Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_007346.4
Sequence Length
2410 nt
GC Content
0.6651
AGCGCGAGCCCCGCCGCCGCCGAGCAUGGACGACCCCGACUGCGACUCCACCUGGGAGGAGGACGAGGAGGAUGCGGAGGACGCGGAGGACGAGGACUGCGAGGACGGCGAGGCCGCCGGCGCGAGGGACGCGGACGCAGGGGACGAGGACGAGGAGUCGGAGGAGCCGCGGGCGGCGCGGCCCAGCUCGUUCCAGUCCAGAAUGACAGGGUCCAGAAACUGGCGAGCCACGAGGGACAUGUGUAGGUAUCGGCACAACUAUCCGGAUCUGGUGGAACGAGACUGCAAUGGGGACACGCCAAACCUGAGUUUCUACAGAAAUGAGAUCCGCUUCCUGCCCAACGGCUGUUUCAUUGAGGACAUUCUUCAGAACUGGACGGACAACUAUGACCUCCUUGAGGACAAUCACUCCUACAUCCAGUGGCUGUUUCCUCUGCGAGAACCAGGAGUGAACUGGCAUGCCAAGCCCCUCACGCUCAGGGAGGUCGAGGUGUUUAAAAGCUCCCAGGAGAUCCAGGAGCGGCUUGUCCGGGCCUACGAGCUCAUGCUGGGCUUCUACGGGAUCCGGCUGGAGGACCGAGGCACGGGCACGGUGGGCCGAGCACAGAACUACCAGAAGCGCUUCCAGAACCUGAACUGGCGCAGCCACAACAACCUCCGCAUCACACGCAUCCUCAAGUCGCUGGGUGAGCUGGGCCUCGAGCACUUCCAGGCGCCGCUGGUCCGCUUCUUCCUGGAGGAGACGCUGGUGCGGCGGGAGCUGCCGGGGGUGCGGCAGAGUGCCCUGGACUACUUCAUGUUCGCCGUGCGCUGCCGACACCAGCGCCGCCAGCUGGUGCACUUCGCCUGGGAGCACUUCCGGCCCCGCUGCAAGUUCGUCUGGGGGCCCCAAGACAAGCUGCGGAGGUUCAAGCCCAGCUCUCUGCCCCAUCCGCUCGAGGGCUCCAGGAAGGUGGAGGAGGAAGGAAGCCCCGGGGACCCCGACCACGAGGCCAGCACCCAGGGUCGGACCUGUGGGCCAGAGCAUAGCAAGGGUGGGGGCAGGGUGGACGAGGGGCCCCAGCCACGGAGCGUGGAGCCCCAGGAUGCGGGACCCCUGGAGAGGAGCCAGGGGGAUGAGGCAGGGGGCCACGGGGAAGAUAGGCCGGAGCCCUUAAGCCCCAAAGAGAGCAAGAAGAGGAAGCUGGAGCUGAGCCGGCGGGAGCAGCCGCCCACAGAGCCAGGCCCUCAGAGUGCCUCAGAGGUGGAGAAGAUCGCUCUGAAUUUGGAGGGGUGUGCCCUCAGCCAGGGCAGCCUCAGGACGGGGACCCAGGAAGUGGGCGGUCAGGACCCUGGGGAGGCAGUGCAGCCCUGCCGCCAACCCCUGGGAGCCAGGGUGGCCGACAAGGUGAGGAAGCGGAGGAAGGUGGAUGAGGGUGCUGGGGACAGUGCUGCGGUGGCCAGUGGUGGUGCCCAGACCUUGGCCCUUGCCGGGUCCCCUGCCCCAUCGGGGCACCCCAAGGCUGGACACAGUGAGAACGGGGUUGAGGAGGACACAGAAGGUCGAACGGGGCCCAAAGAAGGUACCCCUGGGAGCCCAUCGGAGACCCCAGGCCCCAGCCCAGCAGGACCUGCAGGGGACGAGCCAGCCGAGAGCCCAUCGGAGACCCCAGGCCCCCGCCCAGCAGGACCUGCAGGGGACGAGCCAGCCGAGAGCCCAUCGGAGACCCCAGGCCCCCGCCCGGCAGGACCUGCAGGGGACGAGCCAGCCGAGAGCCCAUCGGAGACCCCAGGCCCCAGCCCGGCAGGACCUACAAGGGAUGAGCCAGCCGAGAGCCCAUCGGAGACCCCAGGCCCCCGCCCGGCAGGACCUGCAGGGGACGAGCCAGCCGAGAGCCCAUCGGAGACCCCAGGCCCCCGCCCGGCAGGACCUGCAGGGGACGAGCCAGCCGAGAGCCCAUCGGAGACCCCAGGCCCCAGCCCGGCAGGACCUACAAGGGAUGAGCCAGCCAAGGCGGGGGAGGCAGCAGAGUUGCAGGACGCAGAGGUGGAGUCUUCUGCCAAGUCUGGGAAGCCUUAAGGAAAGGAGUGCCCGUCGGCGUCUUGGUCCUCCUGUCCCUGCUGCAGGGGCUGGGGCCUCCGGAGCUGCUGCGGGCUCCCCUCAGGCUCUGCUUCGUGACCCGUGACCCAUGACCCACAGUGCUGGCCUCCUGUGGGGCCACUAUAGCAGCCACCAGAAGCCGCGAGGCCCUCAGGGAAGCCCAAGGCCUGCAGAAGCCUCCUGGCCUGGCUGUGUCUUCCCCACCCAGCUCUCCCCUGCGCCCCUGUCUUUGUAAAUUGACCCUUCUGGAGUGGGGGGCGGCGGGCAGGGCUGCUUUUCUUAGUCUGAUACCAAGCAAGGCCUUUUCUGAAUAAAUUCAUUUGACUUUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1085.