Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_015894.4
Sequence Length
2248 nt
GC Content
0.6308
ACUGCAGCACCAGCCGUCUGCAGCUCCGGCCGCCACUUGCGCCUCUCCAGCCUCCGCAGGCCCAACCGCCGCCAGCACCAUGGCCAGCACCAUUUCCGCCUACAAGGAGAAGAUGAAGGAGCUGUCGGUGCUGUCGCUCAUCUGCUCCUGCUUCUACACACAGCCGCACCCCAAUACCGUCUACCAGUACGGGGACAUGGAGGUGAAGCAGCUGGACAAGCGGGCCUCAGGCCAGAGCUUCGAGGUCAUCCUCAAGUCCCCUUCUGACCUGUCCCCAGAGAGCCCUAUGCUCUCCUCCCCACCCAAGAAGAAGGACACCUCCCUGGAGGAGCUGCAAAAGCGGCUGGAGGCAGCCGAGGAGCGGAGGAAGACGCAGGAGGCGCAGGUGCUGAAGCAGCUGGCGGAGCGGCGCGAGCACGAGCGCGAGGUGCUGCACAAGGCGCUGGAGGAGAAUAACAACUUCAGCCGCCAGGCGGAGGAGAAGCUCAACUACAAGAUGGAGCUCAGCAAGGAGAUCCGCGAGGCACACCUGGCCGCACUGCGCGAGCGGCUGCGCGAGAAGGAGCUGCACGCGGCCGAGGUGCGCAGGAACAAGGAGCAGCGAGAAGAGAUGUCGGGCUAAGGGCCCGGGACGGGCGGCGCCCAUCCUGCGACAGAACACGUUCGGGUUUUGGUUUUGUUUCGUUCACCUCUGUCUAGAUGCAACUUUUGUUCCUCCUCCCCCACCCCCGCCCCCAGCUUCAUGCUUCUCUUCCGCACUCAGCCGCCCUGCCCUGUCCUCGUGGUGAGUCGCUGACCACGGCUUCCCCUGCAGGAGCCGCCGGGCGUGAGACGCGGUCCCUCGGUGCAGACACCAGGCCGGGCGCGGCUGGGUCCCCCGGGGGCCCUGUGAGAGAGGUGGCGGUGACCGUGGUAAACCCAGGGCGGUGGCGUGGGAUCACGGGUCCUUACGCUGGGCUGUCUGGUCAGCACGUGCAGGUCAGGGCAGGUCCUCUGAGCCGGCGCCCCUGGCCAGCAGGCGAGGCUACAGUACCUGCUGUCUUUCCAGGGGGAAGGGGCUCCCCAUGAGGGAGGGGCGACGGGGGAGGGGGGUGAUGGUGCCUGGGAGCCUGCGUGUGCAGCCGGUGCUUGUUGAACUGGCAGGCGGGUGGGUGGGGGCUGCAGCUUUCCUUAAUGUGGUUGCACAGGGGUCCUCUGAGACCACCUGGCGUGAGGUGGACACCCUGGGCCUUCCUGGAAGCCUGCAGUUGGGGGCCUGCCCUGAGUCUGCUGGGGAGUGGGCAUUCUCUGCCAGGGACCCAUGAGCAGGCUGCAUGGUCUAGAGGUUGUGGGCAGCAUGGACAGUCCCCCACUCAGAAGUGCAAGAGUUCCAAAGAGCCUCUGGCCCAGGCCCCUCCCCACCAGGGCUUUGCAGAUGUCCUUGAAAGACCCACCCUAGAGCCCUUUGGAGUGCUGGCCCCUCCUGUGCCCUCUGCCCUGGUGGAAGCGGCAGCCACAAGUCCUCCUCAGGGAGCCCCAAGGGGGAUUUUGUGGGACCGCUGCCCACAGAUCCAGGUGUUGGAAGGGCAGCGGGUAAGGUUCCCAAGCCAGCCCCAACACCCUUCCCACUUGGCACCCAGAGGGGGCUGUGGGUGGAGGCCUGACUCCAGGCCUCUCCUGCCCACACCCUCUGGGCUGAGUUCCUUCUUUCCCUUGGACGCCCAGUGCUGGCCUUGGAGGACGGUCAGCUGGAGGAUGGCGGUGGGGGAGGCUGUCUUUGUACCACUGCAGCAUCCCCCACUUCUCCACGGAAGCCCCAUCCCAAAGCUGCUGCCUGGCCCCUUGCUGUAAAGUGUGAAGGGGGCGGCUGAGUUCUCUUAGGACCCAGAGCCAGGGCCCUCAACUUCCAUCCUGCGGGAGGCCUUGGCCGGGCACUGCCAGUGUCUUCCAGAGUCACACCCAGGGACCACGGGAGGAUCCUGACCCCUGCAGGGCUCAGGGGUCAGCAGGGACCCACUGCCCCAUCUCCCUCUCCCCACCAAGACAGCCCCAGAAGGAGCAGCCAGCUGGGAUGGGAACCCAAGGCUGUCCACAUCUGGCUUUUGUGGGACUCAGAAAGGGAAGCAGAACUGAGGGCUGGGAUAUUCCUCAUGGUGGCAGCGCUCAUAGCGAAAGCCUACUGUAAUAUGCACCCAUCUCAUCCACGUAGUAAAGUGAACUUAAAAAUUCAAUCAAAUGAACAAUUAAAUAAACACCUGUGUGUUUAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1033.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1071.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 719.91
