Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_013958.4

Sequence Length

1599 nt

GC Content

0.5078

AAACUUGUUGGAACUCCGGGCUCGCGCGGAGGCCAGGAGCUGAGCGGCGGCGGCUGCCGGACGAUGGGAGCGUGAGCAGGACGGUGAUAACCUCUCCCCGAUCGGGUUGCGAGGGCGCCGGGCAGAGGCCAGGACGCGAGCCGCCAGCGGUGGGACCCAUCGACGACUUCCCGGGGCGACAGGAGCAGCCCCGAGAGCCAGGGCGAGCGCCCGUUCCAGGUGGCCGGACCGCCCGCCGCGUCCGCGCCGCGCUCCCUGCAGGCAACGGGAGACGCCCCCGCGCAGCGCGAGCGCCUCAGCGCGGCCGCUCGCUCUCCCCCUCGAGGGACAAACUUUUCCCAAACCCGAUCCGAGCCCUUGGACCAAACUCGCCUGCGCCGAGAGCCGUCCGCGUAGAGCGCUCCGUCUCCGGCGAGAUGUCCGAGCGCAAAGAAGGCAGAGGCAAAGGGAAGGGCAAGAAGAAGGAGCGAGGCUCCGGCAAGAAGCCGGAGUCCGCGGCGGGCAGCCAGAGCCCAGCCUUGCCUCCCCGAUUGAAAGAGAUGAAAAGCCAGGAAUCGGCUGCAGGUUCCAAACUAGUCCUUCGGUGUGAAACCAGUUCUGAAUACUCCUCUCUCAGAUUCAAGUGGUUCAAGAAUGGGAAUGAAUUGAAUCGAAAAAACAAACCACAAAAUAUCAAGAUACAAAAAAAGCCAGGGAAGUCAGAACUUCGCAUUAACAAAGCAUCACUGGCUGAUUCUGGAGAGUAUAUGUGCAAAGUGAUCAGCAAAUUAGGAAAUGACAGUGCCUCUGCCAAUAUCACCAUCGUGGAAUCAAACGAGAUCAUCACUGGUAUGCCAGCCUCAACUGAAGGAGCAUAUGUGUCUUCAGAGUCUCCCAUUAGAAUAUCAGUAUCCACAGAAGGAGCAAAUACUUCUUCAUCUACAUCUACAUCCACCACUGGGACAAGCCAUCUUGUAAAAUGUGCGGAGAAGGAGAAAACUUUCUGUGUGAAUGGAGGGGAGUGCUUCAUGGUGAAAGACCUUUCAAACCCCUCGAGAUACUUGUGCAAGUGCCCAAAUGAGUUUACUGGUGAUCGCUGCCAAAACUACGUAAUGGCCAGCUUCUACAGUACGUCCACUCCCUUUCUGUCUCUGCCUGAAUAGGAGCAUGCUCAGUUGGUGCUGCUUUCUUGUUGCUGCAUCUCCCCUCAGAUUCCACCUAGAGCUAGAUGUGUCUUACCAGAUCUAAUAUUGACUGCCUCUGCCUGUCGCAUGAGAACAUUAACAAAAGCAAUUGUAUUACUUCCUCUGUUCGCGACUAGUUGGCUCUGAGAUACUAAUAGGUGUGUGAGGCUCCGGAUGUUUCUGGAAUUGAUAUUGAAUGAUGUGAUACAAAUUGAUAGUCAAUAUCAAGCAGUGAAAUAUGAUAAUAAAGGCAUUUCAAAGUCUCACUUUUAUUGAUAAAAUAAAAAUCAUUCUACUGAACAGUCCAUCUUCUUUAUACAAUGACCACAUCCUGAAAAGGGUGUUGCUAAGCUGUAACCGAUAUGCACUUGAAAUGAUGGUAAGUUAAUUUUGAUUCAGAAUGUGUUAUUUGUCACAAAUAAACAUAAUAAAAGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-530.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -559.08

