Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_014717.3
Sequence Length
4973 nt
GC Content
0.5628
GAUUUUGCUGAGGCCAGCUUUGGAACAGGGGAGGUGAGUCUGGAGAAGAGAGUUUCCACGUUGUCAUCAUAGGAUCUGGACUCAAGUGACCAAAACCUUGCUUGGAUUUUUACCUGAUGAAGUUUGUCUUGAAAAGUGAAAAUGGUUCCAUUUCCAUUUUCCCUGUUCUCAAGGGAUGGAAGAAGCGAGCCUGUGCCUUGGAGUGUCUUCGGCGGAGCCGGAAGCUGAGCCCCACCUGAGUGGCCCCGUCCUCAACGGCCAGUAUGCCAUGAGUCAGAAGCUGCACCAGAUCACCUCCCAGCUCAGCCAUGCCUUCCCCGAGCUCCAUCCCCGGCCCAACCCCGAGGAGAAGCCCCCCGCAUCCCUGGAGGAGAAGGCCCACGUGCCCAUGAGCGGCCAGCCCAUGGGCAGUCAGAUGGCGCUCCUGGCCAACCAGCUGGGCCGGGAGGUGGACACCAGCCUCAACGGGAGGGUGGACUUGCAGCAGUUCCUCAACGGGCAGAACCUGGGCAUCAUGUCCCAGAUGAGCGACAUCGAGGACGACGCCCGCAAGAACCGCAAGUACCCGUGCCCACUCUGCGGCAAGCGCUUCCGCUUCAACAGCAUCCUCUCCCUGCACAUGCGCACGCACACGGGCGAGAAGCCCUUCAAGUGCCCGUACUGCGACCACAGGGCGGCGCAGAAGGGGAACCUCAAGAUUCACCUGCGGACCCACAAGCUGGGCAACCUGGGCAAGGGGCGUGGGCGUGUGCGCGAGGAGAACCGCCUGCUGCACGAGCUGGAGGAGCGCGCCAUCCUGCGGGACAAGCAGCUGAAAGGCAGCCUGCUGCAGCCCCGGCCGGACCUGAAGCCCCCGCCGCACGCCCAGCAGGCCCCGCUGGCCGCCUGCACCCUGGCCCUGCAGGCUAACCACAGCGUUCCCGACGUGGCCCACCCGGUGCCCUCGCCCAAGCCUGCCAGCGUGCAGGAGGACGCGGUGGCCCCGGCGGCGGGCUUCCGCUGUACCUUCUGCAAGGGCAAGUUCAAGAAGCGCGAGGAGCUGGACCGCCACAUCCGCAUCUUGCACAAGCCCUACAAGUGCACGUUGUGCGACUUCGCGGCUUCGCAGGAGGAGGAGCUCAUCAGCCACGUGGAGAAGGCACACAUCACGGCCGAGUCGGCCCAGGGCCAGGGCCCCAACGGCGGUGGCGAGCAGUCGGCCAACGAGUUCCGCUGCGAGGUGUGCGGUCAGGUGUUCAGCCAGGCGUGGUUCCUCAAGGGUCACAUGCGCAAGCACAAAGACUCCUUUGAGCACUGCUGCCAGAUCUGCGGCCGGCGCUUCAAGGAGCCCUGGUUCCUCAAGAACCACAUGAAGGUCCACCUCAACAAGCUGUCGGUGAAGAACAAGUCCCCCAGCGACCCCGAGGUGCCUGUGCCCAUGGGCGGCAUGUCCCAGGAGGCCCACGCCAACCUGUACUCCAGGUACCUCUCCUGCCUGCAGAGUGGCUUCAUGACCCCGGACAAAGCCGGCCUGAGCGAGCCCAGCCAGCUCUAUGGCAAGGGCGAGCUGCCCAUGAAGGAGAAGGAAGCGCUGGGGAAGCUGCUGUCUCCCAUCUCCAGCAUGGCCCACGGCGUCCCGGAGGGGGACAAGCACUCCCUCCUGGGAUGCCUCAAUCUCGUGCCGCCGCUGAAAUCCAGCUGCAUCGAGCGGCUGCAGGCGGCUGCCAAGGCUGCGGAGAUGGACCCCGUGAACAGCUACCAGGCUUGGCAGCUCAUGGCCAGGGGCAUGGCCAUGGAACAUGGCUUCUUGUCUAAAGAGCAUCCGCUGCAGCGCAACCACGAAGACACUUUGGCAAACGCCGGGGUUCUGUUUGAUAAGGAGAAGCGGGAGUACGUGUUAGUGGGAGCAGAUGGCUCCAAGCAGAAAAUGCCUGCUGAUUUGGUUCACAGCACUAAAGUGGGCAGCCAGAGAGACCUGCCAAGUAAGCUCGACCCUUUAGAAAGCAGUCGGGAUUUUUUGUCACACGGGCUGAACCAGACUCUCGAGUAUAACCUGCAGGGUCCUGGGAACAUGAAGGAGAAGCCCACCGAGUGCCCCGACUGCGGCCGGGUGUUCCGCACUUACCACCAGGUGGUCGUGCACUCCCGUGUCCACAAGCGGGACCGCAAGGGCGAGGAGGAUGGGCUGCACGUGGGCCUGGAUGAGCGGCGUGGCUCGGGCAGUGACCAGGAGUCCCAGUCGGUGAGCCGCUCCACCACGCCGGGCUCCUCUAACGUCACCGAGGAGAGCGGGGUCGGAGGCGGCCUCUCCCAGACCGGGAGUGCCCAGGAGGACAGCCCGCACCCCUCCUCGCCAUCCUCCUCAGACAUUGGCGAGGAGGCUGGGAGAUCUGCCGGCGUCCAGCAACCAGCGCUGCUUCGCGACAGAAGCCUGGGCUCGGCCAUGAAGGACUGCCCGUACUGUGGGAAAACUUUCCGGACAUCCCAUCACCUUAAGGUGCACCUGAGGAUACACACAGGUGAGAAACCCUACAAGUGUCCGCACUGUGACUAUGCCGGCACGCAGUCAGCAUCCUUAAAAUACCACUUAGAGCGACACCAUCGGGAGCGGCAGAACGGGGCUGGGCCGCUGUCUGGGCAACCCCCAAAUCAAGACCACAAGGAUGAGAUGUCAAGCAAAGCUUCUCUGUUCAUCAGGCCAGACAUCCUGAGGGGGGCCUUCAAGGGUCUCCCUGGAAUCGACUUCAGAGGAGGCCCUGCAUCUCAGCAGUGGACAUCAGGGGUUCUCUCCUCUGGAGAUCACUCGGGGCAGGCCACGGGCAUGUCUUCGGAGGUCCCCUCAGAUGCUCUGAAAGGCACUGACCUUCCUUCCAAAAGCACCCACUUCUCUGAGAUCGGAAGAGCUUAUCAAAGCAUUGUGAGCAACGGUGUGAAUUUCCAAGGGUCCUUGCAAGCUUUCAUGGACAGUUUUGUCCUCAGUUCCUUGAAGAAGGAGAAGGACAUGAAGGACAAAGCCCUGGCUGACCCCCCUUCCAUGAAAGUCCACGGAGUGGAUGGUGGUGAGGAGAAACCCAGUGGCAAGUCCUCCCAGAGGAAGUCCGAGAAAUCUCAGUAUGAACCCCUGGACUUGUCUGUGCGGCCAGAUGCCGCCUCCCUCCCGGGCUCCUCGGUAACUGUGCAGGACAGCAUUGCAUGGCACGGCUGCUUGUUUUGUGCUUUCACAACGUCCUCCAUGGAGCUCAUGGCCCUUCAUCUCCAGGCCAACCACCUGGGCAAAGCGAAACGCAAAGAUAACACCAUCGGGGUCACAGUCAACUGCAAAGACCAAGCCCGGGAGGCGAGUAAGAUGGCCCUGCUGCCCUCGUUACAAUCAAACAAAGACCUGGGCCUCUCCAAUAUGAUCAGCUCUCUAGACUCUGCUUCUGAGAAGAUGGCCCAAGGUCAGCUCAAGGAGACUCUGGGAGAGCAGAAGAGCGGUGCAUGGACCGGCCACGUGGACCCUGCAUUUUGUAACUUCCCAUCAGACUUCUACAAGCAGUUUGGUGUUUACCCAGGCAUGGUUGGCUCAGGGGCCUCCAGUUCCUGCCCCAACAAGGAGCCUGAUGGAAAGGCCCACUCUGAAGAGGAUGUCCCCAUCCUGAUCCCCGAAACCACGAGUAAGAACACUACUGAUGACCUCUCUGACAUUGCCUCCUCAGAGGACAUGGACUCCUCCAAGGGGGAGAACAACGAUGAAGAGGAUGUUGAAACCGAACCGGAAAUGAUGACCAAGCCACUGUCUGCCCUCAGCAAAGACAGCAGCAGCGAUGGCGGGGACAGCCUGCAGCCCACAGGCACCUCCCAGCCCGUCCAGGGACUGGUCUCACCUUUAUCCCAAGCACCGGAGAAGCAGUGGCACAGCCAGGGUCUUCUCCAAGCCCAGGACCCCUUGGCGGGCCUGCCAAAGCCGGAGCGGGGGCCCCAGAGCCUGGACAAGCCGAUGAACAUGCUGUCGGUCCUCAGGGCCUACAGUUCUGAUGGCUUAGCAGCCUUUAACGGACUUGCAAGUAGCACAGCAAAUUCUGGAUGUAUCAAGAGGCCAGACUUGUGUGGUAAGUGACACUCCCUGUCCUAGUCGGUCUAUCUGGACUUGCCCUUGUCUGUUCGUGGUCCUCGGUGGUUAUCUGCAGCUUGUUAAUCGUGUAAAGUCAAGAGAAGAAUGUAUACACAUAUGUGUGUUGAAUAAUUACUAUUGGCAUAGGUAUGUGUAUACACACGGUGCACCAAUCUACAGUAUAUAUAGCAGAGAAUCAGAGGCUAAAAAUAUUACCCCAUAUGUUCCAGUAUUAGUCAUGGAUUGCAAAGGCUUAGUAACUUGAGCAGGAGAGAAAACUCCCUCAAAGUCAUAAAUCCUGAGUGACAACUGCUGCUGGAUGACAGAUCCCUUCACCUGUGGACAACCUGGCUGGGGGUGGGGGGCUGUUCCACCAGCUCACCUGAGCAUGUAGAGGUGGGUCCUGCAGUGGUCUCGUGGGUAUUACUGCUUGUGUCUGAUUGUCCUGUAUUUUGUAACACUUUAGAAGAAUACAGAAAAGUGCAGUAAUUCUCUUUCUCCAUAGUAUUUAAGCAGAAAUAUUGCUAGUUUAAUAUUGUGUCAGGUCGUCCUAUUAACCAGGAGCAGAUGACAGUAAAAUUUCAGUGAAUAGCACCUUGACAUCUACAACUUAAAAAUGGUGAUUGAAGCAAAAUAUGUAAACUUGUACGGGGUGAUCGUGUGCUUUGGAACAGAGUAUUGUUGAAGUAAUUAGAAGAUAUAUUAAGGUGUUCCUGGUAAUGAAGGCAUGUAAGUUAUAAUAAUUGUAGCUUUCUGAAUAAGUGUCAAACUAUAUCUUUAAGUGUGCUGUAUGCUGAGUUACAAGUUAGGUCAUUUAUGAAUGGAAUGUAAAAUAAUACUAAAAAUGCUUCAAUAACUUAUCUUGGUAUUGCUAAUAAAAAAAAAAAGCUGUGAAACAUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1945.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2033.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 1148.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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