Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_014294.6
Sequence Length
3056 nt
GC Content
0.3678
AUGCUCGCCCCCGCUGCGGGCUAGCUGUUGUGUUUUUUUUUUUCCCCCGGGCGGCCCGGCGGCUGCGUACUGGCUGUGGGAUGGGAAGUGAAGCCCCAGCGAGCGGCUGCAGCGGGGCCGUGAGGAGCAGCCAGCGGGAGGCGGCGGCGAGUCGGUGAGCAGCUGGGAAGAGCAGAACCGGGGCGGAGCACCUGCAGGCGCGGGCGGCGGCCCCACCAUGGCGAUUCGCAAGAAAAGCACCAAGAGCCCCCCAGUGCUGAGCCACGAAUUCGUCCUGCAGAAUCACGCGGACAUCGUCUCCUGUGUGGCGAUGGUCUUCCUGCUGGGGCUCAUGUUUGAGAUAACGGCAAAAGCUUCUAUCAUUUUUGUUACUCUUCAGUACAAUGUCACCCUCCCAGCAACAGAAGAACAAGCUACUGAAUCAGUGUCCCUUUAUUACUAUGGCAUCAAAGAUUUGGCUACUGUUUUCUUCUACAUGCUAGUGGCGAUAAUUAUUCAUGCCGUAAUUCAAGAGUAUAUGUUGGAUAAAAUUAACAGGCGAAUGCACUUCUCCAAAACAAAACACAGCAAGUUUAAUGAAUCUGGUCAGCUUAGUGCGUUCUACCUUUUUGCCUGUGUUUGGGGCACAUUCAUUCUCAUCUCUGAAAACUACAUCUCAGACCCAACUAUCUUAUGGAGGGCUUAUCCCCAUAACCUGAUGACAUUUCAAAUGAAGUUUUUCUACAUAUCACAGCUGGCUUACUGGCUUCAUGCUUUUCCUGAACUCUACUUCCAGAAAACCAAAAAAGAAGAUAUUCCUCGUCAGCUUGUCUACAUUGGUCUUUACCUCUUCCACAUUGCUGGAGCUUACCUUUUGAACUUGAAUCAUCUAGGACUUGUUCUUCUGGUGCUACAUUAUUUUGUUGAAUUUCUUUUCCACAUUUCCCGCCUGUUUUAUUUUAGCAAUGAAAAGUAUCAGAAAGGAUUUUCUCUGUGGGCAGUUCUUUUUGUUUUGGGAAGACUUCUGACUUUAAUUCUUUCAGUACUGACUGUUGGUUUUGGCCUUGCAAGAGCAGAAAAUCAGAAGCUGGAUUUCAGUACUGGAAACUUCAAUGUGUUAGCUGUUAGAAUCGCUGUUCUGGCAUCCAUUUGCGUUACUCAGGCAUUUAUGAUGUGGAAGUUCAUUAAUUUUCAGCUUCGAAGGUGGAGGGAACAUUCUGCUUUUCAGGCACCAGCUGUGAAGAAGAAACCAACAGUAACUAAAGGCAGAUCUUCUAAAAAAGGAACAGAAAAUGGUGUGAAUGGAACAUUAACUUCAAAUGUAGCAGACUCUCCCCGGAAUAAAAAAGAGAAAUCUUCAUAAUGAAUUAUAAACUAAUUGAUUAAUGUCCCCAAAGAAAUCUGCUUUCUACUAUAUCUUUCAGCAUUAGAGAUUUUUCUGUUCUUGAAAAUACAGUCUGUGCUCUUUGAUUUUUGCUAUUGUACGGUUUCAUGCAUUUUUUUAAAGGGCAUUUGAGGGGAGGAUUAUUGCUAUGAAUGAAAAAAAUAUUUUAGCUUAGACUAAGCUACCUGCCUUCAAAAUAGUUUAGGGACCACCACCAUAUUUUAUUUUGUUUUUAUUUUUGAACAUUUUUCUAAUGAUUUGGAGAGAAAACUAUUUACAAAAAUUCCACAUAUCAGUGAUACAAUUUCUUGCUGUCACCAAUUUUUUAUAAUAGCAGAGUGGCCUGUUCUAAGAAGGCCAUAUUUUUUAAGUUAUCUUUCAGGGUAACAUGGAAAUACUAUAAAGUUGGAUGUCAAACUUUAAUAUGUUUUCAGUGUUCUCUAAUUUUUUGGAAUUUUUGUAGACUUUACACCUGGAAAAAAAGAUUUGUAAAAUCACCGGAACAAUUGUGUGCUUUAUUUUAUAGGUAGUGGUUAUUAGUAUUACAUCCCCAUUUUAAAAACAAAAACAUAAUAAUCGUUACAACACGUGGAGUUUUACUAACAUACAUAUUAAAUCAAAGUAUAUUCUUAAAAGUACUUGUGAAGUAAAAUCUUUCUUGUGCAUUUUCAAUACUUGUAAACUGGAAAUCAGAAAAUAUUUACUAUGAACAGGAAAAUCUGACAUAUAGCCCUUUUUGAUAUGUUUAUUAAUAAUGAUUCUUAAUGGGGCUCAUAAUAAGUUUAAUAUGCACAGCAUCUUAGAAAAGUUUAACCUGCAAACACUUUUAAAACAUAAUGCCUACUUGAUUUAUAUCUAUAAAAAGACUGACAGGUAAUUAUAUUUGGAAAACAUUUAAUGCACUAACUUUAAAGAAAUUGAAAAUUCAGGUGGAUAAAUAGUCUUACAAAAGACAAUGUGCUUUAUGUUAUACCUAUAGCUUUGGUCCCAUCUUUAAUUGAGAAACAUUUAUCUGUAUAAAACAUAUUUUUGGAUAAAUAUAUAUAUAUAUAUUUGUAUCUCUACAGAAAGGCUCUAAAAAGCAUUUGAGGAAAAUAUUUGGUUCCCUUUUCUAUAAUCAUCCUUUAAGAUUCUUAUAGCUACAUUUGGUUUAUUCAUCAUAUUUACAGUAUAUAUAUUGUUCUUUUCAGUGUUCACAUCUUGUUCCCCAUUUCUCACUUGUGUCACCAGCUGUUUGUGCCAUUUUUAGUGUAAAAGUUGCAGACCUAUUAGAUCUGCAGUUUAAGUUGCCAUGCUGCUAGGAAAUUGUCCUUUUUCUUUCUAGCUGUUAACCUACUUCCUGGAAAAAGUAGUAGCUCUCUGUAGCAUUAUGGAGUUUCAGUGGAACCAAAUUUUUGCCAUUAAAAACUGGCAUUAUACUGAACUAUACAUUGAGAAAUCAAUCAAAAUAAAAAUUUUUACUUUCACAAGUUGUAUCCUGGAUGUUUCUGUCAUUGUUGGUGUUUAGGCUAUUUUGGUAUAUAACCUCAUUAAAAUGUACCAUAUUUAAAACACUUCAUAGACAUUCAGAAUAACCCUUUUCAAAAUUGUGUUCUGCAAAUAAACAGAUUUGUUCCACAGAAUAUUGGUGAGGACUACUGGGGGGAUAGAUGGUCAUAACCAAAUAAAUCUGGGAAUCACUGGAUUAAACUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-777.