Frequency: 0.0000

Diversity: 428.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((...(((((((((((((((((((((((.(((.(((.((((((((.(((((((((((.(((((.(((((..((.(((((((........(((...(((((((((.((((((.(..((((((.((((.(((((((.((((((..((((((...)))))).........((((((..(....)..)))))).((((..((((....))))))))..))))))(((.....))).)))))))((((.(((((((((((..((...(((......))).)))))).).))))))....)))))))).)).))))..))))))).((((........)))).))))))))).)))..(((((..((........))..))))).))))))))).....))))))))))))))))(((((((((...........(((((((((((((((((.((((.....(((((((((.(((((((((.....))))))))))))(((((((.......)))).)))..(((((.((((((....................))))))..).))))..........))))))(((.(...((((....(((((((((((((((...((((((.((((.....(((((((.....(((.(((.........................))).)))....((((((.(((((....)))))((.........))....))))))(((((((((((.(((((((((...((((((..............((.(((.....))).)).........((((........))))))))))..((((....))))((((....).))).))))))))))))))))))))))))))).....)))).)...(((((((((........(((((((...(((((......(((....))).(((((....)))))...))))).))))))).......))))))))))))))))))))))))).))))))))...).)))((((.........))))((((.(((.(((((((...((((((((..(((((.....)))))))))).)))...)))..)))).))))))).))))..))))))..))))))))))).....))).))).)))))))).))))))))....))).)))..))))).((((((..(((.((((.(((((((.((......)).))))).....(((.((....))..)))(((.(((.......((((......))))........))))))..))..)))).))).))))))..(((....))))))))).)).))))).))))).((.(((((((..(((.((((.(((.....((((((.....)))))).(((((....(((((.....((((........))))...(((((((.....))))))))))))..)))))....))))))))))..))).))))..))(((((((....)))))))(((......)))((((.(((.........))).))))......((((((...))))))((((((((((...))))).))))).....)))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

..{((({{(((,.((({(((((.{{{{{|||{||,({(((((((,(((..,,|||((((((.(((((((((((..((.(((((((........{{(...((((((((({(((({(.({((,((.({(((,.(((((((.(({(({.{((((((...}}}||}..,.,,{{.((((((..(....)..)))))).)}|,..((((....))))}}}}..}}}||}|{{,}}||}}},)))))))|{||}((((({{{{{{.,{,..,|||,}.}})}},,)))},}})}),))))}}}.)),))))).))))),,,,,}},,,}.((((........)))).))))))))).)}}..(((((..((........)).,))))).))))))))).....))))))))))))))))(((((((...((((({{,,,(((((((((((((((((.((((.....(((((((((.(((((((((.....))))))))))))(((((((.......)))).)))..{{((,.{{{{{{....,.,...........,,||||}}..,.,)))},,.......))))))(((.(...((((....(((((((((((((({,.{((((((.(,((((...,,,,,||}}.,.}||}}}}.........................|||,|......((((((.(((((....)))))((.........))....))))))(((((((((((.(((((((((...((((((.,,,....,{(...{,.,{{..,,,})),,....}},}..((((........)))))))}}}..((((....))))((((....),})).)))))))))))))))))))),},,,,,.,...,,,,,),}}(((((((((........(((((((.,,(((((.,,,,,((,....})),{{{{{....}})))...))))).))}))))},,....))))))))),}},}))))))))))).))))))))...).))),{{{.........|}},{(({{({(.{{{{||{,..{{{{{{{(,,(({{(,..,{|||||,}||}.,))..}))}.}))}),,}))))).))))..))))))..))))))))))),,..{(,(((({.{......,))))),))}))))),})))))))))),.|||||.}}}|..,,,{.{,(((((.((......)).))))).....,,,.||}}}}))..(((((,.{{(({.....((({......}))).....,,.,}},},,.))))).,)}.))})),))),|,||,,}})))}}{|{||||((((((....))))),.((((((((((,.,{{{{{{,....,||,||,.)))))))))).,{{(({{,{,{{,,.....,,||}},}},.,)))))}}{((((((.....))))))},,|||,,,,|||{{,.,,{{{{|,||..,,,..,,,,.,.(((((((....))))))).},,,{{.{||{..,,...}}}}}}}}..,.)}))),..}},..,,|||.,,})),}|((((((((((...)))))}}}))),.....,,..