Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_016219.5

Sequence Length

2707 nt

GC Content

0.5955

GUUGACGGCGCUGCGAUGGCUGCCUGCGAGGGCAGGAGAAGCGGAGCUCUCGGUUCCUCUCAGUCGGACUUCCUGACGCCGCCAGUGGGCGGGGCCCCUUGGGCCGUCGCCACCACUGUAGUCAUGUACCCACCGCCGCCGCCGCCGCCUCAUCGGGACUUCAUCUCGGUGACGCUGAGCUUUGGCGAGAACUAUGACAACAGCAAGAGUUGGCGGCGGCGCUCGUGCUGGAGGAAAUGGAAGCAACUGUCGAGAUUGCAGCGGAAUAUGAUUCUCUUCCUCCUUGCCUUUCUGCUUUUCUGUGGACUCCUCUUCUACAUCAACUUGGCUGACCAUUGGAAAGCUCUGGCUUUCAGGCUAGAGGAAGAGCAGAAGAUGAGGCCAGAAAUUGCUGGGUUAAAACCAGCAAAUCCACCCGUCUUACCAGCUCCUCAGAAGGCGGACACCGACCCUGAGAACUUACCUGAGAUUUCGUCACAGAAGACACAAAGACACAUCCAGCGGGGACCACCUCACCUGCAGAUUAGACCCCCAAGCCAAGACCUGAAGGAUGGGACCCAGGAGGAGGCCACAAAAAGGCAAGAAGCCCCUGUGGAUCCCCGCCCGGAAGGAGAUCCGCAGAGGACAGUCAUCAGCUGGAGGGGAGCGGUGAUCGAGCCUGAGCAGGGCACCGAGCUCCCUUCAAGAAGAGCAGAAGUGCCCACCAAGCCUCCCCUGCCACCGGCCAGGACACAGGGCACACCAGUGCAUCUGAACUAUCGCCAGAAGGGCGUGAUUGACGUCUUCCUGCAUGCAUGGAAAGGAUACCGCAAGUUUGCAUGGGGCCAUGACGAGCUGAAGCCUGUGUCCAGGUCCUUCAGUGAGUGGUUUGGCCUCGGUCUCACACUGAUCGACGCGCUGGACACCAUGUGGAUCUUGGGUCUGAGGAAAGAAUUUGAGGAAGCCAGGAAGUGGGUGUCGAAGAAGUUACACUUUGAAAAGGACGUGGACGUCAACCUGUUUGAGAGCACGAUCCGCAUCCUGGGGGGGCUCCUGAGUGCCUACCACCUGUCUGGGGACAGCCUCUUCCUGAGGAAAGCUGAGGAUUUUGGAAAUCGGCUAAUGCCUGCCUUCAGAACACCAUCCAAGAUUCCUUACUCGGAUGUGAACAUCGGUACUGGAGUUGCCCACCCGCCACGGUGGACCUCCGACAGCACUGUGGCCGAGGUGACCAGCAUUCAGCUGGAGUUCCGGGAGCUCUCCCGUCUCACAGGGGAUAAGAAGUUUCAGGAGGCAGUGGAGAAGGUGACACAGCACAUCCACGGCCUGUCUGGGAAGAAGGAUGGGCUGGUGCCCAUGUUCAUCAAUACCCACAGUGGCCUCUUCACCCACCUGGGCGUAUUCACGCUGGGCGCCAGGGCCGACAGCUACUAUGAGUACCUGCUGAAGCAGUGGAUCCAGGGCGGGAAGCAGGAGACACAGCUGCUGGAAGACUACGUGGAAGCCAUCGAGGGUGUCAGAACGCACCUGCUGCGGCACUCCGAGCCCAGUAAGCUCACCUUUGUGGGGGAGCUUGCCCACGGCCGCUUCAGUGCCAAGAUGGACCACCUGGUGUGCUUCCUGCCAGGGACGCUGGCUCUGGGCGUCUACCACGGCCUGCCCGCCAGCCACAUGGAGCUGGCCCAGGAGCUCAUGGAGACUUGUUACCAGAUGAACCGGCAGAUGGAGACGGGGCUGAGUCCCGAGAUCGUGCACUUCAACCUUUACCCCCAGCCGGGCCGUCGGGACGUGGAGGUCAAGCCAGCAGACAGGCACAACCUGCUGCGGCCAGAGACCGUGGAGAGCCUGUUCUACCUGUACCGCGUCACAGGGGACCGCAAAUACCAGGACUGGGGCUGGGAGAUUCUGCAGAGCUUCAGCCGAUUCACACGGGUCCCCUCGGGUGGCUAUUCUUCCAUCAACAAUGUCCAGGAUCCUCAGAAGCCCGAGCCUAGGGACAAGAUGGAGAGCUUCUUCCUGGGGGAGACGCUCAAGUAUCUGUUCUUGCUCUUCUCCGAUGACCCAAACCUGCUCAGCCUGGAUGCCUACGUGUUCAACACCGAAGCCCACCCUCUGCCUAUCUGGACCCCUGCCUAGGGUGGAUGGCUGCUGGUGUGGGGACUUCGGGUGGGCAGAGGCACCUUGCUGGGUCUGUGGCAUUUUCCAAGGGCCCACGUAGCACCGGCAACCGCCAAGUGGCCCAGGCUCUGAACUGGCUCUGGGCUCCUCCUCGUCUCUGCUUUAAUCAGGACACCGUGAGGACAAGUGAGGCCGUCAGUCUUGGUGUGAUGCGGGGUGGGCUGGGCCGCUGGAGCCUCCGCCUGCUUCCUCCAGAAGACACGAAUCAUGACUCACGAUUGCUGAAGCCUGAGCAGGUCUCUGUGGGCCGACCAGAGGGGGGCUUCGAGGUGGUCCCUGGUACUGGGGUGACCGAGUGGACAGCCCAGGGUGCAGCUCUGCCCGGGCUCGUGAAGCCUCAGAUGUCCCCAAUCCAAGGGUCUGGAGGGGCUGCCGUGACUCCAGAGGCCUGAGGCUCCAGGGCUGGCUCUGGUGUUUACAAGCUGGACUCAGGGAUCCUCCUGGCCGCCCCGCAGGGGGCUUGGAGGGCUGGACGGCAAGUCCGUCUAGCUCACGGGCCCCUCCAGUGGAAUGGGUCUUUUCGGUGGAGAUAAAAGUUGAUUUGCUCUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1155.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1195.50

