Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_016231.5
Sequence Length
3526 nt
GC Content
0.4087
CUUUUGGCAACCCACACCCUUCCACACACGCUCACCCCAAAAUUAAACACCAAGAUCCUCUAACUUGUUUGGAUUGACUGAUGAAGACAUAAAGCUCUAUGUUUUUUGAGGUGGAGUGAGUGGUUUUUCUUCAUUUUUAAAUGGCCAAAUGACAGCUUGACCCAGUUUGCUUUCCAAUCAAAGGGCAUUUAUUUUGAAUGUCUCUUUGUGGCGCAAGAGCCAACGCAAAAAUGAUGGCGGCUUACAAUGGCGGUACAUCUGCAGCAGCAGCAGGUCACCACCACCACCAUCACCACCACCUUCCACACCUCCCUCCUCCUCACCUGCACCACCACCACCACCCUCAACACCAUCUUCAUCCGGGGUCGGCUGCCGCUGUACACCCUGUACAGCAGCACACCUCUUCGGCAGCUGCGGCAGCCGCAGCAGCGGCUGCAGCUGCAGCCAUGUUAAACCCUGGGCAACAACAGCCAUAUUUCCCAUCACCGGCACCGGGGCAGGCUCCUGGACCAGCUGCAGCAGCCCCAGCUCAGGUACAGGCUGCCGCAGCUGCUACAGUUAAGGCGCACCAUCAUCAGCACUCGCAUCAUCCACAGCAGCAGCUGGAUAUUGAGCCGGAUAGACCUAUUGGAUAUGGAGCCUUUGGUGUUGUCUGGUCAGUAACAGAUCCAAGAGAUGGAAAGAGAGUAGCGCUCAAAAAGAUGCCCAACGUCUUCCAGAAUCUGGUCUCUUGCAAAAGGGUCUUCCGGGAAUUGAAGAUGUUGUGUUUUUUUAAGCAUGAUAAUGUACUCUCUGCCCUUGACAUACUCCAACCUCCACACAUUGACUAUUUUGAAGAAAUAUAUGUUGUCACAGAAUUGAUGCAGAGUGACCUACAUAAAAUUAUCGUCUCUCCUCAACCACUCAGCUCAGAUCAUGUCAAAGUUUUUCUUUAUCAGAUUUUGCGAGGUUUGAAAUAUCUCCAUUCAGCUGGCAUUUUACAUCGAGACAUUAAGCCAGGGAAUCUCCUUGUGAACAGCAACUGUGUUCUAAAGAUUUGUGAUUUUGGAUUGGCCAGAGUGGAAGAAUUAGAUGAAUCCCGUCAUAUGACUCAGGAAGUUGUUACUCAGUAUUAUCGGGCUCCAGAAAUCCUGAUGGGCAGCCGUCAUUACAGCAAUGCUAUUGACAUCUGGUCUGUGGGAUGUAUCUUUGCAGAACUACUAGGACGAAGAAUAUUGUUUCAGGCACAGAGUCCCAUUCAGCAGUUGGAUUUGAUCACGGAUCUGUUGGGCACACCAUCACUGGAAGCAAUGAGGACAGCUUGUGAAGGCGCUAAGGCACAUAUACUCAGGGGUCCUCAUAAACAGCCAUCUCUUCCUGUACUCUAUACCCUGUCUAGCCAGGCUACACAUGAAGCUGUUCAUCUCCUUUGCAGGAUGUUGGUCUUUGAUCCAUCCAAAAGAAUAUCCGCUAAGGAUGCCUUAGCCCACCCCUACCUAGAUGAAGGGCGACUACGAUAUCACACAUGUAUGUGUAAAUGUUGCUUUUCCACCUCCACUGGAAGAGUUUAUACCAGUGACUUUGAGCCUGUCACCAAUCCCAAAUUUGAUGACACUUUCGAGAAGAACCUCAGUUCUGUCCGACAGGUUAAAGAAAUUAUUCAUCAGUUCAUUUUGGAACAGCAGAAAGGAAACAGAGUGCCUCUCUGCAUCAACCCUCAGUCUGCUGCUUUUAAGAGCUUUAUUAGUUCCACUGUUGCUCAGCCAUCUGAGAUGCCCCCAUCUCCUCUGGUGUGGGAGUGAUGGUGGAAGAUAAUGUACUACUGAAGAUGUAAUGUAGCUUUCCACUGGAGUCUGGGAUUUGCAAUUCUGGAGGUUAAUCAUGCUUGUACUGUAAUUUUACUAAUGAAGUUUUAAAUUAACAACCACUACUUGUAUGAUAUGAAUAAUAUUUAGAAAUGUUACUAGACUUUUAAUCUUGUAAAGUGGUUGUGCUUUUAGAAGAAAAAUAUUUUACCCAGAGUUGCACAUGUUUUAUGAAUUUAGUGCAGCUGUUAUGGCUCACCUCAGAACAAAAGAGAAUUGAACCAAAUUUGGGAGUUUGGGGUUUUAUGUUUUGUUUUUCUUUUCUAAAAUGAAGUGAGAUUGUUCACACACACACACACACACACACACACACACAAACACAAAGGACAGUCAUACAUUUUGAUAUUUGAGCCAUUCCUAAAGAUUUGGGGUUUUCUAAAACUAAAGAAUCUAGGAACCUUGCCUGCGACCAAUCAUGGAGCCACGUGAGCUGAUCGUGGCUGCACCUGGGGGGAGGGUAGGGAGGAGGGGCAUGCCACCUAAUGAUCAAGCCCUAUAAUUAGCUUCUCAUUAGAGCCGUGAUGGUGAUGUGUGCUGUCUAAAAUCCAAUGUUGUGGGUAGAGAGAAUGAGUUUGUGACUAGGAGAGACUAAACUUUUGUUUUCCUUACCCAGUAUAAAUAUAUAUAUAUAUAUUUAAUCUAUUUUUAUUAGAAGUUUUUCUGCUCUUUCUUACAUAAAAGAACCCCAAGCAUGCAUCUUUCAUGUGUGUAAAUAAUUCAUUUCUGGGCUAAUUUCAAAAGAAUCCCAAUAUUGCUGUAUAGAAAGAGAACUAGCUUGCACAUUUUAGGUCUGUGAAAUUUUGUGAGACUUUUCCUGCACUGGACAGUAAAAAAAUAAUAAAAGACAAAAACAAAUUUAAAAAAAAAUUUAAGCCACAAAAAAAGGCACAUAGGGAAUUAUGUCAAAUGUGUUUGUGUCCUUAGGCAAAGCUGUGGGAGUCUUGAAAUGUCACAGUAGUAAAUAACUUAUUACUUUUUGACAAGUUCUUUUUUUCUGUUGGAACACUGAAUUCUUCUGUGCAUAUGUACAUAUGAAUACAAAUCGAAGGCCUCUACCUCCUGGAGUUAUACAACUUGGCUUGUUUACCUCCACAUGCUGAUGAUGACUAUUUUUUUUUUUUGAGUUCAGUGUGGAGACUUGAAACUUGAAUGUCCCUUCCAACUUUUAUAUUAAAAAUAAAAAGACAAGAAAAUUGAAGAUCAUUUUUCACCUGUACAAGGAAUACUAAUGGAUCGUCUUAAAAUUGGUCUAGGAAAAAACCUUGGUGUGUGUUAUGGACAAUUAACUGUUAAAGUUAUUGUAAGUUAUCUGUAUUUAGCAGAGUAUUUUCAACUUGAGUGAUCUGAGCUGAAUUUGAAGACUAUUAAUAAGUUAUGUUUGGAAGUUUUAACUUCAAUGAAGUAAUUAUUUGCUGUGAAAGAAACAAACAUUGAAUUACUAAACAAAGAUGGUGCAAUAUCUUUGUUUUUUUUUUAUGAGGCUCCUGAGAAUCAACCCAACUGAAGCAUUUCAAUUCACUUGAAUGAGAAACGUGUUUAGUAUCAAAAGAGCCCAAGAAGACACUGGUGUGAAAGGUACAAUCUCAGAGGUUGGUCAAUUACCGUGGCACACUUUCUGGUCACUUUGUACAAUGUAGAUUUGAAGUACAGUGGUGAAAACAUUAAAUGUGACAUUUGAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-974.42 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1039.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 770.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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