGAGGCCUUCUGCCACGCCAACUGCAGCGGCCCCGCGCCCGCGGCCAAGCCCGAUCCCGACGGCGGCCGCGCAGACGAGUGGGCCUGCGAGCUGCGGCUCUUCGGCCGCGUCCUGGAGCGAGCCGCCUGCCUGCGGCGCUGCAAGCGGACGCUGCCCGCCUUCCAGGUGCCCUACCCGCCGCGGCAGCUGCUGCGUGACUUCCAGAGCCGCCUGCCCUACCAGUACCUGCACUACGCGCUGUUCAAGGCUAACCGGCUGGAGAAGGCGGUGGCGGCGGCCUACACCUUCCUCCAGAGGAACCCGAAGCACGAGCUGACCGCCAAGUAUCUCAACUACUAUCAGGGGAUGCUGGACGUCGCCGACGAGUCCCUCACGGACCUAGAGGCCCAGCCCUACGAGGCCGUGUUCCUCCGGGCUGUGAAGCUCUACAACAGCGGGGAUUUCCGCAGCAGCACGGAGGACAUGGAGCGGGCCUUGUCAGAGUACCUGGCAGUCUUUGCCCGGUGCCUGGCCGGCUGUGAAGGGGCCCAUGAGCAGGUGGACUUCAAGGACUUCUACCCGGCCAUAGCAGAUCUCUUUGCAGAGUCCCUGCAGUGCAAGGUGGACUGUGAGGCCAAUUUGACCCCCAAUGUGGGUGGCUACUUCGUGGACAAGUUCGUGGCCACCAUGUACCACUACCUGCAGUUUGCCUACUAUAAGUUGAAUGAUGUGCGCCAGGCUGCCCGCAGCGCCGCCAGCUACAUGCUCUUCGACCCCAAGGACAGCGUCAUGCAGCAGAACCUGGUGUAUUACCGGUUCCACCGGGCUCGCUGGGGCCUGGAAGAGGAGGACUUCCAGCCCCGGGAGGAGGCCAUGCUCUACCACAACCAGACCGCCGAGCUGCGGGAGCUGCUGGAGUUCACCCACAUGUACCUGCAGUCAGAUGAUGAGAUGGAGCUGGAGGAGACAGAACCGCCCCUGGAGCCUGAGGAUGCCCUAUCUGACGCCGAGUUUGAGGGGGAGGGUGACUACGAGGAGGGCAUGUAUGCUGACUGGUGGCAGGAGCCGGAUGCCAAGGGUGACGAGGCCGAGGCUGAGCCAGAGCCUGAACUCGCAUGAGAAGGGGACACCCCACACCGCUCAAGCUUGGGAAGCCUGGUGCCGAUGGCCCCACCCUCACCAGCCUGGGCAGCAGCAAGAACUAUUUAUUAAAAACUUAAGAUGGGCCAGGUGCGGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCAUUUUGGGAGGCCAAGGUGGGUGGAUCACUUGAGGCCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGAUGAGACCUCCGUCUCUACUAAAAUACAUAAAUUAGCCGGGUGUGGUGGCAGGCGCCUGAAAUCCCAGCUACUCAAGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCUGGGAGGCAAAGGUUGCAGUGAACUGAGAUUGCGCCACCGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGCGAGACUCCAUCUUUAAAAAAAAACAAGACGGGCCGGCACGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUGAGAGGCCGAUCACUUGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGCAUGGUGGCACACACCUGUAAUCGUAGCUGAGGCAGGAGAAUCGCCUGAACCCAGGAGGCGGAGCUUGCAGUGAGCCGAGAUCGUGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGUGAGACUCCAUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAACUUAAGAUGGACACAGCUGACUGGACCCCCAUCCUGCCUCACCCAUGGGUGCUGCACCCCAGACCCAUCCUGCCACUUCUAUGUCUCUGGACCACAGGAUGGUGGUGGCAUUGCAGGUUGGCAAGUGGGCUGAUGGGGUCCGCCCUCCUCACUGCUGAGCUCCUCACCUGGACAGUCUCCUGGACAAGGAGUUUCCAGCUGCUGGCUGGAGUCUCAGGCCAAAUUGCAGAGGGUCCUCCAGGGUCCUGAAGAGCACUGGACUAAGAGUCUAGUGGUUCCAGGGCCCUGACCAGUAGGUGCUCAAUAAAUGUUUGUUGUUGAAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1029.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1070.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 684.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...(((((((((((.((((.((((((((.((((.((.(.(((((((((.((((((((((((((((((((.(((.((((((.((.((((.....)))).)))))))).))).))).((.(((..(((((((((((.....))))))).))))....))).)))))))..((..(.((.(((((((.((.((..((((((((.((....)).))))).))).)))).))))))))).).))...(((.(((.....))).))))))))))))))))))))))))).)))))).)))))...))).((..((((.(((......)))))))..)).)))))))))))))))..((((((((.(((..(((((......)))))))).))...)))))).(((.(((((((((((((.((.((.(((.((((..((((((.(.((.(((.((.((.(((((((..((((.((((((..((((((.(((((((.((....((..((((((((((.(..(((....)))..).)))).)))))).))...........((.((.(((..(((.(((((((............))))))))))..)))))))....(((((((((((.((..(((((((.(((((...)))((((((.((((((.(((((((((((((........)))).))))....))))).)))))))))))).)))))))))(((((.(((((.((((.....)))).)))))))))).))))))).)))))))).))))))))))....(((((....(((((((((((...((((.((((((((((..((....))..))))))).)))))))..)))).......((((((...)))).))((((...))))........(((((((((..((((((((......)))..(((((((.((((((.((((((((((.((((((((((.((..((((((((((((((((((((((..((((..((((.((((((.......(((((.((((...)))))))))...(((((((.(((((((.((((((.......))))))))))))).(((.(((..((((((.(((...(((...((.