Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_015710.5

Sequence Length

1504 nt

GC Content

0.6423

CUUCCUUUGACAAGAUGGCGGCAGGAGGCAGUGGCGUUGGUGGGAAGCGCAGCUCGAAAAGCGAUGCCGAUUCUGGUUUCCUGGGGCUGCGGCCCACUUCGGUGGACCCAGCGCUGAGGCGGCGGCGGCGAGGCCCAAGAAAUAAGAAGCGGGGCUGGCGGCGGCUUGCUCAGGAGCCGCUGGGGCUGGAGGUUGACCAGUUCCUGGAAGACGUGCGGCUACAGGAGCGCACGAGCGGUGGCUUGUUGUCAGAGGCCCCAAAUGAAAAACUCUUCUUCGUGGACACUGGCUCCAAGGAAAAAGGGCUGACAAAGAAGAGAACCAAAGUCCAGAAGAAGUCACUGCUUCUCAAGAAACCCCUUCGGGUUGACCUCAUCCUCGAGAACACAUCCAAAGUCCCUGCCCCCAAAGACGUCCUCGCCCACCAGGUCCCCAACGCCAAGAAGCUCAGGCGGAAGGAGCAGCUAUGGGAGAAGCUGGCCAAGCAGGGCGAGCUGCCCCGGGAGGUGCGCAGGGCCCAGGCCCGGCUCCUCAACCCUUCUGCAACAAGGGCCAAGCCCGGGCCCCAGGACACCGUAGAGCGGCCCUUCUACGACCUCUGGGCCUCAGACAACCCCCUGGACAGGCCGUUGGUUGGCCAGGAUGAGUUUUUCCUGGAGCAGACCAAGAAGAAAGGAGUGAAGCGGCCAGCACGCCUGCACACCAAGCCGUCCCAGGCACCCGCCGUGGAGGUGGCGCCUGCCGGAGCUUCCUACAAUCCAUCCUUUGAAGACCACCAGACCCUGCUCUCAGCGGCCCACGAGGUGGAGUUGCAGCGGCAGAAGGAGGCGGAGAAGCUGGAGCGGCAGCUGGCCCUGCCCGCCACGGAGCAGGCCGCCACCCAGGAGUCCACAUUCCAGGAGCUGUGCGAGGGGCUGCUGGAGGAGUCGGAUGGUGAGGGGGAGCCAGGCCAGGGCGAGGGGCCGGAGGCUGGGGAUGCCGAGGUCUGUCCCACGCCCGCCCGCCUGGCCACCACAGAGAAGAAGACGGAGCAGCAGCGGCGGCGGGAGAAGGCUGUGCACAGGCUGCGGGUACAGCAGGCCGCGUUGCGGGCCGCCCGGCUCCGGCACCAGGAGCUGUUCCGGCUGCGCGGGAUCAAGGCCCAGGUGGCCCUGAGGCUGGCGGAGCUGGCGCGGCGGCAGAGGCGGCGGCAGGCGCGGCGGGAGGCUGAGGCUGACAAGCCCCGAAGGCUGGGGCGGCUCAAGUACCAGGCACCUGACAUCGACGUGCAGCUGAGCUCGGAGCUGACAGACUCGCUCAGGACCCUGAAGCCCGAGGGCAACAUCCUUCGAGACCGGUUCAAGAGCUUCCAGAGGAGGAAUAUGAUCGAGCCUCGAGAGAGAGCCAAGUUCAAACGCAAGUACAAGGUGAAGCUGGUGGAGAAGCGGGCGUUCCGUGAGAUCCAGUUGUAGCUGCCAUCAGAUGCCGGAGACUCGCCCUUCAAUAAAAAAUCUCUUCUAGCUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-647.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -672.36

