Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_006757.4

Sequence Length

1065 nt

GC Content

0.5850

AGUGCCUGCAGCCGGUGCUGUCCACAGGGAGCUCCAGCCCUUCUCACACUCGACCCGCAGAAACCACCCACCUUCACCAUGUCUGACGAGGAAGUUGAACAGGUGGAGGAGCAGUACGAAGAAGAAGAGGAAGCCCAGGAGGAAGAGGAAGUUCAAGAAGACACCGCAGAGGAGGACGCGGAAGAGGAGAAACCGAGACCCAAACUCACUGCUCCUAAGAUCCCAGAAGGGGAGAAAGUGGACUUCGAUGACAUCCAGAAGAAGCGUCAGAACAAAGACCUAAUGGAGCUCCAGGCCCUCAUCGACAGCCACUUUGAAGCCCGGAAGAAGGAGGAGGAGGAGCUGGUCGCUCUCAAAGAGAGAAUCGAGAAGCGCCGUGCAGAGAGAGCGGAGCAGCAGAGGAUUCGUGCAGAGAAGGAGAGGGAGCGCCAGAACAGACUGGCGGAGGAAAAGGCCAGAAGGGAGGAGGAGGAUGCCAAGAGGAGGGCAGAGGACGACCUGAAGAAGAAGAAAGCUCUGUCUUCCAUGGGAGCCAACUACAGCAGCUACCUGGCCAAGGCUGACCAGAAGAGAGGCAAGAAGCAGACAGCCCGGGAAAUGAAGAAGAAGAUUCUGGCUGAGAGACGCAAGCCGCUCAACAUCGAUCACCUUGGUGAAGACAAACUGAGGGACAAGGCCAAGGAGCUCUGGGAGACCCUGCACCAGCUGGAGAUUGACAAGUUCGAGUUUGGGGAGAAGCUGAAACGCCAGAAAUAUGACAUCACCACGCUCAGGAGCCGCAUUGACCAGGCCCAGAAGCACAGCAAGAAGGCUGGGACCCCAGCCAAGGGCAAAGUCGGCGGGCGCUGGAAGUAGAGAGGCCAGAAAGGCCCCUCGAGGCAGAGACCCUCCGCCCUCUUGCACACCAGGGCCGCUCGUGGGACUCCACAUCCUCCAGCCCCCACAAUCCUGUCAGGGGCUCCCUGACAGUCCUGGGGGUGGAGAGGCCAUCCCGGGGCGUCCCCCGCGUCUGUGUCCUUGCUGCCUUCAUCCCCUGGGGCCUGUGAAUAAAGCUGCAGAACCCCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-382.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -401.61

Frequency: 0.0000

Diversity: 233.73

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((((..(((((((....((((........))))........((........)).........((((((((.(((.((((......)))).))))))))))).)))))))........(.(((...((((((.(((.((((..(((......)))...((((..(((((((((((...((.........((((....(((.((.(((((....(((.....(((...(((((((.(((((((((..((((.....((.(((........)))))..))))(((...)))..))))))).)))))))))....))))))...))))).))))).....)))).(((((...))))).........((.((((.(.....).)))).)).(((((....)).)))..........(((((((.((.((.(((.(((((..........)))))..(((.((.(((((((((((...(((((((((((......((.....)).......))))))))))).)))..........(((.((((.(((((((..((....))....(((.(((..(.......(((((.((((..(........)..))))))))).......)..))).)))........((.(((((((........)))))))))...)))).))))))))))((((.(((.((...((((((.(((.......(((..((((.((......)).))))....))).......))).))).)))...(((((((..((((...((((....((...)).....((((((....))))))..))))...)))))))(((.((((..((((((.((((.....)))).)))(((((.(((...))).).)))).)))...)))).)))))))))))).)))).))))))))..)))))......))))).)).)))))))(((.(((((((((.(((.....)))))))))))))))..))...))))))))))).)))))))).))))))))).))).).......))))))).......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,..(((((((.{(.(((,({,...|||}}}.}}..||(((((,....(((,...{{.|..........((((((((.(((.,(((......)))}.))))))))))).)).)}.))}.,.}},|,{||...((((((.(((.((((..(((......))}...((((..(((((((((((.,.((.,....,..((((....(((.((.(((((....(((.....(((...(((((((.(((((((((..,((,...,.{(.(((........)))})..))),|||...))}..))))))).)))))))))....))))))...))))).)))))..,..)))).(((((...}}}}|,.||.....((.((((.{.....}.)))).)).{|,,,.,,,)).}}}.,.....,..(((((((.((.(,,(((.(((((..........)))))..(((.((.(((((((((({...(((((((((((......((.....,,.,,....))))))))))).))),,,{...,..(((.((((.(((((((..((....))....(((.(((..{...,...((((({((((..(........)..)))))))))...,...,..))).)))........{(.(((((((........))))))))}...)))),,)))))))))(({{.{{(,,{.,,((((((.(({,,.,,.,{({..((((.((......)).))))..,.)}}...,}.,})).))).)))|,|((((({(..{(({..,((((....({...||.....((((((....))))))..))))...})}||}|(((.((({..,,,(((.((((.....)))).))){{{{|,|{|.,,))),)))))),)))...})}),)))}}))}}))).)))).))))))))..)})))......))))).)).))))))){{|.({((({(((((((.....)))))))))))))))},)).,.))))))))))).)))))))).))))))))).)}}.,.......))))))).,,....