Frequency: 0.0000

Diversity: 766.77

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((((((.((....)).))((((....))))((((...((((((...)))))))))).(((((.....))))))))).(((((((((((((((...))))).))))..)))))).((((((((..((((((.((((((((((((.(((((((((.....))))))))).))..((((((.((................)).)))))))))))))))).....(((((((((..((((.((((((....)).))))...((((..........))))..((.(((((((((((((((((((((.......)))))).(((..(((....)))))).....((((((((....))))))))))))))))))....))))).))...(((((((.......))))))).))))....)))).)))))..(((((..(((((...))).))))))).......(((((.(((((((......))).......(((.((((((((((((((((((.((((((..............((((((((.(((.((.((((.(((.((((((.((((((....(((.....))).(((((((((.((........)).)))))))))(((...((((((....((((((((((((((.((.(((.......((((((...((((..........))))....))))))..((((((.(.((((.....((((.(((((((((((((....))))((((...((((.(((((.(((((((.....))))))).)))...))))))...))))......((((((((((....)))).))))))....))))))))).))))...))).).).))))))((.((((((.......)))))).))))).))))))....((..((((((((((((((.......((((((.((((....(((((((((((((........)))))...((((.((((((((....((.....))...))).))))).))))(((((((((((((((.((...((.((.....))))...))))).((((.((.....)).))))(((((((....(((....)))....)))))))...(((((.((........)).))))).((((.((((..(((((((((..((((((((((((((............)))))))).)).))))..)))).))))))))).)))).))))))))))))(((((....)))))......(((((((((((.(((((...(.((...)).)...))))).)))).))))))).(((..((((((....)))))).)))....))))))))..)))).))))))....(((((((((.........((((.((.(((((...((((.(((((.....((((((...)))))).(((..((((((((((((.((......)).))...(.((((.((((...((((((.((((((......)))))).)...((((((.((.(((..((((((((.(((....))).))))))))....)))))....))))))..))))).)))).)))).)))))))))))..))).((((((...(((((((......)))..))))))))))..)))))))))))))).)).))))(((((((...((((((.((((..(((((...(((...((((((...)))))).....((........))........))))))))..))))..(((((((.((((..(((.((((.((((.....)))))))))))....))))((((((......)))))).....)))))))..((((((((..........((.((((((((.(.((...)).)..))))))))))..........))))))))..))))))...)).))))).....))))))))).)))))))..))))))))).(((((((.((((..((((.((((((...)))))).))))...))))))))))))))))))))))))))).....)))(((((((..((.(((((.(.((((((.(.(((((((((((((...(((.((((..((((.......)))))))))))....)).)))))..)))))))))))))))))))))..))))))).)))))).))))))..))))))).....(((.(((....)))..)))((((((((.(......))).)))))).((((((.((((.........(((.(....).))))))).)).)))))).)))))))))))....))))))((((......)))).(((((((((((((((((.((.(((.......((........)).......))).))...))))))))(((((.(......))))))))))))))))))))))))))))...)))))))).((....))(((((((.((((........))))))))).)))))).))))).....((((.((((.....((((((((((..(((((.((((((.((((.((((.(((.(((((((((.((.......)))))))).)))..))).))))..))))(((((....)))))))))))((((((((((.....))))))))))))))))))))))))))))).))))......))))))