Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_012445.4

Sequence Length

1579 nt

GC Content

0.6536

ACCCGACCGCUGCCGGCCGCGCUCCCGCUGCUCCUGCCGGGUGAUGGAAAACCCCAGCCCGGCCGCCGCCCUGGGCAAGGCCCUCUGCGCUCUCCUCCUGGCCACUCUCGGCGCCGCCGGCCAGCCUCUUGGGGGAGAGUCCAUCUGUUCCGCCAGAGCCCUGGCCAAAUACAGCAUCACCUUCACGGGCAAGUGGAGCCAGACGGCCUUCCCCAAGCAGUACCCCCUGUUCCGCCCCCCUGCGCAGUGGUCUUCGCUGCUGGGGGCCGCGCAUAGCUCCGACUACAGCAUGUGGAGGAAGAACCAGUACGUCAGUAACGGGCUGCGCGACUUUGCGGAGCGCGGCGAGGCCUGGGCGCUGAUGAAGGAGAUCGAGGCGGCGGGGGAGGCGCUGCAGAGCGUGCACGCGGUGUUUUCGGCGCCCGCCGUCCCCAGCGGCACCGGGCAGACGUCGGCGGAGCUGGAGGUGCAGCGCAGGCACUCGCUGGUCUCGUUUGUGGUGCGCAUCGUGCCCAGCCCCGACUGGUUCGUGGGCGUGGACAGCCUGGACCUGUGCGACGGGGACCGUUGGCGGGAACAGGCGGCGCUGGACCUGUACCCCUACGACGCCGGGACGGACAGCGGCUUCACCUUCUCCUCCCCCAACUUCGCCACCAUCCCGCAGGACACGGUGACCGAGAUAACGUCCUCCUCUCCCAGCCACCCGGCCAACUCCUUCUACUACCCGCGGCUGAAGGCCCUGCCUCCCAUCGCCAGGGUGACACUGGUGCGGCUGCGACAGAGCCCCAGGGCCUUCAUCCCUCCCGCCCCAGUCCUGCCCAGCAGGGACAAUGAGAUUGUAGACAGCGCCUCAGUUCCAGAAACGCCGCUGGACUGCGAGGUCUCCCUGUGGUCGUCCUGGGGACUGUGCGGAGGCCACUGUGGGAGGCUCGGGACCAAGAGCAGGACUCGCUACGUCCGGGUCCAGCCCGCCAACAACGGGAGCCCCUGCCCCGAGCUCGAAGAAGAGGCUGAGUGCGUCCCUGAUAACUGCGUCUAAGACCAGAGCCCCGCAGCCCCUGGGGCCCCCCGGAGCCAUGGGGUGUCGGGGGCUCCUGUGCAGGCUCAUGCUGCAGGCGGCCGAGGGCACAGGGGGUUUCGCGCUGCUCCUGACCGCGGUGAGGCCGCGCCGACCAUCUCUGCACUGAAGGGCCCUCUGGUGGCCGGCACGGGCAUUGGGAAACAGCCUCCUCCUUUCCCAACCUUGCUUCUUAGGGGCCCCCGUGUCCCGUCUGCUCUCAGCCUCCUCCUCCUGCAGGAUAAAGUCAUCCCCAAGGCUCCAGCUACUCUAAAUUAUGUCUCCUUAUAAGUUAUUGCUGCUCCAGGAGAUUGUCCUUCAUCGUCCAGGGGCCUGGCUCCCACGUGGUUGCAGAUACCUCAGACCUGGUGCUCUAGGCUGUGCUGAGCCCACUCUCCCGAGGGCGCAUCCAAGCGGGGGCCACUUGAGAAGUGAAUAAAUGGGGCGGUUUCGGAAGCGUCAGUGUUUCCAUGUUAUGGAUCUCUCUGCGUUUGAAUAAAGACUAUCUCUGUUGCUCACAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-695.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -721.49