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -836.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 614.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((.(((((....(((.((((((.................((..(((((((.((.((.((...((.((((.(((.............))))))).))..)).)).)).)))))))..)))))))).)))....))))).)))))))..(((((((.((((((((((((.....(((((.(..(.(((((....))))).).).)))))..((((((.....((..((((((((.((.(((((((.(((.(..((.((........((((.((........))))))((((((........))))))))))..))))..))))))).)).....((((..(((....)))..)))).....(((.(((....))))))((((..((((((.((((.((((((((((((....(((((..(((((((........((((((((.((.(((((.((((((((............)).)))))).).)))).)).))))))))((((((.(.....).)))))).......(((((((((((((((.(((((...((((((.......))))..))....)))..))...))))))))).........))))))....))))))))))))........(((((..........)))))..........((((((.((......))))))))((((((((((.((((((..((((((.............((((((....))))))...((.(((((..(((......)))..))))).)).....(((....))).....((((.(((.......(((....)))......)))..))))))))))....))))))..))..))))).))).)))))))))))).))))(((......)))(((((.....(((((((((....(((((..........((((((.((((..(((((..((.(((((((...((((((......)))))).)))))))))))))))))).....((((((((((((...((((((((....((((....)))).......))))))))...))))))))))))((......))......(((((((((....)))))))))..)).))))......)))))......))))))))))))))...((((((......)))))))))))).))))..))))))))..))....))))))..(((.(((((((..(((.(((.(((..((((((.....((((((..((((((.((...((((.(((.(((..((((((((((((((((.(((....(((......((((....))))..((((.(((((.....))))).))))...)))....)))..))))))....................((((((.(((((((((.................(((((((((((....(((...((........)).))).....)))))))))))(((((((.(((.(((((......)))))...........(((((((...)))))))))).))))))).........(((((((................(((((........)))))(((((((((....)))))))))......(((((((((((((((...((.((.(((((....(((.(((((...............))))))))(((((((.........))))))).........(((((((....))))))).((((((((...(((((((........)))))))...)))))))))))))..)).))....))))))))))))))).....((((((((......(((((...))))).(((((..((((((.(((.((.((((((((((((((..(.((((((..((.(((..........(((...............))).........)))))..)))))).)..)))..((((((((.(((((((.((((((((..(((((..((.((((.((((((((((((.......((((((...(((.....)))...........((((..(((......))).)))).((((((..((((((....))))))..............))))))....)))))).....))))))).......))))).)))).)).)))))..)))))))).....))))..)))))))))))))))))))))).))..).)).))))))...)))))......((((((...((........))..))))))..))))))))........(((((....))))).....(((.((.((...)).)).)))..)))))))..........((((.(((..(((.((((((....((((((......)))))).)))))).)))..))).)))).)))))))))))))))...))))))))))..))).))).)))))))))))).......))))))))))))))).))).)))..))))))).)))......................)))))))))))))))))))((((.(((((((((((((((..(((((...(((.(((..((((((((((((((((((((((((((((.((...)).))))).......((((.((.((((..((((((........))))))..)))))).))))....(((((((((...(((((.(((......))))))))....)))))).)))....)))))))).))))))))).)))))).))))))....))))).))))))))..............................(((((...((((((((((.((........(((((((.........((((((((............))))))))......))))))).)).)))))))))).)))))((((.((((.(((.(((...((((((......))))))