Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_013312.3

Sequence Length

2542 nt

GC Content

0.6133

AGGCCGAGCGGGAGGUCGGGGCUGCGGGCGCUCGCUGGUGGCGGACCCGGAGGCUGCUGCGGCGCCGGGGCUCCGUGGCCUGGAUUGAAUCCGAUCGGGAGCCAUGAGCGUGGACAAAGCUGAGCUAUGCGGGUCUCUGCUCACCUGGUUACAGACGUUCCACGUUCCGUCUCCCUGUGCCAGCCCUCAGGACCUGAGCAGCGGCCUUGCCGUAGCCUAUGUGCUGAACCAGAUAGACCCCUCCUGGUUCAACGAGGCAUGGCUCCAGGGCAUCUCGGAAGAUCCAGGUCCCAACUGGAAGCUGAAGGUCAGCAAUCUGAAGAUGGUCUUACGGAGCCUAGUAGAGUACUCCCAGGAUGUCCUGGCGCAUCCUGUGUCAGAAGAGCAUCUCCCAGAUGUGAGCCUCAUUGGAGAGUUCUCAGACCCGGCAGAGCUCGGCAAGCUGCUUCAGCUGGUGCUGGGCUGUGCCAUCAGUUGCGAGAAAAAGCAGGACCACAUCCAGAGAAUCAUGACGCUGGAAGAAUCGGUUCAGCAUGUGGUGAUGGAAGCCAUCCAAGAGCUCAUGACCAAAGACACUCCUGACUCCCUGUCACCAGAGACGUAUGGCAACUUUGACAGCCAGUCCCGCAGGUACUAUUUCCUAAGUGAGGAGGCUGAGGAGGGGGACGAAUUACAGCAGCGCUGUCUGGAUCUGGAGCGGCAGCUGAUGCUCCUGUCAGAGGAGAAGCAGAGCCUGGCGCAAGAGAAUGCAGGGCUGCGGGAGCGGAUGGGCCGGCCUGAAGGCGAGGGUACCCCAGGUCUCACUGCCAAGAAGCUGCUGCUGCUGCAAUCCCAGCUGGAGCAGUUGCAGGAGGAGAACUUCAGGCUGGAGAGUGGCAGGGAGGAUGAGCGCCUGCGCUGUGCCGAGCUGGAGAGGGAGGUUGCGGAGCUGCAGCACCGGAACCAGGCGCUGACUAGCCUGGCCCAGGAGGCACAGGCCCUGAAGGAUGAGAUGGAUGAACUACGGCAGUCUUCGGAGCGUGCUGGGCAGCUGGAGGCCACGCUGACCAGUUGCCGGCGCCGCUUGGGCGAGCUGAGGGAGCUGCGGCGGCAGGUGCGGCAGCUGGAGGAACGCAACGCCGGCCACGCCGAGCGCACGCGACAACUGGAGGAUGAGCUACGCCGAGCGGGCUCCCUGCGCGCCCAGCUGGAGGCGCAGCGGCGGCAGGUGCAGGAACUGCAGGGCCAGCGGCAGGAGGAGGCCAUGAAGGCCGAGAAAUGGCUAUUUGAAUGCCGCAACCUGGAGGAAAAGUAUGAGUCGGUGACAAAGGAGAAGGAGCGGCUGUUGGCGGAGCGGGACUCCUUGCGGGAGGCCAAUGAGGAGCUGCGCUGCGCCCAGCUGCAGCCGCGGGGGUUGACCCAGGCCGAUCCCUCACUGGAUCCCACCUCCACACCCGUGGAUAACUUAGCCGCAGAGAUCCUGCCUGCGGAGCUCAGGGAGACGCUCCUGCGGCUUCAGCUGGAGAACAAGCGGCUGUGCAGGCAGGAGGCGGCCGACCGGGAGCGGCAGGAGGAGCUGCAGCGCCACCUGGAGGAUGCCAACCGCGCGCGCCACGGGUUGGAGACGCAGCACCGGCUGAACCAGCAGCAGCUAUCCGAGCUGCGGGCCCAGGUGGAGGACCUGCAGAAAGCCCUGCAGGAGCAGGGGGGCAAGACUGAAGAUGCCAUUUCCAUUUUGCUGAAAAGGAAGCUGGAGGAACAUUUGCAGAAGCUUCAUGAGGCAGAUCUGGAGUUGCAGAGGAAGCGGGAGUACAUUGAGGAGCUGGAGCCACCCACUGACAGCAGCACAGCCCGGCGGAUCGAGGAGCUGCAGCAUAACUUGCAGAAGAAGGACGCGGACUUGCGGGCCAUGGAGGAGCGAUACCGCCGCUACGUGGACAAGGCCCGCAUGGUCAUGCAGACCAUGGAACCCAAGCAGCGGCCAGCUGCGGGGGCACCUCCAGAACUCCAUUCCCUGAGGACACAGCUCCGAGAACGGGAUGUCCGCAUCCGACACCUGGAGAUGGACUUUGAGAAAAGCCGAAGUCAGCGGGAGCAGGAAGAAAAGCUGCUCAUCAGUGCCUGGUAUAAUAUGGGCAUGGCCUUGCAGCAGCGAGCUGGGGAGGAGCGGGCGCCUGCCCAUGCCCAGUCAUUCCUGGCACAGCAGCGGCUGGCAACCAAUUCUCGCCGUGGACCCUUGGGACGCCUGGCAUCUCUGAACCUUCGCCCCACUGACAAGCACUGACAGACCUCACAAUCAAGCCAGCCUGGGCUCCACCCACCCUGGCUUCCUCCAGCUCACAUGGCGCCCAGCACUGGGCUUCAGCCAGGUGCUCGAGAGCUUUGAGGCCAUGAUCUCUGCUCUUCCCUCUCCCAGAUUGGUGGGGAGGGAGGGCGGGAGGUAGAUAUAGGCCUGUUCUUUUUAGCAAUGUGAUUCUUGUUGUUGAUUCUCUCUCUGGAGUUCAUGUGCUGCCUCAGGAGACUCUGAUUUUAUAUUUGAGAAAAAUAAAGGCGUUCAAUCUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1119.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1158.89