Frequency: 0.0000

Diversity: 570.51

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((((((......(((.((((((((((((((((((.(..((.((...))))....).))))))))...)).))))))))((((....)))).(((((((...((((((((((((..(((.((.((.((.(((..............))).)).)).)).)))..)))))....))))))))))))))(((..((((...))))..)))(((((.((.....)))))))((((..((((((.((.((.(((((.(...((.(.....((((((((.((((.((((((((.(((((....(((((..................)))))...((((((....)))))).........((((((((((...(((......))).....((((..((((((.(((((...........((((((.((.(((((((...(((.....((((.(((((..((..(((((........))))).))..(((((((.(((((((((((.((((((...((((((.(((..(((.(((.....(....).....))))))..))).))))))..((...)).....((((((((((.((..(((...((((((((........)))...))))).((((((..((((((........))))))....))))))......))).)))))).)))).)).(((((.(((.....(((......))).......))).))))))))))).))))((((((((.(((........))).)).((.((...(((((((....(((((((((...)))).)))))...)))))..)).)).)).)))))).....))))))).))))))))))))...)))).)))(((((.((..((.(((....(((((.((((.(....).)))).)))))))).)))).)))))..))))).)).))...))))))))))).)).))))..))))(((..(((((.((((.((((.((((((((.(((................(((((((((..(((..((.((((.((.(((....))).)).(((((......((((........))))))))).)))).)).)).)..)))))))))(((((((.((.((..((((((((....)))).))))....)).)).))))))))))..)))))..))).)))).)).)).)))))..)))(((...((((((.....))))))...))).....((((..(((((...(((..(((((((........))))).))...))).)))))..)))).)))))))))).....))))).))).))))).........))))))))))))...).)).).))))))).)).)))))).))))...)))..)).))))).))((((((.(((((...(((((((((((((....((((....))))...))).....)))))...)))))............))))).))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,((((((,,.....{{({({(,(({((({(,(((((({,((({.,(((({(((,{,...|||,,}|{{.{(((.(((((.((((,((((.((({.((((((((.......)))))))).}),,)).)).}}.)))).))))).)))}.}|||((({{(((((((((.,,,..}}}}))))|{{((({{{,(,(..((((,,,)}}}..}}|{{{{|||{.....}))})}))|||((.(((((.,..,,,.}})))}}..........{{(((((((.((({,.{({{{((,..,{{....{{{{{.........,.,..,,,.})))),|}||||||...,))))))}....(((((....)))))...{((|.|||,|}}..,....||,.,||}||||}||}}}..},}|||}|.|||{.,,.{|||,|,..((((.......}}.))})|}}||,,(((((,.((({(,{(((.{{{..,,,,|||.||||{{{(((({.((((,{({((((,{.((({,{(({(((.....({{{{{,....,||||,..)))}||||||,{{{....|({{{{{,.,,,,}))}}}).|,},}))))}|{{|.|,,,..,||}}..}))}},|||||}}.((((((........)))))).})))}}}},),}},.})))))...},)))).)}.{{|||||.}}}}.(((((((((((,(.(((((({,,...,|,{(((((((((,,((({({{.,,..{{.{{{{{||....,({(({..{,((,(((.({(((((((,(...,,},.}||||,|{|||,,..{{{{{.{{{....((((.(.(((....(({{{((((((...))).)))))))))).))))),,.|||.}.}|||,,.,|||}}}},,}}))))})))))),)}},)).))))).}}((..(((((((..(((((.(((({,(((,.((.((....)).)).)))))))).)))))....)))))))..)).,...........{{{,{(,((,((((({((.{......(((((((.{.{....}.,)))))))..})))))))))..||||||}||||||,}}..,.},,||||{.((((((.(((.((.(((.((((.....)))).)))..)).))).)))))).))))),}}.})))),.)))))}})))))))))..}}{{.((((....)))).},..}.))))))))))).......((((..(((((...(((..(((((((........))))).)}...))).)))))..))))..,)))).))))....{(,((((((.(((({{((....(((((...)))))....)))))).).)))))).)}|||{|..}}}}...|,,..,}....|||},|{||||||{{,..||||||||||}}}....}}||||,,,.))),,}})),,}))))}|}}.}})))))),,.........}))))),)))))).