Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_012176.3

Sequence Length

1655 nt

GC Content

0.4127

AGACGCGUCACCCACGCUGCGGGCAAGCCAUGGCGGGAAGCGAGCCGCGCAGCGGAACAAACUCGCCGCCGCCGCCCUUCAGCGACUGGGGCCGCCUGGAGGCGGCCAUCCUCAGCGGCUGGAAGACCUUCUGGCAGUCAGUGAGCAAGGAGAGGGUGGCGCGUACGACCUCACGGGAGGAGGUGGAUGAGGCGGCCAGCACCCUGACGCGGCUGCCGAUUGAUGUACAGCUAUAUAUUUUGUCCUUUCUUUCACCUCAUGAUCUGUGUCAGUUGGGAAGUACAAAUCAUUAUUGGAAUGAAACUGUAAGAGAUCCAAUUCUGUGGAGAUACUUUUUGUUGAGGGAUCUUCCUUCUUGGUCUUCUGUUGACUGGAAGUCUCUUCCAGAUCUAGAAAUCUUAAAAAAGCCUAUAUCUGAGGUCACUGAUGGUGCAUUUUUUGACUACAUGGCAGUCUAUAGAAUGUGCUGUCCAUACACAAGAAGAGCUUCAAAAUCCAGCCGUCCUAUGUAUGGAGCUGUCACUUCUUUUUUACACUCCCUGAUCAUUCAGAAUGAACCACGAUUUGCUAUGUUUGGACCAGGUUUGGAAGAAUUGAAUACCUCUUUGGUGUUGAGCUUGAUGUCUUCAGAGGAACUUUGCCCAACAGCUGGUUUGCCUCAGAGGCAGAUUGAUGGUAUUGGAUCAGGAGUCAAUUUUCAGUUGAACAACCAACAUAAAUUCAACAUUCUAAUCUUAUAUUCAACUACCAGAAAGGAAAGAGAUAGAGCAAGGGAAGAGCAUACAAGUGCAGUUAACAAGAUGUUCAGUCGACACAAUGAAGGUGAUGAUCAACAAGGAAGCCGGUACAGUGUGAUUCCACAGAUUCAAAAAGUGUGUGAAGUUGUAGAUGGGUUCAUCUAUGUUGCAAAUGCUGAAGCUCAUAAAAGACAUGAAUGGCAAGAUGAAUUUUCUCAUAUUAUGGCAAUGACAGAUCCAGCCUUUGGGUCUUCGGGAAGACCAUUGUUGGUUUUAUCUUGUAUUUCUCAAGGGGAUGUAAAAAGAAUGCCCUGUUUUUAUUUGGCUCAUGAGCUGCAUCUGAAUCUUCUAAAUCACCCAUGGCUGGUCCAGGAUACAGAGGCUGAAACUCUGACUGGUUUUUUGAAUGGCAUUGAGUGGAUUCUUGAAGAAGUGGAAUCUAAGCGUGCAAGAUGAUUCUCUUUUCAGAUCUUGGGAACUGAAACCAUUUGAAAUUUAUUACUAAGGUCGUGAUGUGAAUAUUUGCUCAGUCAGCCCACCUUGUCCUGCCUUUUUGCAGAUAGGCUUUCAUUUGGACAGCUAUAACUGCUGUGUUUUUUAUAUUAUUUUUACUCUUUACCAUAAAUCAAUUACAAGAAAAGAGUUUCAGUCCUAGUAUUUAGCCCCAAAAUGAACCUUUAAACAUUUUUUUGGUAAUUUUUAUAUUUUCUGUCUUUUUAAAAAUAUUAAAUUCUGGAAAAAACAAGUUUGUGCCUCUCAUUCCCUGAGUUUCUAUUCUUUUGGGUAUAAAGAUUGCCUUAGUGAGAAAUAGCAAAUUUGCUAAACUUUCUAUUCAGUCUUUUCAAGGGUUCAUAAGUGGUUAUCAGAAAAGAAAUUUUUAUCUAUUCUUAAUAAAUACACUGCUUAAAGACUGAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-469.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -500.61

