Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_014464.4
Sequence Length
1758 nt
GC Content
0.4261
GUUCAGGCUGAAGUGUCUUAAUGACUAGAAUUCAGGUUCCAAGGAGAAGCCCACAAGGCUAAGGGUAUUGGAUAUAACGGAAAGUGGAAGCUAUACCUGACUUCCAGAGAAUGUGGACCGGAUAUAAGAUCUUAAUCUUCUCUUAUCUUACUACAGAAAUCUGGAUGGAGAAGCAGUAUUUAUCUCAAAGAGAAGUGGACCUAGAGGCUUAUUUCACUAGGAAUCACACCGUUUUGCAAGGUACUCGAUUCAAAAGAGCCAUUUUCCAAGGGCAAUACUGUAGAAAUUUUGGCUGUUGUGAAGACAGAGAUGAUGGCUGUGUCACUGAGUUCUAUGCGGCGAAUGCGUUGUGCUACUGUGAUAAAUUCUGUGACAGAGAAAAUUCUGAUUGCUGUCCUGACUACAAGUCCUUUUGCCGUGAAGAGAAAGAAUGGCCUCCUCACACACAGCCUUGGUAUCCAGAAGGUUGCUUCAAAGAUGGUCAACAUUAUGAAGAGGGAUCAGUAAUUAAAGAAAACUGCAACUCCUGCACAUGCUCAGGACAGCAAUGGAAAUGUUCCCAGCAUGUAUGCCUUGUUCGUUCAGAAUUAAUUGAACAGGUCAAUAAAGGAGACUAUGGAUGGACAGCACAGAAUUACAGCCAAUUUUGGGGAAUGACUUUAGAAGAUGGUUUUAAAUUUCGCCUUGGCACUUUGCCACCUAGUCCCAUGCUCCUGAGCAUGAAUGAAAUGACAGCUUCUUUACCUGCAACAACUGAUCUUCCAGAGUUUUUUGUUGCUUCUUAUAAAUGGCCUGGAUGGACUCAUGGCCCAUUGGAUCAAAAAAAUUGUGCUGCAUCCUGGGCAUUUUCCACUGCAAGUGUGGCUGCUGACCGAAUAGCAAUUCAGUCUAAGGGUCGAUACACGGCCAAUCUAUCCCCUCAGAAUUUGAUCUCUUGCUGUGCCAAGAACCGUCAUGGAUGCAAUAGUGGAAGCAUCGAUAGGGCUUGGUGGUACCUGAGAAAACGUGGACUGGUAUCCCACGCAUGCUACCCACUUUUCAAAGACCAAAAUGCUACCAACAAUGGAUGUGCCAUGGCAAGCAGGUCUGAUGGGCGAGGAAAACGGCAUGCCACGAAGCCAUGUCCCAACAACGUAGAAAAAUCUAACAGGAUCUAUCAAUGUUCUCCUCCAUACAGAGUCUCUUCCAACGAAACUGAGAUAAUGAAAGAAAUCAUGCAAAAUGGACCAGUUCAAGCCAUAAUGCAAGUCCGUGAAGAUUUCUUCCAUUAUAAGACAGGGAUAUACAGACAUGUUACCAGCACAAAUAAAGAAUCAGAAAAAUAUCGAAAGCUUCAGACACAUGCAGUCAAACUCACUGGAUGGGGCACACUGAGAGGAGCACAAGGGCAGAAAGAAAAAUUUUGGAUUGCUGCCAAUUCCUGGGGAAAGUCAUGGGGAGAGAAUGGCUAUUUCAGGAUUCUUCGAGGAGUAAAUGAGUCCGACAUUGAAAAGUUGAUUAUCGCAGCUUGGGGCCAACUGACGAGUUCUGAUGAACCAUAACAUAUCAUUAAAUUUCCAUAAGGUCAUGCCUUUAAGUAACCCCCUAAAUUGAAGUUUAGCAAUAUGACAUUCUUGGUGACAGUGGAAUCUUUGUCUCUUCACCGUGUUAACAUAAUCUAUCUAUUUUCUUAUUUUCCCCUCUGGUCUAUGCUUCUGCUUCCUUCAUAUUACUGAGCAUUAACAACACCAAUAAAGGACAGCAGAGUCCCUAAAUGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-473.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -504.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 393.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((((..(((.....))).....)))))..(((((.....((((.....)))).......)))))......((((.((((((((((.(((.((..((((((...(((((...(((((..(((.........)))..)))))..)))))....)))))).((((..((((((....((((...)))).((((....(((((((((((((((((((((((..(((.........)))....)))))...((((((((((((.((((...((.((.(((((...(((((((((((....)))..........((.((((((.(((((.(((((((((....)))))).........)))))))).)))))).))..(((((((..((((((((...(((..((((((((((..((((.(((..........))).))))...(((((((((...)))..))))))(((((..((((.....)))).)))))((((..((((...........))))....))))..(((((((..(((((..........)))))..))))))).((.((((((((............)))))))).)).)))))).)))).)))..)))))))))))))))))))))))))))).)).))..)))).))))))))))))...........(((((...))))).)))))..((((((....))))))...))))))..)))))))