Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_013430.3
Sequence Length
2354 nt
GC Content
0.6189
GCCUGGAUUCUCCCAGAGAUUGCCUGGAACACCAGCUCGGGUCCUCGCACACCAUCCUGCGGGUGCAGCCCAGAACUGUCUUCUGAGGAAGAGGUGCUCUCCUGGGCCCCCACUGUCCCCAGGCCUCAGCAAGGCAAGUGAGGUGCUGCCGUCAUCCAGGCUGGACAGUUCAGUGAUUUGCCUGAGGCCCCACAGCAGAGUUCAACUGGAGACAGAGAAACCAGCUAGAGGCAGAGGGAGGUAACACGGAGUCCCCCAGAAAGGUCUGGGCUGCGCGUGCUUCAGGUAACCUCCCUUGACCUUCAGGAGAACGAGAAGGCUGCCUGAUCAGAGAGUCCCUGAAGAAGAUUCUGUGGCUACAGGCUUCAGCAGAGUGUGAGGGAGACCCCGGUUAUUUCCUCAGCUAUUUCCACCAAAUCCUCCUGUCUUUCGUGGCCAACACCCCAGGCAAGGCUUGGGGCCCCCGUCUGCUGCUGGACGCAGAGCCAUGAAGAAGAAGUUAGUGGUGCUGGGCCUGCUGGCCGUGGUCCUGGUGCUGGUCAUUGUCGGCCUCUGUCUCUGGCUGCCCUCAGCCUCCAAGGAACCUGACAACCAUGUGUACACCAGGGCUGCCGUGGCCGCGGAUGCCAAGCAGUGCUCGAAGAUUGGGAGGGAUGCACUGCGGGACGGUGGCUCUGCGGUGGAUGCAGCCAUUGCAGCCCUGUUGUGUGUGGGGCUCAUGAAUGCCCACAGCAUGGGCAUCGGGGGUGGCCUCUUCCUCACCAUCUACAACAGCACCACACGAAAAGCUGAGGUCAUCAACGCCCGCGAGGUGGCCCCCAGGCUGGCCUUUGCCACCAUGUUCAACAGCUCGGAGCAGUCCCAGAAGGGGGGGCUGUCGGUGGCGGUGCCUGGGGAGAUCCGAGGCUAUGAGCUGGCACACCAGCGGCAUGGGCGGCUGCCCUGGGCUCGCCUCUUCCAGCCCAGCAUCCAGCUGGCCCGCCAGGGCUUCCCCGUGGGCAAGGGCUUGGCGGCAGCCCUGGAAAACAAGCGGACCGUCAUCGAGCAGCAGCCUGUCUUGUGUGAGGUGUUCUGCCGGGAUAGAAAGGUGCUUCGGGAGGGGGAGAGACUGACCCUGCCGCAGCUGGCUGACACCUACGAGACGCUGGCCAUCGAGGGUGCCCAGGCCUUCUACAACGGCAGCCUCACGGCCCAGAUUGUGAAGGACAUCCAGGCGGCCGGGGGCAUUGUGACAGCUGAGGACCUGAACAACUACCGUGCUGAGCUGAUCGAGCACCCGCUGAACAUCAGCCUGGGAGACGUGGUGCUGUACAUGCCCAGUGCGCCGCUCAGCGGGCCCGUGCUGGCCCUCAUCCUCAACAUCCUCAAAGGGUACAACUUCUCCCGGGAGAGCGUGGAGAGCCCCGAGCAGAAGGGCCUGACGUACCACCGCAUCGUAGAGGCUUUCCGGUUUGCCUACGCCAAGAGGACCCUGCUUGGGGACCCCAAGUUUGUGGAUGUGACUGAGGUGGUCCGCAACAUGACCUCCGAGUUCUUCGCUGCCCAGCUCCGGGCCCAGAUCUCUGACGACACCACUCACCCGAUCUCCUACUACAAGCCCGAGUUCUACACGCCGGAUGACGGGGGCACUGCUCACCUGUCUGUCGUCGCAGAGGACGGCAGUGCUGUGUCCGCCACCAGCACCAUCAACCUCUACUUUGGCUCCAAGGUCCGCUCCCCGGUCAGCGGGAUCCUGUUCAAUAAUGAAAUGGACGACUUCAGCUCUCCCAGCAUCACCAACGAGUUUGGGGUACCCCCCUCACCUGCCAAUUUCAUCCAGCCAGGGAAGCAGCCGCUCUCGUCCAUGUGCCCGACGAUCAUGGUGGGCCAGGACGGCCAGGUCCGGAUGGUGGUGGGAGCUGCUGGGGGCACACAGAUCACCACGGCCACUGCACUGGCCAUCAUCUACAACCUCUGGUUCGGCUAUGACGUGAAGCGGGCCGUGGAGGAGCCCCGGCUGCACAACCAGCUUCUGCCCAACGUCACGACAGUGGAGAGAAACAUUGACCAGGCAGUGACUGCAGCCCUGGAGACCCGGCACCAUCACACCCAGAUCGCGUCCACCUUCAUCGCUGUGGUGCAAGCCAUCGUCCGCACGGCUGGUGGCUGGGCAGCUGCCUCGGACUCCAGGAAAGGCGGGGAGCCUGCCGGCUACUGAGUGCUCCAGGAGGACAAGGCUGACAAGCAAUCCAGGGACAAGAUACUCACCAGGACCAGGAAGGGGACUCUGGGGGACCGGCUUCCCCUGUGAGCAGCAGAGCAGCACAAUAAAUGAGGCCACUGUGCCAGGCUCCAGGUGGCCUCCCUGGCCUGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1014.