Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_014387.4
Sequence Length
1758 nt
GC Content
0.6155
ACAGCUUCCUGCCGCAGGCGGGCGGGAGGGCGGGCACGGAGAGGCGGGCGCCGAGGAGGGGCAGGUAGGGCUGGGACGCAGGGGUAACUGGAUCCCCCGACUUCAGCCCAGGCCCUGGUCUGACCACCCUGGGAGCAGGGACUUUCCACAGUCAGCUGGACGCACACUCAGCCCAGUAAAAGAGGGGACCCAUCCCGGGAGCCCCGGGGAGGGCACAGCUGCCUCCUCCCGGGCUCCCCUGCCACCUGGUGCCUACCUGCCCCCUGCUCCCUGCCGGGUCCGGUCCUCACCCCAUCUUCAUCUGGCCUUGACUCUGCCCUUGAGGGGCCUAGGGGUGCAGCCAGCCUGCUCCGAGCUCCCCUGCAGAUGGAGGAGGCCAUCCUGGUCCCCUGCGUGCUGGGGCUCCUGCUGCUGCCCAUCCUGGCCAUGUUGAUGGCACUGUGUGUGCACUGCCACAGACUGCCAGGCUCCUACGACAGCACAUCCUCAGAUAGUUUGUAUCCAAGGGGCAUCCAGUUCAAACGGCCUCACACGGUUGCCCCCUGGCCACCUGCCUACCCACCUGUCACCUCCUACCCACCCCUGAGCCAGCCAGACCUGCUCCCCAUCCCAAGAUCCCCGCAGCCCCUUGGGGGCUCCCACCGGACGCCAUCUUCCCGGCGGGAUUCUGAUGGUGCCAACAGUGUGGCGAGCUACGAGAACGAGGGUGCGUCUGGGAUCCGAGGUGCCCAGGCUGGGUGGGGAGUCUGGGGUCCGUCCUGGACUAGGCUGACCCCUGUGUCGUUACCCCCAGAACCAGCCUGUGAGGAUGCGGAUGAGGAUGAGGACGACUAUCACAACCCAGGCUACCUGGUGGUGCUUCCUGACAGCACCCCGGCCACUAGCACUGCUGCCCCAUCAGCUCCUGCACUCAGCACCCCUGGCAUCCGAGACAGUGCCUUCUCCAUGGAGUCCAUUGAUGAUUACGUGAACGUUCCGGAGAGCGGGGAGAGCGCAGAAGCGUCUCUGGAUGGCAGCCGGGAGUAUGUGAAUGUGUCCCAGGAACUGCAUCCUGGAGCGGCUAAGACUGAGCCUGCCGCCCUGAGUUCCCAGGAGGCAGAGGAAGUGGAGGAAGAGGGGGCUCCAGAUUACGAGAAUCUGCAGGAGCUGAACUGAGGGCCUGUGGAGGCCGAGUCUGUCCUGGAACCAGGCUUGCCUGGGACGGCUGAGCUGGGCAGCUGGAAGUGGCUCUGGGGUCCUCACAUGGCGUCCUGCCCUUGCUCCAGCCUGACAACAGCCUGAGAAAUCCCCCCGUAACUUAUUAUCACUUUGGGGUUCGGCCUGUGUCCCCCGAACGCUCUGCACCUUCUGACGCAGCCUGAGAAUGACCUGCCCUGGCCCCAGCCCUACUCUGUGUAAUAGAAUAAAGGCCUGCGUGUGUCUGUGUUGAGCGUGCGUCUGUGUGUGCCUGUGUGCGAGUCUGAGUCAGAGAUUUGGAGAUGUCUCUGUGUGUUUGUGUGUAUCUGUGGGUCUCCAUCCUCCAUGGGGGCUCAGCCAGGUGCUGUGACACCCCCCUUCUGAAUGAAGCCUUCUGACCUGGGCUGGCACUGCUGGGGGUGAGGACACAUUGCCCCAUGAGACAGUCCCAGAACACGGCAGCUGCUGGCUGUGACAAUGGUUUCACCAUCCUUAGACCAAGGGAUGGGACCUGAUGACCUGGGAGGACUCUCUUAGUUCUUACCUUUUGUGGUUCUCAAUAAAACAGAACUUAAAAAAUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-753.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -781.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 438.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((.......)))))))).(((((((((.(.(((((((((..(((.(((((((((((((((((((..(((((((....(((.(((((...(((...((((((...((((...)))).))))))...)))((((......)))).(((((..((.......)))))))......))))).))).)))((((((((.((((.(((((....))))).)))).))))))))))))..)))))).)))))))).))))).)))..))))..((((.(((((((.(((((((((((((((((((((........))))))((((.(((((.((((((......(((((.((......))...)))))((((((...((((.(((((..((((((((((..(....)..))))..((((((...(((..(((((.(((....))).)))))..))).)))))).........)))))).......((((.....))))..)))))...)))).......))))))....)))))))))))))))..((.((((((((((((.((((((............((((.((......))))))..........((((((.(..((((((((..((((((((((((.(((((((.((((...))))....)))))))))....).)))).))))).......)))))).))..).)))))).))))))..)))).)))))))).))