Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_014172.6
Sequence Length
577 nt
GC Content
0.6153
AGGGGACUCCGGGAGGAGGAACAUGGCGGUGGCGGACCUCGCUCUCAUUCCUGAUGUGGACAUCGACUCCGACGGCGUCUUCAAGUAUGUGCUGAUCCGAGUCCACUCGGCUCCCCGCUCCGGGGCUCCGGCUGCAGAGAGCAAGGAGAUCGUGCGCGGCUACAAGUGGGCUGAGUACCAUGCGGACAUCUACGACAAAGUGUCGGGCGACAUGCAGAAGCAAGGCUGCGACUGUGAGUGUCUGGGCGGCGGGCGCAUCUCCCACCAGAGUCAGGACAAGAAGAUUCACGUGUACGGCUAUUCCAUGGCCUAUGGUCCUGCCCAGCACGCCAUUUCAACUGAGAAAAUCAAAGCCAAGUACCCCGACUACGAGGUCACCUGGGCUAACGACGGCUACUGAGCACUCCCAGCCCGGGGCCUGCUGCCUCCAGCAGCCACUUCAGAGCCCCCGCCUUUGCCUGCACUCCUCUUGCAGGGCUGGCCCUGCCUGCUCCUGCGGCAGCCUCUGGUGACGUGCUGUCCACCAGGCCUUGGAGACAGGCUAGCCUGGCCACAGAAUUAAACGUGUUGCCACACC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-222.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -232.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 194.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((((((((...((.(((((.(((((.(((.((((((..(((......)))....(((((.(((((((.(.........)))))).)).)))))((.((((..(((((...)))))..)))).))..)))))).)))...........((((..((((((((((.((.((....)))).....(((((...)))))...(((((((((..(((....)))..))))..))))).(((((((((((.............(((((..........))))).(((((..(((....(((((...)))))....)))..)))))...((((......))))......(((..(((.......)))..)))..((((((((...((..(((....)))..))..))))))))))))))))))).))))..))))))...)))).))))).)))))))..))))))))(((((((.(((...))).)).))))))).)))))))(((((((((((((...((((((((((....))))...))))))..)))).......))))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.(({{{((((({(,..{(,(((((,((((({(({.((((((..,{{.{{,,.||,,,,,(((((.(((((((.{.........)))))).)).))))){{.{(((..(((((...)))))..)))}.}}..)))))).,||(((({((.(((,(((.,..((((.,,.....))}},{|{||{,,,.{{{{,..,))))},||{{({(((((..(({....)))..))))..))))),||||,|||,||}.}}}}}}{{{..(((((..........))))).,|||{..((({{,.,,|||}}},}})),,,.)))..))}))}}}}|||...{{{,,...,},..,,...{{{,,.,{,,,.)}.)))}.((((((((...((..(((....)))..))..))))))))|||||||||,..}})))))}.}}}}.}})))}))}}}.,}}||||,.}}}}}}})||||(({.(((...|||{||{||,}}||{,,,,,(((((((({...|)),,)))))}||,,|}}}.)))))..)))|||{.{||.........,))),)))}....
Back