Frequency: 0.0000

Diversity: 586.13

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((((.(((((..((((((((((((..(((.(((.((((((..((((((.(((((.((((((((((.((((((((..((((((.........((((((...(((((((((.....((((((((.(.((((....)))).).))))).)))....))))))))).).)))))..(((((((((((((...)))))..(((((...))))).((((.(((..((((((((..((....)).)))))))))))))))..(((((((((.(((((((((...(((((.......))))).(((((...)))))..)))).))))).)))...)))))).......((((((((.((((((.((((((((...))))))))....)))))).((((((.(..(((((((.((((.((((((..(((.(((..(((((((..((((((((((((((((((((.(((.(((((.(((((((........((.(((((...(((((.(........).)))))......))))).))...((((.(((..((((......).)))))).))))......(((((..((((((((((((((((..((...))..))))).((.((..((((((((((.((.((((((.(((......))).)))))).)))).....(((((...)))))(((.((((...(((.((((((...(((((.....)))))...)))...))).)))...)).)).)))..))))))))..)).))..(((((((((((((..(((...)))..))(((.((((.....(((((((.(.((((......)))).).)))))))))))))).....)))))))))))...))))))))))).....((((((.(((((((((...((((....((..((((((....)))))).))....((((((........)))))).))))..)))))))((.(((((((.((...(((.....)))...)).))))))).))(((((((.(((((((.(((...)))..)))))))))))))).(((.(((((.((..((((((((((..((((.....((((.(((((.(........).)))))...))))(((.((..(..(....)..)..)).)))..)))).)).)))))))))).)))))))))).))))))..((.((((..((((.....((.((((....((((((...(((((((((............)))))).)))...))))))..)))).)).....))))..)))).))....))))).....))))))).))))).)))((((.(((.((.((((((((.....(..(((((((((....)))).)))))..)(((......))).))))..)))).))..)))))))..(((((.((((((((........(((((.....((((((((((((((((..(((((...)))))..))))))(((((.........)))))..))))))))))((((.((..(((((.(((((((......))))..)))..))))).)).))))....))).)).)))))))))))))...)))))))))))))......)))))))..)))))))....)))..))).))))))(((((((...((((((....)))))).((((..........))))..(((((.(((.((....)).))).))))).....)))))))...)))))))))))).)))))).(((........))))))))))).((((...(((((.((......(((....)))....)))))))...))))...(((((.(((.....))).......(((.((((((..(((((((.((...(((((.......)))).).....)).)))))))((((((.....))))))((..(((..(((((.....)))))..)))..))........(((.(((.(.(((.......))).).))).)))..)))))).)))..(..((((...(((.((((....)))))))...))))..)((((((.........))))))....(((((.((.......(((((((((....((((..((..(((.......)))..))..)))))))))))))......)).))))).)))))))))))))..))))))..))))))))))))..)).)))))))))))))))....))))))))).)))...)).))).))).))))......(((((((..((((.....))))..)))))))))))).))))....((((((.((((((.(((....))).)))))).((((((....((((((((((((((((.((((((((.((((......)))))))))))))).))))))...))).))))))))))).(((((((((.......))))))))).((((.((..(((((......))).))..))))))(((.(((.....))).))).........))))))