Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_006809.5

Sequence Length

1973 nt

GC Content

0.5236

AAGGUGUGCCGCACCACACGGGGGAGGAAGGAAGGAGCUCCCAACUCGCCGGCCUGGCCACGGGAUGGCCCCCAAAUUCCCAGACUCUGUGGAGGAGCUCCGCGCCGCCGGCAAUGAGAGUUUCCGCAACGGCCAGUACGCCGAGGCCUCCGCGCUCUACGGCCGCGCGCUGCGGGUGCUGCAGGCGCAAGGUUCUUCAGACCCAGAAGAAGAAAGUGUUCUCUACUCCAACCGAGCAGCAUGUCACUUGAAGGAUGGAAACUGCAGAGACUGCAUCAAAGAUUGCACUUCAGCACUGGCCUUGGUUCCCUUCAGCAUUAAGCCCCUGCUGCGGCGAGCAUCUGCUUAUGAGGCUCUGGAGAAGUACCCUAUGGCCUAUGUUGACUAUAAGACUGUGCUGCAGAUUGAUGAUAAUGUGACGUCAGCCGUAGAAGGCAUCAACAGAAUGACCAGAGCUCUCAUGGACUCGCUUGGGCCUGAGUGGCGCCUGAAGCUGCCCUCAAUCCCCUUGGUGCCUGUUUCAGCUCAGAAGAGGUGGAAUUCCUUGCCUUCGGAGAACCACAAAGAGAUGGCUAAAAGCAAAUCCAAAGAAACCACAGCUACAAAGAACAGAGUGCCUUCUGCUGGGGAUGUGGAGAAAGCCAGAGUUCUGAAGGAAGAAGGCAAUGAGCUUGUAAAGAAGGGAAACCAUAAGAAAGCUAUUGAGAAGUACAGUGAAAGCCUCUUGUGUAGUAACCUGGAAUCUGCCACGUACAGCAACAGAGCACUCUGCUAUUUGGUCCUGAAGCAGUACACAGAAGCAGUGAAGGACUGCACAGAAGCCCUCAAGCUGGAUGGAAAGAACGUGAAGGCAUUCUACAGACGGGCUCAAGCCCACAAAGCACUCAAGGACUAUAAAUCCAGCUUUGCAGACAUCAGCAACCUCCUACAGAUUGAGCCUAGGAAUGGUCCUGCACAGAAGUUGCGGCAGGAAGUGAAGCAGAACCUACACUAAAAACCCAACAGGGCAACUGGAACCCCUGCCUGACCUUACCCAGAGAAGCCAUGGGCCACCUGCUCUGUGCCCGCUCCUGAAACCCAGCAUGCCCCAAGUGAGCUCUGAAGCCCCCUCCUCAAUCCCUUGAUGGCCUCCCACCCUGUAAGAGGCUUUGCUUGUUCAAAUUAAACUCAGUGUAGUCAAACACAGACAUGGUUGUUGCACCAGAAAGGUCCCCACUAGAGCUAAGCGUGAAGCUGAAGCUCUGUCCCUAUUCCCCCAGCCCAGCUAGCUGAUCACACCAACAGAUCCUCAUCAGCAAAGCAUUUGGCUUUGUCCUGCCCAAGUGGGCUGCAGACUGAGUGCUGCCCUUGUAGCUUCCCCAGACCCCAACUCACUGCAGUUCAUCUGAACAACCUGAGCUCCUGGGCCGGGGUGGAAGGAGGGGGAUAAACCUAAGGCCCUGAUCCAAAGCAGCCUGUUGAGCUGGUUCUCCAGGGCUGCAGUCUCUCCAGGUGUACAGCUGCUGUCCCUGCCCUGUCCUGUCCUUGCACAGUCUCCUAUGUCUGAGCCCCAGUGCCUUCUGUUCGGGCCCUCCUUUGGUGGGAAGGCAGAGCCCUGACCCUUGAAUGGUUGUCCUUGACUCUGUGCUGCUGCCUUCUGCAGAGAGGCACCUAAGCUGUUUAAAGAGCCCAGUGAUUGUGGCUGCUCCUCCUAGAGGUGGGAGGGGGCAAGAGGCCUCCUUGGUCAGUGUCCAUGCUUUCUGGGCAGGGACUUGGUUUUUUGUUCCAACAGUGGCCUUCUCCGGGCUUCAUAGUUCUUUGUAAUAUGUUGAAGUUAAUUUGAAUUGACUGAUUUUGUUGAACUGUGUGUUUAAGCUGUUGCAUUAAAAAGCUUUCUUCUACAUCAAUAUCUGCUGUGCUUUCAUUUAUGCCUUUUCAGCUUUGCACCUGGAACUCUGUAGUAAUAAUAAAAGUUAUUGCUUAUUGGGCAUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-657.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -693.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 560.53

