Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_013270.5
Sequence Length
1332 nt
GC Content
0.6216
ACUGGGAGCGCCUUCCGGAGAGACGCAGUCGGCUGCCACCCCGGGAUGGGUCGCUGGUGCCAGACCGUCGCGCGCGGGCAGCGCCCCCGGACGUCUGCCCCCUCCCGCGCCGGUGCCCUGCUGCUGCUGCUUCUGUUGCUGAGGUCUGCAGGUUGCUGGGGCGCAGGGGAAGCCCCGGGGGCGCUGUCCACUGCUGAUCCCGCCGACCAGAGCGUCCAGUGUGUCCCCAAGGCCACCUGUCCUUCCAGCCGGCCUCGCCUUCUCUGGCAGACCCCGACCACCCAGACACUGCCCUCGACCACCAUGGAGACCCAAUUCCCAGUUUCUGAAGGCAAAGUCGACCCAUACCGCUCCUGUGGCUUUUCCUACGAGCAGGACCCCACCCUCAGGGACCCAGAAGCCGUGGCUCGGCGGUGGCCCUGGAUGGUCAGCGUGCGGGCCAAUGGCACACACAUCUGUGCCGGCACCAUCAUUGCCUCCCAGUGGGUGCUGACUGUGGCCCACUGCCUGAUCUGGCGUGAUGUUAUCUACUCAGUGAGGGUGGGGAGUCCGUGGAUUGACCAGAUGACGCAGACCGCCUCCGAUGUCCCGGUGCUCCAGGUCAUCAUGCAUAGCAGGUACCGGGCCCAGCGGUUCUGGUCCUGGGUGGGCCAGGCCAACGACAUCGGCCUCCUCAAGCUCAAGCAGGAACUCAAGUACAGCAAUUACGUGCGGCCCAUCUGCCUGCCUGGCACGGACUAUGUGUUGAAGGACCAUUCCCGCUGCACUGUGACGGGCUGGGGACUUUCCAAGGCUGACGGCAUGUGGCCUCAGUUCCGGACCAUUCAGGAGAAGGAAGUCAUCAUCCUGAACAACAAAGAGUGUGACAAUUUCUACCACAACUUCACCAAAAUCCCCACUCUGGUUCAGAUCAUCAAGUCCCAGAUGAUGUGUGCGGAGGACACCCACAGGGAGAAGUUCUGCUAUGAGCUAACUGGAGAGCCCUUGGUCUGCUCCAUGGAGGGCACGUGGUACCUGGUGGGAUUGGUGAGCUGGGGUGCAGGCUGCCAGAAGAGCGAGGCCCCACCCAUCUACCUACAGGUCUCCUCCUACCAACACUGGAUCUGGGACUGCCUCAACGGGCAGGCCCUGGCCCUGCCAGCCCCAUCCAGGACCCUGCUCCUGGCACUCCCACUGCCCCUCAGCCUCCUUGCUGCCCUCUGACUCUGUGUGCCCUCCCUCACUUGUGGGCCCCCCUUGCCUCCGUGCCCAGGUUGCUGUGGGUGCAGCUGUCACAGCCCUGAGAGUCAGGGUGGAGAUGAGGUGCUCAAUUAAACAUUACUGUUUUCCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-560.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -584.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 208.70
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((.(((....((((((..((((....))))....((.(((((((..(((((((((((...((((.(((.(((((((((((((((..(.((..(((((..(((.((((((.(((((.(((...((.......))...)))..))))).)))))).))).))))).))).)))))))))))))))...........)))))))((((...((((((((.......(((..((((((..........((((((((((..((((((((((((((((((((((..(((((((((......((((((((..........(((...)))..(((...)))........((((((..((((......)))))))).))..(((((((...((((((.((((.(((((((((((((.(((((......))))).))).)))))))..((((((......))))))((((((..(((((.....)))))))))))..(((.(((((..((((((..(((((((((((....((((((.....))))))((((((((.((((.....((.((........)).)).....))))))).)))))....)))))))).)))))))))..)))))))))))))))))))))))))))).((((((((.(.....(((((((...(((((((((((((..((..((((.........))))(((......))).(((((.(((((.....(((..(((......))).)))....))))).)))))((((((...(((..((((((.(((.....)))))))))..)))...(((((((((.(.....).)).))))))).......(((((((...........))).))))........))))))(((((...((.((((((........)))))).))..)))))....(((...))).))..))))))).))))))....)))).)))))))))))))))))))))))))).)))........))))..))))....)))))).....)))))))))).))))))))..............))))))..))).......))))))))))))((.((((((....)))))).)))))))...))))))))))))).))...)).)))).))).))))))..((.(((((..((((.....(((((..((((((....((((............)))).......((......)).((((..(((((((.........)))))))))))))))))))))))))).))))).))......(((((....)))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((.(((...,(({(,(..((((....))))...,||,(((((((..(((((((((((...((((,(((.(((((((((((((((..(.((..(((((..(((.((((({.(((((.(((.{.((.......)).,.)))..))))).}))))).))).))))).))}.))))))))))))))).},)).}},..,||},,|((({..,((((((((.......(((..((((((..........(((((((({((,(((((((((((((({(((((((..(((((((((,.....{(((((((.......,,{{.({{,,,|.{((.{{{{{{,.......,,{,....|}))}}}}.})).})))).)),.(((((((...(((({(((({{((((((((((((((.(((((......))))).))).)))))))..((((((......))))))((((((..(((((.....)))))))))))..(((.(((((..((((((..,{,((((((((....((((((.....))))))((((((((.((((.....,{..(,.(,....,)},)}....))))))).)))))....)))))))).,}}))))))..)))))))))))))))))))))))))))).((((((((.{.....(((((((...((((((((((((({(({..,,,{.{{.....,|}))(((......|||.{{{{|,{((((....,({({,,..{||...,))).}),))))}))).})))){(((((...(((..((((((.(((.....)))))))))..)))...{((((((((.{,....).)).))))))}.......(((((((...........)))},)))........)))))}(((((.{.((.((((((........)))))).)).})))))....(((...))).),,)))))))).))))))....)))).)))})))))))))))))))))))))).)))....,...)))}..})))....)))))).....)))))))),)}))))))))..............))))))..))).......))))))))))))|{.((((((....)))))).}})))))...))))))))))))),||,..,,.}))),))).))))))..((.(((((..((((.....((((,.{((((((.,(,((((.,....,...,.||||.......,,....|.}}|||||..{,{{|||}}}}.{{{{.,,)))),,,,))))))))))))))).))))).))......{((((....))))}......
Back