Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_014736.6

Sequence Length

2132 nt

GC Content

0.4109

CCUUGUCCAGUGAAACACCCUCGGCUGGGAAGUCAGUUCGUUCUCUCCUCUCCUCUCUUCUUGUUUGAACAUGGUGCGGACUAAAGCAGACAGUGUUCCAGGCACUUACAGAAAAGUGGUGGCUGCUCGAGCCCCCAGAAAGGUGCUUGGUUCUUCCACCUCUGCCACUAAUUCGACAUCAGUUUCAUCGAGGAAAGCUGAAAAUAAAUAUGCAGGAGGGAACCCCGUUUGCGUGCGCCCAACUCCCAAGUGGCAAAAAGGAAUUGGAGAAUUCUUUAGGUUGUCCCCUAAAGAUUCUGAAAAAGAGAAUCAGAUUCCUGAAGAGGCAGGAAGCAGUGGCUUAGGAAAAGCAAAGAGAAAAGCAUGUCCUUUGCAACCUGAUCACACAAAUGAUGAAAAAGAAUAGAACUUUCUCAUUCAUCUUUGAAUAACGUCUCCUUGUUUACCCUGGUAUUCUAGAAUGUAAAUUUACAUAAAUGUGUUUGUUCCAAUUAGCUUUGUUGAACAGGCAUUUAAUUAAAAAAUUUAGGUUUAAAUUUAGAUGUUCAAAAGUAGUUGUGAAAUUUGAGAAUUUGUAAGACUAAUUAUGGUAACUUAGCUUAGUAUUCAAUAUAAUGCAUUGUUUGGUUUCUUUUACCAAAUUAAGUGUCUAGUUCUUGCUAAAAUCAAGUCAUUGCAUUGUGUUCUAAUUACAAGUAUGUUGUAUUUGAGAUUUGCUUAGAUUGUUGUACUGCUGCCAUUUUUAUUGGUGUUUGAUUAUUGGAAUGGUGCCAUAUUGUCACUCCUUCUACUUGCUUUAAAAAGCAGAGUUAGAUUUUUGCACAUUAAAAAAUUCAGUAUUAAUUAAACAUUACUUAUUCUACCCUCUUUUUUGGCAAGGAGGACAAAUACGCAAUGUUGGAAAACCUUGGAUGGAUAUCUUCUCUUUAAAAAAAUGUAAAGAUAAUUUGGUCUUGAGGGUUUAAACGGUUGAUAAUGCCUCUACAACAACAAGAAAAAAGAUAAAAUACUAGGAUAGAAUCAUGGUGGGCACAGUGGCUUCUCAGGAGGCUGAGGAGGGAGGUUUGCUUGAGUCCAGGAGUUGGAGACCAGCCCAGGCAACAUAGCGUAAACCCUAUCUCUAAAACAAUUUUUAGCCGGGUGCGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUCUGGGAGGCCGAGGCGGGUGGAUCAUGAGGUCAGGAGAUCGAGACCAUCCUGCCUAACAAGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCCGGGCGCGGUGGCGGGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUGGCGUGAACCCGGGAAGUGGAGCUUGCAGUGAGCCGAGAUUGCGCCACUGCAGUCGGCAGUCCGGCUUGGGCGACAGAGCGAGACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAUUUUAAAAAAGGCUGAGUGCAGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGCAGGUGGAUCACCUGAGAUAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAGCAUGGUGAAACUGUCACUACUAAAAAUGAAAAAAUGAGCCAGGCAUGGUGGCACAUGCCUGUAAUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCUGGGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCCCAGAUUGUGCCACUGCACUCCAGCCUGAACAACAGAGUGAGACAAUGUCUUAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAAAAUAUAUAUUUAUAUAUGAACAAUAAAAAAUUAGCCUGGCAUGGUGGCACACACAGUGGAACCAGAUCCCAUCUCUUAAAAGAAAUUUUCCUAGGAUUUGCAUUUGAUUCGCUAUCAUAAAAUAUAAUUUUAAAGUUGGAAGUCAAUAUAACAUGAAAGGCAAAUCAUGCCAUAAACCCAUAGGCAUGGCAAAACUCCUAAGAGCUACUAUGACAUUUUUCAACAUAACCAGAGGUAUAAUUGAAGAAGUGGGUAUAAUAUUCCUCAUCACCCUUUUUGCAGCAGCCUGUUGUCAAAAGUAAUCAUAUUUUAGUAGGCAUAUUUUUCUGAAAUACGUUUGUAAUAAAUGCAUACUUAUUUUUACAAUACACUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-606.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -647.62

