Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_007308.3
Sequence Length
3312 nt
GC Content
0.3901
GGCGACGACCAGAAGGGGCCCAAGAGAGGGGGCGAGCGACCGAGCGCCGCGACGCGGAAGUGAGGUGCGUGCGGGCUGCAGCGCAGACCCCGGCCCGGCCCCUCCGAGAGCGUCCUGGGCGCUCCCUCACGCCUUGCCUUCAAGCCUUCUGCCUUUCCACCCUCGUGAGCGGAGAACUGGGAGUGGCCAUUCGACGACAGGUUAGCGGGUUUGCCUCCCACUCCCCCAGCCUCGCGUCGCCGGCUCACAGCGGCCUCCUCUGGGGACAGUCCCCCCCGGGUGCCGCCUCCGCCCUUCCUGUGCGCUCCUUUUCCUUCUUCUUUCCUAUUAAAUAUUAUUUGGGAAUUGUUUAAAUUUUUUUUUUAAAAAAAGAGAGAGGCGGGGAGGAGUCGGAGUUGUGGAGAAGCAGAGGGACUCAGUGUGGUGUAAAGGAAUUCAUUAGCCAUGGAUGUAUUCAUGAAAGGACUUUCAAAGGCCAAGGAGGGAGUUGUGGCUGCUGCUGAGAAAACCAAACAGGGUGUGGCAGAAGCAGCAGGAAAGACAAAAGAGGGUGUUCUCUAUGUAGGCUCCAAAACCAAGGAGGGAGUGGUGCAUGGUGUGGCAACAGUGGCUGAGAAGACCAAAGAGCAAGUGACAAAUGUUGGAGGAGCAGUGGUGACGGGUGUGACAGCAGUAGCCCAGAAGACAGUGGAGGGAGCAGGGAGCAUUGCAGCAGCCACUGGCUUUGUCAAAAAGGACCAGUUGGGCAAGGAAGGGUAUCAAGACUACGAACCUGAAGCCUAAGAAAUAUCUUUGCUCCCAGUUUCUUGAGAUCUGCUGACAGAUGUUCCAUCCUGUACAAGUGCUCAGUUCCAAUGUGCCCAGUCAUGACAUUUCUCAAAGUUUUUACAGUGUAUCUCGAAGUCUUCCAUCAGCAGUGAUUGAAGUAUCUGUACCUGCCCCCACUCAGCAUUUCGGUGCUUCCCUUUCACUGAAGUGAAUACAUGGUAGCAGGGUCUUUGUGUGCUGUGGAUUUUGUGGCUUCAAUCUACGAUGUUAAAACAAAUUAAAAACACCUAAGUGACUACCACUUAUUUCUAAAUCCUCACUAUUUUUUUGUUGCUGUUGUUCAGAAGUUGUUAGUGAUUUGCUAUCAUAUAUUAUAAGAUUUUUAGGUGUCUUUUAAUGAUACUGUCUAAGAAUAAUGACGUAUUGUGAAAUUUGUUAAUAUAUAUAAUACUUAAAAAUAUGUGAGCAUGAAACUAUGCACCUAUAAAUACUAAAUAUGAAAUUUUACCAUUUUGCGAUGUGUUUUAUUCACUUGUGUUUGUAUAUAAAUGGUGAGAAUUAAAAUAAAACGUUAUCUCAUUGCAAAAAUAUUUUAUUUUUAUCCCAUCUCACUUUAAUAAUAAAAAUCAUGCUUAUAAGCAACAUGAAUUAAGAACUGACACAAAGGACAAAAAUAUAAAGUUAUUAAUAGCCAUUUGAAGAAGGAGGAAUUUUAGAAGAGGUAGAGAAAAUGGAACAUUAACCCUACACUCGGAAUUCCCUGAAGCAACACUGCCAGAAGUGUGUUUUGGUAUGCACUGGUUCCUUAAGUGGCUGUGAUUAAUUAUUGAAAGUGGGGUGUUGAAGACCCCAACUACUAUUGUAGAGUGGUCUAUUUCUCCCUUCAAUCCUGUCAAUGUUUGCUUUACGUAUUUUGGGGAACUGUUGUUUGAUGUGUAUGUGUUUAUAAUUGUUAUACAUUUUUAAUUGAGCCUUUUAUUAACAUAUAUUGUUAUUUUUGUCUCGAAAUAAUUUUUUAGUUAAAAUCUAUUUUGUCUGAUAUUGGUGUGAAUGCUGUACCUUUCUGACAAUAAAUAAUAUUCGACCAUGAAUAAAAAAAAAAAAAAAGUGGGUUCCCGGGAACUAAGCAGUGUAGAAGAUGAUUUUGACUACACCCUCCUUAGAGAGCCAUAAGACACAUUAGCACAUAUUAGCACAUUCAAGGCUCUGAGAGAAUGUGGUUAACUUUGUUUAACUCAGCAUUCCUCACUUUUUUUUUUUAAUCAUCAGAAAUUCUCUCUCUCUCUCUCUCUUUUUCUCUCGCUCUCUUUUUUUUUUUUUUUUUACAGGAAAUGCCUUUAAACAUCGUUGGAACUACCAGAGUCACCUUAAAGGAGAUCAAUUCUCUAGACUGAUAAAAAUUUCAUGGCCUCCUUUAAAUGUUGCCAAAUAUAUGAAUUCUAGGAUUUUUCCUUAGGAAAGGUUUUUCUCUUUCAGGGAAGAUCUAUUAACUCCCCAUGGGUGCUGAAAAUAAACUUGAUGGUGAAAAACUCUGUAUAAAUUAAUUUAAAAAUUAUUUGGUUUCUCUUUUUAAUUAUUCUGGGGCAUAGUCAUUUCUAAAAGUCACUAGUAGAAAGUAUAAUUUCAAGACAGAAUAUUCUAGACAUGCUAGCAGUUUAUAUGUAUUCAUGAGUAAUGUGAUAUAUAUUGGGCGCUGGUGAGGAAGGAAGGAGGAAUGAGUGACUAUAAGGAUGGUUACCAUAGAAACUUCCUUUUUUACCUAAUUGAAGAGAGACUACUACAGAGUGCUAAGCUGCAUGUGUCAUCUUACACUAGAGAGAAAUGGUAAGUUUCUUGUUUUAUUUAAGUUAUGUUUAAGCAAGGAAAGGAUUUGUUAUUGAACAGUAUAUUUCAGGAAGGUUAGAAAGUGGCGGUUAGGAUAUAUUUUAAAUCUACCUAAAGCAGCAUAUUUUAAAAAUUUAAAAGUAUUGGUAUUAAAUUAAGAAAUAGAGGACAGAACUAGACUGAUAGCAGUGACCUAGAACAAUUUGAGAUUAGGAAAGUUGUGACCAUGAAUUUAAGGAUUUAUGUGGAUACAAAUUCUCCUUUAAAGUGUUUCUUCCCUUAAUAUUUAUCUGACGGUAAUUUUUGAGCAGUGAAUUACUUUAUAUAUCUUAAUAGUUUAUUUGGGACCAAACACUUAAACAAAAAGUUCUUUAAGUCAUAUAAGCCUUUUCAGGAAGCUUGUCUCAUAUUCACUCCCGAGACAUUCACCUGCCAAGUGGCCUGAGGAUCAAUCCAGUCCUAGGUUUAUUUUGCAGACUUACAUUCUCCCAAGUUAUUCAGCCUCAUAUGACUCCACGGUCGGCUUUACCAAAACAGUUCAGAGUGCACUUUGGCACACAAUUGGGAACAGAACAAUCUAAUGUGUGGUUUGGUAUUCCAAGUGGGGUCUUUUUCAGAAUCUCUGCACUAGUGUGAGAUGCAAACAUGUUUCCUCAUCUUUCUGGCUUAUCCAGUAUGUAGCUAUUUGUGACAUAAUAAAUAUAUACAUAUAUGAAAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-901.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -969.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 754.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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