Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_007213.3

Sequence Length

1260 nt

GC Content

0.5992

ACAUUAACCGGCAGGAUGUCGGAGGUGCGGCUGCCACCGCUACGCGCCCUGGACGACUUUGUUCUGGGGUCGGCGCGUCUGGCGGCUCCGGAUCCAUGCGACCCGCAGCGAUGGUGCCACCGCGUCAUCAACAACCUCCUCUACUACCAAACCAACUACCUUCUCUGCUUCGGCAUCGGCCUCGCUCUCGCCGGGUACGUGCGGCCACUUCAUACGCUCCUGAGCGCGCUGGUAGUGGCGGUGGCCCUCGGCGUGCUGGUGUGGGCAGCUGAGACCCGCGCAGCUGUGCGCCGCUGCCGCCGCAGCCACCCUGCAGCCUGCCUGGCCGCAGUGCUUGCCGUCGGCCUCCUGGUGCUCUGGGUCGCGGGCGGCGCUUGCACCUUCCUGUUCAGCAUCGCCGGGCCGGUGCUUCUGAUCCUGGUGCACGCCUCGUUGCGCCUGCGCAACCUUAAGAACAAGAUUGAGAACAAGAUCGAGAGCAUUGGUCUCAAGCGGACGCCAAUGGGCCUGCUACUAGAGGCACUGGGACAAGAGCAGGAGGCUGGAUCCUAGGCCCCUGGGAUCUGUACCCAGGACCUGGAGAAUACCACCCCACCCCCAGCCCAUAAUUGGGACCCAGAGCCCUUUCCCAGCACUUAAAACAGGAGCCUAGAGCCCCCUGCCCAAACAAAACAGGACAUCUGUGACCGCCCUACCCCCACGCCAGCCCCAAACUAAGAUAUCCCUCACACCCAGCCCCCAUUACCUAGGGACAAGAGUCUUCCCCAGCCUUGAACCCAGGACCAAGAGCCACCUACAUCCAGCCCCAAAACUGGCUUCAGGCCAGAGCAUCCAUGGCCAAUUUCAAAUUGUGAACCCAGAGACACUCCCAUCCACCCUUCUCCAUGCUCAUCCCCAAACUGGGGCCUGGGGCAAGGCACUCUCAAAUCUUGAACCCUGGACCAAAGCUUUUCCAGACCCCACCCUACCUUCCAACCCAGGUCAAGACAUUGCCAAAUCUUGAACUCAGAACCCAAGUGUUCCAUGCCCCUGUGUGGAUGGAGUCGGGUAUCCUGACUGUUGGACCCCUGGUCCAGGUGAUCCCGACCCUCACCAGUCCCAUUUGCCUCCCUCCAGCUCUGCUUAGGCAUUUUGCCCCUCACCCCAAUGUUCCACACCAUCGACAACCAAGGGGUGAGGUGGGGACAGGCCUCAGCAGGGAAUGGGGCGUAUAUGUUAGUGUUGCUGCAACAAUAAAGCCUGUUGCAUCUCUCAUGCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-466.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -483.57

Frequency: 0.0000

Diversity: 320.89

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((.(((.((((((.((.((((((...((....))..))))))..(((.(((((((((.((((((.((((.((..(((((.(((((((....((((((((.(((((((((((....))))))))............................(((......(((.(((((.((((.........))))(((((.((((((((.......((((....)))).((.(((.((((.((((((...(((((.((.((((((.(((((((.(.....).))))))).)).)))))))))))..)))))))))).))).)).))))))))))))))))))..))).....)))))).)))))))).(((((.(((.(((......)))..))).)))))(((((((.(((((((.....(((((..(((((((((((....))))))(((((........)))))....(((((((.....)))))))..(((((..(((....))))))))....)))))..(((((.(((.((.((.((.(((.(((((((..((((((.......)))))).))))).))...)))))))........((((....)))).......)).))))))))))))).....))))))))).).))))((((...........))))..))))).)))))))..)).....)))).))))))))).......................(((........)))...)))))).)))...((((((..(....)..)))).))..)).)))))).)))......((((.(((((((((.........)))))............)))).))))........((((((((.(.....((((.....(((((...)))))((((((..((((.....((((...))))...(((((..........)))))...........))))....))))))((((((..........)))))).....((((......)))))))).....).))))))))(((((((...)))))))..((((((...))))))(((((.........))))).((((((((.............(((((((.((((...((.(((((((((((..((((..........)))).....))))))))).)).))...)))).)))))))))))))))......))))))))...(((((((........))))))).............

Thermodynamic Ensemble Prediction

.........(((,((((((,((.((((((...((....))..)))))),,(((.({(({{({{.((((((.((((.({..(((((.(((((((,,.,((((((((.(((((((((((....))))))))............................{{{......{{,.{((({.{(({...{{...,||||(((({.((((((((.......((({....}))).{{,||{.||||,((((((...(((((.((.((((((.(((((((.(.....).))))))),))}}}),)))))))..))))))}})).})}.)).))))})))))))))))))..)))....,)))))).})))))))|(((((.(((.({{....,,|||..}}}.}}}}}(((((((.(((((((.,...(((((..(((((((((((....))))))(((((........)))))....{{{{{((.....)))))))..(((((..(((....))))))))....))))).,(((((.(((.((.((.((.(((.(((((((..((((((.......)))))).))))).))...))))))).......,((((....)))).......)).))))))))))))).....)))))))},.).)))){{{|,..........)))),.})))).)))))))..}}...,.)))).)))))),,,...|,..,,,.,........,..{{,.....,,.|||.{{||}||}.,,,...|{((((..|,,}}}..,,}}.||..}}.}}}}}}.|||......,{||||,..(((((,........)))))...,,,,.....}))}.,,}|,{{..,,.((((((((................(((({...})))).,.((((((.(({(({.{,,..,,||||...(((((..........)))))...........{{{........)))|(((((..,,......)))))}..,,,}|.....})}))}}}.)))))).).))))))))(((((((...)))))))..((((((...))))))(((((.........))))).|||,{{{,|||,,..,.....(((((((.((((...((.(((((((((((..,(((..........},.),,...))))))))).)).))...)))).))))))),,)))))}},,.,})},))))}.,,(((((((........))))))).......}))}..