Frequency: 0.0000

Diversity: 623.90

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........((((......((.(..(((((...(((..(((((((((((((.((((((((((((..((((..(((((((((.((..(((((..(((..((((((((((.........(((.((((.....)))).)))...))))))))))......))).)))))...)).)))).)))))..)))).))))))...............(((((((.(((...))).)))))))((((((.(((....)))(((...........(((((..((((((((......)))))))).(((((.........)))))((((((......))))))...((((.(((((....((((((.((........))))))))..))))))))).((((.((((((..((((.......))))..)))))))))).......))))).((((((((.(((((((((((.(((((....)))))....(((((((((((((......)))..))))))))))..........(((((((((.....((((((((..(((..(((.((((((.......((((...((((.((((..........))))))))..))))(((((((((((.((((((((((....................((((....)))))))))))).)).)))))))))))....)))))).))).)))))))))))....)))))))))((((((..((.((((((((...((((.....))))..))))))))))..((((((((..((....((((((((....))))).)))..(((((((........)))))))............((((((.(.((((....(((((((......)))))))...)))).).))))))...(((((((((((.((((((((..(...........)..))))))..)).))))..)))))))....)).))))))))....)))))).....................)))))))...)))).))))))))....(((((((((((..((((.(((((((((((((((((.((((.((.(((((...))))))).))..)).))).)))))))...))))).............((((....))))(((....)))......))))))..)))))))))))((((((((.(..((((.(((.(((((...........))))))))......))))..))))))))).....................)))))))))((((((((((.......).))).)))))).))))))..))))..)))))))))..))).)))))...).)).((((((...((((((.((((((.(.((....)).))))))))))))).((((((((.(((((((...))))).............................(((((((((((((((((.((..(((....((((((....)))))).....)))((((((...)))))).....((.(((((..(((((((((((((...((((((.....))))))...............)).))))))).))))(((....)))((((((((((.((.((((((((((.((..(....)..))))))...)))))))).))).))))))).)))))))....)).))))))))))).))))))...........((((((...))))))............................((((((....))))))................((((..(((((((.....)))((((((..(((((..((..(((((...(((...))).)))))..)).))))).))))))....((((((...))))))..((((.....))))....))))..))))....((((((...........))))))(((((((((....)))........((.((((((((....(((...)))....))))))))))((((...............)))).))))))....)))))))))).((((((....)))))).))))))..........((((((.((.((((.....)))).)).)))))).......)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

...,,,..((((.....,{{,,.,(((((...(((..(((((((((((((.((((((((((((..((((,.(((((((((.,,..(((((..(((..((((((((((.........(((.((((.....)))).)))...))))))))))......})).)))))...},.)))).))))),,))}).))))))..,..,.........(((((((.(((...))).)))))))((((((..{{,,..|}|{{{....,||,.||||{{|,.{(((((((......)))))))},((({,.....,,,.))}|,{(((((......)))))}.,.((((.(((((....((((((.((........))))))))..))))))))).((((.((((((..((((.......))))..))))))))))......{|||||.{((((({(,((((((({({{.(((((....})))}....(((((((((((((,.....}}),}))))))))))..........|{{{{{{{|.,{{|{{{{{({{..({{..(((.(({{{{.,,{,{{({{{.,{(((({(({({{.{{{{,{,|}}||||||,|||,,{{{{{{{(((.{(((((((,,.....}}}}}}},,,}},..||||...,)))),)))}})),)},))))}}})})),.,,}}}|||.}}}.}))})}))}}},}},})))))))|{{{{{|.,{|,(((({{{{,,.{(((,,,,,||||.|||}}}}||||,,..{{{{|,|{{{{{{{{{((((({....})))}}}},,}||{((((........)))}}},.||||.,,,,,,}}},,}}},.,,,,,..{{|||||...},.)))))))}}}}.,,.}|||||||...(((((((((((.((((((((..(,{{.....,,.)..))))))..)).))))..))))))).,,,{{{,,....,)))..}}}}))},................,,,)))))})},.,})).))}))))}....((((((((({{{{((((.((({({,((((((((((.((((.((.(((((...))))))).))..}).})).))))))),,.}}}||{{{,....})))}},{({{{{||||{,,.,.}))),},..})))))).})))))))))))((((((((.(..((((,(((.(((((,........,.))))))))..,...))))..)))))))))...................,,}}|)))))){((({{{{{|,,,.,..}}))}.)))))}.))))))..))))..)))))))))..))).)))||{..||||,{{{((({{((.((({.,..||,}}}}}}))}|}|{|}||||}}||||.|,,..},}}))|{|||}}}}||||....................}}}}.....(((((((((((((((((.((,,((({,..((((({....}))))).....}))((((((...)))))).....((.(((((..(((((((((((((...((((((.....))))))...............)).))))))).))))(((....)))((((((((((.((.((((((((((.((..(....)..))))))...)))))))).))).))))))).)))))))....)).)))))))))))}})))))...........|{((({...))))),............................((((({....})))}}................(((({.((((((({(...,...{{(({..,,,.|,}}|,.({{....}}}.....|{.{{|{|{{{{{..,{{{{{.|{{.{,,({{{({...}|||}}..,,||}.}}}}})}.,..,}}},.,}}).,,,((((((.{.......,.)))))))))}}..}}}}}.))))))))})),{.((((((((....(((...)))....))))))))}}((({.........,...,.}}}}{((({((((({...)))))}}))))}......|,|,,,|}})}}}..,}))))))|{{{{{.((.((((.....)))).)).)))))),}},,..)}},.