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1125.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 664.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((.(((((.(((((((((..((((((......)))..)))..(((((((((((((((((((.(((.((.(((((.(((.((((..(..((((((.((.(((.(((.(((((.((((((((..(((.((.((.(((..(((((((((((.....)))...((.((((((.....))))))))..)))))))).(((......))).(((((..((....((((((((..(((((...(((((........)))))......(((((((.((.....((((((....(((.(...).)))......)))))).......)).)))))))..(((((((....(((((......((((((...))))))(..((((..(((((.((.(((((((((((((.....((((((((...(((((.((......)).))).)).....))))))))...(((.......))).......))))))))))))).)))))))....(((((..((....)).)))))(((((((((((((((..(..(((.((.((((((((((.((((((((((.((.((.((((((...(((((((((((..(.......)..)))))....(((((..(((...)))....))))).(((((.....((.(((((.(((..(((((((((...(((((((.(.(((.(....).))).).)))).)))(((((..((((((((((((((..((..((.(((((.((((....))))(((((((((((((((.(.((..(((((........)))))...(((((((((..(((((((.......)))))))..(((((((((((.((..((((((((((.(((((.(((.(((((((...))).)))).)))))))).)).((...(((.((((((((((.(((((((((..((((((((.(...((((.((.((.......))))((((.((((..((((...(((..(((((..(.(..(..(((.....)))..)..).)..)))))..)))...))))....))))))))..))))....).))))))))...)).))))..(((((((.......))))))).))).))))))))))...)))...))..))))))))..(((...((((...(((.(((....((((...((((..(((....(((((......)))))..)))..))))..))))....))))))...)).))..)))(((.((((......)))).))).((((((.....)))))))))))))).))))).((((((...(((....)))....))))))..)))))))))))))))))))..))))))))..))))).))..))..)..)).)))))))))))....))))).)))))))))((....))))).))))).))...))))).))))))...)))))))))).))))))))))..(((((...)))))(((((...((((....))))......))))).......(((.......)))....((((.((......))..)))))))))))))).)))))..)..))))))....((.((((...)))).)))))))))))..((((.......))))........(((...(((((.(((((.(((((..(((.((.(((..((((.......))))........)))...))))).))))).)))))..))).)).)))..((((.......)))).....))))..).))))).)))))))(((....)))..(((((.((.(..(((...((((((.((((((.((((.((..((((((....(((((((((.((...(((((........(((..((((((((((((((((.((((((.(((((.(((...(.(((..((((.......))))........))).)...))).))))).)))....((......)).)))..)))))))...(((((...))))).....(((((((......)))))))...)))))))...((((.....)))).))..))))))))...)).)))).))))).)))))))).)))))))))).)))))).))).).)).)))))))))).))))).)))))..))))))))..)).)).)))...)))))))).(((((.((((((......((.((........)).))..)))))))))))..(((...)))........)))))))).))).))...))))))..)..)).))..))).)))))))))))))))...........)))))))).)))))))))))).))).)))))))