Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_016131.5
Sequence Length
3561 nt
GC Content
0.4122
GUCUCAGGCAGCGCGCACGCCGGCGUGAGAGGGCACGGGGAAAAGGUGGCUCUGGCCGGGGUGGCUCGGUUUCCUGGGGCUAUGUAACUGAGCUCGUCGACUUAGGGGUCCUUCUUCGCUGCCCUCGCCGCGUGCUAGCAGGGAGUUUCCGCUCGGGAGAGAGACUGUCCUCACGCCCGCUGCGCCUCCUCGACGGCAGAGCAGGCUUGCUCGCCCGUGGGAGCGUCCCGGCCGAGAAGCCCUGAGGGGGGAGGGGAGGCCAUUUUGUCCCGACCGACUCCCCGGAACCGGGCGGACGGGCUGGGAGAGGCUGCGGAGCCGCGGUCGCCGCCCUCGGAGGCACUGGACGCCGCCACUGUCGGGGCUUCCUCAAAGCUGUUCGUAGGUCGCCCGCGCCGUCUCGAGCCUUUUUCCCACGCUUCCCCGGUCCUCCGGCCUGAGAACGCCCGAGUGAGGAGUUGGCCGUAGUGAGAGGGACCGAUCCCUUGGGGCCGCCGGCGGCGAGAGCCCGAGCCGCUCCUCCCAAUGGCGAAGAAGACGUACGACCUGCUUUUCAAGCUGCUCCUGAUCGGGGAUUCCGGAGUGGGGAAGACCUGCGUCCUUUUUCGUUUUUCGGAUGAUGCCUUCAAUACUACCUUUAUUUCCACCAUAGGAAUAGACUUCAAGAUCAAAACAGUUGAAUUACAAGGAAAGAAGAUCAAGCUACAGAUAUGGGAUACAGCAGGCCAGGAGCGAUUUCACACCAUCACAACCUCCUACUACAGAGGCGCAAUGGGUAUCAUGCUAGUAUAUGACAUCACCAAUGGUAAAAGUUUUGAAAACAUCAGCAAAUGGCUUAGAAACAUAGAUGAGCAUGCCAAUGAAGAUGUGGAAAGAAUGUUACUAGGAAACAAGUGUGAUAUGGACGACAAAAGAGUUGUACCUAAAGGAAAAGGAGAACAGAUUGCAAGGGAGCAUGGUAUUAGGUUUUUUGAGACUAGUGCAAAAGCAAAUAUAAACAUCGAAAAGGCGUUCCUCACGUUAGCUGAAGAUAUCCUUCGAAAGACCCCUGUAAAAGAGCCCAACAGUGAAAAUGUAGAUAUCAGCAGUGGAGGAGGCGUGACAGGCUGGAAGAGCAAAUGCUGCUGAGCAUUCUCCUGUUCCAUCAGUUGCCAUCCACUACCCCGUUUUCUCUUCUUGCUGCAAAAUAAACCACUCUGUCCAUUUUUAACUCUAAACAGAUAUUUUUGUUUCUCAUCUUAACUAUCCAAGCCACCUAUUUUAUUUGUUCUUUCAUCUGUGACUGCUUGCUGACUUUAUCAUAAUUUUCUUCAAACAAAAAAAUGUAUAGAAAAAUCAUGUCUGUGAGUUCAUUUUUAAAUGUACUUGCUCAGCUCAACUGCAUUUCAGUUGUAUUAUAGUCCAGUUCUUAUCAACAUUAAAACCUAUAGCAAUCAUUUCAAAUCUAUUCUGCAAAUUGUAUAAGAAUAAAGUUAGAAUUAACAAUUUUAUUUUGUACAACAGUGGAAUUUUCUGUCAUGGAUAAUGUGCUUGAGUCCCUAUAAUCUAUAGACAUGUGAUAGCAAAAGAAACAAACAAAAGCCAGGAAAACACUCAUUUUCGCCUUGAAUAUGUAAAUGGGAUUAAUUUUGUCCUGUGCCUUAUGUGGAAAGGAACUUCUUUGGUUUUCCUUUUUUGUUCUGGUGGAAGCAUGUGCAGGAGACAUAUCAUCCAAACAUAAACCAUUAAAAUGUUUGUGGUUUGCUUGGCUGUAAUUUUCAAAGUAGUUAAUUGAGGACAAAGGGUAAUGCAGAAGUGAUAGCUUUGGUUUGCUGAGUCUUGUUUUAAGUGGCCUUGAUAUUUAAAACUAUUCCUGCCACCAUUUCUUCUCCUUGGCCACUUCUUCCUUGCGUCUCCCUGCAUGCUGCUUUAUUUGCUUCUCCCUCCCCAACCACCUCAUGGUAUAUUUAAGAGUGAAAGGGACAAACUAGUAGGUUUGUCAAGUUUAAUAUAAAGCACUGAUGUAACUUGCUAGGUAAACGGAAAGAUAAGUUCUAACUGCCUACUAUCCAAUGUCAGUUAAUUGGUGUCUUCCCCCCUCAUUUGCUCUCUUCCCUAAAAUGUGUCCCAGAUGCCUUCAUUUGCUGUUUUACUUCUAUGUUCUGCUUUUCCUCCUCUCUUUGUUCCCUUCCUGUCUAUCCAUUGAGUUUAUGAAAUGGAAGAGUUAACUGCAUGCACUAGUGUUUGGAGGGUGUUGUGGUUUGUCUUUCUAAUUAGGUGUAUAGCCUAUUCACUUUCCUAGAAUAAAUCUCUUAACCUAAAUUUGAGUAGUCUGCAUUUUGGCAACUCCUCUAGCAGCUUGGUAGCCUAGUACAGGUUGUUUUUUUAAAAAAGGAAAAGCAGGAAGGAGGAGUGAAUUUUAUUAACAUGUUUGCCAAAUGUAUUGAGAUUUGGCCUCUGAAGAACACUUUUUCAGUGUUAAGUUUCUUUACCUUAAGAUUCAGAAAUACUUUAGAAUAUUAUUAAUUUUAAGUCCUGUCUUUACAUCCUUUUGGAAAACUUGUAUUACCAUGGGUUUGGAAAAAGGACAACGAAAGGCUUUUCAUGUAAAGAUAAGAUCUUUAGCUAUCUCUAACCCUGUCCUUUUUUCACUGCAUUUUUUCUAGUUUUGCUUCAUUGCUUAUCAUUAGGAUAGGGUAAGUGAAGUUUGCUAUGCUGCUAGCAUCCUAAGAUGAUACCUUUGUUGAAAGAAUUGUGAAUAGCAUGAUUCAUUUCUAGCAGAGGCUGAGUUUAGGACAGCAGCUUCCAUUGAGAAGUCUUUCUGUGUCGUGAAUAGCAUUUUAAUGACCUCUUGGCUCACAUAAGCAAACAACAUAGGGACGUAUCUGCUAUGAAAAUCCACAAAUUUUUCAGAUAGUGCCCUAAAAACAAUUUUAUAUGCCUCACUGGUUGUUAUUCUUAGGUUAUUCCCACACUUGACUUUAUCAUUGUUUACUACUAGUAAAAAGCAGCAUUGCCAAAUAAUCCCUAAUUUUCCACUAAAAAUAUAAUGAAAUGAUGUUAAGCUUUUUGAAAAGUUUAGGUUAAACCUACUGUUGUUAGAUUAAUGUAUUUGUUGCUUCCCUUUAUCUGGAAUGUGGCAUUAGCUUUUUUAUUUUAACCCUCUUUAAUUCUUAUUCAAUUCCAUGACUUAAGGUUGGAGAGCUAAACACUGGGAUUUUUGGAUAACAGACUGACAGUUUUGCAUAAUUAUAAUCGGCAUUGUACAUAGAAAGGAUAUGGCUACCUUUUGUUAAAUCUGCACUUUCUAAAUAUCAAAAAAGGGAAAUGAAGUAUAAAUCAAUUUUUGUAUAAUCUGUUUGAAACAUGAGUUUUAUUUGCUUAAUAUUAGGGCUUUGCCCCUUUUCUGUAAGUCUCUUGGGAUCCUGUGUAGAAGCUGUUCUCAUUAAACACCAAACAGUUAAGUCCAUUCUCUGGUACUAGCUACAAAUUCGGUUUCAUAUUCUACUUAACAAUUUAAAUAAACUGAAAUAUUUCUAGAUGGUCUACUUCUGUUCAUAUAAAAACAAAACUUGAUUUCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-973.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1044.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 920.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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