Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_016269.5
Sequence Length
3575 nt
GC Content
0.5192
GAGAAGCAGUGGGGAGGCGCAGCCGCUCACCUGCGGGGCAGGGCGCGGAGGAGGGACCCGGGCUGCGCGCUCUCGGGCCGAGGAACCAGGACGCGCCCGGAGCCUCGCACGCGGCCAAGCUCGGGGCGUCCCCUCCCCUCGGCCGGGCGAACUCAAGGGGCGCAGCUCUUUGCUUUGACAGAGCUGGCCGGCGGAGGCGUGCAGAGCGGCGAGCCGGCGAGCCAGGCUGAGAAACUCGAGCCGGGAACAAAGAGGGGUCGGACUGAGUGUGUGUGUCGGCUCGAGCUCCGGGCAGAGGCAUUUGGGCCCGAGGCCCCCGCUGUGACUCCCCGAGACUCCGCAGUGCCCUCCACUGCGGAGUCCCCGCGCUUGCCGGCAAAAACUUUAUUCUUGGCAAACUUCUCUUUCUCUUCCCCUCCUCCUCGGCCCCCAUCUUCUGCUCCUCCUCCUUCUCUAGCAGAUUAAAUGAGCCUCGAGAAGAAAAACCGAAGCGAAAGGGAAGAAAAUAAGAAGAUCUAAAACGGACAUCUCCAGCGUGGGUGGCUCCUUUUUCUUUUUCUUUUUUUCCCACCCUUCAGGAAGUGGACGUUUCGUUAUCUUCUGAUCCUUGCACCUUCUUUUGGGGCAAACGGGGCCCUUCUGCCCAGAUCCCCUCUCUUUUCUCGGAAAACAAACUACUAAGUCGGCAUCCGGGGUAACUACAGUGGAGAGGGUUUCCGCGGAGACGCGCCGCCGGACCCUCCUCUGCACUUUGGGGAGGCGUGCUCCCUCCAGAACCGGCGUUCUCCGCGCGCAAAUCCCGGCGACGCGGGGUCGCGGGGUGGCCGCCGGGGCAGCCUCGUCUAGCGCGCGCCGCGCAGACGCCCCCGGAGUCGCCAGCUACCGCAGCCCUCGCCGCCCAGUGCCCUUCGGCCUCGGGGGCGGGCGCCUGCGUCGGUCUCCGCGAAGCGGGAAAGCGCGGCGGCCGCCGGGAUUCGGGCGCCGCGGCAGCUGCUCCGGCUGCCGGCCGGCGGCCCCGCGCUCGCCCGCCCCGCUUCCGCCCGCUGUCCUGCUGCACGAACCCUUCCAACUCUCCUUUCCUCCCCCACCCUUGAGUUACCCCUCUGUCUUUCCUGCUGUUGCGCGGGUGCUCCCACAGCGGAGCGGAGAUUACAGAGCCGCCGGGAUGCCCCAACUCUCCGGAGGAGGUGGCGGCGGCGGGGGGGACCCGGAACUCUGCGCCACGGACGAGAUGAUCCCCUUCAAGGACGAGGGCGAUCCUCAGAAGGAAAAGAUCUUCGCCGAGAUCAGUCAUCCCGAAGAGGAAGGCGAUUUAGCUGACAUCAAGUCUUCCUUGGUGAACGAGUCUGAAAUCAUCCCGGCCAGCAACGGACACGAGGUGGCCAGACAAGCACAAACCUCUCAGGAGCCCUACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCCGAUGACGGAAAGCAUCCAGAUGGAGGCCUCUACAACAAGGGACCCUCCUACUCGAGUUAUUCCGGGUACAUAAUGAUGCCAAAUAUGAAUAACGACCCAUACAUGUCAAAUGGAUCUCUUUCUCCACCCAUCCCGAGAACAUCAAAUAAAGUGCCCGUGGUGCAGCCAUCCCAUGCGGUCCAUCCUCUCACCCCCCUCAUCACUUACAGUGACGAGCACUUUUCUCCAGGAUCACACCCGUCACACAUCCCAUCAGAUGUCAACUCCAAACAAGGCAUGUCCAGACAUCCUCCAGCUCCUGAUAUCCCUACUUUUUAUCCCUUGUCUCCGGGUGGUGUUGGACAGAUCACCCCACCUCUUGGCUGGCAAGGUCAGCCUGUAUAUCCCAUCACGGGUGGAUUCAGGCAACCCUACCCAUCCUCACUGUCAGUCGACACUUCCAUGUCCAGGUUUUCCCAUCAUAUGAUUCCCGGUCCUCCUGGUCCCCACACAACUGGCAUCCCUCAUCCAGCUAUUGUAACACCUCAGGUCAAACAGGAACAUCCCCACACUGACAGUGACCUAAUGCACGUGAAGCCUCAGCAUGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCAAAAAGACCUCACAUUAAGAAGCCUCUGAAUGCUUUUAUGUUAUACAUGAAAGAAAUGAGAGCGAAUGUCGUUGCUGAGUGUACUCUAAAAGAAAGUGCAGCUAUCAACCAGAUUCUUGGCAGAAGGUGGCAUGCCCUCUCCCGUGAAGAGCAGGCUAAAUAUUAUGAAUUAGCACGGAAAGAAAGACAGCUACAUAUGCAGCUUUAUCCAGGCUGGUCUGCAAGAGACAAUUAUGGUAAGAAAAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAACUACAGGAAUCUGCAUCAGGUACAGGUCCAAGAAUGACAGCUGCCUACAUCUGAAACAUGGUGGAAAACGAAGCUCAUUCCCAACGUGCAAAGCCAAGGCAGCGACCCCAGGACCUCUUCUGGAGAUGGAAGCUUGUUGAAAACCCAGACUGUCUCCACGGCCUGCCCAGUCGACCCCAAAGGAACACUGACAUCAAUUUUACCCUGAGGUCACUGCUAGAGACGCUGAUCCAUAAAGACAAUCACUGCCAACCCCUCUUUCGUCUACUGCAAGAGCCAAGUUCCAAAAUAAAGCAUAAAAAGGUUUUUUAAAAGGAAAUGUAAAAGCACAUGAGAAUGCUAGCAGGCUGUGGGGCAGCUGAGCAGCUUUUCUCCCCUCAUAUCUGCGUGCACUUCCCAGAGCAUCUUGCAUCCAAACCUGUAACCUUUCGGCAAGGACGGUAACUUGGCUGCAUUUGCCUGUCAUGCGCAACUGGAGCCAGCAACCAGCACAUCCAUCAGCACCCCAGUGGAGGAGUUCAUGGAAGAGUUCCCUCUUUGUUUCUGCUUCAUUUUUCUUUCUUUUCUUUUCUCCUAAAGCUUUUAUUUAACAGUGCAAAAGGAUCGUUUUUUUUUGCUUUUUUAAACUUGAAUUUUUUUAAUUUACACUUUUUAGUUUUAAUUUUCUUGUAUAUUUUGCUAGCUAUGAGCUUUUAAAUAAAAUUGAAAGUUCUGGAAAAGUUUGAAAUAAUGACAUAAAAAGAAGCCUUCUUUUUCUGAGACAGCUUGUCUGGUAAGUGGCUUCUCUGUGAAUUGCCUGUAACACAUAGUGGCUUCUCCGCCCUUGUAAGGUGUUCAGUAGAGCUAAAUAAAUGUAAUAGCCAAACCCACUCUGUUGGUAGCAAUUGGCAGCCCUAUUUCAGUUUAUUUUUUCUUCUGUUUUCUUCUUUUCUUUUUUUAAACAGUAAACCUUAACAGAUGCGUUCAGCAGACUGGUUUGCAGUGAAUUUUCAUUUCUUUCCUUAUCACCCCCUUGUUGUAAAAAGCCCAGCACUUGAAUUGUUAUUACUUUAAAUGUUCUGUAUUUGUAUCUGUUUUUAUUAGCCAAUUAGUGGGAUUUUAUGCCAGUUGUUAAAAUGAGCAUUGAUGUACCCAUUUUUUAAAAAAGCAAGGCACAGCCUUUGCCCAAAACUGUCAUCCUAACGUUUGUCAUUCCAGUUUGAGUUAAUGUGCUGAGCAUUUUUUUAAAAGAAGCUUUGUAAUAAAACAUUUUUAAAAAUUGUCA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1203.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1269.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 1095.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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