Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_013258.5

Sequence Length

757 nt

GC Content

0.6407

GGAGCCGACUUCCUCCUGGUCGGCGGCUGCAGCGGGGUGAGCGGCGGCAGCGGCCGGGGAUCCUGGAGCCAUGGGGCGCGCGCGCGACGCCAUCCUGGAUGCGCUGGAGAACCUGACCGCCGAGGAGCUCAAGAAGUUCAAGCUGAAGCUGCUGUCGGUGCCGCUGCGCGAGGGCUACGGGCGCAUCCCGCGGGGCGCGCUGCUGUCCAUGGACGCCUUGGACCUCACCGACAAGCUGGUCAGCUUCUACCUGGAGACCUACGGCGCCGAGCUCACCGCUAACGUGCUGCGCGACAUGGGCCUGCAGGAGAUGGCCGGGCAGCUGCAGGCGGCCACGCACCAGGGCUCUGGAGCCGCGCCAGCUGGGAUCCAGGCCCCUCCUCAGUCGGCAGCCAAGCCAGGCCUGCACUUUAUAGACCAGCACCGGGCUGCGCUUAUCGCGAGGGUCACAAACGUUGAGUGGCUGCUGGAUGCUCUGUACGGGAAGGUCCUGACGGAUGAGCAGUACCAGGCAGUGCGGGCCGAGCCCACCAACCCAAGCAAGAUGCGGAAGCUCUUCAGUUUCACACCAGCCUGGAACUGGACCUGCAAGGACUUGCUCCUCCAGGCCCUAAGGGAGUCCCAGUCCUACCUGGUGGAGGACCUGGAGCGGAGCUGAGGCUCCUUCCCAGCAACACUCCGGUCAGCCCCUGGCAAUCCCACCAAAUCAUCCUGAAUCUGAUCUUUUUAUACACAAUAUACGAAAAGCCAGCUUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-317.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -329.86

Frequency: 0.0000

Diversity: 245.36

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((...((((((((....(((((((((......(.(((((((..((((..(((..((((.(((.((.((((((((..((((((((..(((......(((((((((.(((..(((...(((((((.((((..((.........))..)))).)..)))))).(((...)))))).)).).))))))))).)))..)))))).))..))))))).).))..))))))).)))....((((.....((((.....)))).....)))))))).))))))).)......))))).))))..(((((((.(((((..((((..((((.(((((((((((.(......)))))((((....(((((.(((((((..........))).)))).))).))....))))))))))).........((((..(((((((((((.....((..(((((((.........)))((((((((.((((((((.(((((...))))))))...)))))...))).)))))..((((...))))....))))..)).....)))((((((....))))))....))))))))..))))..))))..)).))..))))).)))))))..))))))))....)))....((((((..((((.((((.(..((((.((......))))))..).)))))))).(((...)))....))))))..(((..(((...((..((....(((.....)))...))..)).)))..))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

{{,(((((((.......)))))))(((((.(.(((((((.(((((,((..(((((({,,.(((((,{((((((,.((((({(((({.{(({{,,..||||||||{{(,{..|{{...((((((((.,(((.{(..((..{((((({||||,|{((((((({((,.{({{||||{|,.|,|||||.|||.},}}})}))))}},.|}))|)|}.},)}.}))}}..))))))),}))||.})))))}..}}}}.))).})).))))),,,|||}}.}}}),..})))))))))..)})}}|,|}.))))),.}||)|}.|),)))}}.(((({{...{{.{{{(,,,.)))}.)),|)}}}.(((((({{(((((..(((((,{{{..,((((((......))}}))).,......,.((((..(((((((((((...,.((..(((((((.........)))((((((((.((((((((.(((((...))))))))},.,})))...)))}})))),.((((...)))).,..))))..)).....)))((((((....))))))....))))))))..)))).,|,}..{(((((.((((({..||...),..))))))...))))))..}})),))))).)))))}..(((((....))))).}))))))..))))))).)))))).,{{{|....,,.}},..,,,,,|{,,..{{{..(((({(,({.....,,}}.)))})).))).,}.,.