Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_012398.3
Sequence Length
5069 nt
GC Content
0.6358
GGCGGCGCUUGUUGUUCGGCGGCGGCGGUCGCAGCUCGGGUCCCCCUCGGGCGCCCCCGCCGCCGUCCGCGCGCGGCCAUGGAGCUGGAGGUACCGGACGAGGCGGAGAGCGCUGAGGCGGGGGCCGUGCCCUCGGAGGCGGCGUGGGCGGCAGAGAGCGGGGCGGCGGCAGGUUUGGCUCAGAAGAAGGCGGCCCCAACAGAGGUUCUGUCCAUGACGGCACAGCCGGGCCCUGGCCAUGGGAAGAAGUUGGGCCAUCGAGGUGUGGACGCAUCCGGCGAAACCACCUACAAGAAGACCACCUCCUCCACCCUGAAGGGUGCCAUCCAGCUGGGCAUCGGCUACACCGUGGGCCACCUGAGCUCCAAGCCCGAACGCGACGUGCUCAUGCAGGACUUCUACGUGGUGGAGAGCAUCUUCUUCCCCAGCGAAGGCAGCAACCUCACCCCCGCCCACCACUUCCAGGACUUCCGCUUCAAGACCUAUGCACCUGUCGCCUUCCGCUACUUCCGGGAGCUCUUUGGGAUCCGGCCAGAUGAUUACUUGUACUCCCUGUGCAAUGAGCCGCUGAUCGAGCUGUCCAACCCGGGCGCCAGUGGCUCCCUCUUCUACGUCACCAGCGACGACGAGUUCAUCAUCAAGACCGUCAUGCACAAGGAGGCCGAGUUCCUGCAGAAGCUGCUCCCUGGCUACUACAUGAACCUCAACCAGAACCCGCGGACGCUGCUGCCCAAGUUCUAUGGGCUGUACUGCGUGCAGUCGGGGGGCAAGAACAUCCGCGUCGUGGUCAUGAACAACAUCCUGCCCCGCGUGGUCAAGAUGCACCUCAAGUUCGACCUCAAGGGCUCCACCUACAAGCGGCGCGCCAGCAAGAAGGAGAAGGAGAAGAGCUUCCCCACCUACAAGGACCUGGACUUCAUGCAGGACAUGCCCGAGGGGCUCCUGCUGGACGCCGACACCUUCAGCGCCCUGGUCAAGACGCUGCAGCGGGACUGCCUGGUCCUGGAAAGUUUCAAGAUCAUGGACUACAGCCUGCUGCUGGGCGUGCACAACAUCGACCAGCACGAGCGCGAGCGGCAGGCGCAGGGCGCCCAGAGCACCUCAGAUGAGAAGCGGCCUGUGGGCCAGAAGGCGCUCUACUCCACGGCCAUGGAGUCCAUCCAGGGUGGCGCCGCGCGCGGGGAGGCCAUCGAAUCGGAUGACACGAUGGGCGGGAUCCCCGCUGUGAACGGCCGCGGGGAGCGGCUGCUGCUGCACAUUGGCAUCAUCGACAUCCUGCAGUCCUACAGGUUCAUCAAGAAACUGGAGCACACCUGGAAGGCCCUCGUCCACGAUGGGGACACGGUGUCCGUCCACCGCCCCAGCUUCUAUGCCGAGCGCUUUUUCAAGUUCAUGAGCAACACGGUCUUUCGGAAGAACUCCUCCCUGAAGUCCUCGCCCUCCAAGAAGGGGCGCGGCGGAGCCUUGCUAGCUGUGAAACCGCUGGGGCCCACCGCUGCCUUCUCGGCCAGCCAGAUCCCUAGCGAGCGGGAGGAGGCCCAGUACGACCUGCGGGGGGCCCGCAGCUACCCCACGCUGGAGGACGAAGGCCGGCCCGACCUCCUGCCCUGCACGCCACCUUCUUUCGAAGAAGCCACUACAGCCUCCAUUGCCACGACUCUGUCAUCCACAUCCCUCUCCAUUCCUGAGCGGUCCCCCUCGGAGACGUCGGAGCAGCCGCGGUACAGGCGGCGCACACAGUCGUCUGGACAGGAUGGCAGGCCGCAGGAGGAGCCACCCGCGGAAGAGGAUCUGCAGCAGAUUACAGUGCAGGUGGAGCCUGCGUGCAGCGUGGAGAUUGUGGUCCCCAAAGAGGAGGACGCAGGGGUGGAGGCUUCCCCGGCCGGUGCCUCUGCUGCUGUUGAAGUAGAAACUGCCAGCCAGGCCUCAGACGAGGAGGGCGCACCUGCCAGCCAGGCCUCGGACGAGGAGGACGCGCCCGCCACCGACAUCUACUUUCCCACCGAUGAGAGGAGCUGGGUGUACUCCCCGCUCCACUAUAGCGCCCAGGCCCCCCCGGCCUCCGACGGCGAGAGCGACACAUAAUUUCUAUGCAGCCCCCGACCCAGAGCCGAGCUCCACUUCUGCUCCGGCUGCCCCCGAAGGCGCUGCCCACCCCGCUGAGGCCCAGAGCUCGGGAGAUGCCCGCCUCGCCGCCCCACCGGACCUCGUCCUCCCCCUGCACGGAUGCCGACGGCCGGGCCCCUCCCCGACAAGCCUCCCAGGGCCCCGGCACCCCGGUCGGCAGCCUGCCCCUGUGAGACCCACCCUCCCGAGCGGCCAAUCGCAUUUGAGUCCUUAUUUGGCACAGAGACGGAAGCACGUGUGUGCCGUUUUAGGAAAAGAACAAAAAAGACACAAACAAACCAACCAGAGGGAGAAGAGCCCCUGCCCACUGCACUCUUUGGUUCUCUGCUGUGCCUGCCUGUGUCCUGAGGAAGAAGCCAGGCUGUUCGCGGUGGCCUCUGGGGACCUGAGCCCCGGGGGCCCCAUCGGCCUGCAGAGGGGACGGCUGGGGUCCCGAGCAACUCUGCCUCCAUCCACGUGGGAAGCGGACCCUCCUGCCCUCAGCUUGGGUUUGGGGGCCUCAGUGCAGGACAUCUGGCCUGAACAUCGACUGUGGGGACAGCCCUCGCCCUGCCAAGCACUGCGGCCACUCAGCAGCUAUGUUCCCGCCGCAGUGGGGCCCUGACGCCCACCUCCCAGGUGCCCCUCGAGCAAAAACCUCUGGCGCCUCCAAUCCAGACCCACCACAGCUGGAGGGCCAGGCCUCCUCUUCCCCAGGCUGCCACCCACGCUGGCGGAGCUCAGGGCUGGGGACUUGUCCUUCUCUUCCAACGUAGGCCACUCAGCAACUGGCAUGGAGGGCCCAGGCAACGGAGACGUUUUCUCCAUGGCAGGACAGAGCGGGAGGCCGGGCCUUGGGCCACAGGAGACCAGCUCAGGGCGGAAGGUCAGGCUCCCCGCCCCCUCCACGUGGAGACAUGGCCUAGGGGGCCAGGCCCGGCUCCACAGGAGUCUCCUUCAGGACUGGUGUGGAUGUCCGCCGCCUCUUUCUUGUUUAAGUGAUGUGAUGUCUCCGAGGAGGGGAGAGAAGACUUUGUUUCCGACUCAUCACCCUCCAAGAGGGCAGCGCUCCCAGUGGUGGGACUCAGCCCAGACUGCCCUGGGGCAGCUUCCUGGGCCCGCUGCGCUCAGAGGGUGCUGGUUGGAGGCCAGAGCUCGGCAGAGUCACCCACCCUGCCCUUCCCCAGGACCCCUGAGAGGGGCUUAUUGGUGAUGGCUGUGGGAAUCCCCCACUUCCAAGAUGUGCCCAGGAUGUGAGGAGCUGGAGUGGAAGCUGCACCUUUGGGAAGAAUUCCUCUCCAGACCUGGCAGAGCCUGGUGUGGGGUCUGAGACGGCCGGAGAACCUCCCAGGCAGGGCUCUGUGUUUUGUCUGUUACAACCUCCGUAUGACGCCACGCCACCCGCUGUUCACGUCCCGUCGGCCUCCUGCACAGCCCACACGCUGCGCCCGGAAGGCCCCUGCUGUGGAGAAGCCGGACCCAUCCCCGAGGUCCCCAGCGAGGACACACACUCCACGAGAGCAGCCCCUCCACUCUGCCCAGGAGAGGGGCCGACCCUCCUCGGGAACCGGCCAGCCGCGUGGCUCCCAGCAUCCAUCAGGACAAGCCCACGUGGGGUCCUCCCUGCGUGCUCAGAGGGUCUGUCCAGCCCUGGGAAGCGACCUUGGCCUCAGUUCACAGCCUGGUGCUCAUCUGCUGGCACCGGGCAUCCACCCAUCAGCCCCCGCCCUGUCCCUCCGAAGGACACCCAGCAGGCACCCCCCGGGGAGGCAGGGGCAGAGGUCAGAAGGGGUGUCUGGGACCUGGAUGGCCAGCAGGGACAGGGGCAUUGUCAUCUCAAAGGCCCAACCCCCAGAGGCCACACCAGUCCUCCCAGGGAGUCCUCGAGUCGCCCUGCCCAGAGCCCUGGCACCAGAGACGCCAAGAGCCUGUGGGGUGACUCGGAGCAGCAGGUGUGGCCCCGGGCGGGCGGCACCGCGUCCAGGGCAGCCUCCCUCCGCUGAGUGACACGGGACACCAGUGCCCGGCCGACGCGCCUUUGCAGGAGAAAUGUGCAAACCUCUGUGGAUACCAUUUCAUUUCCAUUCUUGUGUUGUCUCCAAGGCCCUUUUGGAGAUAUACUUGGUGUUGGUUGUGUUUUUUGGUUCCUUUUCAGAGAACUGUAAACCGAGGCUGACGUGCUCCACUGACUGUGCCGAGGGGCGGGGGCAGGAGGACGGCAAGACCUAUUUAUAAUAUUUAGCGAACUCGGUCUCCCUCAGAUCCCCCGCGAGGGAGGCUGCUGGACCCACCCCGCUGUCCCCCAUGAUAGAAGUCUGUAAAUACCUUGGUGACCAAUGCCCACUUCCCCUCCUGGGUCACCUCUGAUGGCUGCUGUCCACUGAGAACGUGGGCAGUGUCCAAAUUCCUGUACUGUAAAGACUAAAAGGCGUUUGCUCUGAGACUGACAAGGCGGAAACUUCCAUGUGUCUCCUGCCAGGCUCUGUCCCCCUACGCCAUCCCGACACGUCCCCGUUCCCCCGAAACCUGGCUCAGUGCAAUACUCCCAUUGCCAUGGGGUCCUUCACCAUGGUACUGUCUCCACAGCCCUCAGUCCCCACCCCAGGAGAGGCGCCUGCCACCUCCUCCUCAUCUCCGGUGGUUCAAUCGCUCCGCCUGUCCCCAACCCAGUCCCAUUUUUAUGGCCAAACUGAUUCUGAAACAAAAUGAAACUGCAAACCUCGUGUGUCUUAACUCCCCCCAGGGAUGCCACUCCAUUCCUCCGCCCCGUGGUCUGGUGCGUGACAAUCCAAAGCGCCGAGACGAGGGUGCUGUGUCCCUCAAACCCAGAGUGGUGGGCGCCUCUGAAACCAUACAGCCACUCCUGGCCCCAAACACUGGUUUGCAUCCCAGGUUCCUCGCCCACCUACCCCCGCCACACCCCGUCUUUUUAGAGAUCUCUCUAAUAAAUCGGGUAAUAAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2190.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2268.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 1181.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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