Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_006745.5
Sequence Length
2227 nt
GC Content
0.3740
GGCUCCACCCCCAAGCCAGGCGAGGCAGGUUCCGAGGUUGGAACACCUGGCGAGUCCUCGGUGUCGGUGGCCGGCAGUCAUCUCGCGGCCGUUCAGAAUUAUAAGGCUGUCUGCAGAGAUUUGAAAAAUGGCAACAAAUGAAAGUGUCAGCAUCUUUAGUUCAGCAUCCUUGGCUGUGGAAUAUGUAGAUUCACUUUUACCUGAGAAUCCUCUGCAAGAACCAUUUAAAAAUGCUUGGAACUAUAUGUUGAAUAAUUAUACAAAGUUCCAGAUUGCAACAUGGGGAUCCCUUAUAGUUCAUGAAGCCCUUUAUUUCUUAUUCUGUUUACCUGGAUUUUUAUUUCAAUUUAUACCUUAUAUGAAAAAAUACAAAAUUCAAAAGGAUAAGCCAGAGACAUGGGAAAACCAAUGGAAGUGUUUCAAAGUUCUUCUCUUUAAUCACUUCUGUAUCCAGCUGCCUUUGAUUUGUGGAACCUAUUAUUUUACAGAGUAUUUCAAUAUUCCUUAUGAUUGGGAAAGAAUGCCAAGAUGGUAUUUUCUUUUGGCAAGAUGCUUUGGUUGUGCAGUCAUUGAAGAUACUUGGCACUAUUUUCUGCAUAGACUCUUACACCACAAAAGAAUAUACAAGUAUAUUCAUAAAGUUCAUCAUGAGUUUCAGGCUCCAUUUGGAAUGGAAGCUGAAUAUGCACAUCCUUUGGAGACUCUAAUUCUUGGAACUGGAUUUUUCAUUGGAAUCGUGCUUUUGUGUGAUCAUGUAAUUCUUCUUUGGGCAUGGGUGACCAUUCGUUUAUUAGAAACUAUUGAUGUCCAUAGUGGUUAUGAUAUUCCUCUCAACCCUUUAAAUCUGAUCCCUUUCUAUGCUGGUUCUCGGCAUCAUGAUUUCCACCACAUGAACUUCAUUGGAAACUAUGCUUCAACAUUUACAUGGUGGGAUCGAAUUUUUGGAACAGACUCUCAGUAUAAUGCCUAUAAUGAAAAGAGGAAGAAGUUUGAGAAAAAGACUGAAUAAAUAUCUCACGUAAACCUUCCUGAAAGAUAAACGUUUUCCUGAAUUCAGAAACUAGUAGCUAACAUUGCUUCUGGAGAGCAGAAAUAAGCAUGUCUUCUGGCUACUAAGUGAUAAAAAGAACAUUAACAACCUUUAAUUACCUUCCUAGUGGGAACUUUUUCUACUUUACCUACAAGUUCUAUAUAUGUAGAAAUGAAUAAAUAUAUAUUUAAGUACAGUUUUCAUGAGGAAGUUUUAAAAGACCAUGUUCCUAAGCUUCCAAGAAGGUUUUGGAUACUAGAAGUAUUAAUCUAUGGCUUUUCUCCCAGUAAAACCAUAGGCCUGAAGUUCACAUUGGGUCUUUAAAUCUUUUAGAUAUAUACUGGUCAUUUCAGAAAAUUCUUCAUAGUGGUAUUGGCCUUAUAUUUAACUUUUUUUUUAUUUUUUUUUUGAGACAAAGCCACACUCUGUCUCCUUGGCUGGAGUGUGGUGGCACAGUCUCAGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCCAGUUCAAGCAAUUCUUCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGCACCCGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUGUAGAGAUGGGGUUUCACGAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCAAACUUCUGACCUCAAGUGAUCUGCCCACCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUAAGCCACUGCGCCCGGCCUUUUUAACUUUAAACAUGUUUUAGAAUUCACCUAAAGAUCAAAAUAUCAUGGAUUGAACCUCAUCAAUUGAUAGCAGUGAGUGACUGAAGCUUCCAAAUCAAGAAAAGCCGGCACCAAGAACUUCCAUUCUAAUCUAGAGCUGACCAGUUUGAGCUGAUUCUCUCUUUGAAGAGUCCUUCUUGAUUGCAGUGCAGUACUGGCAUUUCUGAAUGGAUGUAAGUGGAGUAUUUUAGUCUAAAGGCUUUUCAAAUUACUUGAAUUUUUUUAAAAAUUGAGGAGCUUUAUUUCUAUUUACCCUUCCAUUUUUGUAUAUCAAAUUUCCAUUGUCAUUAAAAACUGUAUCUUGAAACUUUGUGAACUGACUUGCUGUAUUUGCACUUUGAGCUCUUGAAAUAAAUGUGAUUUUUGUGUGAUUAUCUGGUUUCCAGUUUUAAACAUUAACUGUCACCUUUUAUUCUUAAACUUGAAAGUACAGAAAUCAUUAAAUUAUUAAGUUGUACAAUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-564.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -609.32
Frequency: 0.0000
Diversity: 601.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((.....(((((((..(.(((((((((....))))..))))).)..).))).)))...)))))))((((((........(((..(((((((((((((((..((((.((.....(((.....(((.(((...........(((((((...(((((((((((..((((..((((....((((((....(((......))).....))))))....))))))))..)))))..)))))).))))))).............)))))).....)))..)).)))).))))))))))).))))))).....(((((((((((((((((((((((((((((((...((((((.....)))))).))))).)))))))...))).)))).))))...))))))))....(((((((((.((.((((.......)))))).))))))))).....))))))......(((((.(((.......((((((((((..((((((((.....(((((((((((....((((((((.((.....))))))))))((((((((((....((((((((..((((...((..(((........)))..)).................(((((((....)))))))....((((((...((.(((...(((((...((((((((((((........((((.(((..((((((.((((.(((...))).)))).))))))..)))...))))(((((.(((((((((.....((.((.(((((((.((((....(((........)))..)))).))))))).)).)).))))))............((...((((.(((((((...(((((...(((...(((((...(.((((((....((((...))))))))))).)))))