Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_014030.4
Sequence Length
3783 nt
GC Content
0.6305
AGAAGCGGCCGGGAGCCGCGCAGGGGGCGGAGAGAGGAGCCGCGAGCGGCGGCGGGGCGGCGCGGGGCGGAGGGCGCCCGAGGGCGAGCGGGCAGGCGGGCACGGCGGGUUCCGGGCCAGCCCCGGGGCGGACGGUUGGCCGGGCGCGCGGAGCCUCGCCGGGGCCUCGCCGGAGCCGGGCCGGGCAGCAGGGGCCGCCGCCGCCGCCCGGGCCCGCCGCCCGCGCCCCCCACGCUGGCCCAGAGGGCUGCGGCCGCGUCGCCGCUGAGGAUGUCCCGAAAGGGGCCGCGAGCGGAGGUGUGUGCGGACUGCAGCGCCCCGGACCCUGGCUGGGCAUCCAUCAGCAGGGGUGUGCUGGUGUGUGACGAGUGCUGCAGCGUGCACCGGAGCCUGGGACGCCACAUCUCCAUUGUCAAGCACCUUCGCCACAGCGCCUGGCCUCCCACGCUGCUGCAGAUGGUGCACACGCUUGCCAGCAACGGGGCCAACUCCAUCUGGGAGCACUCCCUGCUGGACCCCGCACAAGUGCAGAGCGGCCGGCGUAAAGCCAACCCCCAAGACAAAGUCCACCCCAUCAAGUCAGAGUUCAUCAGGGCCAAGUACCAGAUGCUGGCAUUUGUGCACAAGCUUCCCUGCCGGGACGAUGAUGGAGUCACCGCCAAAGACCUCAGCAAGCAACUACACUCGAGCGUGCGGACAGGCAACCUGGAGACAUGUCUGCGCCUGCUCUCCCUGGGUGCCCAGGCCAACUUCUUCCACCCAGAGAAGGGCACCACACCUCUGCACGUGGCUGCCAAGGCAGGACAGACACUGCAGGCCGAGCUGCUUGUAGUGUAUGGGGCUGACCCUGGCUCCCCUGAUGUUAAUGGCCGCACACCCAUUGACUAUGCCAGGCAGGCGGGGCACCAUGAGCUGGCGGAAAGGCUGGUUGAGUGCCAAUAUGAGCUCACUGACCGGCUGGCCUUCUACCUCUGUGGACGCAAGCCGGAUCACAAGAAUGGGCAUUACAUCAUCCCACAGAUGGCUGACAGCCUUGACUUAUCCGAAUUGGCCAAAGCUGCUAAGAAGAAGCUGCAGGCGCUCAGCAACCGGCUUUUUGAGGAACUCGCCAUGGACGUGUAUGACGAGGUGGAUCGAAGAGAAAAUGAUGCAGUGUGGCUGGCUACCCAAAACCACAGCACUCUGGUGACAGAGCGCAGUGCCGUGCCCUUCCUGCCUGUUAACCCGGAAUACUCAGCCACGCGGAAUCAGGGGCGACAAAAGCUGGCCCGCUUUAAUGCCCGAGAGUUUGCCACCUUGAUCAUCGACAUUCUCAGUGAGGCCAAGCGGAGACAGCAGGGCAAGAGCCUGAGCAGCCCCACAGACAACCUCGAGCUGUCUCUGCGGAGCCAGAGUGACCUCGACGACCAACACGACUACGACAGCGUGGCCUCUGACGAGGACACAGACCAGGAGCCCCUGCGCAGCACCGGCGCCACUCGGAGCAACCGGGCCCGGAGCAUGGACUCCUCGGACUUGUCUGACGGGGCUGUGACGCUGCAGGAGUACCUGGAGCUGAAGAAGGCCCUGGCUACAUCGGAGGCAAAGGUGCAGCAGCUCAUGAAGGUCAACAGUAGCCUGAGCGACGAGCUCCGGAGGCUGCAGCGAGAGAUCCACAAGCUGCAGGCGGAGAACCUGCAGCUCCGGCAGCCUCCAGGGCCGGUGCCCACACCUCCACUCCCCAGUGAACGGGCGGAACACACACCCAUGGCGCCAGGCGGGAGCACACACCGCAGGGAUCGCCAGGCCUUUUCCAUGUAUGAACCUGGCUCUGCCCUGAAGCCCUUUGGGGGCCCCCCUGGGGACGAGCUCACUACGCGGCUGCAGCCUUUCCACAGCACUGAGCUAGAGGACGACGCCAUCUAUUCAGUGCACGUCCCUGCUGGCCUUUACCGGAUCCGGAAAGGGGUGUCUGCCUCAGCUGUGCCCUUCACUCCCUCCUCCCCGCUGCUGUCCUGCUCCCAGGAGGGAAGCCGCCACACGAGCAAGCUUUCCCGCCACGGCAGUGGAGCCGACAGUGACUAUGAGAACACGCAAAGUGGGGACCCACUGCUGGGGCUGGAAGGGAAGAGGUUUCUAGAGCUGGGCAAAGAGGAAGACUUCCACCCAGAGCUGGAAAGCCUGGAUGGAGACCUAGAUCCUGGGCUUCCCAGCACAGAGGAUGUCAUCUUGAAGACAGAGCAGGUCACCAAGAACAUUCAGGAACUGUUGCGGGCAGCCCAGGAGUUCAAGCAUGACAGCUUCGUGCCCUGCUCAGAGAAGAUCCAUUUGGCUGUGACCGAGAUGGCCUCCCUCUUCCCAAAGAGGCCAGCCCUGGAGCCAGUGCGGAGCUCACUGCGGCUGCUCAACGCCAGCGCCUACCGGCUGCAGAGUGAGUGCCGGAAGACAGUGCCCCCAGAGCCCGGCGCCCCAGUGGACUUCCAGCUGCUGACUCAGCAGGUGAUCCAGUGCGCCUAUGACAUCGCCAAGGCUGCCAAGCAGCUGGUCACCAUCACCACCCGAGAGAAGAAGCAGUGACCUCUCUCCCCACACCCUCACCUGCACCCUAGGACCUCACUGGCCAUAGGAGCUGGGCCACUCCAGACAUUAAUCCCCACCCCAACAGAGCCACUGGCACAAGUGCCCUUAGUGCUGCCACACUCCCUGGCAGCCAGGUGCCCUGGUGCCCACCCCUGUCGAGCCCCUAAGGAUGGGGAGGUGGGGGGGCAGGAGCUUCUGUCCCCCACAUUCCAUGCACCUCCCCUCUGUAUAUAGCAUCUCCCCCCUCCUAGUGAGCAGGGGCCUGCAAGGCAUCACUCCCAGCCCCUCGCCUUCUAGGGCACCCUCAGCAAAGGGGCAGGUGGGGACACUCCAAGUGGGGCAGCUCUCCGUACAUGCGCCCCACCCCCAUGAGCCAGUUCAGCCCUACUGGGGGCUGAGCGGGGGCAUCCCCUCCUUUGUACAUAGUCUCCAUGGAUGUCCCUGCCCUGUAGCCACCAGCCCCUUGCUGCUCUCCCUUUAAUGCCAUAUGGCCCCUGCCUAGGGCACAGGCCCCAACCUGUGUGCUGGGGUCCCCAGCAGCAAACACUGGAAAGUCUGUUUUUUUUUUUUCUUUCUUCUUCCCCACCCCUUAAUUUUAACUUUGUGGUAACUGAGUGCCCCCGCGUGCCUGCGUGUUGAGUGUGUGGGCGGCAGUGCCGUUCCGGAGGCCUGGUCCAUCUGGAGUUUUGAGGGGUGAGGGGACCAGAGCAGUGGGACCAGCAUGGGGAUCAGCUUCCCUUCCCCACCUGGAGCCAGGGACUGUCCGGGUAGCCAGUUUUGGUCCUGCCAGCUGCCUCCCUGAUCCCUCCCCACUCUCGCCCCUUCUCUAUGAACUUAAAUCAAAAACCACUUCCCUCCAUCUCCUCCUGCUCCUGCGUGGAGGGGGAAUGUGUGCUGGCUAGGGUGGAGGACUGAGCACCUGAGCCUGGGGCUGGCUCCCCGGGGUCCCCGACUCAGCUGGUGGCUGUGGAGCUGAGUCCCCUCCCCGUAACCUCUGCAAGGCCAGCACCCACCAUCACUACCUGCACCUGCUGUGGUCCCACCCUCUGGAGGCCUGGGAACCUGGCUGCAGCCUGGGAAGGCUGGAGAGGCAGACGGUGGGACCCACCAGCUCUCUCCCCAUCCCGCUUCUUCCCUGGGGGCCAGGCCCUACCUGUGUGGUGGUGGGUGGGCUGUCAAGACGUGUCAUGUACAUUUGUAUCAAAAAUAAAGAAGUGACCAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1676.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1738.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 1019.06
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((.....)))))(((((((((((.(((((..((((.(.(((((.((((((((((((((((.((((((.(...((((((((((((((((((((((.(((((((....((((((((...(((((((.((((.((((((((((((((.((((((((..(((((.((....)).))))).)))....)))))..))).)).))))).)))).)))).)))).))).....)))))))).(((((((((((((((((.(....((((..((((((.(..((((((.(.((.((.(((((((((...((((.(((((......((((.((.((((.((((..((((((((((...(((((....((.((((........))))))..(((((((.((((.((.((((((((((..(((((.((((..(((((..(((....))))))))..)).)).)))))....(((((((((((..((((....((((.....))))...)))))))))).....((((((((((..(((((..(((.....)))..)).....(((.................))).......(((.((........)).)))))).)))))))))).))))).((((....)))).)))))))))).....((...........))..............(((((((((((((.((........).).)))))))))..))))....)))))))))))))...((((((.......)))))).)))))))))))))))..)))).)))).)).))))....(((((((((((......)))))))))))..((((((......))))))((((..((((((((........)))))))).....)))).(((.((((((((..(((((.(((...((((((((((...(((..((((((((...(((((((((.((..(((((....))))).)).)))))).)))...............((((........))))((((.((.((((..((..(((((..((((((..(((..........((((.((((.((((.(((...(((((((.......(((((...(((.((..((((((((((((.((.....))...((((...((((((((((((............)))..(((((((((((.(((.((.((...)).))...)))))))))..))))).....)))))))))...)))).(((((...(((((......)))))..))))).........)))))))).))))..)).)))...)))))(((..((.......))..))))))))))((.((((((((.(((((((..(((((..((((((.(((.(((...(((.(((((.((.....((((.((.....)))))).....)).))))).)))......((.(((..(((...)))..))).))...(((.....))))))))).))...))))..)))))..)))))))..))))))))..)).)))..)))).)))).))))......)))..))))))..)))))))..))))))))))))))))))..)))))))..))))))...)).).))))).(((((((((..((.((.........((((((((.......)))))))))))))))))))))......))))))).).))).((((....))))...(((.(.......).)))..)))))