Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_006928.5

Sequence Length

2178 nt

GC Content

0.5528

AGCGCUCCUCCCCGCAAAUGAUCCCGCCCCAGGGGCCUAUCCCAGUCCCCCCAGUGCCUUUGGUUGCUGGAGGGAAGAACACAAUGGAUCUGGUGCUAAAAAGAUGCCUUCUUCAUUUGGCUGUGAUAGGUGCUUUGCUGGCUGUGGGGGCUACAAAAGUACCCAGAAACCAGGACUGGCUUGGUGUCUCAAGGCAACUCAGAACCAAAGCCUGGAACAGGCAGCUGUAUCCAGAGUGGACAGAAGCCCAGAGACUUGACUGCUGGAGAGGUGGUCAAGUGUCCCUCAAGGUCAGUAAUGAUGGGCCUACACUGAUUGGUGCAAAUGCCUCCUUCUCUAUUGCCUUGAACUUCCCUGGAAGCCAAAAGGUAUUGCCAGAUGGGCAGGUUAUCUGGGUCAACAAUACCAUCAUCAAUGGGAGCCAGGUGUGGGGAGGACAGCCAGUGUAUCCCCAGGAAACUGACGAUGCCUGCAUCUUCCCUGAUGGUGGACCUUGCCCAUCUGGCUCUUGGUCUCAGAAGAGAAGCUUUGUUUAUGUCUGGAAGACCUGGGGCCAAUACUGGCAAGUUCUAGGGGGCCCAGUGUCUGGGCUGAGCAUUGGGACAGGCAGGGCAAUGCUGGGCACACACACCAUGGAAGUGACUGUCUACCAUCGCCGGGGAUCCCGGAGCUAUGUGCCUCUUGCUCAUUCCAGCUCAGCCUUCACCAUUACUGACCAGGUGCCUUUCUCCGUGAGCGUGUCCCAGUUGCGGGCCUUGGAUGGAGGGAACAAGCACUUCCUGAGAAAUCAGCCUCUGACCUUUGCCCUCCAGCUCCAUGACCCCAGUGGCUAUCUGGCUGAAGCUGACCUCUCCUACACCUGGGACUUUGGAGACAGUAGUGGAACCCUGAUCUCUCGGGCACUUGUGGUCACUCAUACUUACCUGGAGCCUGGCCCAGUCACUGCCCAGGUGGUCCUGCAGGCUGCCAUUCCUCUCACCUCCUGUGGCUCCUCCCCAGUUCCAGGCACCACAGAUGGGCACAGGCCAACUGCAGAGGCCCCUAACACCACAGCUGGCCAAGUGCCUACUACAGAAGUUGUGGGUACUACACCUGGUCAGGCGCCAACUGCAGAGCCCUCUGGAACCACAUCUGUGCAGGUGCCAACCACUGAAGUCAUAAGCACUGCACCUGUGCAGAUGCCAACUGCAGAGAGCACAGGUAUGACACCUGAGAAGGUGCCAGUUUCAGAGGUCAUGGGUACCACACUGGCAGAGAUGUCAACUCCAGAGGCUACAGGUAUGACACCUGCAGAGGUAUCAAUUGUGGUGCUUUCUGGAACCACAGCUGCACAGGUAACAACUACAGAGUGGGUGGAGACCACAGCUAGAGAGCUACCUAUCCCUGAGCCUGAAGGUCCAGAUGCCAGCUCAAUCAUGUCUACGGAAAGUAUUACAGGUUCCCUGGGCCCCCUGCUGGAUGGUACAGCCACCUUAAGGCUGGUGAAGAGACAAGUCCCCCUGGAUUGUGUUCUGUAUCGAUAUGGUUCCUUUUCCGUCACCCUGGACAUUGUCCAGGGUAUUGAAAGUGCCGAGAUCCUGCAGGCUGUGCCGUCCGGUGAGGGGGAUGCAUUUGAGCUGACUGUGUCCUGCCAAGGCGGGCUGCCCAAGGAAGCCUGCAUGGAGAUCUCAUCGCCAGGGUGCCAGCCCCCUGCCCAGCGGCUGUGCCAGCCUGUGCUACCCAGCCCAGCCUGCCAGCUGGUUCUGCACCAGAUACUGAAGGGUGGCUCGGGGACAUACUGCCUCAAUGUGUCUCUGGCUGAUACCAACAGCCUGGCAGUGGUCAGCACCCAGCUUAUCAUGCCUGGUCAAGAAGCAGGCCUUGGGCAGGUUCCGCUGAUCGUGGGCAUCUUGCUGGUGUUGAUGGCUGUGGUCCUUGCAUCUCUGAUAUAUAGGCGCAGACUUAUGAAGCAAGACUUCUCCGUACCCCAGUUGCCACAUAGCAGCAGUCACUGGCUGCGUCUACCCCGCAUCUUCUGCUCUUGUCCCAUUGGUGAGAACAGCCCCCUCCUCAGUGGGCAGCAGGUCUGAGUACUCUCAUAUGAUGCUGUGAUUUUCCUGGAGUUGACAGAAACACCUAUAUUUCCCCCAGUCUUCCCUGGGAGACUACUAUUAACUGAAAUAAAUACUCAGAGCCUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-861.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -898.01

