Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_014365.3

Sequence Length

1861 nt

GC Content

0.5218

AGAAGAAGUUUCUAGGCGCGCGUGCCCUGGGUUUAUUAAGCUCCUGGCUCCGCUCUAGACCUCAGCGGUUCUGGCUGCCAGCCUGGGCAGCCUGGGAAGCCUGGGAGGACGGUGGCUUGCCGGUCUGUCGUGAGGCAGUGCGGACGGGGACCCUCUGGGAUUCUGCUGGAUCUGCCCCGGGGGUUACCUUUGGGGGCUGGGACCCCAGUCGAGGGGACACAACCGUCCCUGGCAGUGGUUGGUUCUGCUUCUCCCUGCAGAAAAGCAGCAUUUUCGGAAGCUGAAGAAUAAGCUAGCCCAGCCACACCACCUUGUUGUGUGACCUUGGGCAGGUGGUUCUGUCUCUCUGAGCCUCUGUUUCUCUCUGAGCUGAGCAGCCACCAUGGCUGACGGUCAGAUGCCCUUCUCCUGCCACUACCCAAGCCGCCUGCGCCGAGACCCCUUCCGGGACUCUCCCCUCUCCUCUCGCCUGCUGGAUGAUGGCUUUGGCAUGGACCCCUUCCCAGACGACUUGACAGCCUCUUGGCCCGACUGGGCUCUGCCUCGUCUCUCCUCCGCCUGGCCAGGCACCCUAAGGUCGGGCAUGGUGCCCCGGGGCCCCACUGCCACCGCCAGGUUUGGGGUGCCUGCCGAGGGCAGGACCCCCCCACCCUUCCCUGGGGAGCCCUGGAAAGUGUGUGUGAAUGUGCACAGCUUCAAGCCAGAGGAGUUGAUGGUGAAGACCAAAGAUGGAUACGUGGAGGUGUCUGGCAAACAUGAAGAGAAACAGCAAGAAGGUGGCAUUGUUUCUAAGAACUUCACAAAGAAAAUCCAGCUUCCUGCAGAGGUGGAUCCUGUGACAGUAUUUGCCUCACUUUCCCCAGAGGGUCUGCUGAUCAUCGAAGCUCCCCAGGUCCCUCCUUACUCAACAUUUGGAGAGAGCAGUUUCAACAACGAGCUUCCCCAGGACAGCCAGGAAGUCACCUGUACCUGAGAUGCCAGUACUGGCCCAUCCUUGUUUUGUCCCCAACCCUAGGGCUUCUCUGAUUCCAGGAUACAUUACUUUAGCUGAACUCAGAUUUAGUGCAAGUAAAAUGUUAGAGGGUGCGGGGGUGAGGACUGACCACAGAUUCCCUGGAUAGUGUAGUGGUAGAUUUCUCCACAGGAUAGCGCAAUUGGCAAAUCAUGCUUGGUUGUGUUAGGCCAAAAUACUAGUUUUGCUUUCUUUACCUUUUCUAUCUUGAUGAAAAUGUUGCACAUUCUAUAGUUGCAAAACACAUAAAAGGGGACUUAACAUUUCACGUUGUAUCUUACUUGCAGUGAAUGCAAGGGUUACUUUUCUCUGGGGACCUCCCCCAUCACCCAGGUUCCUACUCUGGGCUCCCGAUUCCCAUGGCUCCCAAACCAUGCCGCAUGGUUUGGUUAAUGAAACCCAGUAGCUAACCCCACUGUGCUUCCACAUGCCUGGCCUAAAAUGGGUGAUAUACAGGUCUUAUAUCCCCAUAUGGAAUUUAUCCAUCAACCACAUAAAAACAAACAGUGCCUUCUGCCCUCUGCCCAGAUGUGUCCAGCACGUUCUCAAAGUUUCCACAUUAGCACUCCCUAAGGACGCUGGGAGCCUGUCAGUUUAUGAUCUGACCUAGGUCCCCCCUUUCUUCUGUCCCCUGUGUUUAAGUCGGGAUUUUUACAGAGGGAGCUGUCUCCAGACAGCUCCAUCAGGAACCAAGCAAAGGCCAGAUAGCCUGACAGAUAGGCUAGUGGUAUUGUGUAUAUGGGCGGGACGUGUGUGUCAUUAUUAUUUGAGUUAUGCUGUUGUUUAGGGGUAAAUAACAGUAAAUAAUUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAAGGAGCUGACGUUCUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-668.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -702.66