...))))..))))))))).(((((...((((((.................))))))....)))))....)).)).).))))))..).))))))..))))).))))))))))))))))).....((((((((.((((((......)).)))))))))))).....))))))))))).......((((......))))))))))))..))).)))))))..).)))))).)))))).))))))))))((((....)))).)))))..).)).))...)))))))))).(((((((((..((.((.(((............)))...)).))...)))))))))(((((((..((((((((((((((.((((.(((((..((((.....(((((.((((.(((....))))))).))))).......(((((((((.(((.((((((.((((((..(((((..(((.......)))..))))))))))).....))).)))))).)))))))))..(((....)))...)))).))))).)))))))))..........((((((.......))))))..))))))))).......))))))).(((((((((.(.(.(((((....((.((((((...((((((((....)))(((((.(((((((((((...................)))))))....((((....(((((((((....((((.((((((...(((....)))...))))))...))))...)))))))))...))))........((((((.............)))))).........))))))))).((((((.((.....)))).)))).))))).................(((((((((......((((((.(((((.((.(((((..(.(((((((.......))))))))))).)).)).)))))..........((((......(((.(((((((((((((((((((....))))))))))..........)))))))))))).......)).))..((((((((..(((((((((((((((.(((((.................))))).))))((((.(((((((...(((((.((((((.(((((...(((((((.((...........)))))))))..............((((((((....))))))))((((((((((((.......................))))))))))))...((.((((((((....((((((((...........(((....))).....(((((.(((((((......))))))).)))))......))))))))...)))(((((................)))))............................))))).)).))))).)))))).)))))...))))))).))))(((((((...))))))).(((((..((((.......((((((..((((..((((((.(..(((.((((((.((((..((((((...........)))))).))))....(((((...((.(((.((.((((..((((...)))))))).))))).))))))).))))))))))))))))))))..)))))).........))))....))))).....)))))))))..))..))))))))...))).))).....)))))).))).))))))))))))).).).))))))))).(((((.....(((((((((...........)))))))))....)))))....))))))..((((..(((((((((((((...(((((...((((.(((((((.(((....)))..)))).))))))))))))...((((.((..((((((((....(((((...))))).)).)))))))).))))((((((.....))))))((((.....)))).))))))))))))))))).......((((((((.....(((((.......)))))...)))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((((..((((((((((((((((,,((((,((({.((((....}}))(((((((((((((((((.((((((.(...((((((((((,{(,(((((((({(((((((..,.((((((((...(((((((.((((.((((((((((((((.((((((((..(((((.((....)).))))).)))....)))))..)))},),}))))))})).)))).))}),)))}....)))))))).(((((((((((((((((.{,{({(((({{((((((....||(((((((.((((((((((((((({.(((,.,,{,,.}||.}|,(({(({((((((((,..((,(((((,(,,(((((.(((((..{((({{{{(((({|.,,(({{.|{(({.|||},...||{{{{((({..(((((.(({{..(((((..(((....))))))))..)).)).))))).,,,||{{{(((({{..((((....{(((..,.,||}}...})))})}))),,.,,(((({{((((..,{{((..(((.....)))..}}.....(((...}}}.......,,..|||.,....{{{{.{|,.......)).))))))|)))))))))).}}})).{(((....)))).}}))))))})}}})))))}.,.}}}}}.))..,...........(((((((((((((,,{........,.}.)))))))))..))))....})))))))))}})},.{{((({.......)})))),))),})))))))))).))))))}((((.(((((..({.(((((((((((......))))))))))).}},..))).)).)))).