Frequency: 0.0000

Diversity: 285.75

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((((..(((.((((((((((.((.((..(.(((((((..(((......)))))))))).)..))..((((.((((((.((((.(((((.(((((((((......)))......((((((.((((.((((((.((.....)).)))).))))))..))))))...................))))..)).))))))))).)))))).))))(((((......)))))..((((((....((((((.....)))))).))))))((((((..((.(((..(((.(.(((((..((.....))..)))))).))).))))))))))).....))))))))))))..))).)))(((.....(((((((.(((.((.((((((((((((((((((.....)))).)))((..((((((((((.(..((((...((((.....(((.((.((.((.((((..(((((((.(((((..(..(((.(((((.((((..(.((((((..((((((((((((((((.....))).)))).))....(((((..(((((.((((((...)))))))))))..))))))))))..))..)))))))..)))).))))))).)..).)).))).)))))))..)))).)).)).)))))......)))).)))).))))).))))))..)).....)))))))).))).)))))....))))))).......)))((.(((((((((((........((((((.......)))))).((((.......)))).))))))))))).))...((((((((.((((((...))))))(((((...)))))((((..(((...(((.((((........))))))))))..))))(((((((((((((((.((((..(((.((.((((((.((((((((((((((.......(((((.(((.(...((.(((((...)))))...))...).)))..))))))))))))..((.((.(((((((((.((((((((((((.(((.(((...)))))).((((((.......)))))).(((((......))))))))))))))).((((((((......))).))))).((.((.((((((.((((((....((((((........)))))).(.(((.((((.(((((...((........)).....))))).)))).))).).((((((((...........))))))))(((((.....))))))))))))))))))).)))).))))))))).)).)).....((((......))))(((.((((((.(..............(((((((....(((....))).....)))))))..............).)))))))))))))))))))))).(((......(((.(((((....))))))))..)))..)))))..)))).)))))).)))...))))))..(((((...)))))......))))))))..))))(((((.(((....(((((...))))).....)))))))).((((.(((...))).)))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((((((,.(((.(((((((((({((.((..{.(((((((..{((.....,)}}))))))).)..))..((((.((((((.((((.(((((.(((((((((......)))......((((((.((({,(({(((.((.....)).)))).))))))..)))))).......,...........))))..)).))))))))).)))))).))))(((((......)))))..((((((....((((((,...,)))))).))))))(((((,.,((.(((..(((.(.(((((..((.....))..)))))).))).))))))))))).....))))))))))))..))).|||({{..,..(((((((.(((.((.((((((((((((((((((.....)))).)))((..(((((((({{{(..((((...((((....,(((.((.((.((.((((..(((((((.(((((..,,.{((.(((((.((((..(.((((((..((((((((((((((((.....))).)))).)),...(((((..(((((.((((((...)))))))))))..)))))}))))..)}..)))))))..)))).))))))).},.).))}})).)))))))..)))).)).)).))))).,....)))).)))).))))).))))))..)).....)))))))).))).)))))....))))))).......}}}((.(((((((((((........((((((,....,.)))))).((((.|....})))).))))))))))).}}...((((((((.((((((...)))))}{(({{...}}))}{(((..(((..,((,{((((........))))))))))..)))|(((((((({((((((.((((..(((.((.{(((((.((((((((((((((.......(((((.(((.(...{{.(((((...)))))...}}...).)))..))))))))))))..((.((.(((((((((.({({{...(((..{{{.|||...)))}}|{((((((..(({(({{{{,{{{|,,)).,)}.,))))).,||)))})||{||(((({,{....))))))((({(,((,((((((.(((((({,,.((({((........)))))).|,{({,{({{.(({{(...{,.,....,})),,,..))))),)))).}||,}.((((((((.,{....,,..))))))))||||},,...,)))))))))))))))))).}))).))))))))).)).)).....((((......))))((,{((((((.(..............(((((((....(((....))).....)))))))...........,,.}.)))))))))))))))))))))}.(((....,.(((.(((((....)))))))).})))..)))))..)))).)))))).},)}..)))))),.(((({...}))))......))))))))..})))(((((.(((.,..(((((...)))))...,.)))))))),{,{{.(((...,,).}})}.........