...((..(((((((.........(((.....)))........)))...))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((.(((((.(((((((((..((({((......)))..)))..(((((((((((((((((((.(((.((.(((((.(((.((((,((.,{((,(({(,,,((.((({({{{{}|||(((((,.(((.((,((,{((,(((.{(((((.{..{(((((,{{(({(((({({{{,,||||||,|,(((((((((,{{(({{,..,,,.{(((((,{...}}||,,,{||..,.{({,,.(((((.{....,.))))}....,}|{{{|||}||}}}},|||,||,...((({{...}.))}...,|,}|||||.......}).))}}))),.,,|||||...,|||||||||,|{(((({...))))))}..||||,,{((({.((.(((((((((((((.....((((((((...(((((.((......)).))).)).....))))))))...(((.......))).......))))))))))))),)}))))}....(((((..((....)).)))))(((((((((((((((..(..(((.((.((((((((({.((((((((((.{(.((.((((((...(((((((((((..(.......}..)))))....(((((,,({{...||}...,})))).{(({{.....((.(((((,(({.,(({((((((.,.{(({(((.,,(({,(,,,,},|}}.,.))}))})}{(|{{..{(((((((({({{{,.{{..{(.(({{||((((,,..|||}(((((((((((((((.(.((..{((((........))))}...((((((((({.(((((((.......))))))),.(((((((((((.((,,{(((((((((.(((({,(((.(((((((...))),}))).)))))))).)).{{...(((.((((((((((.(((((((((..((((((((.(...((((.((.((.......))))((((.(((({.((((...(((..(((((..(.(,.{.,{,,,.},}).,.,}...,)..)))))..)))...)))).},.)))}))))..))))....).))))))))...)).)))}..(((((((.......))))))),))).))))))))))...)))...},..)))))))|{,(({..,{{,{...{{{.(({....((((...((((..(((.,..(((((......)))))..)))..))))..))))....)))))).,,))}})}}...,{{,(((({....,}}||,|}}.{{||||,....))))),}||||}}}.})))).((((((...{{{....))}....))))))..)))))))))))})))))))..))))))))..))))),)).,))..}.,)),,}))))))))}....))))).)}}))))))|{....}}))),))))).))...))))).))))))...)))))))))).)))))))))).,(((((...)))))|((((...((((....))))......))))}...,...(((.,....})))...,((((.((......))..)))))))))))))).)})))..)..))))))...,((.(((((.(((((.,(({.{(.(((.,((((.......))))........)))...}}))).))))).))))).)))))))))))..((((.......))))...,,}},)}},,,}}||}||||||.|||||.|||}.}|,|||.,{{{{,.,,.,.}))}...,,|}|||||||||}}|}||})),|||....}}||}|||||.||||,{{{|,,.{(((((.(((({{{((((.((..{(((((....(((((((((,{(...(((((,..,{,..|((...,{|{,||((((((((.((((((.(((((.(((...{.(((.,((((.......))))........))).,...))).))))).)))....((......)).)))..))))))))..(((((...)))))..,,,(((((((......)))))))...})))|||...((((.....}))).}}.}))}}}))).,)))}))}),))))),)))))))).)))))))))).)))))).})).)}))})))))))))).))))))))))))),.)))))).,)}.}}.))).},))}))}))}|||{({(((({,......((,(({,,,,,..||.||.,||||}|}}|||..,||...)))}},,....))))})))}}}),))}}}}}}}})})),},,.))..))).)))))))))))))))...........)))))))).))))))))))))))}).)))))))...{(..((((,{{..,,.....,||......,|{,......)))...))))..)}
Back