....))))............(((((((((((((..((((((((...(((((((..((.....))..)).))))).............((((((.(((((((((..(((...((((((.((((....((((((.((((....)))).)))....(((((.....)))))..(((........))).((((((.((((..(((((....(((.(((((.(((((..........))))).))..(((((.((((............(((((.........)))))((((((.....(((((((.(((((....((((.(((....(((.....))))))..)))))))))..)))).)))......)))))))))).)))))(((((((...(((((.((...((((....))))...)).)))))...(((......))).(((.............)))((((((.((((((((.......((((((..((............))..))))))...)))))))).))))))......)))))))...)))..)))....)))))....))))))))))...........))).....)))).)))))).)))))))..))))).))))))....))))))))............))))))))))))).))))))...)))).(((((((((((((((((((((((((.....(((((((((.((....(((...((.((((.(........(((((.......)))))).))))))))))).)))))))))....))))..(((((..(((((((((....(((...(((......)))....))).....)))))))))..)))))..(((((((....))..))))).....))))))).)))))........................))))))))))).))).)).)))))))))))).........))))))..................((((......)))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.(((((..(((.....))).....)))))..(((((.....((((.....)))).......))))}.,,...(({{{(((((((({{.(((.((..((((((...(((((...(((((..(((.........)))..)))))..)))))....)))))).((((..((((((....((((...)))}.((((....(((((((((((((((((((,,{{..{{{.........})}...,||}},...((((((((((((.((((.,,,(.((.(((((...(((((((({((....|||,.........{{.{(((((.{((({.,{((((({{...,}}},}}}},.||||.|||}}}}},))}))),))..(((((((..((((((((...({,..((((((((((..((((.(((..........))).))))...(((((((((...))}.,))))))(((((..((((.....)))).))))){(((..((((...........))))....)))),,(((((((..(((((..........)))))..))))))).,||((((((((.,..........)))))))).,,.}))))).)))).})}..)))))))))))))))))))))))))))).)).}),.)))).)))))))))))).....,,,...{((({...})))}}))))}..((((((....))))))...)))))),.}))))))....)}}}....,,,.....{{{{({(({{((({{|(((((({...{{{((((,,({.....)),.))))}}}}.............((((((.((((({(((...{(,..((((((.((((((((((((((.((((....)))).)))....(((((.....)))))..{{{.{{(({((({,.{{{(,{,{(((((((((((({{..({,(,((.(((((..........))))).)),,}|}||}|((((..{(,.((({{.((((..((((((,....}.)))))}.))))))))),.|||||,...,(({,(({....|||..,.,))))))))))})))))))).))).}})},....)))),))),,{|{||,{((((((...{{{((.((...{(((....)))).,.)).))))).,.(((......))),(((,,,....,,,...)))((((((.((((((((.,.....((((((..((............))..))))))...)))))))).))))))......))))))}.,,....|||,....}},........,..,,.||......,,....)))})..)))).)))))).})}}))}..))))).))))))....}}}))}}},,..,||||....,}}}}))))}}}.))))))...)))).((((((((((((((((((((({(((.,.,,(((((((((.{{..,,,,{....|}||}|,,.......,{|||{....,,,}||}||,,}},}},}}},,))||||}}},|,|}||,..(((((..(((((((((.{{.(((...{((......))}....)}}..,,.)))))))))..)))))...||,,||}},,}},,)))},.....))))))).)))))........................))))))))))).))).)}.)))))))))))).........))))))..................((((......)))).........
Back