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(.(((((((((((...((((((...(((..((((((((......((((.((((....)))).))))........((((((...))).)))))))))))((((.((((.....(((.((....((..((((......))))..))....)).)))..)))).))))(((.((((((((.(((((.((...((((((.......))))))..((((((..(((..((((.((...(((........)))..)).))))...(((((...)))))....)))..))))))(((((..(((.(((((.(......).))))))))..))))).((((((..(((....((((((((((((.((.((...(((((((..(((((.(((((..((((((...)))).))....)))..)))))))..)))))))...)).))..........))))))).)))))))))))))))).)))))...)))))))).)))...)))...))))))))))))..((((((.(((....))).))))))..........(((((..(((.........(((((((((((........((((.(((((((((((((((((((((((((..(((((...(((((((((...((((.((((((..(.((((.(((....(((((........((....))......)))))((((.......))))....))))))).).))).)))))))..))).)))))).)))))..)).)))))))(((....(((((((((((((((((((((....((.((((((....((..(((......)))...))....(((((.(((((((((((.(((((((((....)))).((((((......(((.......))).)))))).....................((((((.((..((((..((((((((.((.....))..))))))((((.((......)).)))).........((((((((...((.....((((((((..(((....((.((((...((((.....((((.......((..(((.....)))...)).......))))......)))).....((((....)))).((((((..((...))..))))))..)))).)).....)))..)))).)))).........(((((((((((.(((((.((.((((((((..(((((((.(((.....)))..)))))))..(((.(((((((.((((((..((((((((.........)))).......(((((((.....)))))))...((((....))))(((((..((((((((((....)))))..............))))))))))((((....))))......)))).)))))).)))).))))))..))))))....((..(((((((.....((.(((((....).)))).))...)))))))..)).)).))..)))))))))))).))))))))))))))))..)))).)).)))))).....)))))))....))))))))))))))((((.(((((((.....))))).)).)))).((((.......)))))))))).)))))))).))))).)))).......))).)))..)))........((((((.(.((..((.(((((((((((((....)))))))))((((((((((((((((.((((............)))).))))))...)))))))))).....)))).))..)).).))))))....)))))))))).........(((((((....))))))).....((((((..((((.....(((((.((......)).))))).....))))))))))...)))))).)))).....)).))))).)))).......)))..))))).(((((((((....))))))))).....))))).).

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,(,(((({((((((...((((((.,,{((..((((((((......((({.((((....)))).})))........((((((...))).)))))))))))((((.((((.....(((.((....((..((((......))))..))....)).)))..)))).))))(((.(((((((({(((((.((((.{(((((.......)))))},,,,({({,,{{{..(({{.{{,,,{{{...,,,.,}}}..}}.}}}}...{((((...}||||....,}}.,))}|}|(((((..(({{{{(((.,.,...,},}}}}})}}..))))).||{{||}.,|,},|{((((((((((((.,..{,.,,(((((({,.{{{{{||,{{{..{,{{{{.,.)))).}}.,,,,,,..,})))))..)))))))..})).{{,......}},))))))).))))))),},},)))).))))}.,})))))))).)))...)))}..))))))))))))..({(({(,(({.,,,|||{|||,,|{{{.......,||||..|||,...,.{{.{(((,{{|||,..,,....((((.(((((((((((((((((((((((((..(((((...(((((((({...((((.((((((..{.(((,{(((....{((((........((....))......))))}{(({.......))))....))))))).).))).)))))))..))).)))))).)))))..)).)))))))|{{.{,,(((,({({{((((({((((({.,.{((.((((((.||.,,..{{(({,,,{|||{{{,|,...(((((.((((((((({,.,,{{,((((....))))...,{{|..,||,(({|......}}||||||{((,{......|}},,,{{,{,.,{,,,{.{{.,||||..|||(((((.({,...,)).,))}))}((((.((......)).)))).........{{((((({.,{(({.,..,,((({{...,,.,,||(((,,{{{{,((({{{..,{{{..||,,,,{{,.{{|.....,}),,.},.|,,,|,|||)|||...,((((((((({,,....,}},.{(((((..({...}}..)))))}.,{,..,,.,..........,.(((({{.,..}|}|,{{,,||||||}}|||||,,,.,|{,,,,,.,{((((((.(((.....)))..)))))))..{,,.{((((((.((((((..((((((((.........)))).......(((((((.....)))))))..,(,,({.{{||||(((((..((((((((((....)))))..............))))))))))||||}}.}),,)......)))).)))))).)))).))))))))))))......{{..(((((((.....{(.(((((....).)))).))...))))))),,))..,,)},,))))}}}}})}},)}))}})))))))}}}.})))),)}.})))}}....,)))))}},,,.}))))))))))))){{{|,{||{{{{,,.,})}}||,||.}}}).{{{{,......))},)))))).)))))))),)))))}|}}}....,}|}))}}},..,}|,,,.....{(((((,{.{{.,|{}|||{||{(((({{..,.))))))|||((((((((((((((((.((((.{,....,,.,.)))).))))))...))))))))))))}..}))),))},)}.}.)))))},..,)))))))))).........(((((((....))))))).....{(((((..((((.,...(((((.{{......}}.))))).....))))))))))...)))))).)))).,,,.,)}}})))}}))).,}},,})}}|,|||,|,(((((((((....))))))))).,..,)))}),).