Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_016185.4

Sequence Length

1434 nt

GC Content

0.5014

AGCGGCGGCUCCUGCAGCGGUGGUCGGCUGUUGGGUGUGGAGUUUCCCAGCGCCCCUCGGGUCCGACCCUUUGAGCGUUCUGCUCCGGCGCCAGCCUACCUCGCUCCUCGGCGCCAUGACCACAACCACCACCUUCAAGGGAGUCGACCCCAACAGCAGGAAUAGCUCCCGAGUUUUGCGGCCUCCAGGUGGUGGAUCCAAUUUUUCAUUAGGUUUUGAUGAACCAACAGAACAACCUGUGAGGAAGAACAAAAUGGCCUCUAAUAUCUUUGGGACACCUGAAGAAAAUCAAGCUUCUUGGGCCAAGUCAGCAGGUGCCAAGUCUAGUGGUGGCAGGGAAGACUUGGAGUCAUCUGGACUGCAGAGAAGGAACUCCUCUGAAGCAAGCUCCGGAGACUUCUUAGAUCUGAAGGGAGAAGGUGAUAUUCAUGAAAAUGUGGACACAGACUUGCCAGGCAGCCUGGGGCAGAGUGAAGAGAAGCCCGUGCCUGCUGCGCCUGUGCCCAGCCCGGUGGCCCCGGCCCCAGUGCCAUCCAGAAGAAAUCCCCCUGGCGGCAAGUCCAGCCUCGUCUUGGGUUAGCUCUGACUGUCCUGAACGCUGUCGUUCUGUCUGUUUCCUCCAUGCUUGUGAACUGCACAACUUGAGCCUGACUGUACAUCUCUUGGAUUUGUUUCAUUAAAAAGAAGCACUUUAUGUACUGCUGUCUUUUUUUUUUUUCUUUUGAAGAACAGGUUUCUCUCUGUCCUUGACUCUUGGGUCUGUGGGCCAUGGCAUGAGUGUUUUCUAGUAGUAGAUUGGAGGGAAAGCUUUGUGACACUUAGUACUGUGUUUUUAAGAAGAAAUAAUUUGGUUCCAGAUGUGUUAGAGGAUCUUUUGUACUGAGGUUUUUAACACUUUACUUGGGUUUACCAAGCCUCAACUGGACAGACCAUAAACAGUCCACAGGCACCGUUCCUGCCAGGCCCCAACCCACAGGGAGUCUCUCCGCAGAGCCUUCUUGGUGUUGCCCUAACUUGCCAGUGGCCUUUGCUCAGAGCCUCCUCCUGUGACAUGUGAACAAUGAAGAGGCCUGCGCCUCCUGCCUUGCCGCCUGCAAAGCAAAGAAACUGCCUUUUAUUUUUUAACCUUAAAAAGUAGCCAGAUAGUAACAAGACUGGCUGGCUGAUGAGCAAAGCCUUUGCUCUCACGCAGAGGAAGGCUUGGAUGUACAAUGAAACUGCCUGGAACUAAAAGCAGUGAAGCAAGGGAGGCAAUCACACUGAAGCGGGUCUUCCUCCAGGAACGGGGUCCCACAGGCGUGUUGUUUUAAAUAACCUGAUGCUGUGUGCAUGAUGCUGGUGCUUGACCAUGAAAGGAAAGUCUCAUCCUUAAAAUGUGUUGUACUUCACAAUCCUGGACUGUUGCUUCAAGUAAACAAUAUCCACAUUUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-476.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -500.40

Frequency: 0.0000

Diversity: 273.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((((((.....((((((.((.(((.((((((((......))).)))))...((((...))))...((((.....)))).(((((((((.......)))....))))))......))).)))))))).....)))))))((((((..(((...((....(((((..(((((((.((.(((((((((((.((((..((((((((.(((((.(..((......))..).)))))))))))))........(((((.......((((((((...))))))))....((((...))))))))).((((((....((((.((((.((((((((((((.(((((.(((((((...((((...(((((.((((((....(((((((((.((((((((.....(((.((...(((...((((((...(((((((..(((.(((.((((((......((((((.((((((((.....((((.((((((.((..((((.(((((.(((..(((....)))...)))..)))((((..((((...........)))).)))).)).))))...))..))))))..))))..))))))))...)))))).....)))))).)))..)))..)))))))...)))..)))...))))))))....)))).)))))))))))))..(((((((((((..........)))).)))))))..((((((....))))))..))))))))))))))).)))))))..)))))(.(((((.(((((.((((((((((((....))))...((((.....(((...(((((........)))))...)))........(((((....)))))(((((((((.(((((.......))))))))))))))....(((((.....)))))))))...(((((............))))).))))))...)).)))))))))))....(((((((((.((((..((((((((...(((((((((...))))..))))).)).))))))..)))).)))..)))))).(((.......)))..(((((....)))))...))))))))))(((...))).....((((.((.((((((((((....))))))))))..)).)))).)).))))))))..))))))((((....(((((((......)))))))...)))))))).)........)))))))))).......)).)))))))..)))))....))...)))..).)))))....(((((((.(((.(((.(((((((((...(((......)))...))))).))))...))).)))((((..((((((..(((((........)))))...))).))))))).......)))))))..)))))((((((................)))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

,((((((((((((.....((((((.((.(({.((((((((......))}})))))...((({...))))...((((,...,)))).(((((((((.......)))....))))))......})}.)))))))).....)))))))((((((..(((...((.,..(((((..(((((((.((.(((((((((({.((((,.{(((((({{(((((,{..((......)),.,.})))))))))))}........(((((.......((((((((...))))))))....((((...))))))))).((((((....((({{((((.((((((((((((.(((((,(((((((...(({,.,{(((({{((((((....(((((((((.((((((((.....(((.((...(((...{(((((...(((((((..(((.(((.((((((......((((((.((((((((.....((((.((((((.((,.((((.((,{,,{{{,,||{.||,|||...|||..,.,{||{..((((..,.....,..)))).)))).},.}}))...),..))))))..))))..)))))))}...)))))).....)))))).)))..)))..)))))))...)))..)))...))))))))....))))},))))))))))))..(((((((((((.,......,.)))).)))))))..{(((((....))))))..))))))))))))))).))))))).}))))|(.(((((.(((((.(((((((((((({{..,,,)}}}||||,....(((,..(((((........)))))...,}),,,.....,,(((,{{{|||},(((((((({{(((((.......))))))))))))))....{{|||,...,))))||||,...(((((.,........,.))))).)))),},,})).))))))))))},...(((((((((.((((..((((((((..,(((((((({...})))..))))).)),})))))..)))).)))}.,))))).(((.......}))..(((((....)))))...))))))))))(((...))).....((((.{{.{(((((((((....))))))))))..}).)))).}).))))))))..)))))),(((....(((((((......)))))))...)))))))).}........}))))))))).......)).)))))))..)))))....))...)))..).)))))....(((((((.{((.(((.((((((((({{{(((...,}})))...))))).))))...))).)))(({{..{(((((..(((((........)))))...))).))}}}}}..,,...))))))).,)))))|{{{{{................})))),.