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((.((..(((((.((.(((.(((((((((((((((((....(((((((.(((......)))..(((((((((((((..((.(.(((((........))))).).))...).))))).))))))).((((..((((...(((((((.....((..(((..((((..(((.(.....).))).))))...)))..))))))))).))))..))))((((((((((....)))).)))))).(((((..((((.(((((............((((((.....))))))...........)))))..)))).((((....)))).(((.....)))(((((....)))))))))))))))))........))))))))))))((((...)))).)))))..))).))..))).))..))..))))))))....((((((((((...........)))))).)))).((..(((......)))..))..((((.((((((((((..((....)).....((.(((((((((((...))(((.((((((.(.......).)))))).))))))).))))).)).(((((((((.(((...(((((((.((.((((((...))))))(((.((((...)))).)))((.((((((((.((.........)))))))))).))..)).)))).)))...)))...)))))))))((.((((((.(((((((((((..(((((((..((((((((((.(((((..(.(((((((((.(((....(((.((.((((((((.((((((.......))))))(((.((((((((.(((.(((((((((((....)))).(((((....)))))(((((((...))))))).......)))).))).))).(((((((...((((.(.(...).).)))))))))))...)))))))).)))....)))))))))).)))))).))))))))).)..)))))...)))(((((((.(((((((.............))))))).....)))))))))))))).....)))))))..)))).).)))))).)))))).))..((((((((((((((((..((.((((........)))).))..))))))(((((((((((((((((((.(((((.......((((...((((((((((((.(..((....))..).))).)))).))))))))).....))))).))))))).(((((((((..((((((.....(((((.((..(((...(((((.(.(((((..((.((.......)).))..).)))).).))))).)))..)).))))).))))))....((.(((((((....))).)))).)).))))))))))))))))(((((((((.....(((.......)))......)))))))))((((.(.((((((....(((.(((((.(((((((.((((.(((((...((((((((((((((..(((...))).))))))).)))))))..)))))..))))...((((.....))))))))))).)))))))).......)))))))))))))))).)))))...)))))((((((((...((((((((((((((((....)))))))))...))))))))))))))))))))))))).))))((((.(((...(((.(((.((((.(((((((((((((((((...((((((.(((((((((.(((((............))))).)))))))(((((....)))))))))))))...))))).(((((((((((((.(((((..(((.(((((((((((((..(((((...)))))....))))...)))))...)))))))..)))))))))....)))))))))..)))...))))))))).)))))))...))).))).)))).....((((((((((.......)))))))))).(((((((((..(((((((((((((.(((((((.(((..((((..(((.(((.(((((...((((.......)))).))))))))...))))))))))))))).....)).)))))....))..)).))))))))...))))).((((((((..((((...))))...))).)))))