Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_014222.3
Sequence Length
804 nt
GC Content
0.5062
AUGCGCAGGCGCCGUGUGGCACUCGGCGGUCGAAAGGGGAGUUCAAGGAGACGGGGGCGACGCGGCUGAGGGCUUCUCGUCGGGGUCGGGGCUGCAGCCGUCAUGCCGGGGAUAGUGGAGCUGCCCACUCUAGAGGAGCUGAAAGUAGAUGAGGUGAAAAUUAGUUCUGCUGUGCUUAAAGCUGCGGCCCAUCACUAUGGAGCUCAAUGUGAUAAGCCCAACAAGGAGUUUAUGCUCUGCCGCUGGGAAGAGAAAGAUCCGAGGCGGUGUUUAGAGGAAGGCAAACUGGUCAACAAGUGUGCUUUGGACUUCUUUAGGCAGAUAAAACGUCACUGUGCAGAGCCUUUUACAGAAUAUUGGACUUGCAUUGAUUAUACUGGCCAGCAGUUAUUUCGUCACUGUCGCAAACAGCAGGCAAAGUUUGACGAGUGUGUGCUGGACAAACUGGGCUGGGUGCGGCCUGACCUGGGAGAACUGUCAAAGGUCACCAAAGUGAAAACAGAUCGACCUUUACCGGAGAAUCCCUAUCACUCAAGACCAAGACCGGAUCCCAGCCCUGAGAUCGAGGGAGAUCUGCAGCCUGCCACACAUGGCAGCCGCUUUUAUUUCUGGACCAAGUAAAGAUGGGUCCGUGGCCCACACUCGGUCAUGUGCUCAGACAACGACUGAUGAAAACGCCCAUGCGGUUUGCAUCGACUGAUAGUGUGUUCUUUCCGGGAUCACAAACAUUAACAAAAAAGUUAACUUAUGUGACUUGGCAGUUAUUCUAUACCAUUUCCUGUCCAUUAAAAUUUUUAAAGGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-259.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -275.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 199.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((.(((((((.((.((((....((................))..)))).)).)))))))...((((((.(((((..(((((..((((.(((...(((((((((....((((.(((((....((((((((((.(.((((((.((..(.(((...((((((.((((.(.(((.((((((.(((..(((((..((.....))..)))))..)))))....(((((....)))))((((((.(((.........)))..)))))))))).))).).))))))))))))).)..)).)))))).).))))))))))((((((....((((..((((((..((..(........)..))..))))))))))))).))).((((((.....(((((((.((((((.....)).)))).....)))))))....)))))).......(((((((((.((((.((..((((((...(((..(((((((......((....)).....)))))))..)))....)))).........))..)).).))).).))))))))..(((((......)))))((.((.(((((....))))))).))..........(((((...........)))))))))))))).))))).)))).)))))).)..)))))))))).)).))))...(((((......)))))((((.(((..((..(((((.(((((....(((((......)))))....)))))))))).)).))).)))).......)))))((.(((((...))))).))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,.{((((,(((((((.((.((({,,..((,,..,,,,..|||..,},,.)})).)).))))))),..{({|||,||{{{,{(((((,,(((({({({{.{,{((({((...,((((.{{{{{}},}|(((((((((,(.((((((.((..,.(({..,((((((.((((.{.(((.((((((.(((..(((((..((,....)}..)))))..))))}....(((((....)))))((((((.(((.........))).,)))))))))).))).}.))))))))))))}.)..)).)))))),).))))))))),((((((....((((..((((((.,((..{........}..)).,))))))))))}}).))).((((((...,.((((((({((((((.....)).)))}..}..}))))))....)))))).,...},{||||||{|,|||}||||}||{{((.,,({{||(((((((......((....}}.....)))))},.,|||,{{{|}||,,|||.|,..,..,.,|,|||,|,|}}}}}}},,{{{{{...,,.)))))((.({{(((((....))))))).)).......,..(((((..,,.....}.)))))|||}}}}}},)}}))|)}}|,}}}}}}.)..}))))))}}}.|,.}}}}.,|||||}},}}},}}.})||||.|,|,,||..||||{.(((((....(((((......)))))....)))))))))),)),},}.))},.......))))}{{.{{{{,...,}}}}.)),..
Back