Frequency: 0.0000

Diversity: 341.99

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((((((((.(((((.((((.......(((((...(((((((((...))))......)))))..)))))))))..))))).....(((((((....)))))))...((((..(((((..(((...)))..)))))..))))........))))))))))).......((((((.(((((((((.(((((((((.((........)))))))))(((.((((((......))))))..)))...)).)))))))).)..))))))((((((...((((..........((((((................))))))(((((((((.(((...((((...((...(((((((.((((((.(((((((((((((.(((((((((...((((....((((......(((....(((((((((((((.(((.(((((((((((..(((((((((((...((((.((((.(((((((((...((.(.(((.........)))).))...)))))))).).).)))))))............((((....))))..........)).)))))))))..(((((((((((..........((((((.....)))))))))))))..))))))))))))....)))))).))).))....)))))))))))((.((((..((((.((((.((((((.(((((...((((......))))..)))))..)).)))).)))).)))))))))).((.....)).))))..)))).....))))))((((....)))).........))).)))))))))))..........)).)))))).)))))))))...)))).))).))))))))).......(((((.((....((((((((....))))))))...)).)))))(((.((...(((((((.(((((((.(((......((((((((..((.((((((((((((.((((((..(((((.....(((((((((....))))....(((((.......)))))(((((((........(((..((....))..)))........)))))))....))))).....))))).))))))....((((((((.((((((((((((..((.((...((((((((.(..(((((((....(((((((..((((((..............))))))..((((((.((....)).))))))(((..((((((((((...((((((..((((.(((........)))))))....))))))..((((......))))))))).)))))..)))(((((.......))))).))))))).......)))))))..).))))...))))..)).))...)))))))))))))).)))))).(((..((((((..........))))))...))).............)))))).................................(((((((((((((.....)))).............))))))))).)))))).))))))))))(((((....)))))..))).))))))))))))))...)).)))...((((.((((.((((.(((........))).))))..))))...))))))))...))))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((((((((((.(((((.((((.......(((((...(((((((((...))))......)))))..)))))))))..))))).....(((((((....))))))).,{((({,.{((((..{(,...}}}.,)}))).,)}})..,,},..))))))))))).......((((((.{((((((((.(((((((((.((........)))))))))(((.((((((......))))))..)))...)).)))))))).}..))))))((((((...((((,....,,,,,,{{{{|,|,,...,,.......)))}},(((((((((.(((...((((...{(,..(((((((.((((((.(((((((((((((.((((((((({(((,(((....,,,....,,}.}}}.})))}}}},,...{((((((((((((..((((.......)))).,.))))))))))))|((((((...{{,{.(({.........}))}.}}...)))))))||(((,{,(((((((({{..((({{((((((..{{{...,},(((((((((((((.((...(((((((.(((((..{,.,(.((((((.....)))))).)}{{{{{.....}|}|||...,}))..)))).).)))))))....))..))))))))).))))....)))))))))).........(((({,....,,,,.....,}},}}.,{{{,.{{{{...{{{........))},}},)}))}})))},...,)))))}{{{{...,)))),,,.....,))).)))))))))))..........)).)))))).)))))))))...)))).))).))))))))).......{((((,({....{(((((((....)))))))}..,|,.,}))|(((.((,..(((((((.(((((((.(((......((((((((..{(.((((((..,.({.((((((..(((((.....(((((((((....)))}....,((((.......))))|(((((((........(((..{{....)}..)))........)))))))....))))).....))))).)))))),|,.((((((((.((((((((((((..((.({...((((((((.{..(((((((....{({{(({{.((((((....,......,..))))))}}}||||({((,{{{},.}||||.,{{..{{,,,,,||,..}||||||,{(((({(((,.....|,}}||}|||,,.}}||||{,({((......}})))}))),,,}}}..}))(((((.......))))).,..}}}},,,,,,.)))))))..}.))))...))))..)).})...)))))))))))))).)))))}.,.{{{((((,(,.........|,|||||||}|,,{{{{..{{{{{{|,||.....,||}}}}}}}.}})}}})}))}},......{{{{{{{{{((((.....)))).......,,.,,,))))})}},.)))))).))))))))))(((((....)))))..))).))))))))))))))...)),))),..{(((,((({.((((.(((........))).))))..})},,},))))))))...))))))....