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....((((.(((((..((((((((((((..(((.(((.((((((..((((((,(((((,(({({{((((,((((((((,,{(((((....,,,,,(((((|,..(((((((((.....((((((((.(.((((....)))).).))))).)))....))))))))).}.)))))..(((((((((((({...)))})..(((((...))))).((((.(((..((((((((..,{....,}.)))))))))))))))..(((((((((.(((((((((...(((((.......))))).(((((...)))))..))))}})))).)))...)))))).......((((((((.({,{{({((((((({...})))))))....{||,||,((((((.(..((((((,{((((.((((((..(((.(((.,(((((((..((((((((((((((((((((,(((.(((((.(((((((........((.(((((.,.(((((.(........).))))).,....))))).))...((((.(((,.{(((......).)))))).)))).......((((..((((.(((((((.((..(((((.,{..((((..(({((..(((((((((......,,|||..||}.}}}})))}.})))).,}.}......,,(((((,((({,{,..(((...(((.((((((...(((((.....)))))...))}.,.))).))).,,),..,)))).)))))||||.{||.,|{{{{{(({{{.,{{{..{{{...))).,})))}.{{||,....{.(((((((((((((..{{((((((((.((.{,{(((((.,.....(((({{,,({..,.{{|(((((,.|......}.))))).(((((((...((((....((..((((({....}))))).))....((((((........)))))),))))..)))))))((.(((((({.((...(((.....)))...)).})))))).)){((((,(((((((((.(((...)))..)))))))))}))}|{{({{{{{({{(((.,.,.{||({(.,{|||.},)}),}))))}||.|...,||..|{|||||...)))},)))}}},)..},.)))}}}..,{{|||.|||,,.))))))))))))))))))))))))).}}.))))))))))))).}||}}...((.((((....((((((..,(({((((((............)))))).)))...))))))..)))).)).....)))))..)))))))))..)))).))))))))))).))))).)))((((.(((.((.((((((((.....{..(((((((((....)))).))))),.){((,.....))).))))..)))).))..)))))))..(((((.((((((((........(((((.....((((((((((((((((,.(((((...})))}},)})))|{((((.........))))),}))))))))))((({.((..(((((.(((((((......))))..)))..))))).)).})))....))).)).))))))))))))).,.)))))))))))))......)))))))..))))))).,..)))..))).))))))(((((((...((((((....)))))).((((..........))))..(((((.(((.((....)).))).))))),....)))))))...)))))))))))}.))))))}}.}}}....,..}})))))))).}}}|}}.||||}}||}.|||.|||.|,|)})|...|{(|{{{{..|||{||.|((((.,,,....{|,|{{..{..(((.((((((.{(((((((.((..{,{(((.......)))).).,...)).)))))))|(((((.....)))))|((,.(((..(((((.....)))))..)))..,}}}},....{{{.{{(.{.{{(,......}})||.},,.})),.)))))).)))..}..})),}}.,|(((((((.......,))))))).|{||{({,,(,......,((((((.....(((((.((.,.....(((((((((,,,,{((({.{{..|||,..,,,,,||,{,}..)))))))))))))......)).))))).)})))))))}}),.,)}}))),,))}))))},))))))..)))),)))}})))))....))))))))).)))...)).))).))).))))......(((((((..((((.....))))..)))))))))))).))))....((((((((((((((((((((((.,{{|||||.((((((....((((((({(((((((({((((((((.((((......))))))))))))))))}))))...)}}.))))))))))).,,||||{{,.{,.,{.,,,,},,)).}}|}},.)))))))))).))))))..{(((|....|)))},,,,,,,{{|,,,..,,,,,..))))},,.......