Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_015675.4

Sequence Length

1371 nt

GC Content

0.5740

AGAUCGCCGAAGCGUCGGACUACCGUUGGUUUCCGCAACUUCCUGGAUUAUCCUCGCCAAGGACUUUGCAAUAUAUUUUUCCGCCUUUUCUGGAAGGAUUUCGCUGCUUCCCGAAGGUCUUGGACGAGCGCUCUAGCUCUGUGGGAAGGUUUUGGGCUCUCUGGCUCGGAUUUUGCAAUUUCUCCCUGGGGACUGCCGUGGAGCCGCAUCCACUGUGGAUUAUAAUUGCAACAUGACGCUGGAAGAGCUCGUGGCGUGCGACAACGCGGCGCAGAAGAUGCAGACGGUGACCGCCGCGGUGGAGGAGCUUUUGGUGGCCGCUCAGCGCCAGGAUCGCCUCACAGUGGGGGUGUACGAGUCGGCCAAGUUGAUGAAUGUGGACCCAGACAGCGUGGUCCUCUGCCUCUUGGCCAUUGACGAGGAGGAGGAGGAUGACAUCGCCCUGCAAAUCCACUUCACGCUCAUCCAGUCCUUCUGCUGUGACAACGACAUCAACAUCGUGCGGGUGUCGGGCAUGCAGCGCCUGGCGCAGCUCCUGGGAGAGCCGGCCGAGACCCAGGGCACCACCGAGGCCCGAGACCUGCAUUGUCUCCUGGUCACGAACCCUCACACGGACGCCUGGAAGAGCCACGGCUUGGUGGAGGUGGCCAGCUACUGCGAAGAAAGCCGGGGCAACAACCAGUGGGUCCCCUACAUCUCUCUUCAGGAACGCUGAGGCCCUUCCCAGCAGCAGAAUCUGUUGAGUUGCUGCCACAAACAAAAAAUACAAUAAAUAUUUGAACCCCCUCCCCCCCAGCACAACCCCCCCAAAACAACCCAACCCACGAGGACCAUCGGGGGCAGAGUCGUUGGAGACUGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGAAGGGGAGUGAGCGGCCGCCCCCAGGGCGGAGAUCCAGGAGCUGGCGGCCGCCGAUCCGAUGGAGAAGGGGGGACCCAGGCCAGCAGGAGACAGGACCCCCGAAGCUGAGGCCUUGGGAUGGAGCAGAAGCCGGAGUGGCGGGGCACGCUGCCGCCUUCCCCAUCACGGAGGGUCCAGACUGUCCACUCGGGGGUGGAGUGAGACUGACUGCAAGCCCCACCCUCCUUGAGACUGGAGCUGGCGUCUGCAUACGAGAGACUUGGUUGAACUUGGUUGGUCCUUGUCUGCACCCUCGACAAGACCACACUUUGGGACUUGGGAGCUGGGGCUGAAGUUGCUCUGUACCCAUGAACUCCCAGUUUGCGAAUUAUAGAGACAAUCUAUUUUGUUACUUGCACUUGUUAUUCGAACCACUGAGAGCGAGAUGGGAAGCAUAGAUAUCUAUAUUUUUAUUUCUACUAUGAGGGCCUUGUAAUAAAUUUCUAAAGCCUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-522.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -546.33

Frequency: 0.0000

Diversity: 369.26

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((.....(((....))))))))(((((((.....(((((.....(((((((((..(((((((....(((((((((.......))))))))).....))).....))))..))))).))))...)))))...)))))))((((((((((((((((((.((((((..(((((...((((.(((......))).))))(((((.....)))))..(((((((((((......(((((..(((.((((((.((((((((((.((((.(((....(((((((((.(((((((.((.((((((.(.((((((((.........)))))))).).)))).)).)).)).....(((((((((((((((..((.((((((((((((.((((((.(((((((.((((((.(.......).)))))).))))))).))...(((((((...(((.((((..((((.(((.(((.((((((((((((...((((........((((((((.((((((.....((((...)))).((.((((((..............)))))))).........)))))).)))))))))))).....)))))....((((.(((.((.((((((.....))).))))).))))))).((((.(((.(.((.......)).).))).........((((((((((.(.(((((((((((.....)))))).(((((((.(((((((..((....)).)))))))...............(((.......)))...((((((..(((((((((....(((((.......(((.......).))......)))))....)).)))))..........))..)))).)).)).)))))(((.((.((((((((((((.(((......))).)).)..))))))))))).)))...))))).))))))))))))))))))))))))).)))..(((((.((....)).)))))...)))).))))..)))...)))))))..))))..(((((((.......)))))))........(((((((((((((((.((..(.(.....))..)).))))))))...)))..)))).)))).)))))))).))...)))))))))).)))))..))))).)))))))))..(((..((((.(((.....)))..)))).))))))..))))..)))).)).)))))))))).)))))))))))).)))))))..(((((......)))))..)))))......)))))).)))..))))))((((((((((..((((....)))).))))))))))...((((((...))))))........))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,.,{({(((({.,({{,,,({{|,,|||{}||({{,,,{{(((({.....,..,||{{||,{{||||{....((({(((((,,,,,..|||||||||.....}|}||||,}))}||||||},|((((......)}}},}}})}}||||{,{((((((((((({(((,,,.((((((({.((((.(((,,...,}}|.}}}){{{{{,,,.,))))).....})))))))..}}}.|||}}..})))))|{|((((,{,...}))),})||{.....|||{{{{||.|||||{{|||||||{{{.|,{{{{|||({{..,...}))))}})}.},}}||.}||||||}||,..(((((((((((((((..((.((((((((((((.((((((.(((((((.((((((.(.....,.).)))))).))))))).))...(((((((...(((.((((..((((.(((.(({{(((((((({({{...(({,........((((((((.((((((..{,.((((...)))).|(,((((((....,.....,...)))))))).........)))))).))))))))||||,,,{{||||}....((((.(((.((.((((((.....))).))))).)))))))|((((.(({.{.{(.......)).},})).....,,..((((((((((.{.(((((((((((.....)))))),(((((((.(((((((..((....)).)))))))...............,,,......,))}...(,(((({,({((((({(....(((((.......{({.......}.))......)))))....)).))))).,.||.....))..)})),)).)).)))))|((.((.((((((((((((.(({......})).)).}..))))))))))}.)))...))))).})))))))))))))))))))))))).))}..(((((.((....)).)))))...)))).))))..)))...)))))))..))))..(((((((.......))))))),|||....(((({{{((((((((.((..(.{.....})..)).)))))))),.,))).,)))}.)))).)))))))).),,..))))))))))},))))..|||||,|||||,},,..,,,)})))))))}....,{(((({.((((.((.(((((.......))))))).)))).}...)))))},.,{{{{{..{((((,....}}}}},)))),.,}}))}|||{,,,||||,.}}}.}))))))|||,||||||,,|{((,...))}}.}}}}}}}))),,...,|||}}},,,,.},.......,}}}})))}.