Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_012280.4

Sequence Length

1899 nt

GC Content

0.5245

GUUCACAUCAGGUCCCGGCCCGCCGGAACCUGGGCGAUCCACGAUGCCGAGUUUGCCACGCUGCGACAGCCCAUAGGCUUGCCCCCCCGGGCAUUCGGGUGGACUACGAACACAAACUGAAGCCCUAGGACUUGUCGCCCGUUUGCGCUCUCGCCGAGGCACAGGCUGCUCGCGGACCACCCUGCUCCGAAAACUAAGAGGUAGGUGGUAGCCCAUUCAUCUGGUUACUGAUACUGGCCGGCAUCAGUGGACUGUCGGCAGGUCCUUGAGCAACUGGUGUGUGAAAUGGGACGGACGUCAAAGGACAAGCGGGAUGUCUACUACCGCCUGGCCAAGGAGAAUGGCUGGCGUGCUCGCAGCGCCUUCAAACUGCUACAACUGGAUAAGGAAUUCCAACUCUUCCAAGGCGUGACACGGGCAGUUGACCUGUGUGCAGCCCCAGGCAGCUGGAGCCAGGUGCUGAGCCAGAAGAUCGGGGGCCAAGGGUCCGGCCACGUGGUGGCUGUGGACCUGCAGGCUAUGGCUCCACUACCAGGUGUGGUACAGAUCCAGGGGGACAUCACCCAGCUGUCCACUGCCAAGGAGAUCAUCCAGCACUUUAAGGGCUGCCCUGCGGACCUAGUGGUGUGUGACGGGGCUCCUGAUGUAACCGGUCUCCAUGAUGUUGAUGAGUAUAUGCAGGCCCAGCUCCUCCUAGCUGCUCUGAACAUUGCUACACAUGUCCUGAAGCCAGGGGGCUGCUUUGUGGCCAAGAUAUUCCGAGGCCGGGAUGUGACGCUCCUCUACAGCCAGCUGCAGGUCUUCUUCUCCAGCGUGCUGUGUGCCAAGCCCAGGAGCAGCCGGAACUCUAGCAUCGAGGCCUUCGCUGUCUGUCAGGGCUAUGACCCUCCCGAGGGCUUCAUCCCGGACCUGAGCAAACCCCUGCUGGACCAUUCUUACGACCCAGAUUUCAACCAGCUGGAUGGUCCCACCCGCAUCAUUGUGCCUUUUGUGACCUGUGGGGACCUGAGCUCCUAUGAUUCGGACCGCAGUUACCCACUGGACCUAGAGGGCGGCUCAGAGUACAAGUACACUCCACCCACACAGCCCCCCAUCUCGCCACCAUACCAGGAGGCCUGCACGUUGAAGAGGAAGGGGCAGCUGGCCAAGGAGAUCCGCCCCCAGGACUGCCCCAUCAGCAGAGUGGACACGUUUCCCCAGCCCCUGGCCGCCCCUCAGUGCCACACCCUGCUGGCCCCUGAGAUGGAAGACAAUGAAAUGAGUUGUUCACCUUAACCCAUUACGCUGGCAAACUGAUACAACUCAGAAACUGCUCAAUGUCAGGAAAACCGGAACUUGUUGAUGAACUUGUUUUCAAAAUAUCAUCUCAUCAACGAGGCCUGGACAAACAAGCCCUGAGGAGGGAUCUGCAACAACCCUGAAGACAACAAGGAAAGAAACCAUGAAAGUCUGUCUGUACUGCAGUGGGAAUUCUUGAGUGAGGUCUUACCUCUUCUUUAAACCUCUUCAGGAGUGUCCUGAUUAUGUCCAGAAUUUUCCCUAAAGGCAGGGAUUCUUAACCUGGAUAGAAGCCAGGGGUAACCAUGAACUUGAUGGAAGAAAAUGUUACAUCUUUAUUUUCAGCAAUGAAACUGAAAUUUAGCCUUACUCCCAAGUUAUAAAUGCUGGCAACAAAUCACAGUAGUAAAAGCAGUACCUGGGAUUUUCCCACCAAUACAAACCAGUUACAGCAACUGUAAUGUAACAUAAAAAGGGCAUCUUGAAGUAUUGUUCAUAUUUGUCACCUCUUGGAAUGAUAGCAGAUCCUGUAAGUUGAUGUAUUAAUUAAAAAGCCCAUAUAUUACUGCAUCUCAAUUUUGUUUCAAUUUAAUAUAUAGUAAUAAUUGUAAUUCAAUGUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-643.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -679.02