...................(((........)))...((((...((((......))))...)))).(((((((....))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((((.((.,(((((.((.(((.(((((((((((((((((.,.{(((((((.(((......))){{(((((((,{(((,{{({{(.(((((........))))},||}}..||.))))).))))))).|||{,.,{{||||((((({{,.....{,(({{(((((((...(((({,...,}.)))).,...))).))))..||||{{|,|,,||||(((({(((({,...||||.||||,...))))..||((,(((((..,,{{,.,,..((((((.....)))))).....,.....,},}}..))}}.((((....))))||||||....))|||||},}})))}}}})}})))))))..,..,..)))))))))))}((((...)))),)))))..))),))..))}.}}..))..))))))))....((((((((((..,.....,..))))))}}))).((.((((({{.,{{{{..,,...,|,.{||||{{.,,..{|,,..)){{.,{({.{{|||{||{{{.{{{{({{.{(((((,(,......}.}}))}).))))))),,}})),))|(((((((({.(((...(((((((.,{.((((((...))))))(((.((((...)))).))),(,((((((((.({.....,...,}))))))),.)),.}}.)))).)))...)))..})}})))))))})}}|,||.,{(({((((.({{|(((,(({{(((((((({(,{{{((,,{.(((((((((.(((,{{{,((,((,(((({(((,{{((((,...,{{||,|||,(({((,({({({(,({(((((((((({....},}}.{||||,,.,}))))|{|||||}}}),)))))}}},.,,)}})})))})))}|{(({{{...{(((,{{(,,,{||,|||||||}},)})})))))))).})),}}}))))))}))),,}}))).))))))))).}..}}|||{|.}},(((((((.(((((((...{,...}..,.))))))).,,..)))))))},.}}))|||{{|..,,))},||||,}.}}|||||||||||.{,,{(,((|((((,{(((((..{|.({((.|,,.,..)))).}),,))})))((((((((((((((((((({(((((.....,.((,,,{.((((((((({{{.{..((.,,,))..}.))),)))).)))))}))},.,,.))))),})))))).(((((((((,,((((((.,{..(((((.((..(({...(((((.,.(((({.,((.(({....|.}),)).,|.)))).|.))))).}))..)).))))),))))))..,.{{.(((((((....)))}}))),)),))))))))})))))))(((((((((.....(((.......)))......}))))))))((((.(.((((((....(((.(((((.(((((((.((((.(((((...((((((((((((((..(((...))).)))))))))))))))..)))))..))))...(((({...,))))))))))).))))}))).......))))))))))}))))).}}}}},,,||}}}|{{{((((...((((((((((((((((....)))))))))...)))))))))))))))))))}))|||,|||{((((.(((...(((.(((.((((.(((((((((((,(((((...((((((.(((((((((.(((({....,...,,..))))).)))))))(((((....)))))))))))))...))))),|{{({({(((((((({....,|||,,|}))))|)}}(((.(((({...})}}|,|}|.(((((((((|{{....,,,.,...,.)))})))))))))})))|,..,,,..,))))))))).)))))))...))).))).))))))}..((((((((((.,....,)))))))))),}))}})})}..|)|))}}}|||||}|||||{{.,,{..,|||||(((.(({,(((((...((((.......)))).))))))))...))))))),})))))).....}}.)))))))))))}))).)))).)))....}}},.|,{{{{({,.{({{...))})...))),)}}}|,...}},..,,,,,,,...|{{........)))...,,,,...((((......)))}...,},,.(((((((....)))))))}).
Back