Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_007328.4
Sequence Length
1382 nt
GC Content
0.3792
CCACUCUUGACUCACUCUGAGCCUUCACAGGGCAGUCUGCGAAGAUUGCAGGCAUUGUUUGUUCUUGUCUUGGAUUUAUGCCUUUAAAUUUCACCUUUUAUUACACAGCUAUAGCAGGCCUUUUUAUGAGACUAACCUGGCCUCUCCACUAAAGGAUGUGUGACUUUCUGGGGACAGAAGAGUACAGUCCCUGACAUCACACACUGCAGAGAUGGAUAACCAAGGAGUAAUCUACUCAGACCUGAAUCUGCCCCCAAACCCAAAGAGGCAGCAACGAAAACCUAAAGGCAAUAAAAACUCCAUUUUAGCAACUGAACAGGAAAUAACCUAUGCGGAAUUAAACCUUCAAAAAGCUUCUCAGGAUUUUCAAGGGAAUGACAAAACCUAUCACUGCAAAGAUUUACCAUCAGCUCCAGAGAAGCUCAUUGUUGGGAUCCUGGGAAUUAUCUGUCUUAUCUUAAUGGCCUCUGUGGUAACGAUAGUUGUUAUUCCCUCACGUCAUUGUGGCCAUUGUCCUGAGGAGUGGAUUACAUAUUCCAACAGUUGUUACUACAUUGGUAAGGAAAGAAGAACUUGGGAAGAGAGUUUGCUGGCCUGUACUUCGAAGAACUCCAGUCUGCUUUCUAUAGAUAAUGAAGAAGAAAUGAAAUUUCUGUCCAUCAUUUCACCAUCCUCAUGGAUUGGUGUGUUUCGUAACAGCAGUCAUCAUCCAUGGGUGACAAUGAAUGGUUUGGCUUUCAAACAUGAGAUAAAAGACUCAGAUAAUGCUGAACUUAACUGUGCAGUGCUACAAGUAAAUCGACUUAAAUCAGCCCAGUGUGGAUCUUCAAUAAUAUAUCAUUGUAAGCAUAAGCUUUAGAGGUAAAGCGUUUGCAUUUGCAGUGCAUCAGAUAAAUUGUAUAUUUCUUAAAAUAGAAAUAUAUUAUGAUUGCAUAAAUCUUAAAAUGAAUUAUGUUAUUUGCUCUAAUAAGAAAAUUCUAAAUCAAUUAUUGAAACAGGAUACACACAAUUACUAAAGUACAGACAUCCUAGCAUUUGUGUCGGGCUCAUUUUGCUCAACAUGGUAUUUGUGGUUUUCAGCCUUUCUAAAAGUUGCAUGUUAUGUGAGUCAGCUUAUAGGAAGUACCAAGAACAGUCAAACCCAUGGAGACAGAAAGUAGAAUAGUGGUUGCCAAUGUCUGAGGGAGGUUGAAAUAGGAGAUGACCUCUAACUGAUAGAACGUUACUUUGUGUCGUGAUGAAAACUUUCUAAAUUUCAGUAGUGGUGAUGGUUGUAACUCUGCGAAUAUACUAAACAUCAUUGAUUUUUAAUCAUUUUAAGUGCAUGAAAUGUAUGCUUUGUACACGACACUUCAAUAAAGCUAUCCAGAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-343.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -371.60
Frequency: 0.0000
Diversity: 312.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((.((((((...))))(((....)))(((((((....)))))))((((((.....((((.......))))..))))))........................((....))(((((..................))))).(((......)))(((((((...((.((((((...........))))))))..))))))).(((((((....((((((...(((((...)))))..........(((((.(..........).))))).........((....)).........((((((((((((..(((...(((......)))...))).......((((((....((((((((((((.....((((((((((((...(((((...((...(((.....))).)).(((.(((.((.(((((.((((((....(((....)))))))))...))))))).))).)))....)))))))))))))))))((((....))))......))))))))))))(((........)))...(((....)))((((((((((((..((..((((((.......)))))).))..)))............(((....((((((((((......(((((.((((((((...)))))).))..))))).((((((((....))).)))))((((....))))...(((....((((((((((((......((((...((((((....(((((......((((((.(((((((((.((......)).))))((((((((((....((...((((.(((((.(((((..(((((((((((....(((((((((((...((((((....))))))...)))..)))))))).............((((((((((......))))))))))...((((.....)))).......(((((.(.(((((......))))).).))))).......))))))))....)))..)))))...............(((((..........)))))))))).))))...)).......))))))))))...((((..........))))...))))).))))))..))))).))))))))))......)))..))))))))))))))))))))))..)))...))))))))).))))))..)))))))).))))((.(((.(((.(((((((((((((((........))))))......)))))....))))))).))).))))))))..))))))).................(((((...)))))......((((((...))))))(((((((.............)))))))..)).)))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,,,,,,..{{,.{{{{,((((({.,||}{((((((,,,.}}}))))||||{..,...,,{{,||||,((((((((((((((((..((((...............{{....)}(((((...,,,......}},...))))).(((,,,...||,(((((((...((.((((((...........))))))))..)))))))}}...{||.||||,.,{,...{{||,.,,))))).....,,...(((((.,..........).)))))....)))}...))))))),,))))...)))}...(((((((((...(((......)))....{(,......|||,,.....((((((((((((.....((((((((((((...(((((.,,,,..,|,,...,,|,}.},.{((,(({.((,(({{(.((((((...{(({....,}}}))}}),},))))))),))),))),,..)))))))))))))))))((((....})))......))))))))))))(((........)))..)))))))))..(((((((({(((..((..((((((.......)))))).))..))),,.,,.....,.||,||,.((((((((((......{((((.{,((((((...)))))).,,..))))).((((((((....)))}}))))((((....})))...(((....((((((((((((......((((...((((((....(((((......((((((.(((((({{({(({,....|,,|}|,((((((((((.,,.((...((((.(((((.(((((.,(((((((((((....(((((((((((...((((((....))))))...)))..)))))))).,,..........((((((((((......)))))))))).,}{|{{,|||,|,||.......(((({.{.(((((......))))).).})))).......))))))))....))),.)))))...,,,....}},..(((((..........)))))))))).))))...))....,..))))))))))...,,||,,,.....)))))}},,))))).))))))..))))).))))))))))......))),.})))))))))))))))))))))....,)}})))))))))})),,))}})}}}}..,,}}}}.,},,}}}}..{{(((((....,,,....(((((((({{(({.......{{,{..{{{{{,{({{{{{(({(((({....})))}.,,}}},,..}})}))})}..}}}),,|,,,.,,,,,{{{||,,,,,})}}}}}}}}.)))))))).....,,,..))))}})),............
Back