..))).....)))))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{(({(({(,((.((((((((,(((((....))))|,({{(.((((((...}))))),)}}.(((((.....))))),{{{{((((((((({(((((...))))).})))}.}}}|||,.||{{,(,.,....((((({(((({{,((.(((((((((.....))))))))).)).,,||{{|,||,......,,,,,.,,,)}.,}}))))))))))))},,,||||.(((((({..{{{,{((,((.,..}}.,}}).|,||,,...,.}))}.))))))),.||{((((((((((((((((((.......)))))}{({,..(((....}}},|}},...((((((((....))))))))))))))))))},,,}))))..,...(((((((.......))))))).{((((..(((((.((((({{(((((..(((((...))).))}}}}}......{((((((((,,(((......))).......((({((((((((((.,..,{{{....,..}....,.}}}|(((((((....(((((((.{(({...((((.((((((........(((.....))|,(((((((((.((........)).))))))))).}|.((((,....}))}(((((((((((((.((..((....))..))))))..)))))))))..,..{.{{{....)))},.....))))))))))...}}}|((.(((((((((((((....))))((((...((((.(((((.(((((((.....))))))).)))...))))))...))))....,.((((((((((....)))).)))))),..,))))))))).))))))))))....)))))))|{.((((((.......)))))).)))))))}.....))))}})}))}})}))})))}.......((((((.((((....(((((((((((((........))))),..((((.((((((((....((.....)).}.))).))))).))))(((((((((((((,({({,..,|.|({{{{.}}})}}})||||.{{{{,||,....}|,||||{((((((....(((....))).,.,}})))},...{((((.{(,.....,.)).))))).{(((.{(((,.{((((((((..((((((((((((((............))))))))},).))))..)))).))))))))).)))))))))))))))))(((((....)))))......{((((((((((.(((((...,{({...,,,)...))))).)))).))))))}.(((,.((((((....)))))).))).,,.})))))))..)))).)))))){({.((((((,(({{{{{.{{(((((.,..,,)}}..}|||,.,,.||})))}(((({{..})))}}}.|||}}|,,}}}.(((.(.,....}.)))))))))))))...))))}})))))))}||||||},....,||||..(((.(((..({(((((((.((((((((.(((....))),)))))))){{{(((.((((((((((((,.|..(((((((((|(|{,((|{||,(((((.....)))))...||||||,,}}}.{||{{{{|||(((,(({,|||.||||||||||{}|.|(((((((,(,((((((,,{.((((..(((((...,((.{..((((.{((({||{(....)}.}.}),}}}.)))}..,},}},)))))..)))){{((((,(({((,,..(((.((((.((((.....))))))))}}|{{{{|,||((,,(({{{{{{.}||,|{{{{.|,,,}},}}|||{({(({{......{(((.,((((,{(.(((((....,|(((((...||{|{.......,})((((((((((({,,{,..,|,{{(|,,.....||||||)),..,,,))..})))))),,..|)))),{((((..((((.((((((...)))))).))))...)))))))))},))}},))))).).}.)))}..)))|{{{{((..((.(((((.(.(((((,,{.(((((((((((((.{.(((,((((,.({(({,....,)))}}))))))....)).))))),.)))))))))))))))))))})..)))||||{|,|||.....,)),.))))))},,,,,|,,.(((....)))..)))||||||||}}}..,,.)))}))))))}}}}}}.}|||}}.,......,||}}.,.}}}})))..,..,}),)))).,,))|)))}))})}..)),})}}||}}.}}}))}.,(((((((((,|(((|{{|{{.(((,,{{{.|,..{{{.{..|||,}..,.}))},,}.}))}}})))))}}},})}..,.}))),})))))))))}))))))))))))))))))))))).)),.,}))...,,,{,((((,......}))))))))))).)).))).))).....((((.((((.....((((((((((..(((((,((((((.((((.((((.(((.(((((((((.((.......)))))))).)))..))).))))..))))(((((....))))))))))){(((((((((.....))))))))))))))))))))))))))))).))))......,))))|{{.{{{{......))))))),..