((((((((((((((((........)))))))).....((((((((.(((((((...,,((({(({,{{((((((((((((((((....{{{((({,.(((((((((.((..(((((....))))).)).)))))).))}...,..|||||.,..,,{{{||.....))))|{{|.,,||||{,.||,.,,,,..,{|||,...{{||{|.....}.}))},},}|}}|}},|,,}}}}}||||||,,....((((.((((......)))).)))).{{.,|||,,..,....,|||.|..(((((.(((....)))...))))}{|.(((((....))))),)),})}},))))))).)))))))).....(((,............,,))).)))))))),{,...(((,((((..(((({...,..,.}}}}}..)))).))),.}}.,.))))))))))))).}}|{,,||||.,.,..((((((,,(((((.{.((((((((.(((((((..(((((..((((((,({{.{{|.,.(((.(((((.{{.....((((.((.....)))))).....,}.))))).)))....{{((.,,,}}||{.,.||,{{||,{||...(((.....))))))))),,),..))))..)))))..)))))))..))))))))..,(((.((((....)))).))){{.{((((((({(((|......(((({....((|({|,{.((((,...{(((........))))||||..|..||||.(((((((((.,.(,..........{((((((((.......))))))))),,.))))))))).)))),),)))))...)))}}.,,,,|}}},....(((.(.......).))).,||||((..((((..,....,.)))).,))..})))})))))))}.},........,,.))))))))))))..,||||},|}||}}|}),,,,))),},..))),,.))))))))))))))))).....((((((((.((((((......)).))))))))))))..,..))))))},||{({.(((....))),})))})))))))))),.))).)))))))..}.)))))).)))))).))))))))))}....(({(((((({.((,....}.))..||},,}}}||}.{{{{.|,|,.}}}}..,{{,.,,,.(((({...((,.((((((({((((((((((((((({({.((((((((((((((.((((.(((((..((((..,..(((((.((((.(((....))))))).)))))..,,...(((((((((.(((.((((((.((((((..(((((..(((.......)))..))))))))))).....)))},))))).)))))))))..||,.,...,,...)))).))))).))))}}))),,..{{{{{((({,.,..}}|||}))),,..)))))))))..,|.({(((((((((..(((((((.((.((.....}},(({{,.....)})})).((((..((.(((((.(((((((((((.......,{,.......,,)))))))....((((....(((((((((....((((.((((((...(({....,}),..))))))...))))...)))))))))...)))}........((((((.{..........,))))))........,))))))))),)})))).)).)))))))..)))).)))))))).})}..|........,.,,,,,.,.,||{,|,,...(((((.{(.(((((..{.(((((((.......)))))))}))).)).)}.)))))...}}))})}.|||}}}...(((.(((((((((((((((((({....}))))))))).,,.....,,)))))))))))),,.....}},.........,(((((...(((((((((,,..,((({{........{{{{...},.....}))|}.....(((({,{(((((.((((({{{({,{{...(((((((.((...........)))))))))......,,,...,.((((((((....))))))))((((((((((((..............,}.......))))))))))))..,}}..))))).)))))))))))...........}}}}}....)))}})))))}))){((((((......))))))}((((((...))))))},,,....,,{{{(({...,............}},}||..{((((((((((((((....{((((,{(((..{({,{{,((({({(((.((({{{.{{{{.{,..,,),))}))))).))))}.,}}}.)))}}}}}))})..}))))})))))))))).)))))..}}))))))))).((((..((((((...........)))))).))))....{((((...((.(((.{(,((((..((((...))))))))},}))).)})))))))))))).}.))...)))))...},},,............,,}}}}))))).,))})))).,))))))))))){((|{|,,{(,(((((((({.(((.((.(((((.(((.((.,((((...(({{{{.|,..{{||.,.)))),.})))))...))))..)).))).))))))).))),{{{.....)))..))))))))}.||,||}|.},.}}}......((((,(((((((((.((((..|{((.{{...)).)))|.((((((....)))))).|,...)))).)))))))})}},))))...)))))....)))))))}....{((.((((.{{((({(((.....))))),))}).)))).))}.,.{{{{((((,..{,((({(.......}}}}}.,,)))),)))).
Back