Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_006907.4
Sequence Length
2269 nt
GC Content
0.6307
CUGGGUGCGGGUGCCGCGUGGCGGCCGCAGCGCUGAGGGGUGGGUACGACCCGCGCACGGUAGCUGGGUUGGGGUCGGGCUCCGGGAAUGGUGGGCGGCGGUCGCCGGGUGGGGCGCGACGGUAGCCCAGUUCUGGGCGGGGUGGGAACCCAGACGGGGGACCCCUAGGCGCCGGGCCCUCCCUCUCCCCGUACUUUUCCCCCUUCCCAGUCAUUUCUUCUGCGGAACCUCCACCCCUCCAGUGGGUGCGGGACCCUAGGCAGCAGGCCAGGCACCGCCGCUCUGACUGGGGGCCCCGAAGCAGUUAACGGGCCGGACAGCAAAGUGGAAAGUUAGACCAGCUGGGACCAGGGGAGGUGGGCACCCGGCUGCGGGAGGAGCGGCCAGGCUGGCACUGCCCCCCUAACUUGCUCUCGAUCCUGCCGGUCUCGUCCCGCAGAGCCGGUGCCAUCUGUGGGGGCUUUGGGCCAGGGGUCUCCGGACAGCAUGAGCGUGGGCUUCAUCGGCGCUGGCCAGCUGGCUUUUGCCCUGGCCAAGGGCUUCACAGCAGCAGGCGUCUUGGCUGCCCACAAGAUAAUGGCUAGCUCCCCAGACAUGGACCUGGCCACAGUUUCUGCUCUCAGGAAGAUGGGGGUGAAGUUGACACCCCACAACAAGGAGACGGUGCAGCACAGUGAUGUGCUCUUCCUGGCUGUGAAGCCACACAUCAUCCCCUUCAUCCUGGAUGAAAUAGGCGCCGACAUUGAGGACAGACACAUUGUGGUGUCCUGCGCGGCCGGCGUCACCAUCAGCUCCAUUGAGAAGAAGCUGUCAGCGUUUCGGCCAGCCCCCAGGGUCAUCCGCUGCAUGACCAACACUCCAGUCGUGGUGCGGGAGGGGGCCACCGUGUAUGCCACAGGCACGCACGCCCAGGUGGAGGACGGGAGGCUCAUGGAGCAGCUGCUGAGCAGCGUGGGCUUCUGCACGGAGGUGGAAGAGGACCUGAUUGAUGCCGUCACGGGGCUCAGUGGCAGCGGCCCCGCCUACGCAUUCACAGCCCUGGAUGCCCUGGCUGAUGGGGGUGUGAAGAUGGGACUUCCAAGGCGCCUGGCAGUCCGCCUCGGGGCCCAGGCCCUCCUGGGGGCUGCCAAGAUGCUGCUGCACUCAGAACAGCACCCAGGCCAGCUCAAGGACAACGUCAGCUCUCCUGGUGGGGCCACCAUCCAUGCCUUGCAUGUGCUGGAGAGUGGGGGCUUCCGCUCCCUGCUCAUCAACGCUGUGGAGGCCUCCUGCAUCCGCACACGGGAGCUGCAGUCCAUGGCUGACCAGGAGCAGGUGUCACCAGCCGCCAUCAAGAAGACCAUCCUGGACAAGGUGAAGCUGGACUCCCCUGCAGGGACCGCUCUGUCACCUUCUGGCCACACCAAGCUGCUCCCCCGCAGCCUGGCCCCAGCGGGCAAGGAUUGACACGUCCUGCCUGACCACCAUCCUGCCACCACCUUCUCUUCUCUUGUCACUAGGGGGACUAGGGGGUCCCCAAAGUGGCCCACUUUCUGUGGCUCUGAUCAGCGCAGGGGCCAGCCAGGGACAUAGCCAGGGAGGGGCCACAUCACUUCCCACUGGAAAUCUCUGUGGUCUGCAAGUGCUUCCCAGCCCAGAACAGGGGUGGAUUCCCCAACCUCAACCUCCUUUCUUCUCUGCUCCCAAACCAUGUCAGGACCACCUUCCUCUAGAGCUCGGGAGCCCGGAGGGUCUUCACCCACUCCUACUCCAGUAUCAGCUGGCACGGGCUCCUUCCUGAGAGCAAAGGUCAAGGACCCCCUCUGUGAAGGCUCAGCAGAGGUGGGAUCCCACGCCCCCUCCCGGCCCCUCCCUGCCCUCCAUUCAGGGAGAAACCUCUCCUUCCCGUGUGAGAAGGGCCAGAGGGUCCAGGCAUCCCAAGUCCAGCGUGAAGGGCCACAGCCCCUCUUGGCUGCCAAGCACGCAGAUCCCAUGGACAUUUGGGGAAAGGGCUCCUUGGGCUGCUGGUGAACUUCUGUGGCCACCACCUCCUGCUCCUGACCUCCCUGGGAGGGUGCUAUCAGUUCUGUCCUGGCCCUUUCAGUUUUAUAAGUUGGUUUCCAGCCCCCAGUGUCCUGACUUCUGUCUGCCACAUGAGGAGGGAGGCCCUGCCUGUGUGGGAGGGUGGUUACUGUGGGUGGAAUAGUGGAGGCCUUCAACUGAUUAGACAAGGCCCGCCCACAUCUUGGAGGGCAUCUGCCUUACUGAUUAAAAUGUCAAUGUAAUCUAA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1037.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1072.28
Frequency: 0.0000
Diversity: 387.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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