Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_006843.3

Sequence Length

1605 nt

GC Content

0.5813

GACCAUUCAGAAGACUGUCCACCCGUCCUCAGCCCCCUCUCUUCGUGGGCUAUCUACUCAGUUGAUCCCUCCCUCGCUGGCUUGGCUCUGACUCCUGCUCAGACCCAUCACCUUUGCCGGGAAUGAUGUCUGGAGAACCCCUGCACGUGAAGACCCCCAUCCGUGACAGCAUGGCCCUGUCCAAAAUGGCCGGCACCAGCGUCUACCUCAAGAUGGACAGUGCCCAGCCCUCCGGCUCCUUCAAGAUCCGGGGCAUUGGGCACUUCUGCAAGAGGUGGGCCAAGCAAGGCUGUGCACAUUUUGUCUGCUCCUCGGCGGGCAACGCAGGCAUGGCGGCUGCAUAUGCGGCCAGGCAACUCGGCGUCCCCGCCACCAUCGUGGUGCCCAGCACCACACCUGCUCUCACCAUUGAGCGCCUCAAGAAUGAAGGUGCCACAGUCAAGGUGGUGGGUGAGUUAUUGGAUGAAGCCUUCGAGCUGGCCAAGGCCCUAGCGAAGAACAACCCGGGUUGGGUCUACAUUCCCCCCUUUGAUGACCCCCUCAUCUGGGAAGGCCACGCUUCCAUCGUGAAAGAGCUGAAGGAGACACUGUGGGAAAAGCCGGGGGCCAUCGCGCUGUCAGUGGGCGGCGGGGGCCUGCUGUGUGGAGUGGUCCAGGGGCUGCAGGAGGUGGGCUGGGGGGACGUGCCUGUCAUCGCCAUGGAGACUUUUGGUGCCCACAGCUUCCACGCUGCCACCACCGCAGGCAAACUUGUCUCCCUGCCCAAGAUCACCAGUGUUGCCAAGGCCCUGGGCGUGAAGACUGUGGGGGCUCAGGCCCUGAAGCUGUUUCAGGAACACCCCAUUUUCUCUGAAGUUAUCUCGGACCAGGAGGCUGUGGCCGCCAUUGAGAAGUUCGUGGAUGAUGAGAAGAUCCUGGUGGAGCCCGCCUGCGGGGCAGCCCUGGCCGCUGUCUAUAGCCACGUGAUCCAGAAGCUCCAACUGGAGGGGAAUCUCCGAACCCCGCUGCCAUCCCUCGUGGUCAUCGUCUGCGGGGGCAGCAACAUCAGCCUGGCCCAGCUGCGGGCGCUCAAGGAACAGCUGGGCAUGACAAAUAGGUUGCCCAAGUGAGGACGGACCCCUUACCGAUCUGUGCUCUCCUAGCCCAAGAGACCCCUGGAGGGGCUGGAGUUUUAUCCAGCGCCUCGUCGUAUGUUUGGCUGAGCACCUGUGGCCUGGGUGCAGGUUAACUUCUUGUUAUCAGGAGCCCACUAUGCAGAGGCCAAAGGUCGGCAGCCAGCGAGGCUAUGAAUUGGACCUUUUUGGUAUCUGUGUGACUGCUCUGUGCCCAUCCUUAGCCAACUUGCUGGCGUGACAAGUGCCCACAAGUAACACACCAGGUACCCAGAGCAGGGUGGACAGGAGAGACCUGAAUCACAGCAGUGAGGAAUUCCUCAAAGCUGUGACCUCGCCCCUGAACUUGUUCCCAGUGAAGGUCAACAGGGCCACCAACCAGGGUUGAGGAACCAUCUCAGCCAUCCUCCCAGGAAGCCCACCCCUGACCCUUACUAAUUUUUCUAAUGUGCAAACUUUUUCAUUGAAAAAUAAAAUAUAUUUAUGAAACAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-652.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -679.45

