Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_016183.4

Sequence Length

2049 nt

GC Content

0.5159

ACCGUCUUCCGCCGCACGUGGAUUCAGCGCGAUGCCCAAAUCCAAGCGCGACAAGAAAGUCUCCUUAACCAAAACUGCCAAGAAAGGCUUGGAAUUGAAACAAAACCUGAUAGAAGAGCUUCGGAAAUGUGUGGACACCUACAAGUACCUUUUCAUCUUCUCUGUGGCCAACAUGAGGAACAGCAAGCUGAAGGACAUCCGGAACGCCUGGAAGCACAGCCGGAUGUUCUUUGGCAAAAACAAGGUGAUGAUGGUGGCCUUGGGUCGGAGCCCAUCUGAUGAAUACAAAGACAACCUGCACCAGGUCAGCAAAAGGUUGAGGGGUGAGGUGGGUCUCCUGUUCACCAACCGCACAAAGGAGGAGGUGAAUGAGUGGUUCACGAAAUACACAGAAAUGGACUACGCCCGAGCUGGUAACAAAGCAGCUUUCACUGUGAGCCUGGAUCCAGGGCCCCUGGAGCAGUUCCCCCACUCCAUGGAGCCACAGCUCAGGCAGCUGGGCCUGCCCACCGCCCUCAAGAGAGGUGUGGUGACUCUGCUGUCUGACUACGAGGUGUGCAAGGAGGGCGAUGUGCUGACCCCAGAGCAGGCUCGCGUCCUGAAGCUUUUUGGGUAUGAGAUGGCUGAAUUCAAGGUGACCAUCAAAUACAUGUGGGAUUCACAGUCGGGAAGGUUCCAGCAGAUGGGAGACGACUUGCCAGAGAGCGCAUCUGAGUCCACAGAAGAGUCAGACUCAGAAGAUGAUGACUGAAAGGGACUCGGGACUGAAGGUCUCCUGGAAGCUUCUGGGUCUCACUGGACCAUCAGGACUGCUGCCGCCCCUCUGGAGAGAGCAGCUUUUUAUUUGUCUGUAGACAGGGAACAUGAUGGGCACUGACCUCCUGUAAAGAAUAAAACUGUGGGCCGGGCGCGGUGGCUCACGCCUGGAAUCCCAGCACUUUGGGAAGCCGAGGUGGGCAGAUCAUAAGGUCGGGAGAUUAAGACCAUCCUGGCUAACACGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUAGAAAAAAAAACUAGUUGGGCAUAGUGGCAUGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCACUUGAACCCGGGAGGUGGAGGUUGCCGUGAGUUGAGAUUGGACCACUGCUCUCCAGCCUGGGCAACAGAGUAAAACUCUGUCCCAAAAAAAAAAAAAGAAUACAACCUUGCAGGAUGUCUCUCCUGGAGACAGCAAGAGGGAGAGGAGGGAGAGGGCUCUUUCUUAGAAAAGAGGCCUUUGGUGAGCCCAGAAGUUUGAAACCAGCCUGGGCAAUUCAGCAAGAUCCCGUCUCUACAAAAAAUAAAAAAAAAUUAGUCGUGGUGCCACUUGCCUGUGGUCCCCACUGCUUGGGAGGCUGAGGUGGGAGAAUUGCUUAAGCCUGAGAGUUGGAGGCUCAGUGAGCCAUGAUCAUGCCACUGCACUCCAGCCUGGGUGGCCAUUGAAUUCUGCGUGGAUUGCCUCAGUUUGCCUUGUCAGCCAACUUCCACUGGCUGCCUUGGCACUGCCAUGACAGCACAGCUCCACACCAGAGCUGGGGUUUCUCUUCAGUCCUGGGUACCCCUUGGCAGAGGGAUUUGCUGAGGAAAAUUAGGUAUCCUUCCUAGCCCUCCACACACUUCCAAACCAGGGCUGCGGAUCUGAUGGAUGCCAGGAAGACAGCCUUGGGCUGAGAGUGACAUCACUGCAAGAGUUGAGAGCCAGCGUCUAAAGUGUCCACGGCAUCCUGGGAGGUUUUAUCCUUGGUGACUCUAAUGGUAGAUUUUUGUCCACCUUGUUCUAUUUGCUUUUGUUUGUUUUUGAUUUUUCUGUUUUAAAAUUUUAAGGAGAGAUGGGGUUUCACCAUGUUGCCCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGAGCUCAAGCGAUCUACCCACCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUAUAGGUGUGAGCCACCGCAUCCAGCCCACAUUGUUCUAUUUGUAUUUCAUGAAAGCAGUUCUGAAUGAGAGUAAAUCAGCUUCAGGGUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-840.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -876.03

