Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_016142.3

Sequence Length

2396 nt

GC Content

0.3848

GUCAUCCUCACCGUCACGGCCGGCGCCUCCUCCUGGAUUCAUUCACUCGCUCUUUUCAUUCACGAAGGUAGUGAGGCCUAGUGGAAAGCCAUGGAGAGCGCUCUCCCCGCCGCCGGCUUCCUGUACUGGGUCGGCGCGGGCACCGUGGCCUACCUAGCCCUGCGUAUUUCGUACUCGCUCUUCACGGCCCUCCGGGUCUGGGGAGUGGGGAAUGAGGCGGGGGUCGGCCCGGGGCUCGGAGAAUGGGCAGUUGUCACAGGUAGUACUGAUGGAAUUGGAAAAUCAUAUGCAGAAGAGUUAGCAAAGCAUGGAAUGAAGGUUGUCCUUAUCAGCAGAUCAAAGGAUAAACUUGACCAGGUUUCCAGUGAAAUAAAAGAAAAAUUCAAAGUGGAGACAAGAACCAUUGCUGUUGACUUUGCAUCAGAAGAUAUUUAUGAUAAAAUUAAAACAGGCUUGGCUGGUCUUGAAAUCGGCAUCUUAGUGAACAACGUGGGAAUGUCGUAUGAGUAUCCUGAAUACUUUUUGGAUGUUCCUGACUUGGACAAUGUGAUCAAGAAAAUGAUAAAUAUUAAUAUUCUUUCUGUUUGUAAGAUGACACAAUUGGUACUGCCUGGCAUGGUGGAAAGAUCCAAAGGGGCUAUUCUGAACAUUUCAUCUGGCAGUGGCAUGCUCCCUGUCCCACUCUUGACCAUCUAUUCUGCAACCAAGACUUUUGUAGAUUUCUUCUCUCAGUGCCUCCAUGAGGAGUAUAGGAGCAAGGGCGUCUUUGUGCAGAGUGUCCUGCCAUACUUCGUAGCUACAAAACUGGCUAAAAUCCGGAAGCCAACUUUGGAUAAGCCCUCUCCGGAGACGUUUGUGAAGUCUGCAAUUAAAACAGUCGGCCUGCAAUCCCGAACCAAUGGAUACCUGAUCCAUGCUCUUAUGGGCUCGAUAAUCUCAAACCUGCCUUCUUGGAUUUAUUUGAAAAUAGUCAUGAAUAUGAACAAGUCUACACGGGCUCACUAUCUGAAGAAAACCAAGAAGAACUAAGCAUUGAUAACUGCAUUGUAACUUGGCCAGAUGCUCCAGCAUAUGCACGUUCACUGCAAAGCACCCUACUGGUUUUGAAAAUCUGACCUUGUCAUUUCAAUAGUUAUUAACAUGACUAAAUAUUAUCUUAAUUAAGAGGAAAAUAGAAGUUGCUUUUAGGGGUUUCUGACAUAUAUUCUGGAUACUAUCCGAGGUAAUUUUGAAGUUUAAUAUAAAUGCUCAUAUCAAAUGAAUAUAGAACUAAUAUUGUCGGGAACACCUAAUAGAAAGGAAUACUAUUAUAGCAAAUCACAGAAUGAUAGACUCAAGCAUAAAACUUGGCAGUUUUAUCUGCUUCAAAAUGCCAUUGAUCAUUAUUCCUGUAUUUUCUCUGAAACUGAUUAUAAAAACCAAUGUCCAGCUACUCUUUUGUUUUUGACACUUGAAGAAAUGGAGAUCGAUUUGAUUUGUUUAUAAGCAGACACACUGCAAUUUACAAAGAUCUCUUUACGGUUUUAUAAAAUUAUCUUCCAGUUUGUACAUUUAUAUGGAAUUGUUCUUUAUCAAGGGUAGCUAAUGACAUGAAAAUAAUUGUGAAAUAUGGAAUUAUUUCUGACACAUGAAGCCCACUAAACUAUGCUUUCUUAUAAUGCAUAUUUCUUCUCAGUUUAAAUGUAUGUAAAUAUCGAAGCUAUAUGGUAUGAUUUAUAAAGAUAAAUGGGCCAAAGUGUACAUUGAGACUGGCAGCCAUCUAUGGUACCACUGAAACCCUGACCCAGAAAAGUGGCUUGCUUGGACACCCAGCUGCCUUUGUUUCUGCAUUAAACCAAUAUUGAUCACACAUAUGACACAGGCUAGUCCUAUAAAAGUAAUGACUUCAUAGAAAUGGCAUUAUAAUUUUUAAGUUGAUACUCUACAGGUAGCUAUUGAUAUAAUUAGUUUUAAUAAAACAUGCUGCAACCAUGGUAUACAACAAAAAUACAUUUCUUUGGUGAUUGAAAUUAAGGCCGUAUUUACAAUGACUUAAUAUAAGACUGACUUUUAUCCUGCUUCAUAACUUGUAUGGAGAACUCACCAAGAAAGAAUUCAAUACUGUGAAAUAUGCAGCAAGAAGAUUGGUCUUUACCUAGGCUGUGUUUCCUAAGCUCUGAGUUUUCAGCACCAGUAGAUUUGUAUUAAAAGAAAAAAAAAUGGGGCCUUAGCUUCUGGCUUUUAAUUUUGCCAGCUAAGGACAUAAAACAAAAAUAAACAAACAAAAACAAAUAGCCAUCUGCUAUCAGCAUCAUUAUGUAAAAGAAAAUAUAUUUUAGCCCCUAAAAUUAGGAAGAAUGUAAUCUCAGAAUAAAGGUUGUCAUUUAAGUUGAAUAAAUAUAUAGCUUUAUGAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-605.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -653.28

Frequency: 0.0000

Diversity: 618.19

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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