Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_015696.5

Sequence Length

1229 nt

GC Content

0.5045

GUCUUUGCCCUCGCGACGCCGCCACCUCCGGAACAAGCCAUGGUGGCGGCGACGGUGGCAGCGGCGUGGCUGCUCCUGUGGGCUGCGGCCUGCGCGCAGCAGGAGCAGGACUUCUACGACUUCAAGGCGGUCAACAUCCGGGGCAAACUGGUGUCGCUGGAGAAGUACCGCGGAUCGGUGUCCCUGGUGGUGAAUGUGGCCAGCGAGUGCGGCUUCACAGACCAGCACUACCGAGCCCUGCAGCAGCUGCAGCGAGACCUGGGCCCCCACCACUUUAACGUGCUCGCCUUCCCCUGCAACCAGUUUGGCCAACAGGAGCCUGACAGCAACAAGGAGAUUGAGAGCUUUGCCCGCCGCACCUACAGUGUCUCAUUCCCCAUGUUUAGCAAGAUUGCAGUCACCGGUACUGGUGCCCAUCCUGCCUUCAAGUACCUGGCCCAGACUUCUGGGAAGGAGCCCACCUGGAACUUCUGGAAGUACCUAGUAGCCCCAGAUGGAAAGGUGGUAGGGGCUUGGGACCCAACUGUGUCAGUGGAGGAGGUCAGACCCCAGAUCACAGCGCUCGUGAGGAAGCUCAUCCUACUGAAGCGAGAAGACUUAUAACCACCGCGUCUCCUCCUCCACCACCUCAUCCCGCCCACCUGUGUGGGGCUGACCAAUGCAAACUCAAAUGGUGCUUCAAAGGGAGAGACCCACUGACUCUCCUUCCUUUACUCUUAUGCCAUUGGUCCCAUCAUUCUUGUGGGGGAAAAAUUCUAGUAUUUUGAUUAUUUGAAUCUUACAGCAACAAAUAGGAACUCCUGGCCAAUGAGAGCUCUUGACCAGUGAAUCACCAGCCGAUACGAACGUCUUGCCAACAAAAAUGUGUGGCAAAUAGAAGUAUAUCAAGCAAUAAUCUCCCACCCAAGGCUUCUGUAAACUGGGACCAAUGAUUACCUCAUAGGGCUGUUGUGAGGAUUAGGAUGAAAUACCUGUGAAAGUGCCUAGGCAGUGCCAGCCAAAUAGGAGGCAUUCAAUGAACAUUUUUUGCAUAUAAACCAAAAAAUAACUUGUUAUCAAUAAAAACUUGCAUCCAACAUGAAUUUCCAGCCGAUGAUAAUCCAGGCCAAAGGUUUAGUUGUUGUUAUUUCCUCUGUAUUAUUUUCUUCAUUACAAAAGAAAUGCAAGUUCAUUGUAACAAUCCAAACAAUACCUCACGAUAUAAAAUAAAAAUGAAAGUAUCCUCCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-395.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -417.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 292.43

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......((((((((..((((((((((...((......))..))))))))))...)))((((.(((((((((((((((((..((.(((.....))))).)))))))))).....))))).....(((((((.........(((((.....(((.((((((.((..((...((((.((((((...(((((.((((....((((.((....))))))))))..)))))...))))))...)))).))..)).)))))).)))...)))))...(((......))).))))))).))))))..(((((((.....((((((((((...........((((((((.(((.(((((((.((((...((((((((((((..((((...........((..((((.(((((....)))))......))))..))..((.(((..(((((....))))).))).))((((((....(.(((((...(((...)))...))))).)...))))))..))))..))))))...))))))...)))).)).((((((.(((((...(((((.((..((((((..(((((......)).)))(((.((((.............)))).)))........))))))...))....))))))))))))))))...))))))))...(((((.((((.((((((((.........))))))))......((((((((((.....((((.((((....))))))))...((((.((((.......)))).))))...............(((....))))))..)))))))...........)))).)))))((.((((...((.(((((((((((....))).)))))...))).)).))))..))..))))))))......))))))))))))))))).....((((.....)))))))))((((((((((..((((........))))(((..((((((.(((...)))..((.....)))))))))))......((((((((.........))))))))...((((((.((((...(((((((((.((((.(((((((...((((((....)))..)))...)))))))))))......................(((((........)))))))))))))).))))))))))...........))))))))))............................

Thermodynamic Ensemble Prediction

,,,.,((((.{((,,.((((((((((...((......))..)))))))))).))).))))|,|||(,((((((((((((..((,(((...,,)))}).)))))))))|{....,,.,|.....{{{({{|,,.......(((((.....(((.((((((.((..((..,({((.((((((...(((((.(((({.{{,(((.,,....)),)))))))..)))))...)))))).,}}))}.))..)).)))))).))).,.)))))...{{{......}}|,||}|}}|,.|||},..|{,(({,|||,.,||||||||,,,,.},....,||{||,{|.|||}{{{||||,||||...((((((((((((..((((..,....{{{.{{.,||,(.(((((....|)))),.....,)))..}}..||.{((..(((((....))))).))).}}((((((....(.(((((...(((...)))...))))).)...))))))..))))..))))))...))))))...|}||{||,((((((.(((((...(((((,({..((((((..(((((......)),}))(((.((((.............)))).)))........))))))..,))....})))))))))))))))...|||,,|}}....|{|||{{{{.((((((((.......,.)))))))),,,.,.{{,{{{{{.(((((((((((.....{((({((((((,,,{(,,..,,|,,,,...||||,|,,}|,....,...,,,,}}|{...{{{|((,{{{,{{..,.}}}}}.}})).))..,,}}.{{.((((...{(.{{(((((((((....}}).))))),..,)}.)).))))..))...,,)))))),}.,}))||...,))....)))))))))))....,,|}},}))}.((((((((((,,({((.,......}}}|{{,..{((({{.{|{,,,|||..((.....)),))))))},......((((((((.........))))))))...{(((((.((((...(((((((({.((((,(((((((...((((((....)))..)))...))))))),,))}}}....,,,...{{{{.....,,,,,...}}},.},)))))))))))).))))))))))..,.....,,.))))))))))...........,},.,}},}}}}}}...