Frequency: 0.0000

Diversity: 603.30

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(((((((((.((((....)))).)))))(((.(((...))))))(((..(((.(((..(((((((.((...(((((((((....))))).(((((((.........)))...))))))))...)).).)))))).)))..)))..)))(((........)))((((((.(((((..((((((.(.........).)))))).(((((((.........))))))).......(((((((((....)).))))))).))))).))))))((((((.((((...(((((.(((((((...(......)..))))))).....((((.(((((.......)))))))))..(((.((((((((.....(((((((..(((((..((.........))..))).))..)))((((((((....).)))))))))))....)))).)))))))((((((((((.(((((....((((((((((.((((((((((((...))))))..))))))(((((...((((...(((...(((.(((((.(((......(((((........(((((((((((((...(((.....))).(((((...(((.((((...)))).)))...))))).(((.((((((((((.......((((((((.((.(((.((.((((.......((((((((.((((((.(((..((.(.((((........)))).).))))).))))))..))..)).))))...((((((((....))))))))...)))).)).)))(((((((((...(((((((((.((((((((((((((.........((((..((..(.((((((((...((((((((((......((((......)))).....))))))))))............((((......))))(((((((((........................))))))))).....(((....)))((((((((.(.((.(((((...(((.(.(((........))).).)))...))))).)).).)))))))).))).))))).)..))...))))...))))))............(((.((......)).)))..)))))))).))))))))).))))))))))).))))).)))....)))))..))))).)))))..)))))))).)))))))).....)))))))).))).)))))))...)))))))))))))))...((..((((((.......))))))..)).............)))))...((((......))))..((((((....(((((((...((((..(((((((((((...(((((...))))).....)))))))))))..))))........((((((((((((.............(((..........))).(((((.((((...((((.....).)))...))))...)))))(((.(((((...))))))))......)))))))))).)).)))))))..(((((((.....(((((......)))))........)))))))...(((((((....))...((((((..(((..((...((((.((.((((.(((((....))))).)))))).)))).))..))))))))).......)))))..........)))))).....)))))))))).....)))))....)))).))))))(((((...)))))))))))).......((((....((((......))))....(((((((....))..)))))((((...))))...(((((......)))))...))))...((((((((..........(((...))).........))))))))((((.....))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

....((({(((((.((((....)))).)))))((({,((...}})))).(((((((((.((.(((((((,({.,,((({{((((....)))),,(((((((.........)})...))))))))}},)).},}))))),{,({((,((((.{(({..{|{...|||{((,{||{{(((({({((((.{.........).))))))))))(({({({{{.{{{|,,..,.....,{(((((((,,,{((((((.,((.((..((((((,.{{..{{{{{.{{{...,,,,,,))},,}),.})))))..)).))..)))))))..,|||.|||||,},.}}})))))||||{{,,,.,,|||||,,,.,,{{{{{,,..,((((..((.........))..)))},|{{}|,{{{{{|||,,,,}.})))))}})}))){{{||,.,)))).))}.)))),,)}))))},.,.((((((((((.((((((((((((...)))))}..))))))(((((.,.((({...{{{...{((,(((({,(((..,{.(((({,........,({(((((((({{,..(((.....}}}.{((((...{((,((((...)))).))}...)))})}|{{.((({({((((..|....{((((({(.{{.(((.({.((((,....,.(({{((((.{{{{{{.|||,.{|,|.{(({,|.....,))))||,},})).)))))),,)},.,}.)))}...{{{{{{{{.,,,)))}}}|}...}|}|,|}.|}|(((((((((...{((((((((.(((((((({(((((.,.(((((.{(((((((.((..(((.......))).|)}..)))),}}.}}.))))).}|,|,,,.,,|}||},.,},}}}}}},||{{(((,....,.,|||(({{(({((.........||.........,,}.))))))))).....{{{....}}}((((((((.(.((.(((((...(((.(.(((........))).).)))...))))).)).).))))))))})))}}|{||........})}}....)})))),,..........(((.((......)).)))..)))))))).))))))))}.))))))))),,.))))}.)}}...,))))),,))))).))}}}},,})))))),}}},,,,}.,||,)))))})}.}}}.})))))),,.))))))))))))))),{{{(..{{{{{{....,,.||||}|,,.,.,...|||,,..}})))))))})||.|||,||||,...{{|{||,..||}}|.....((((..(((((((((((...(({{,...,}}}).....)))))))))))..)))).....,..}}.,)))).,|((((((((......((((((((....,{{{{({{{,.((({,..{{((,..,.|,}}},,.)))),..)))})|,|.(((((...)))))}))}},.....)))))))),{((((((..((((((..(({{...(((((......)))))}}}}...(((((.......)))))({,..|,.,.((((((..(({,{,,...((((.{,.((((.(((((....))))).))))},.)))).}}.,))))))))).....(((({,..........}}))}||....}},,}}}.(((((...)))))....{{{,...{,((({{{{.,,)))}}}))},))))))..))))))},,|{{{,.....)))}....(((((((....))..)))))))))))))},,,,{{{((((((.{{{(...........,.,)))).))))}},,,,,,}}|},,|,........{{{{{{....))))}}.....))))..