Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_013271.5

Sequence Length

1025 nt

GC Content

0.7424

GCAGCCUCGCCAGCUCGCCCCGGCACUGCGCACUUGCCAGCCAGUCCGCCCGUCCGGAGCCCGGCUCGCUGGGGCAGCAUGGCGGGGUCGCCGCUGCUCUGGGGGCCGCGGGCCGGGGGCGUCGGCCUUUUGGUGCUGCUGCUGCUCGGCCUGUUUCGGCCGCCCCCCGCGCUCUGCGCGCGGCCGGUAAAGGAGCCCCGCGGCCUAAGCGCAGCGUCUCCGCCCUUGGCUGAGACUGGCGCUCCUCGCCGCUUCCGGCGGUCAGUGCCCCGAGGUGAGGCGGCGGGGGCGGUGCAGGAGCUGGCGCGGGCGCUGGCGCAUCUGCUGGAGGCCGAACGUCAGGAGCGGGCGCGGGCCGAGGCGCAGGAGGCUGAGGAUCAGCAGGCGCGCGUCCUGGCGCAGCUGCUGCGCGUCUGGGGCGCCCCCCGCAACUCUGAUCCGGCUCUGGGCCUGGACGACGACCCCGACGCGCCUGCAGCGCAGCUCGCUCGCGCUCUGCUCCGCGCCCGCCUUGACCCUGCCGCCCUAGCAGCCCAGCUUGUCCCCGCGCCCGUCCCCGCCGCGGCGCUCCGACCCCGGCCCCCGGUCUACGACGACGGCCCCGCGGGCCCGGAUGCUGAGGAGGCAGGCGACGAGACACCCGACGUGGACCCCGAGCUGUUGAGGUACUUGCUGGGACGGAUUCUUGCGGGAAGCGCGGACUCCGAGGGGGUGGCAGCCCCGCGCCGCCUCCGCCGUGCCGCCGACCACGAUGUGGGCUCUGAGCUGCCCCCUGAGGGCGUGCUGGGGGCGCUGCUGCGUGUGAAACGCCUAGAGACCCCGGCGCCCCAGGUGCCUGCACGCCGCCUCUUGCCACCCUGAGCACUGCCCGGAUCCCGUGCACCCUGGGACCCAGAAGUGCCCCCGCCAUCCCGCCACCAGGACUGCUCCCCGCCAGCACGUCCAGAGCAACUUACCCCGGCCAGCCAGCCCUCUCACCCGAGGAUCCCUACCCCCUGGCCCCACAAUAAACAUGAUCUGAAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-531.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -547.69

Frequency: 0.0000

Diversity: 192.50

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((((((((((((.((((((((.(((.((....)))))..((((.((((....)).))..)))).))))))))))).))))))))).))........(((((((((.(((..((((((.((((......((.(((((((..((((((((......))))......(((((...))))).((((((....(((((.(((((((......(((.(((((((((((((.(((..(...((((((..((((((....))))))..)))))).)..))).))).)))))))))).))).((.((.((((((((.((.(((....(((((((.(((.(...((((((.((((((((((((.((((((.((..(((((.(.....((((((((((((((.(((.(((..((((.(.(((.(((..((.....))..))).)))))))).))).))).))))).((....)).)))))))))..).)))))..))))).))).)).))))))))))))))))....).))))))))))....))).)).)))))))).)).)).))))))).)))))....))))))...((((((((.((..(((((...)))))((..((((.....))))..))..........)).))))))))..)))).((((.((((.(((((.(((((....((.(((((.(((((((.(..((.(((((((((.((...)))))))))))..)).)))))((....))....((((........))))((((..((((((.((((((((((.(((.((......((((..........)))).((((((.(..(((((((((.....(((((...)).))).....)))....))))))))))))))).))).)))))))))).))...))))..))))...))).))))).))..)))))..)))))..)))).))))))).))))))......)))).).)))))..))).))))))).))...................

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.((((((((((((.((((((((.{{(.((....}},||||,||{{{......|}|},,,.)))}.))))))))))).))))))))).)).,,{{{{,{((((((((.(((.{(((((({((((..,,,,({,(({{(({{{,((((({.{,,,{(((((((,...,((((...))))))|||||{....(((((.(((((((......(((.(((((((((((((.(((..(...((((((..((((((....))))))..)))))).)..))).))).)))))))))).))).((.{(.((((((((.((.(((....(((((((.(((.(...((((((.((((((((((((.(((((((((..(((((.{.....((((((((((((((.(((.(((..((((.{.(((.((({.(,....,))..)}}.)))})))).))).))).))))).{{....}}.)))))))))..).)))))..)),)))))).)).))))))))))))))))....).))))))))))....))}.)).)))))))).)),)}.))))))).)))))....|}||||{,{(({{..,{..,.)|{{{|,}.)))))}))..))}),),,)))}))),.))))),,.}))}}))}}.}}))),||{((((.((((.(((((.(((((....((.(((((.(((((((.(..,{.(((((((((.((...))))))))))).,,).))))){,....,,....((((........))))((((..((((((.((((((((((.(((.({......((((..,....,..)))).((((((.(..(((((((((.....((((,...,).))).....)))....))))))))))))))).))).)))))))))).))...))))..))))...))).))))).))..)))))..)))))..)))).)))}}))).,,,||{{....,,))}).,,,,,..))).))))))).}}.............,.})).