Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_016335.6

Sequence Length

2203 nt

GC Content

0.6296

CCCGCCAUGGCUCUGAGGCGCGCCCUGCCCGCGCUGCGCCCCUGCAUUCCCCGCUUCGUCCCGCUGUCCACGGCGCCGGCCUCCCGCGAGCAGCCCGCAGCGGGCCCAGCGGCCGUGCCAGGAGGUGGGUCGGCCACGGCAGUGCGGCCGCCGGUGCCCGCCGUGGACUUCGGCAACGCGCAGGAGGCGUACCGCAGCCGGCGAACCUGGGAGCUGGCGCGGAGCCUGCUGGUGCUGCGCUUGUGCGCCUGGCCCGCGCUGCUGGCGCGCCACGAGCAGCUGCUGUAUGUUUCCAGGAAACUUCUAGGACAGAGGCUAUUCAACAAGCUCAUGAAGAUGACCUUCUAUGGGCAUUUUGUAGCCGGGGAGGACCAGGAGUCCAUCCAGCCCCUGCUUCGGCACUACAGGGCCUUCGGUGUCAGCGCCAUCCUGGACUAUGGAGUGGAGGAGGACCUGAGCCCCGAGGAGGCAGAGCACAAGGAGAUGGAGUCCUGCACCUCAGCUGCGGAGAGGGAUGGCAGUGGCACGAAUAAGCGGGACAAGCAAUACCAGGCCCACUGGGCCUUCGGGGACCGCAGGAAUGGUGUCAUCAGUGCCCGCACCUACUUCUACGCCAAUGAGGCCAAGUGCGACAGCCACAUGGAGACAUUCUUGCGCUGCAUCGAAGCCUCAGGUAGAGUCAGCGAUGACGGCUUCAUAGCCAUUAAGCUCACAGCACUGGGGAGACCCCAGUUUCUGCUGCAGUUCUCAGAGGUGCUGGCCAAGUGGAGGUGCUUCUUUCACCAAAUGGCUGUGGAGCAAGGGCAGGCGGGCCUGGCUGCCAUGGACACCAAGCUGGAGGUGGCGGUGCUGCAGGAAAGUGUCGCAAAGUUGGGCAUCGCAUCCAGGGCUGAGAUUGAGGACUGGUUCACGGCAGAGACCCUGGGAGUGUCUGGCACCAUGGACCUGCUGGACUGGAGCAGCCUCAUCGACAGCAGGACCAAGCUGUCCAAGCACUUGGUAGUCCCCAACGCACAGACAGGACAGCUGGAGCCCCUGCUGUCCCGGUUCACUGAGGAGGAGGAGCUACAGAUGACCAGGAUGCUACAGCGGAUGGAUGUCCUGGCCAAGAAAGCCACAGAGAUGGGCGUGCGGCUGAUGGUGGAUGCCGAGCAGACCUACUUCCAGCCGGCCAUCAGCCGCCUGACGCUGGAGAUGCAGCGGAAGUUCAAUGUGGAGAAGCCGCUCAUCUUCAACACAUACCAGUGCUACCUCAAGGAUGCCUAUGACAAUGUGACCCUGGACGUGGAGCUGGCUCGCCGUGAGGGCUGGUGUUUUGGGGCCAAGCUGGUGCGGGGCGCAUACCUGGCCCAGGAGCGAGCCCGUGCGGCAGAGAUCGGCUAUGAGGACCCCAUCAACCCCACGUACGAGGCCACCAACGCCAUGUACCACAGGUGCCUGGACUACGUGUUGGAGGAGCUGAAGCACAACGCCAAGGCCAAGGUGAUGGUGGCCUCCCACAAUGAGGACACAGUGCGCUUUGCACUGCGCAGGAUGGAGGAGCUGGGCCUGCAUCCUGCUGACCACCGGGUGUACUUUGGACAGCUGCUAGGCAUGUGUGACCAGAUCAGCUUCCCGCUGGGCCAGGCCGGCUACCCCGUGUACAAGUACGUGCCCUAUGGCCCCGUGAUGGAGGUGCUGCCCUACUUGUCCCGCCGUGCCCUGGAGAACAGCAGCCUCAUGAAGGGCACCCAUCGGGAGCGGCAGCUGCUGUGGCUGGAGCUCUUGAGGCGGCUCCGAACUGGCAACCUCUUCCAUCGCCCUGCCUAGCACCCGCCAGCACACCCUUAGCCUCCAGCACCCCCCGCCCCCGCCCAGGCCAUCACCACAGCUGCAGCCAACCCCAUCCUCACACAGAUUCACCUUUUUUCACCCCACACUUGCAGAGCUGCUGGAGGUGAGGUCAGGUGCCUCCCAGCCCUGCCCAGAGUAUGGGCACUCAGGUGUGGGCCGAACCUGAUACCUGCCUGGGACAGCCACUGGAAACUUUUGGGAACUCUCCUCGAAUGUGUGGGCCCAAGGCCCCCACCUCUGUGACCCCCAUGUCCUUGGACCUAGAGGAUUGUCCACCUUCUGCCAAGGCCAGCCCACACAGCCCGAGCCCCUUGGGGAGCAGUGGCCGGGCUGGGGAGGCCUGCCUGGUCAAUAAACCACUGUUCCUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-981.52 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1018.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 521.16

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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