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1049.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 565.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((......(((((.((..((((....((((.((((((((.(((((......(((.((((((((((((.((...(((((.((....((.(((((.....((((((.(((((....((((((((((((...(.((((.(((((((........))).)).)).)))).)..)))).))))))))....(((.(.(((...(((....)))...)))).)))...))))).))).))).....)))))))))))))).)))))))))))))).))).(((((((.(((..((((..(((...)))..)))).))).)))))))((((.......)))).......(((((((((...))))...)))))))))).))).))))).))))..))))...)).))))).......((((((((.(.(((((((((....((((((((...)))))))).((((((((((((((((..(((((((......(((...(((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((((..(((......(((((....))))).....)))..)))))))))).)....)))))))))))).((((((..(((.((((((((((((((.............)).)))))))(((..(((((..(((.((((((((((((....((((((((((((((((((((((((....(((((((.....))))))).((((((.(((((.............((..((((............))))..)).............))))).)))))).((.((((....)))))).(((((.........))))).((((....))))(((((((((((((.((((.(...(((((((.(.((((..(((((((.....(((((((.((((((((.((.((((((((((.((((((((.(((((.....))))).(((((((((((...((((.(((....)))..)))).)))))))........)))).......((((....((((..(((((((...(((((((..((((............(((.(((.((((..((...))..)))).))).))))))).))))))))))))))))))....))))((((((.(..(((.........))).(((((.((((((.(..(((.....)))..)..).)))))))))).....(((((((.((.((.............)).)).))))).))).))))))(((((...))))))))))))).))))..........)))))).))))))))))))(((((......))))).........((((((.((((((((.....((((((((......)).))))))((((((((((.(((((((.(((...........)))..)))))))..(((((..((......)).)))))))))))))))))))....)))).))))))((((..((.((((........)))).)).))))...))))).)))))))..))))).)))))))...).)))).).)).)))))...........)))))))))))))))))).....)))))))...))))........((((((((......)))))))).))))))))))))..)))..)))))..))).....))))))))..)).)))).....)))))))))).(((..((((....))))..))).............))))))))))).)))...)))((((....))))((.((((.(...........).)))))).(((((((..(((.((((((.((((((((.((((((((((((((((.((((((...(((.((((.((((((.(((.((......))))).)).)))).)))))))..)))))).))...........))))))).))))))))))....))))))))))).)))...))))))).......)).))))))))..(((((..(..(((.((......))..))).)..))))).)))))(((((((..(((((((((.((..........(((...........))))))))))).((((((((.((....)).))))))))((((....))))))).)))))))..))))))))........)))))).))).)...))))))))....(((....)))))))))))..............((((.(((((.((((((..((((....))))