(((((((...((....(((((((......)))).)))...))))))))).))))...))))))))).)).)))))))..))))...........(((((((..((((((......(((.(((((.((..(((((.....(((....((((((((((((((((((((((((.(((((....((((...(..((((((((.((((..(((.......)))..))))..(((((....)))))((((((((((....))).))))(((((.(((((((((.(((....)))..)))).))..)))))))).((.(((((.............)))))))......)))))))))))..)....)))).....)))))))).........)))....))))))))))))..)).))))..)))..))))).)))))))..)))))))))...)))))))..((((((((.((((((...(..(((....((((...)))))))..)...))))))..))).))))).((((.(((.(((((......(((((................)))))))))).)))))))......((((((.((((...(..(((((((((................(((....)))....(((((...)))))....))).))))))..)...)))).)))))).))))).).)))))))))((((.((((((.(((((((....((((....))))..(((((.....((((((((((((((((((.....)))))))))))..)))))))...)))))....((((.....))))..))))))).)))))).)))).))))(((((((.......)))))))..((((...((((((..((((((........)))))).....((((...((((((((......)))))))))))).......))))))....))))..((((((....((((((........)))))).))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((({(((((((.......))))))))}(((((((((.(.(((((((((..(((.(((((((((((((((((((..(((((((....(((.(((((,..({{,,,{(((({..,|||,},,)}},.||||}}..}))){({{......)))).(((((..{{.......)))))))....,.))))).))).)))((((((((.((((,(((((....))))),)})).))))))))))))..)))))).)))))))))))))).)))..))))..((((.(((((((,(((((((((((,.(((..{(..(({{...,.,|||((({,(((((.((((((.({{{.(((((.((......))...})))){||||{...{{|{,|{|||.,{|{((((((|,.,,{{{|.,|},,..((((((...(((..(((((.(((....))).)))))..))).)))))).......}.)))))}..,,,,.{{{{.....}}}}..})))),,.}}}|,,,,.,,||||||,.,,|||}|||}}}})))},}|{.((((((((((((.((((((............((({,((......))))))...,,,....(((((({(({{(((((((,.{(((((((((((.(((((((.{(((...))))....)))))))))....).)))).))))).},,,..})})))}))}...)))))}.))))))..)))).)))))))).))|,|||||,|,||,,|}}}}}|))},)}))))}}.}}}...,,,,,))))..)}))).))))))))).)).)))))))..))))...........(((((((.,((((((......(((.(((((.((..(((((.....(((.,..((((((((((((((((({{{{(((.(((((({(((,,......}||||((((((((,..,(({....,,|,,,,|||,.,({((({{{.},||}{{{(({{(((....))),)))){{,|,||{{||||||.{||},..,})}}))||,||,.}}}},)))})),||{(({.......,}}|{|||,,||{{.....,)))).))))}.),,.}))))})}..))))))))..,,,,,..}}},,,,))))))))))))..)).))))..)))..))))).)))))))..)))))))))...)))))))..((((((((.(((((({{{,..({{{{{.,{{||,||},.},.}}}..,))))))..)))}})))).((({,(((.(((((.....,((({(................,))))))))).)))))))......((((((.((((...{..(((((((((.,,......,,.....(((....)))....(((((...)))))....)))}})))))..}...)))).)))))).))))).).)))))))))((((.((((({.(((((((....((((....))))|.(((((.....((((((((((((((((((.....)))))))))))..)))))))...)))))....((((.....))))..})))))).}))))).)))).))))((((((({....,.)))))))..((((...((((((..((((((,,...,,,)))))).....((({...((((((((......)))))))))))).......))))))...,)))),,||||||...,{{(({,{{{{{{..,.,....))))))..,.......
Back