(..((((((((.((((.(((.......))))).)).))))))))..).))......)))...))).)))).)).....)))))).)))))))(((....)))...))))))...))))..))))..............))))))))))))....).)))))))).)..)).))......((((((..(.(((((.(((...(((((.((.....(..((.((((..((((...))))......)))).))..)....))))))))))..))))))))))))...))))))))))).))...........)))))...)))))))).)))))..))))))))))).)))((((....((((((....)))))).....)))))))))))...)))))(((((((.(((...)))...)))))))........(((((....))))).................))).)))))))))))))))))))))))).)))))))......))..)))).))).))))....))....)))))))))))...))).(((((((.(((.((.((((....)))).)))))((((((...(((.((((..((((.....................(((...(((.((((.....)))))))...)))......((((((....(((((((.(((((((.(((...)))...)))))))..)).)))))....)).)))).....................(((.((((((((.(((......))).))))).)))..))).))))..)))))))..))))))((((((((..(((((((.((((....)).))))))))))))).))))((((.....(((.((..(((((((......................))))))).....)).)))(((((((.(((..(((.(((..((((((.(((.....)))))))))..(((((((.((..(((.(((.....)))))))).)))))))((((......)))))))))).))))))))))))))...)))))))))))))......(((((....(((((.....)))))..)))))(((((((..(((.((((..((......)).)))).)))..((((((((((..((.(((((((((...))))))))).)).)))))))))).)))))))....(((((((.......)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,(((((.((((,,(((((((((((((((((((.,(((((({({,((((((.((((((((((((((((((((((.(((.((((((.((.((((.....)))).)))))))).))).))).((.(((..(((((((((((.....))))))).))))....))).))))))))}.,.(({{{.{{((,{({((,...}||}|||||{(({{{{||{||,||{||{{{|||,|||||||||,|{|,...(((.(((.....))).}}},.,||||}|||||||||||,,|{|(({,..}})))....)).})),)))))))}}}.,)}))})))}})),,)))))))),},,,||{.((((((((.(((,.{((((......)))))))).))...)))))).))}}|||||}})))}}},}}.}}})))))})))))},)))))).}},,,|,|}|}}|||||||..,,{({(,,{||..,,.|||}|||||,,.||}}..}|}}((((((((((.{,.(((....)))..).))))}}))))).{{..,||..|{{.{{.|||(((.,(({{(((((((..,,.......,)))))))))).,)))}}}}..{.(((((((((((.((..(((((((.(((({...}))((((({{((((((.(((((({{{{{{{......|,|||}.,}))}}}.))))).)))))))))))).)))))))))(((((.(((((.((((,...,)))).)))))))))).)))))))},))))),}.|||||}||||{,..((,,{||..||||||,((((...((((.((((((((((..((....))..))))))).)))))))..)))).....{.{{{,|,,.,|||{(((((((...,,,,....,...))))))))).,||.,,.{{,,({((({(({(((({{{.,,{{{{...{,{(({(({((((((({(((({,,((((((((((((((((((((((..((((..((((.((((((,{,,.{{({{{|,|{||,,.,}}}|||||{..(((((((.(((((({{((((((.......))))))))))))).(((.(((..((((((.(((...(((...({.{..((((((((.((((.(((......,))))).)).))))))))..}.,).,,...)))...))).)))).)).....)))))).))))))),||..},),}...})))))...))))..))))..{,....}}.,..)))))))))))).)},,.,})))))).},,||.||..,...,{{(((.,(,({{({.(((,..{{{{{,||}|,..|}}||.|{{{..((((...))))...,,,)))}.))}}))}.}))))))))))..)}}}}|||||}},,,|}||||||||,,},.,.....,,,,||,,,...,,}))}}},)))})}))})}}))))}..,,|((((,...(((((,....})))))...,.))))))))))|||,}}}},(((((((.(({...}))...)))))))....,,,,(((((....))))).................,,),}|||||||||||||||||||||....({(((((........))))).)))))).....))))},{{|||,}},.,}..})))}(((((........}}}})}))}})))))})|||{((({{...|||.||(({{((((.,{{{...........,,,|,{(((,(((,.,,||}}},.,))))))...,||||{,,|{{{{{{||{.{{,{({,,((({((({((({,.,||,,{||||||,...,.||||,...,|}|}|,,...,.................|||}}}}.}}}),{{.,,.{{{{{{{{,.,,.{.((((({((({,..|||((((..||}}}}{(((((((..(((((((.((((....)).))))))))))))).))))|||.,.|||{((,|{..(((((((..,................,,.)))))))....,)).,}}|{,|||||{||}}|||}||,..((((((.(((.....)))))))))..{((((((.(({,,{(.(((.....)))))))).)))))))||||}}}},})),}))))},.)))))))),)}})))}})))))))))}}}}|}}.}}||({{..{.{((((.....)))))}})))}},|}}}))})))))}}}}})}|,}}}}}))}).))}))},.((((((((((..((.(((((((((...))))))))).)),)))))))))){||,,,.)))}}||{({{{.....,,)))))))....
Back