Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_015917.3

Sequence Length

1032 nt

GC Content

0.5446

AGAAGCUGGGCAGCCUCUGCCGGGUUCCGGGAAAAGGAGCUCCUGCUGCCACUGCUCUUCCGGAGCCUGCAGCAUGGGGCCCCUGCCGCGCACCGUGGAGCUCUUCUAUGACGUGCUGUCCCCCUACUCCUGGCUGGGCUUCGAGAUCCUGUGCCGGUAUCAGAAUAUCUGGAACAUCAACCUGCAGUUGCGGCCCAGCCUCAUAACAGGGAUCAUGAAAGACAGUGGAAACAAGCCUCCAGGUCUGCUUCCCCGCAAAGGACUAUACAUGGCAAAUGACUUAAAGCUCCUGAGACACCAUCUCCAGAUUCCCAUCCACUUCCCCAAGGAUUUCUUGUCUGUGAUGCUUGAAAAAGGAAGUUUGUCUGCCAUGCGUUUCCUCACCGCCGUGAACUUGGAGCAUCCAGAGAUGCUGGAGAAAGCGUCCCGGGAGCUGUGGAUGCGCGUCUGGUCAAGGAAUGAAGACAUCACCGAGCCGCAGAGCAUCCUGGCGGCUGCAGAGAAGGCUGGUAUGUCUGCAGAACAAGCCCAGGGACUUCUGGAAAAGAUCGCAACGCCAAAGGUGAAGAACCAGCUCAAGGAGACCACUGAGGCAGCCUGCAGAUACGGAGCCUUUGGGCUGCCCAUCACCGUGGCCCAUGUGGAUGGCCAAACCCACAUGUUAUUUGGCUCUGACCGGAUGGAGCUGCUGGCGCACCUGCUGGGAGAGAAGUGGAUGGGCCCUAUACCUCCAGCCGUGAAUGCCAGACUUUAAGAUUGCCCGGAGGAAGCAAACUCUUCGUAUAAAAAAAGCAGGCCAUCUGCUUAACCCUUGGCUCCACCAUAAGGCACUGGGACUCGGAUUUCUCUAUCUGAUAGAGGUAUUUUCUGUGGCCCUGGGAGCUGUCUGUCUUUCCCCUACCCCCAAGGAUGCCAGGAAGACGUCCACCAUUAGCCAUGUGGCAACCUUUACUUCUAUGCCUCACAAGUGCCUUUCAGAGAGCCCCAAUUCUGCUUUCCCACAAAAUAAACCUAAUGCCAUCAGGCAAAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-359.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -378.44

Frequency: 0.0000

Diversity: 243.38

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((.(((((((.((..((((.(((((((((....(((.(((((((((((....(((((...)))))..)))))).))))).)))((((.(((((.((((((((..(((.((.(((.........))))).)))..)))))))).).....))))))))..........))))))).....)).))))..)).))))))).))......(((.((.((((((.((.(((((.((.(((....))).)).))))((.....)).....(((((((.((((......((((((((.(((.(..(((((((..((......((((((.((((.(((.(......).))).)))).....))))))...((((..((((...(((((((....))))....))))))).))))))..)))))))..).))).))))))))(((((((....((((((...((((.(((((((((.(((.(((((((((.((((((((((((.((...((((((....(((((((((.....((((((((.(((((.((...(.((....((((...))))..)).)....)).))))).)).))).)))...)))))))))...))))))))))))))).....(((.(((.(((((((..........)))))))...((((((..(.((.((.(((((.....(((.((.(((((........))))).)).)))......))))).)))).)..))))))..........))))))(.((((......)))).).......((((((.....))))))..(((.((.((........)).))..)))..((((((......))))))...))).)).)))))))))..)))))..))))).)).))))(((.......)))..))))))....))))))))))).)))))))((((.............)))).....).)).))))))..)).)))..............................((((....)))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(,((((.(((((...))))),)})},,(((((,(((.(((((((((((....(((((...)))))..)))))).))))).))),,.({((,.{{((({({,,|||}}}|,.||||,{{{{({,,......(((((((((.(((....,,((,..{((.(((({...))))).}}....}),.}}}}))).))))))))).......,))),,,.,{,,(({(..((((,.,,.,,,}}}}}))})|,}}}}..},{((((....((((((((.((((......((((((((.(((.(..(((((((..((..,,,........{{{|}},..},,,((((.(((((((.({..,(((((,.{{,.....,.)),,))))|(((....)))}..}).)))))))))))))..)))))))..).))).))))))))(((((((,...((((({...((((.(((((((,{.(((.(((((((((,,(((({({((({,{{,.{((((((,,{,(((((((((.....((((((((.(((((.({...,.{{....((((...))))..)}......)).))))).)).))).)))...))))))))),,,||||}}|{||||||,.....,,|}|||}|{(((((.,,.....,.)))))},...,{{|||,,|.,,{((.(((((.,,..(((.((.(((((........))))).)).)))...,,.))))).)))}.,.,))))),}},,.....,}}}}||{|{|.|....,}))}},,.......((((((|...}))))))..(((.,{{((........,)}),..)))..{{((((..,,,,|}}}}),,,))).}}.))))))))).,}))},}.))))).)).)))){({.......})).,))))))..,.))))))))))).))))))))....))))}.......,||,.....})})}})}}))}})|}}.}},....}}}))))))...............((((....)))).....