...))).))).)))).)))).......)))))))))))(((....))).....(((((((......))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((({((((({({{(((.(((((({.{,,,{.,,,,,{(({((..((((((,.(({||,||,,.||}||||,|||..,}}}},.}}}})},)))).)))}}))))}))}))|||||..}},||,,}.,))....,))))}))))))}..(((((({,((((((((((((,....(((((.(..(.(((((....))))).).).)))))..{{{(((.....((..((((((({.{{.(((((((.(((,{..({{(({,,....,|{{(.((........))))}|{(((((........))))))))}),,}))),,))))))).}}...,.((((..(((....)))..)))).....{{,{(({....)))))|((((..((((((.((((.((((((((((((....(((((..(((((((........((((((((.((.(((((.((((((((............)}.)))))).).)))).)).))))))))((((((.(.....).))))))..,,...(((((((((((((((.{,(((...({{(((.......)))}..})....)))..}}...))))))))).........)))))).,,,))))))))))))........(((((..........)))))..........((((((.((,....,))))))))((((((((((.((((((.{((({,...,........,,(((((({...,,||||,,.{|.{((((..(({......}))..))))}.},.....|||}...,,}...}}||||,|||.......(((....)))...,{{|,...,,)))))}}}....))))))..))..))))).))).)))))))))))).)))){({......})}(((((,....{((((((((....(((((....,.....(((({(.((((,.{((((,.({.(((((((...((((((......)))))).)))))))))))))))))}.....{(((((((((((...((((((((({..((((....))))....})))))})}})...)))))))))))}{{......||,...,.(((((((((....)))))))))..}},})))......)))))......))))))))))))))...((((((......)))))))))))).)))),.))))))))..))....))||||,.(((.{((((((..(((.(((.(((..((((((.....((((((,.((((((.((...((((.(((.(((..((((((((((((((((.(((....(((......{(((....)))){,((((.(((((.....))))).)))}.}})))....)))..))))))....................{(((((.(((((((((....{...,,,,,,,,.{((((((((((....(((...,{........}}.))).....))))))))))|(((((((.(((.(((((......)))))...........(((((((...)))))))))).))))))),........(((((({,,,,{...........(((((........))))}(((((((((....)))))))))......{((((((((((((((...,,.{(.(((((....,,{|(((((...............))))))}}(((((((.........))))))).........(((((({....|)))))).((((((((.,,(((((((........))))))).,,))))))))}))))),)).,,....))))))))))))))}.,{{,((,(({,,.....,|,,{|}},}},}}.{,{{.,,,,,{{|{(((,{{,{(((((((((((((..(.((((((..((.(((..........,,,...............}},.......}.)))))..)))))).)..)))..{((((({{{(((({{,.{(((((((..(((({..((.{(({.((((((((((((.,,....((((((...(((|...,)))...........{{{{..(((,....,))).}}}}.((((((,{{,((,{,{{({{,..,.}}|,.,||,,}}.))))))....)))))).,||.))))))),......})))).)))).)}.}))))..)))))))}...,,}}}}..}}})))))))}})))))))))}.,,.,..||{|||....}})))).......,,|||,},,|.....,,,.,,..,}}}},..,)))))))}.......(((((....)))))..,,,|{,.,|.({|,.,}.,),)))..)))))))..........||||.{{{..{{{.{{{{{{....{{{{{{....,,||||||,|}}}}),))),,))).)))}.}))))))))))))),...))))))))))..))).))).)))))))))))).,.....))))))))))))))).))).)))..))))))}.)))...||{|,.,,,}},......}))))))))))))))))))){(({{(((((((((((((((..(((((...(((.(((..((((((((((((((((((((((((((((.({...}).)))))}......((({.((.((((,.((((((........))))))..))))}).}}}},{|{({,{{{{{{..,|||||,|{{,,,,{,|}},,))),,,}}}}}}}.))),...,))))))),})))))))).)))))).))))))....))))).)))))))).....,{{,,......,}},,.........(({((...(((((((({{,((.....,..(((((((.,,.,{...((((((((............)))))))).},,}.))))))).)),)))))))))).)))))((((.((((.(((.(((...((((((......))))))...))).))).)))).)))).......))))))))))|(((....))),....(((((((......))))))).......
Back