Frequency: 0.0000

Diversity: 404.38

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..........(((((.(.(((..((((((((.(((((...(((..(((((((......))).......((((....(((......)))))))............((((..(((.........((.....(((((....)))))....))..((((((((((((.((((.....((..((((((...((((((((((((((((.....(((......))))))))))))))))))).....((((((.((....)).)))))).((((((.....))))))........((((.((((.((((...(((((.....)))))..))))))))..)))).))))))..))...)).))..))))))))))))...((((((((...............))))))))....((((((.(.....).))))))...(((((..((((....))))((((.(((((...........))))).)).))))))).(((((((((.(((......((((((((((....)))).)))))).))).))))))))))))..))))))))..)))))))).))))))))..)))).)).)))..(((((((((((((......((((..((((((............).)))))..))))..((((((((((.......((((.((((((....(((.((.....)).)))((((.(.(((((((((((.......(((((...((....))...))))).....)))))))))..))..).)))))))))).)))))))))))))).....(((((((((((((..(((((.((((.(((.((...........)).))).))))..))).(((.((.((.......)))).)))..(((((((...(((((((.(((.(((((((((((((((((.((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((.(.((.(((((((.((.((((((.(((((.(((((.(((((((((((((((((.((.(((((((((((((((((((((((((..((..(((....)))..))..))))))))(((((....)))))(((((((........((((....((((((((((.(((((((.(...(..((((((..((((((((.(((.((((..(((((((...))))))))))).....................(((((((((((((.((((((....)))...(((((..((((((((((((.((((((......)))))).)))).(((..((((((....(((((.(((((((((((.....(((((..(((((((((.........................((((.(((((......)))))..)))).((((...)))).)))))))))...)))))...)))).)).))))).(((((...)))))........((....))((((((((((((((((...(((....((((((((.......((((..(((..(.((((((........)))))).)..)))))))))))).)))..)))..)))).)))).)))))))).....)))))..)))))))))((((((((((....))))))))))...........))))))))..)))))..........((..((((((((((...((((........))))..).)))))))))..)).))).)))))).))))))).)))))))).))).))))))..)..)))))))).)))(.((((.((((((.((((.....)))).)))))).)))).))))))))))))......)))))))..)))))...)))))))))))).........)).))))))))))))))))).))))).))))).)))))).)).))))))).))...).))))).))))))))))).)))))))))))))))))).))))))))))))))))).))).))))))))))))))............))..)))))))))).))).((.....))))))))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

..........(((((.,.(((..((((((((.(((((...(((..(((((((......))).......((((....{((......)))))))...,,.......{{((...((((((.....((...,.(((((....))))).,,.}}....,.)))}}|(((((((...{{((,(((((.({..((((((((((((((((...,,{{{...,,.}}})))))))))))))))).....,,,,{{.,,...{|,{||||||(((((((((((,{{{.,|........|||,.((((.((((...(((((.....)))))..))))))))}}),))})|(((((((..({.|.....,).)}.))))))),.,,(((((({,.............,||,,,,,..},((((((.{.....}.))))))....}))))))}..}}}}))))}}})),,,,}).}}))}....,},})))..))))))).(((((((((.(((......((((((((((....)))).)))))).))).))))))))).,...))))))))..)))))))).))))))))..))),.)).)))..(((((((((((((..,,..((((..((((({,...........}.)))))..)))).,((({,,,||}},..,.(((((.((((((..,.{{{{{{.,..|||.|},{{{{.|.|||((((((((.,.....(((((...((,...},,},))))).....))))))))|,,|,..)})))))))))).))))),|||||,,,.,}}}|,(((((((((((..,,{{{{((({.{{{,||..,,.......||,||}.}})),}))}.{((.((.((.......)))).)))..(((((((...(((((((.(((.(((((((((((((((((.((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((.{.((.(((((((.((.((((((.(((((.(((((.(((((((((((((((({.((.((((({{{{{{{,,,,,((((((((..((..(((....)))..))..))))))))(((((....)))))((((((({{{{{...((((....((((((((((.(((((((.,..,(.,((((((..((((((({.{{{.((((..(((((((...)))))))))))..................,,,(((((((((((((,(((,{(|||.,,,...(((((..((((((((((((.((((((......)))))).))))|,,,..((((((..{|||,...,}}||||||}}..{(((((((((((((.((({,.....................(((((((((((((......))))).((({.....}))),{((((((((((.((((((,{,...((({.((.(((((((...(((((.({,{,....,})))))))..)))))))))}}}}}}}.....)))))).)......}))))))))}|(((..(.((((((........)))))).)..)))}..)))))))),{,.,{|{{{..,.,,{|}||||((({..,,|},},,,.}}))),}}}}|,})},))))))))))))))))........,,..})))))))..))))).....,,||,|{..((((((((({...((((........)))}..).)))))))))..}).))),)))))).))))))).))))))))},)).)))))}..).,)))))))).))),,((((.{{{({(.((((.....)))).)))))),)))}.})))))))})))......))}}}))..))}},),,)))))))))}},....,}}}.)).})))))))))))))))).))))).))))).)))))).}).))))))).))...,.))))).))))))))))).)))))))))))))))))).))))))))))))))))).))).))))))))))))))...........,,)..))))))))))).}}.,,.....,,))))))))))))).