..))))))(((.((......))..))).......(((((((((..((...))....))))))))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((({{,,,.(|{{,.{{||((,...,,|{{{.((((((((.(((((......(((.((((((((((({.((...(((((.((....((.(((((,.{{.((((((.(((((....((((((((((((.{,(.((((.(((((((........))).)).)).)))).),.))))}})))))))....(((.(.{(({..(((....))).},)}}).))).}.))))).))).)))..}}.)))))))))))))),)})))))))))))).))).((((({,.,{{,,|{{{,,(({{.||,}..}},),))).||||||,(((,{({{{{.,},,....}}}|||,|}|,,.}}))),.,.}},}.))))).))).))))).||},...,}},,,||,.,,,,.......((((((((.{.(((((((((....{(((((((...)))))))|,((((((((((((({((..(((((((..,,..{,,...(((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..,((((((..(((......(((((....))))).....)))..)))))))}}).}....)))))))))))}.((((((..(((.(((({(((((((((.............)).)))))))(((..(((((..(((.((((((((((({,{{{((,(((((((,(((((((((((((..{.{((((((.....)))))))}((((((.(((((.............,{..((((............)))).,)),......,,,.,.))))).)))))).((,{(((....}}}}}}.,{{,,..,,{{,.{||||,.{(((....))))((((((,,((,(({((,({({{{((((,,({(.{,(({{(,(((((....}||||,,|}|||,||||,,|}||||||||||},||,,|||}||{||.,,,,))))}||{|{|,|||||.|}{||}}|||..{{|||||||||,}}|}}||}.......||||.||||,.((((....((((..(((((((...{((((((,.((((............(((.(((.((((..((...))..)))).))).))))))).))))))))))))))))))....))))((((((.,..(((.........))).(((((.((((({.{..(((.....))),,}..).)))))))))).....(((((((.((.((.............)).)).))))).))).))))))(((((...))))),|||||||,||||{{.,,,.,..}}}}}),))}}}}}}}}))((((({{.{{{|||||{{{...((,((((((.((((((((.....{(((((((......)).)))))}((((((((((.,((((((.(((...........)))..)))))}}.,{{(,,,{{{..,,..,,,))}))))))))))))))))....)))).))))))}}.))))).((((........)))).,|,{|,...,))},),))))),,,}))))).}}}},)),,.}.}}}).),)}}}})}),,........,)))))))))))))))))).,{,,||||||{{{.,,)},,.}},,}|{||||||}))).)).),)))))))))))))))))..)))..)))))..))}.....))))))))..)).))))....,)))))))))).(((..((((....))))..))).............))))))))))).)))...,,,((((....))))||.((((,,...........).))))}}.(((((((..(((.((((((.((((((((.((((((((((((((((.((((((...(((.((((.((((((.(((.((......))))).)).)))).)))))))..)))))).))...........))))))),})))))))))....))))))))))).)))...))))))).......))}}))))))}..(((((..{..(((.{{......))..)}}.}..))))).)))))(((((((..((((((((({{,......,...(((...........)))}))))))).((((((((.((....)).))))))))((((....))))))).)))))))..)))))))).},..,..)))))).))).}...))))))))...))}}),..})}))))))))..............((((.(((((.((((((..((((....))))..))))))(((.((......))..))).......(((((((((,.((...))....))))))))))))))))))..
Back