Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_016020.4

Sequence Length

2799 nt

GC Content

0.4248

GGAGCGGCGGUGAAGGUCCUGGGUGAGGUAGGGUUGGAUGGUGCUUGCCGCGUAUCAUGGCUGCCUCCGGAAAACUCAGCACUUGCCGUCUCCCUCCGUUGCCCACGAUUCGAGAAAUCAUUAAGUUGUUAAGACUGCAAGCAGCGAAGCAGCUAUCACAGAAUUUCCUCCUGGACUUGAGGCUGACAGAUAAGAUUGUAAGGAAAGCUGGCAAUCUGACAAAUGCUUAUGUUUACGAAGUGGGCCCUGGGCCAGGGGGAAUCACAAGAUCUAUUCUUAAUGCCGACGUCGCUGAACUUCUGGUGGUUGAAAAGGACACUCGAUUUAUUCCUGGAUUACAGAUGCUUUCUGAUGCAGCACCUGGGAAACUGAGAAUUGUUCAUGGAGAUGUCUUGACAUUUAAGGUAGAAAAGGCUUUUUCAGAAAGUCUUAAAAGACCCUGGGAAGAUGAUCCUCCAAAUGUACAUAUUAUUGGAAAUCUGCCUUUUAGUGUUUCAACUCCACUGAUUAUCAAGUGGCUUGAAAAUAUUUCCUGUAGAGAUGGACCUUUUGUUUAUGGCAGAACUCAGAUGACUUUGACUUUUCAAAAGGAAGUGGCAGAGAGACUUGCAGCCAAUACAGGAAGCAAACAGCGUAGUCGCCUCUCUGUUAUGGCUCAGUACCUCUGCAAUGUUCGACACAUCUUUACGAUUCCAGGACAAGCUUUUGUCCCCAAACCAGAGGUGGACGUGGGCGUGGUGCACUUCACUCCCUUGAUACAGCCCAAGAUAGAGCAGCCAUUCAAGCUGGUGGAAAAAGUGGUUCAGAAUGUAUUUCAGUUCCGAAGGAAAUACUGCCAUCGAGGGCUCAGAAUGUUAUUCCCUGAAGCGCAGCGCUUGGAAAGCACGGGCAGGCUGUUAGAGUUGGCAGACAUAGACCCUACUCUUCGGCCCCGCCAGCUCUCCAUCUCACACUUUAAGAGCCUCUGUGAUGUAUACAGAAAAAUGUGUGAUGAAGACCCACAACUCUUUGCAUAUAAUUUCAGAGAAGAACUCAAGCGAAGAAAAAGCAAAAAUGAAGAAAAAGAAGAGGAUGACGCAGAGAAUUACAGACUCUAGCUGCUGCCUGGGGGCGAGCAGCCUACCAGAUGUCGAUUUGCACUACGUGGAGCUUCUUAUAUAGGUACUCUUUUGUCUUUACAGAAUGACGAUACAAAUGCCAAUGACCAGAUGUGACUUAUUUUCCUUUUACUAUACAGCUUGGCAGAGAAAAUAAAUAUCAUCAAAUAAGAUACAGUACAAGCUUUCUUUUAAUAUAUACUGUAUAGAUAGUUAUGACAUGUUUAGUAUAAACAGCAUCUAUUACAAUCUAUCUUACAAAAAUGAAGUAUCUGCACAUUUUGCCCCUAAACCACAUUAAAAUAACUUAAAUAUGCUUUAAAUAAAGCAAAAACUAACAAACAGCUGAAAGAAAAUGCCCAGAGGAUUUUAAAAAAUGGCCCUUUGAAAACUAUUAAUCACGACUUCCCCAGCCUUACUUUUUCCACAUAACUUAAUUAUUAGAAUGUAAUUUUAAGGAUCCUAAAUCAUUUGAUACCUGCUCAAAGUGGAUAUAAACUAAGUAAUUUACAGAUUCUGACCAGUUUCAUCUAGGUUUCUGAUCCACAAUAAAUUAAAAUAACUUAAAUCUUUACAACCAUUUUGUGGGAAAAUGUAUACUGCACAAAACCCAGGAAUGAACAGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGCAAUUUCCACUUUACCACCAGUUUAAAAGUAAAAUGAGGAAUUUAACCCAUAUCUGGAUUGAAUCAUACUAUGAUUUUCCGUGGCUCUCUGUUUCAUAAAAACACUCCUCACUGACAACAGAUGUUAAACUCUGGACACUGAAUUCUCGCUCUAGAACAGAAUUUAGGUCGAUGGUGGCAUUUUCAGACUGACUGUCAAGGGACUGGUGACGGAUCUGCGCCUUGAGCAAAGUUCCUCUGUCCCUCUUGGUGCUGUUGGCUUUUCGUUUAAUGGGGCAGAAGUGCCCCCGGACCAGUUUGGGCUGCUCUCCUCCUUUCUGACCCUCACCCGACUCCGGGCCAGGCUGCUGCUCAGCCUCGGGGUGAACGUCUGGGUCCUCGGAAAUCCUCAGUCUCUGGAACUGAAUUUCGAUGUCUUUAGUAGGGCUGCCCUGCUUCACAGUCUGACGGUGGUCAUCAUCUUCAUCGCUCAGGAUGUCACUCUCUUUGAUGAGAUUGUCGGCAAAAUCUGCCAAGCCGGGGUGUGGGUAUUUCCCGGGAGAAGUGCUCUUGGAGUCCUGCCUGCCCUCAGCCGUGGGGCAGCCGCUGCUCUGGGUGCCGCUGCUCAAGCUGCCCUCGUCAGAGUCCAGCAAGGUUCCCUUGCCAGUCUCACCGGUCCACUCGUUGCUGGAGGAAUUCUUCAGGACUUUUAAAGACCUGGAUGAAGCUACAGUGAGAAAAACACAUUUCGCUGUGAUACAGAAACAGGUUACACAAUGUGUAAUGUUUGCCUCAAAGCUUGUGUAAGAUUUAACAUUAAGAUUUUAUUUUAUGAUAUGACUUCAGUUAGCAACUAUCCUGGUAAUUAGGCAAAAAUGUAGCUACUGAAAACAUGGACAUUUUUGACUUAGGUUUACAGUUGUAAGUUAGGCAAUUCAGCAUUUUUAGAUUACCAGAGCUCAAUUAUGUAAAUAGAACUAGACACUAGAAACUACUACAUGGGCUAAGAUUCUUAUUUUGCCAAGGAGUAAGUUGAAAAGUUAAUUGGUAAUAAUAAAUCUAGGCUCCUUUCUUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-777.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -834.75

Frequency: 0.0000

Diversity: 692.51

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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