..))).....))))).))))))).))))..)).........(((.((((.....)))).)))...((((.((((((((((((...((.(((....((((((..............(((((((((....((((..(((....)))))))(((((((((((((.(((((((.....))))....)))))))....))))))))).(((((..((((............)))).)))))((((((.(((((((((.(((((((......................)))))))((((((......)))))).....))))))))).)))))).....(((((((((((.....((((((.....((((....((((((...))))))...((((((.((((((...)).)))))))))))))))))))).))))..)))))))..))))))))).......((((.....)))).............(((((.(((..((((...........................)))).))).)))))((((((((((.((((((((.((((((((((.((((........)))).......((((((((((((...((.......(((...)))........)))))))))).....))))...))))))))))))))))))................)))))))))).....))))))...))).))..))))))))))))..))))..(((((((...(((.((((....)))).)))...))))))).((((((......))))))((((.(((((............(((((((.((((((.....(((......)))((.((((((......)))))).))....))))))..)))))))...........))))))))).)))))))).))))))))))))....))))))))))...))))))(((((((.....).)))))))))).))))))))...)))....)))))))..(((((((.((((((((((............((((((((((((.((..(((((....))))))).))))))))))))..))))))))))...)))))))(((.....))).))))))..)))))........))))..)))))))))))))).(((.((.((((((((.((.((((((.......((((((.(((((....((((......((((...))))......)))).....)))))..))))))))))))..)).)))))))))).)))............))).))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({,,((((.....(((((((..(.(((((((({....}))),.})))).)..).))}.))),..))}))))((((({......,.(((..(((((((((((((((..{((((((((({{((......,((...{...((((((((((.((((.{{(,,,.((((,....,.}))).,})}.}))}.||..}}}}}}}},,,,.)))),,)))))}....|{{{.....,||}||{((((((..,(({|,|....,},.)}}.)))))))}|}}.|,..,)))}))).))))))))))).))))))).....{{(((((((((((((((((((((((((((((...((((((.....)))))).))))).)))))))}..})).))))}}))),..})))))},....(((((((((.{{.((((.......))))}}.))))))))).....)))))),,,...{((((.(((.,,.,,.{(((((((((.,(({{{,{(,,,{.{{{{,,|||||,...((((((({.{{.....)})))))))}{{{||||,,|{{{{((((((({..(((({..{{..(({........)))..})..}||}.,,........(((((((....)))))))....((((((...((.(((,,,(((((...((((((((((((........((((.(((..((((((.((((.(((...))).)))).))))))..)))...)))){{{{(,({{,{{{{,....,,,.{{.(((((((,((({....{((........))}..}}}).)))}}}).}).||||,}||,.....||,.,,}||...{{{(.(((((((...{,(((((({....))))}}...|.,(((((....((((...}))))))))|{{|||.,..........)))))}))))))).}}}}..}),..,,,...{{{.{{{{..,,,))}}.}))...((((.((((((((((((...((.(((....((((((....({(((((({,(((((((((,...{{{{,.(((....))),}||((((((((((((,{(((((((.....))))....)))))))....))))))))).||(((,{((((,,..,,......,}}}.}},,,((((((.(((((((((.,{{{(((.....,,,,,.,,........,))))}},{(((((......)))))),,...))))))))).))))))..,{,((((((({{({,{{.,((((((...|,}}|))},))|,{{{.{,|||,|,..,((((((.((({({...}).)))}))))))},,|||,,}},,}}}.,))))))),,}}}}}}})),,{{{,,..(((({.,{{{|{,.....,,,....}}}.,.))))).))))},},,..,,,,,}}}}},........((((((.((.....)).)))))).{(((((((.((((((((((.,{({....{,..|}}),......{({{{,,{{{{,...||,.......|||,,.,}..,,,,,.,.,}})))))....})))}...)))))))))))))))))}..,,,,|||,,,},)))})).,)))))).))))))))...))).))..))))))))))))..))))..(((((((...(((.((((....)))).)))...))))))).{((({{.,....)))))|((({.(((((............(((((((.((((((.....,{{......|||{,.((((((......))))))})),...))))))..)))))))...........))))}))))})})))))}.))))))))))))....))))))))}},..))))))(((((({.....}}})))))}}}}.}))}}})|,,,}},,,.,})}}}},..{((((((.((((((((((.,..........((((((((((((.({..(((((....))))),}.)))))))))))),.})))))))))...))))))},{{.....)},.,}}}},.,))))}.,...,,,)))}.,)))))))))))))}.{((.{{.((((((({.{{.((((((.......((((((.(((((..,.((((......((((...))))......)))).,,..)))))..)))))))))))}..)).}))))))),,.))}.........,}.))).))))).....
Back