Frequency: 0.0000

Diversity: 581.08

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((..((((((((.((((((((.(((((((((((((((..(((.((((((.(....((((.....))))..(((((((......))))))).((((((..((((.((.(((((((...(((..(((((....)))))..))).(((((...)))))((((((....))))))(((((((((..((((...(((((..(((((((((((((.((((((......))))))((..((((((((((((((........))))))..(((((.(((((((...)))))))....))).)))))))))).))..(..(((((.((.....(((((((.(((((.........)))))))))......(((((.(((..((((((...)))))).))))))))........((((((((......((((((((.(((.(((((........((((...))))......)))))..))).))....))))))))))).)))))).....)).)))))..)...(((....))).)))))))).........))))).)))))(((((((((((...)))..))))))))..)))))))))))))......)))))))))......(((((.((((((...)))))))))))))))..)))))).).))))))..)))((((.(((((......)))))))))..(((((..(((((((.((((....))))..(((((....(.((((((.((((.....)).)).........(((.((((.(((.....(((((.............)))))..))).)))).))).(((((((((.(((...))).))))))))).....(((((((((((((((((..(((((((((((....(.((.((((.............)))).)).).(((.....))))))))))..((((.....((((......))))..)))).)))).)))))..))))).....((((..((((((.(((((.(.(((.(((((((...........((((((..((((((......))))))..))))))...)))))))))).).)))))..((((((....)))..))).((((..(((((((((.((....))))))....(((((((((.((((.....))))..)))))))))(((.(((((....))))))))......((.(((((.........))))).)))))))..))))..(((....)))........))))))..)))).........(((.((..((((((.....)))))))).))).....))))))))))))))))))).(((((((....)).)))))....)))))))..))))).((((((((((...)))))))))))))))).)))))))........((((.(((((...((.((((((((((((..(((((.((((((.......)))))))))))(((((.....)))))..................(((.((..((((.(((.(((...(((((((...))))))).....(((.(((...((((......))))))).)))((((.((((((((........)))))..)))))))((((((.....(((((((.......))..)))))......)))))).((((((....))))))(((....))).....))).))).))))..))))).....)))))))..))))))).))))))))).)).)))))))).).(((((((((..(((((((((((((((((....)))))))))))..))))))...)))))))))...........)))))))....))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

{(((..(((((((,,((((((((,({((((((((((((((({((.((((..((.(((((((.....)),,))))..)).)))).))))((((((((((...((((((,,{((((((((.({((.(((((.((.((,(({.(({{{((((((((((((((,,{(....}}||{{((((,,((({{{{{|...{||((((((....)))))},.((((((......)))))|((..((((((((((((((........))))))..(((({.(((((((...)))))))....))).}})))))))).}}|}}}.,,.),)))}}})}))))))|}(((((.,.....}.))))).,{((((({(((({{.{{{..((((({...}))))).}}||||||,,,,...|{(({{(((......({((({((.(({.{((((........(((,...}))),.....))))).,})).))....))))))))))).))}...{,{{{{({{(({{{,..{.{((,,..|||,,{{{.||||,..))}).)))..,{{{,,{((((({((((((((((((({|,{(((((((.(((....))).))).)))).},)))....))))))))))))||.,}))|})),.,,|{{{{.,......})))),}||||||,{,{({(((({,....,))))},}}}|..}}}}}}))}}}}}.|||{||||||||....||}....|||}|}|})}}})}|,.......,)))}}})}(((.((((.(((.{{,.{((((..,..........)))))}}))).)))).))).(((((((((.(((...))).)))))))))......))))))))))}},}||.||...((((((,....(.((.((((.............)))).)).)}||}}}.....)).))),)).)),))))))).)|)))))))).}}.|}|(,{{.((({....})))...}}..{(({..((((((.{((((.(.((,{((((({,........,,.((((((..((((((......))))))..)))))}..})))))))))).).))))){,{||{{|,,|,}}},||},}|||,.,||||.{||{}||,..,)))))).||.(((((((((,((((.....)))).,))))))))}((|{(((((....))))))))..,,,,}}}|||{|,.,,,.,.,)}},,,|{{||||,,,,....},}))}..}}}},,....))))))..}}}}...,,,.,|(({..,..(({{{|,,,,,))))))}}.,,,....,,,{((((.....)))))...(((((((....)).)))))}))))).)))))).)))).((((((((((...))))))))))))))))))))))))........{{{{.{{{{|...(((((((((((((((..(((((.((((((.......)))))))))))(((((.....)))))..................(((,((,.((((.(((.(((...(((((((...))))))),,...{({,(((...,,(({..,,,,,,,))).)))(((,{((((((((........)))))..)))),))},,,,,.,,,,(((((,,.,.....}}..))))}.....,))))|((((((((....))))))))}....)),.....))).))).))))..|)))}.....)))))))..)))))))}))})))))),)),}))))))},|.(((((((((..(((((((((((((((((....))))))))))),.,))))),,,))))))}))...........)))))))....))))..