Frequency: 0.0000

Diversity: 382.13

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(..((((.((((((.(((((((((...(((((((((........).)))))......((((((.((.....((((((((((((((.((((((....).))))).))).((.((..((((((..((((((.((((((.(((((.((((((.((.(((((.(((((((((((((((((((...(((((((((((((.(..(((((((((((..(.((((.(((((((((..((((((.((......)).))))))..))))))))))))))..)))))))))...))..))))).)).)))))))..(((((((.((((((..((((.((..((.(((((((....)))))).).))..)).)))).))))))......(((((((...)))))))....(((((((((.((((((((((((....)).)))))).....))))))))..(((.(.(((((((((......(((((....(((....)))....)))))........(((..(((........)))))))))))))))))))((((...(((((......)))))...)))).)))))...))))).))...(((......)))))))))))...))))))).))))....))))).))((((((.(.(((((.((((((.((((.(.(((((((((...((((..(.....(((((((((((((..(((.(((((.(((((((((((((((((........(((((............)))))..........)))))).(((..((((((.(..((....))..).))))))..)))((((((.....))))))..............(((((.......)))))...))))))))))).)))))..)))...))))))).))))))..)..)))).....))))))))).)...))))))))))))))).).))))))))))))..((((.........)))))))))..))))))......((((((....(((((((.......))))))))))))).)))))).))))))..)).)).(((..(((..((....((((((...((...((((((((.....((((((.......))))))))))))))..)).))))))))..)))..)))..((((.((((((......)))))).))))((((.((.(((((((..(((...(((((((((..(((((.......)))))..)))))...))))..)))...))))))).)))))))))))))))))..)).))))))........((((((((((((..((((.((((..(((..(((((((......)))).)))...)))..)))))))).)))).))))))))..)))..)))))))))((((.((.((((.(((((((..(((((....)))))..)))))))(((((.(((((........(((.((........)).)))........))))).))))).......))))...))))))((((.........))))............))))))))))..)......((((((....(((((.....)))))))))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

...,,(((((..,.((((((((((...(((((((({........).)))))......{(((((.((.....(((((((((((,((,((({({....|,||}}},|||,{{((((((({(((..,{{({{.{((({(.(((((,(((({(,,(.{{{{{.||||||{|||{{{(((({{..,{{{{{{{{||(((.,..(((((((((((..(.((((.(((((((((..((((((.((......)).))))))..))))))))))))))..)))))))))...))..|||||{||.},}}|||{{((((,,,.||||||,,|{((.{|,.{{,(((((((....)))))).}.}}..,,,|||}.}}))))......(((((((...)))))))..,,(({(,{{,,.,{||((((((({....)),,))))),.,,,)}}})))))})))}}}||,..,|||,,.,}}|{{{,.{{{((({..{|||,,.{||,||........((({{|((.....,,,||||||..,|||||,,,..}}))).,||{{(.....,)))))...||}...||||{,.,|||}.||,.{{((......)),}|||||}}..,||||||,..,))})),))))),))((((((.(.(((((.(((((((((((.(.(((((((((...((((..{...{.(((((((((((({.,(((,(((((.((((((((((({{((((,.......{{{{{|{.....{,,|.}}|||,,..,.....}}}}}}.{{{..||{{{|,|}}|{,.,,)).{|,|||||,..}))((((((,...,))))))....},,,,,....(((((.{....})))))...))))))))))).)))))..}}),,,))))))).)))))).,,..)))).....))))))))).)...))))))))))))))).).)))))))))))).|||{{.,,,,,...)}))})))),,)}})),,,,,,.(((((,..,((((((((.,...,.))))))))))))).,}}}}|((((((((((((((((((.((((,((({...{{((((((..{{......}})))))}.}}(((.(((((.........).))))).))))))){(((,{{,,,{{.....((((.((((((......)))))).)))),,,}..}.}},)))))))).)))))))}}))))).)))))}...{(((((....)))))},},.,,.,)))),))||...})),))))))))))))))..}).))))))........((((((((((((..((((.((((..(((..{{{((((......)))).}}}...)))..)))))))).))))}}))))))).,)))..)))))))))),,{.,..,,{,.(((((((..(((((....)))))..))))))).,}}....}}}},.,{{{|,..(((((.(((((...((((..{{....,|((((((({.....,))))))}.,|||...,))..)))).....))))).))))).{{{((((.{(((..........,,}}}}))))))}.........,,,,},}},,..