Frequency: 0.0000

Diversity: 468.18

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((........))).......(((......)))(((((((.((((((((((((((((...)).)))))).)))........((((((...((((((....)).))))...)))))).))))).)))))))...(((((.((((.(((((((......(.(((((((((((......((((((((.(((..((....)).)))))).)))))((((((((....)))).))))............(((((((.(((((((((((.....))))))))))).))..((((((.(((((..((.((((...((((....)))).....))))...))..)))))))))))......((((..(((....)))....)))).))))).)))).))))))))..........((((((((((((((.((((((((((.((((((((((((((((..(((....)))..))))).(((((((.((((......(((.((((((....(((((((.(((((((((....((((...))))...))))..))))).))))))).....)))))).)))(((((((((((....(((((((.(((((.((((...(((((((..((((((.((((.(..((((((.((((.((.....))))))((((...))))((((((((.((.....)).)))...)))))......((((...........))))......)))))).).)))))))))))))(((.(.(((((((((((......((....((((....))))....)).......)))))))..)))).).)))..((((((.((((((((....((..((((((((((((((((.((((((((.((((.((((.(((((((((((((.(((((((..(((...(((....((((((..((((((((((.....((((....(((..(((.(((..(((((..............))))).)))...)))..))))))).......))))).)))))...((((((.(((.(((...((((.....((...(((((((((.((....)).)))))))))...)))))).))).)))..)))))).((.(((((.(....(((((((((((((((.......((....))........))))))))))))))).....).))))).)).))))))))).))).....))))))).)....)))))))).)))).))))))))(((....)))...)))))))).)).))))).(((.((((....)))).))).(((((((.((....)).)))))))(((...((.......)).))).))))).))))..)))))))))).))))))...........))))...)))).))))))))))))(((.(((.(((.....)))..))))))...)))))))))))(((((((((((((((((((........))))....(((((((((....))))).))))(((((..(((.((((...(((((.((.(((((((((...))))))))))).))))).))))..))).)))))))))))))))))))).))))))))))).....((((.(((((((((((....)))))(((((((((...((((((.(((.(((...))).)))((((((..(((..(((((....(((((((((((((((.(((((((...(((((......))))).((((...)))).......))))))).))))((((((.((...)).)))))).)))))........)))))).))))).)))..))))))..(((((((....)))).)))..)))))))))))))))....(((.....)))((((....(((((.((..((((..(.((((.((((.((((((...........)))).....)).)))))))).).)))))).)))))))))))))))))))....)))))))..)))).))))))))))...)).....))))))))))))....)))))))....)))).)))))((((((((((((...(((..(((((..(((.((((((.((.(..(((.((((........)))).....)))..))).)))))).))))))))..)))......)))))))).)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((........})).......(((......)))(((((((.((((((((((((((((...))},))))).)))........{(((((...((((((....)).))))...)))))).))))).))))))),},{((((.((((.(((((((......{,(((((((((((.....,((((((({.{{{..{|.,..}).}}}}))},,}}|((((((((....)))).)))),..}}}......(((({((.(((((((((((.....))))))))))).))..((((((.(((((..((.((((.,.((((....)))).....))))...))..)))))))))))......((((,,(((....)))..,.)))).})))).)))).)))))))...........((((((((((((((.((((((((((.((((((((((((((((..(((....)))..))))}.(((((({{((((......(((.((((((....(((((((.(((((((((....((((...))))...))))..})))).))))))).....)))))).)))|((((((((((.(..{(((((({((,,({(((,,(((((((((..((((((,(,{(,(..{{{{{,.|||,.||,}}..}}},,|((((...))))||||,,{{}||}...,))},,)}}})))))}}}}|.{{{,......|,...}|}|..,,..||||||.|{|||,,,,|||((|(((.(.(((((((((((.....{((....((((....))))....)).......)))))))..)))).).)))..((((((.((((((((....((..((((((((((((((,{.((((((((.{(((.((((.((((((((((((,.(((((((..(((...(((({{{{,,,(((.(((((((({{{,...{((({{,{((({{(((.(((..((({{..............))))}.|}}...,,}..,}))).}}})).,.))))),,,||||,.((({{(.({{.,,,....|,,,,}.|||||.(((((((((.((....)).)))))))))...,}))))))))}})),.}}}}}}.((.(((((.{....(((((((((((((((.......{,....,....,....))))))))))))))).....}.))))).)).})))))))).))).....))))))).,....)))))))).)))).)))))))|(((....)))}..)))))))).},.))))).(((.((((....)))).))).,((((((.((....)).))))))}(((...,{,,.....}).)}}.))))).))))..)))))))))).)))))).....,||{.|||,...})),)}),,)}))))),,..))}}}.}}}}}},,},,..,},)}},,,))))))))))}(((((((((((((((((((........))))..{{.((((((((....)))))}),))(((((..(((.((((..{(((((.((.(((((((((...))))))))))).))))).))))..))).)))))))))))))))))))).))))))))))).....((((.((((({{{{((....|||||(((((((((|..|(((((.(((.(({...})).))}((((((..(((..(((({..,.(((((,|.||{||,|.|{{{(((,{{(((((,,..,,|||||,,,,{.,,))),..}}}..))))))),,|||((((((.((...)).))))))}}}|||||......,))))).))))).))}..)))))).,({,{{{{.,,,|}}}.}}}..)))))))))))))))..,||{{,....)})||||....(((((.({..{(((..{.(((,{((((.((((((...........)))).....)).)))))))).).))))}}.)))))}))}))))))))))...})))))))}.,))).))))))))))...)),....})))))))))))....)))))))....)))).))))}((((((((((((...(((..{{{{,.,(({,{((({{.({,{,,{{|,|,|,........,,||.,,{{|,}..},)})))})).,,,}}}}}..}}}......)))))))).)))).