Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_006634.3

Sequence Length

660 nt

GC Content

0.5909

ACUGCGGCCGCUCCGCAGGCAGAGAAGCCGGGAGCGGGCGAGGCGGCGGCGGCAGCAGCGAUGGCAGGAAUAGAGUUGGAGCGGUGCCAGCAGCAGGCGAACGAGGUGACGGAAAUUAUGCGUAACAACUUCGGCAAGGUCCUGGAGCGUGGUGUGAAGCUGGCCGAACUGCAGCAGCGUUCAGACCAACUCCUGGAUAUGAGCUCAACCUUCAACAAGACUACACAGAACCUGGCCCAGAAGAAGUGCUGGGAGAACAUCCGUUACCGGAUCUGCGUGGGGCUGGUGGUGGUUGGUGUCCUGCUCAUCAUCCUGAUUGUGCUGCUGGUCGUCUUUCUCCCUCAGAGCAGUGACAGCAGUAGUGCCCCACGGACCCAGGAUGCAGGCAUUGCCUCAGGGCCUGGGAACUGACCCAGCUGGUCCUGAAGGAGAAGCCAAAUGGCUGCACUGGCCGAUUCUGGUCUCCAGAGGACCUUGGUGUUUGCUCUCCCUUGACCCACCCCAGUGAGUGCCAAAGGGCAGCCCCAACAUGUGCACCCCUGCAUUUCCUGUCAUGCCACAGACUGGCCCUUGAGGGCAGCCUGCUGUACUGGCCAUGCUGGGCCAGCCCCACCUGGAGCUCAGUAAAAACUGCUGUUUGAUUAAAAGCUGGUAUCUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-258.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -272.27

Frequency: 0.0000

Diversity: 215.59

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((.....))))))(((((...((((((((.((((((..((((((((.((((((.((((((((((.......(.((.((.(((((((..((.(((.....(((((((((.....(((............)))..((((.((((..((((.((((((((((......))..)))).)))).)))).)))).)))).((((.......))))...........(((...))).(((((........)))))......))))))))).....))).))..))))))).)).)).)..)))))).))))...))).))))))))))).))))))..)))))....((((((.(((((((...(((((((.((..((((..((..(((((....((((((((((((......))))...)))))))).(((((((((....))))(((...(((((((((((...))))))....)))))...))))))))............(((.((((((...((((..((.(......).))..)))))))))).)))..))))).))..)))).)).)).)))))..))))))).((((((......))))))......(((.....))).....))))))((((......)))).))).))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

,(((((.(((((((.|.(((......)))}))))))).){(((.((,(((((((((((((,{,,(((((...((({.(((,({.,((((,((.(({,(,..{({((({(((.{.....}.))}..}.,))))){|...((((.((((..((((.(((((((({(......}}..)))).)))).)))).)))).)))).,,,||.....,,{,.....,.((((.((({.,{|{{(((((........)))))..,,,.,||}}}.)))).)))).)))),.))),)).))))}.},.))).)))),}..))))).,,,))))))))}))))),..)),)))}...}||||{((((((({.,(({,,||,((..((((,.,((((((..{(((((((((((((((......)))),..((((((...((((,.{((({{(((((.....)))),,}}.))))))))..)))))){(((.({{{(((((...,,,{(.(((....))).)),.,,,)))))))}.)))}...(((({....)))))...||{{...,..,))}.,.))))),})}))))))))))),,,.||||||.||||||||}||,.,,.,)))}.}})}|}},...))))))))).........}}}},,.,},,,.